|
|
Prenatální diagnostika cystické fibrózy a chorob s expanzemi trinukleotidů - výuka na středních školách
Nováková, Stanislava ; Ehler, Edvard (vedoucí práce) ; Pavlasová, Lenka (oponent)
Cystická fibróza a choroby s expanzemi trinukleotidů jsou závažná dědičná onemocnění, která slouží v mé diplomové práci jako modelové příklady vhodné pro výuku zajímavých témat lidské genetiky na středních školách. Pomocí vhodné metody prenatálně-genetického vyšetření je možné v rizikových rodinách určit diagnózu vyvíjejícího se plodu a stanovit odpovídající prognózu v dalším prenatálním a postnatálním vývoji. Praktická část práce je věnována obsahové analýze učebnic biologie pro střední školy a přípravě modelové hodiny genetiky na středních školách. Cílem obsahové analýzy učebnic biologie pro střední školy bylo vyhodnocení jednotlivých učebnic dle několika předem zvolených kritérií. Cílem prezentace navržené modelové hodiny bylo na základě odpovědí získaných z dotazníků zjistit, zda se žáci vyšších ročníků středních škol zajímají o předmět genetiky, dále zjistit, co žáky na hodinách nejvíce zaujalo, případně čemu nerozuměli a co se jim zdálo být obtížné. Hodina byla vedena formou odborného semináře, metodou výuky byla přednáška. Z vybraných učebnic biologie pro střední školy byla na základě průměrného hodnocení nejlépe vyhodnocena učebnice Biologie pro gymnázia od autorů Jelínka, J. a Zicháčka, V., která je na zkoumaných školách využívána jako studijní materiál. Z dotazovaných žáků středních škol...
|
|
|
Kompletizace genomu Burkholderia cenocepacia ST32 a identifikace prognostického markeru infekce způsobené kmenem ST32 u pacientů s cystickou fibrózou
Vavrová, Jolana ; Dřevínek, Pavel (vedoucí práce) ; Wiedermannová, Jana (oponent)
Bakteriální druh Burkholderia cenocepacia patří mezi závažné původce infekcí dýchacích cest u pacientů s cystickou fibrózou. Problematický je výskyt kmenů šířících se mezi pacienty epidemicky. V ČR byla v minulosti zaznamenána epidemie způsobená kmenem ST32. V této práci byla ve spolupráci s bioinformatickým týmem stanovena kompletní genomová sekvence referenčního izolátu 1232 epidemického kmene ST32 B. cenocepacia pomocí sekvenačních metod nové generace a řešením problematických úseků kombinací Sangerova sekvenování, bioinformatických postupů a manuálního skládání sekvenčních čtení lokalizovaných v těchto úsecích. Finální verze genomu byla anotována pomocí PGAAP a v současnosti je finalizována. Cílem této diplomové práce bylo také najít prognostický marker infekce kmenem ST32 u pacientů s cystickou fibrózou. Na základě výsledků transkriptomového experimentu s tímto kmenem bylo v této práci vybráno 19 genů, jejichž genová exprese se zdála být v souvislosti s rozvinutím cepacia syndromu - závažného, většinou fatálního stavu infekce. Pomocí PCR v reálném čase byla srovnávána jejich exprese mezi izoláty z doby cepacia syndromu a měsíc před cepacia syndromem od 4 pacientů. Byla ověřena i možnost analyzovat změny v expresi těchto genů přímo v klinickém materiálu. Identifikovali jsme geny pro sekreční systém typu...
|
|
|
Slepičí protilátky jako prostředek pasivní imunizaci nemocných cystickou fibrosou
Hadrabová, Jana ; Hodek, Petr (vedoucí práce) ; Kubíčková, Božena (oponent)
Cystická fibróza (CF) je vrozené onemocnění zejména dýchacích cest a zažívacího ústrojí. Přenos je autozomálně recesivní, nemoc spočívá v mutaci genu pro protein CFTR, který funguje jako iontový kanál pro přenos chloridových aniontů. Důsledkem omezení jeho funkce je výrazné zahuštění plicního sekretu, ve kterém se pak snadněji zachytávají a rostou specifické mikroorganismy, zejména Pseudomonas aeruginosa. Infekce je nejprve léčena pomocí antibiotik, bakterie se však vůči nim brzy stávají rezistentní. Vzniká chronický zánět, jehož následkem je jizvení plicní tkáně (fibrosa). Zejména kvůli rezistencím vůči antibiotikům jsou hledány nové metody léčby pacientů s CF. Takovou metodou by mohla být pasivní imunizace pomocí slepičích protilátek IgY, které jsou specifické proti virulenčním faktorům Pseudomonas aeruginosa a jsou schopny je neutralizovat. Tyto protilátky je možné z roztoku pomocí nebulizátoru přeměnit na aerosol, který by mohli pacienti vdechovat. Protože by, vzhledem ke své struktuře, samy mohly potenciálně způsobovat zánětlivé reakce, bylo potřeba vyzkoušet inhalaci zdravými jedinci. K tomu bylo využito potkanů Wistar, jako experimentálního modelu. Nejprve byly protilátky izolovány, pak byl enzymaticky odštěpen fragment Fab a byla provedena purifikace. V inhalačním experimentu byl použit...
|
|
|
Vývoj diagnostiky a léčby cystické fibrózy v kontextu fyzioterapie
Jindrová, Barbora ; Smolíková, Libuše (vedoucí práce) ; Babková, Lenka (oponent)
Bakalářská práce na téma Vývoj diagnostiky a léčby cystické fibrózy v kontextu fyzioterapie je zpracována formou rešerše s kazuistikou. Práce je rozdělena do tří částí. První část obsahuje základní informace o cystické fibróze, její etiologii, patologii, přidružených onemocněních, klinickém obrazu a léčbě. Hlavní část práce je soustředěna na vývoj diagnostiky cystické fibrózy a změny její léčby se zaměřením na pokroky fyzioterapeutických metod. Práce se zabývat také tím, jak se v důsledku těchto změn měnila prognóza a zdravotní stav pacientů s cystickou fibrózou. Dále práce obsahuje popis technik využívaných ve fyzioterapii cystické fibrózy. Poslední část práce obsahuje kazuistiku dvou pacientů s cystickou fibrózou.
|
|
|
Molekulárně genetická diagnostika cystické fibrózy
Matějčková, Iva ; Krkavcová, Miroslava (vedoucí práce) ; Kotlas, Jaroslav (oponent)
Cystická fibróza (CF) je velmi rozšířené a závažné onemocnění. Jde o autozomálně recesivní chorobu s incidencí 1 : 2500 - 1 : 4500. Při tomto onemocnění dochází k mutacím CFTR genu, které jsou zodpovědné za poruchu chloridových kanálů. Jde o multiorgánové postižení, které postihuje především respirační a gastrointestinální systém, dále ale i hepatobiliární systém, reprodukční systém a potní žlázy. Cystickou fibrózu lze diagnostikovat pomocí potního testu, molekulárně genetické diagnostiky, výjimečně také pomocí transepiteliálních rozdílů potenciálů, tato metoda ale není dosud v České republice prováděna. Od roku 2009 se v České republice provádí novorozenecký screening CF, který napomáhá k rychlejší diagnóze a následně k rychlému zavedení vhodné terapie. Zavedení včasné terapie totiž výrazně zlepšuje prognózu pacienta. V současné době se pacienti s CF dožívají v průměru třiceti až čtyřiceti let. Pro diagnostické vyšetření CFTR genu se využívá postnatální, prenatální nebo preimplantační materiál. Z těchto vzorků se izoluje DNA, která se dále vyšetřuje pomocí genetických metod, které jsou založeny na principu PCR, reverzní hybridizace, restrikční analýzy, sekvenování DNA nebo MLPA. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
|
|
|
Detekce faktorů virulence a genů rezistence bakteriálních patogenů u pacientů s cystickou fibrózou
Jandová, Oldřiška ; Melter, Oto (vedoucí práce) ; Nyč, Otakar (oponent)
Cystická fibróza je autozomálně recesivní genetické onemocnění, které je způsobeno mutacemi v genu CFTR (Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator). Tento gen kóduje stejnojmenný protein, který pokud je narušena jeho funkce, je odpovědný za patogenezi tohoto onemocnění. Cystická fibróza je charakteristická častými respiračními infekcemi, které vedou k destrukci plicní tkáně. Tyto infekce se vyznačují přítomností typických bakteriálních patogenů např. S. aureus, P. aeruginosa a dalších. Právě S. aureus patří mezi typické oportunní patogeny, které u pacientů s cystickou fibrózou způsobují vážné komplikace. Kmeny S. aureus se vyznačují produkcí mnoha faktorů patogenity a vlivem důrazné léčby antibiotiky také rezistencí k používaným antibiotikům. Jednou z možností, jak mohou bakterie snížit svou citlivost k určitému antibiotiku je tvorba fenotypových variant SCV, které se vyskytují u skupiny pacientů, kteří jsou intenzivně léčeni antibiotiky. Pacienti s cystickou fibrózou touto skupinou bezesporu jsou. Cílem bakalářské práce bylo studium izolátů S. aureus od tří pacientů s cystickou fibrózou, kteří jsou dlouhodobě infikováni tímto patogenem. U těchto izolátů určit zda se mění jejich vlastnosti či rezistence v průběhu chronické infekce. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
|
|
| |
|
|
Význam stanovení markerů oxidačního stresu v kondenzátu vydechovaného vzduchu pro hodnocení progrese plicního onemocnění u pacientů s cystickou fibrózou
Fila, Libor ; Kolář, Pavel (vedoucí práce) ; Macek, Milan (oponent) ; Vondra, Karel (oponent)
Cílem práce bylo zhodnocení vztahu markerů oxidačního stresu (OS) v kondenzátu vydechovaného vzduchu (KVV) u dospělých nemocných s cystickou fibrozou (CF) k tíži plicního onemocnění, stavu výživy a systémovým antioxidantům a markerům zánětu, dále ke krátkodobému a střednědobému vývoji plicních funkcí a stavu výživy a konečně k posouzení odpovědi na léčbu inhalačními kortikosteroidy (IKS). Metodika: Nemocní s CF byli vyšetřeni ve stabilizované fázi onemocnění během rutinných ambulantních kontrol. KVV byl odebrán u pacientů s CF a členů kontrolního souboru pomocí přístroje ECoScreen (Jaeger). Z markerů OS v KVV byly vyšetřeny nitrity a nitráty pomocí kapalinové chromatografie a 8 -isoprostan metodou kompetitivní enzymoimunoanalýzy. U nemocných s CF byly zaznamenána demografická data včetně dominantního patogenu kolonizace dýchacích cest a léčby IKS. Dále bylo provedeno vyšetření plicních funkcí, skiagramu hrudníku, stavu vyživy a systémových antioxidantů a markerů zánětu pomocí standardních metod. Hodnoty markerů OS v KVV u nemocných s CF byly srovnány s kontrolním souborem a korelovány s klinickými parametry. Ke stanovení vztahu markerů OS v KVV k vývoji plicních funkcí a stavu výživy byli pacienti s CF vyšetřeni s odstupem jednoho, tří a pěti let. Rozdílové hodnoty usilo vně vydechnutého objemu za první...
|
|
|
Zavedení diagnostiky nových bakteriálních patogenů Inquilinus a Pandoraea izolovaných od pacientů s cystickou fibrózou a stanovení jejich citlivosti k antibiotikům
Šulcová, Romana ; Melter, Oto (vedoucí práce) ; Nyč, Otakar (oponent)
Cystická fibróza patří mezi nejčastěji se vyskytující autozomálně recesivně dědičné onemocnění. V dnešní době mají lidé s tímto onemocněním, díky včasné diagnostice a léčbě dalších přidružených příznaků, lepší prognózu než před několika lety. CF je onemocnění, které je podmíněno mutací genu CFTR (Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator) na chromozomu 7. Defektem proteinu CFTR dochází k poruše resorpce a sekrece elektrolytů v chloridovém kanálu a tím k tvorbě viskózního hlenu v plicích, který je hlavní příčinou chronických bakteriálních infekcí dolních dýchacích cest. Mezi nejčastějšími patogeny, které způsobují závažné infekce dýchacích cest u pacientů s CF patří: Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Burkholderia cepacia komplex. U pacientů s CF se dnes prokazují v dýchacích cestách nové bakteriální druhy, jejichž biologické vlastnosti nejsou dosud známé a jejich role v etiopatogenezi onemocnění a epidemiologii nejsou přesně známé. K jejich detekci se v dnešní době používají specifické metody amplifikace a nebo sekvenace genu pro 16S rRNA. Nově se objevující patogeny patří například do rodu Pandoraea a Inguilinus, které řadíme do skupiny gramnegativních nefermentujících tyčinek, a proto jsou často zaměňovány za jiné jim fenotypově podobné bakteriální druhy, jejichž výskyt je u CF...
|
|
|
Zavedení diagnostiky nových bakteriálních patogenů Ralstonia a Achromobacter izolovaných od pacientů s cystickou fibrózou a stanovení jejich citlivosti k antibiotikům
Michálková, Alice ; Melter, Oto (vedoucí práce) ; Bébrová, Eliška (oponent)
Cystická fibróza (mucoviscidosis) je nevyléčitelné geneticky podmíněné onemocnění, které je způsobeno mutacemi v genu CFTR (Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator Gene). Mezi nejčastější příčiny zvýšené mortality a morbidity pacientů patří bakteriální infekce dýchacích cest, které mohou být způsobeny i méně častými patogeny. Bakteriální druhy rodů Ralstonia a Achromobacter nejsou pro zdravého člověka patogenní, ale patří mezi patogeny prokázané ve sputu pacientů s CF. Avšak kvůli jejich fenotypové podobnosti s ostatními bakteriálními patogeny vyskytujícími se u pacientů s CF unikají pozornosti mikrobiologa. Cílem práce bylo navržení metod pro identifikaci rodu Ralstonia, stanovení kvantitativní a kvalitativní citlivosti k antibiotikům a zpracování literární rešerše zaměřené na problematiku rodu Achromobacter. Kmeny Ralstonia spp. byly identifikovány pomocí metod fenotypových a genotypových, byla stanovena jejich citlivost k antibiotikům a navržena originální metoda genotypové identifikace R. respiraculi.
|
host ::
RSS.