| Archeologický ústav, Brno (99) |
| Archeologický ústav, Praha (246) |
| Astronomický ústav (244) |
| Biologické centrum (414) |
| Biotechnologický ústav (48) |
| Botanický ústav (395) |
| Biofyzikální ústav (298) |
| Entomologický ústav (50) |
| Etnologický ústav (534) |
| Farmakologický ústav (1) |
| Filosofický ústav (530) |
| Fyzikální ústav (578) |
| Fyziologický ústav (80) |
| Geofyzikální ústav (197) |
| Geologický ústav (458) |
| Historický ústav (483) |
| Hydrobiologický ústav (116) |
| Knihovna AV ČR (73) |
| Masarykův ústav a Archiv (494) |
| Matematický ústav (415) |
| Mikrobiologický ústav (506) |
| Národohospodářský ústav (890) |
| Orientální ústav (39) |
| Parazitologický ústav (8) |
| Psychologický ústav (320) |
| Slovanský ústav (114) |
| Sociologický ústav (2,820) |
| Sociologický ústav (CVVM) (55) |
| Technologické centrum (0) |
| Ústav analytické chemie (485) |
| Ústav anorganické chemie (420) |
| Ústav biologie obratlovců (528) |
| Ústav dějin umění (349) |
| Ústav experimentální botaniky (113) |
| Ústav experimentální medicíny (140) |
| Ústav fotoniky a elektroniky (626) |
| Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského (463) |
| Ústav fyzikálního inženýrství (0) |
| Ústav fyziky atmosféry (264) |
| Ústav fyziky materiálů (1,005) |
| Ústav fyziky plazmatu (600) |
| Ústav geoniky (1,303) |
| Ústav chemických procesů (2,044) |
| Ústav informatiky (1,637) |
| Ústav jaderné fyziky (440) |
| Ústav makromolekulární chemie (436) |
| Ústav molekulární biologie rostlin (42) |
| Ústav molekulární genetiky (85) |
| Ústav organické chemie a biochemie (565) |
| Ústav pro českou literaturu (450) |
| Ústav pro elektrotechniku (0) |
| Ústav pro hydrodynamiku (613) |
| Ústav pro jazyk český (779) |
| Ústav pro klasická studia (0) |
| Ústav pro soudobé dějiny (283) |
| Ústav přístrojové techniky (1,418) |
| Ústav půdní biologie (192) |
| Ústav státu a práva (161) |
| Ústav struktury a mechaniky hornin (377) |
| Ústav teoretické a aplikované mechaniky (1,265) |
| Ústav teorie informace a automatizace (1,561) |
| Ústav termomechaniky (3,147) |
| Ústav výzkumu globální změny (569) |
| Ústav živočišné fyziologie a genetiky (93) |