2026-03-29 00:02 |
Hotspots and drivers of alien plant species upward spread to the arctic-alpine tundra in the Krkonoše/Karkonosze National Parks (Central Europe)
Vítková, Michaela ; Sádlo, Jiří ; Čuda, Jan ; Kupková, L. ; Šrollerů, A. ; Lysák, J. ; Červená, L. ; Hrázský, Z. ; Potůčková, M. ; Hejda, Martin ; Pipek, Pavel ; Pyšek, Petr
The study focuses on the Central European arctic-alpine tundra threatened by alien invasive and native expansive plant species. It identifies hotspots and drivers of their spread from foothills to the tundra.
Detailed record
|
2026-03-22 00:01 |
Mapping invasive Veratrum album from UAV imagery: neural network training for deep learning novices with no intention of scripting, using a consumer-grade laptop.
Šrollerů, A. ; Potůčková, M. ; Červená, L. ; Kupková, L. ; Lysák, J. ; Hrázský, Z. ; Vítková, Michaela ; Pergl, Jan ; Čuda, Jan ; Kolombová, Natálie ; Kušková, Klára ; Kutlvašr, Josef ; Perglová, Irena ; Sádlo, Jiří ; Vítek, Vojtěch ; Pyšek, Petr
The study explores the use of deep learning in remote sensing through ArcGIS Pro for detecting the species Veratrum album from high-resolution UAV imagery. Training data were generated directly from imagery using segmentation and vectorization, with the process streamlined by AutoDL tools. The results achieved high detection accuracy (F1 score 0.90), demonstrating that effective deep learning applications can be implemented with minimal expertise and standard hardware.
Detailed record
|
2026-03-22 00:01 |
Monitoring the spread of invasive and native plant species by advanced airborne methods: implications for management
Čuda, Jan ; Kupková, L. ; Pergl, Jan ; Červená, L. ; Černá, M. ; Hlaváčová, E. ; Hrázský, Z. ; Kolombová, N. ; Kysela, L. ; Kušková, Klára ; Kutlvašr, Josef ; Lysák, J. ; Perglová, Irena ; Polák, M. ; Potůčková, M. ; Sádlo, Jiří ; Svobodová, P. ; Vítek, Vojtěch ; Pyšek, Petr ; Šrollerů, A. ; Vítková, Michaela
Efficient management of alien plants in protected areas requires precise and up-to-date data on their distribution, which is costly and time-consuming to collect. The early detection of newly arriving alien species is crucial, but challenging in rugged, mountainous terrain that is difficult to access. Furthermore, species management should be prioritised according to their impact on native communities. Therefore, we have developed automated technology to monitor the spread of selected invasive and native plant species in areas under different management regimes, and to assess their\nimpact on co-occurring plants.
Detailed record
|
2026-03-22 00:01 |
Advances in Algae Exploitation
Vítová, Milada
The proceedings of the “Advances in Algae Exploitation” were created for the international seminar “Advances in Algae Exploitation” on November 11, 2025 in Třeboň. The speakers presented current results and future prospects in the field of using micro- and macroalgae for environmental and biotechnological purposes.\nThe seminar took place within the framework of the project SS07020063 AlgaRePo: Revitalization of phytotoxic soils using cyanobacteria and algae, which is co-financed with state support from the Technology Agency of the Czech Republic within the Environment for Life Programme. This project was financed within the framework of the National Recovery Plan from the European Recovery and Resilience Instrument.
Detailed record
|
2026-03-14 00:01 |
Monitoring rozšíření a managementu invazních a expanzních rostlin s využitím pokročilých metod DPZ - Průběžná zpráva 2025
Kupková, L. ; Potůčková, M. ; Červená, L. ; Lysák, J. ; Hrázský, Z. ; Šrollerů, A. ; Polák, M. ; Novotná, B. ; Vítková, Michaela ; Čuda, Jan ; Sádlo, Jiří ; Černá, Marie ; Hlaváčová, Eliška ; Karabeleš, K. ; Kušková, Klára ; Kutlvašr, Josef ; Kysela, Lukáš ; Pergl, Jan ; Perglová, Irena ; Rajznoverová, Ivana ; Sixtová, Zuzana ; Vítek, Vojtěch
Hlavním výsledkem roku 2025 je propojení detailního botanického mapování s pokročilou detekcí invazních druhů z UAV snímků pomocí metod strojového učení. Bylo optimalizováno terénní mapování (tři klíčové fenologické termíny) a současně vytvořeno 15 specializovaných map, 98 tematických vrstev a 114 fytocenologických snímků. Botanická část přinesla nové poznatky o vysokém regeneračním potenciálu lupiny mnoholisté a o zásadním významu správného načasování managementu. Ověřena byla vysoká přesnost detekce z RGB dat a funkční systém terénní validace bezprostředně po snímkování.
Detailed record
|
2026-02-22 00:02 |
Příčiny úpadku a systém účinné obnovy prioritních typů stanovišť subalpínských trávníků
Hédl, Radim ; Bobek, Přemysl ; Dudová, Lydie ; Fabšičová, Martina ; Szabó, Péter ; Houška, J. ; Červenka, J. ; Kachalova, O. ; Skokanová, H. ; Vymazalová, M. ; Mrázková, M. ; Látal, O. ; Bilošová, H.
Výsledky ukazují, že za odumíráním nestojí jeden konkrétní faktor, ale komplexní synergie několika vlivů. Z výše uvedených hypotéz se jako relevantní ukázaly být první dvě, zatímco pro další dvě hypotézy se nepodařilo najít důkazy a jsou zřejmě jen málo pravděpodobné, i když nikoli zcela vyloučené. Hlavním, chronicky působícím faktorem je sukcese po ukončení tradičního hospodaření, které udržovalo tundru otevřenou a druhově relativně pestrou. S ústupem pastvy a dalších činností došlo k zarůstání konkurenčně silnějšími travami (třtina chloupkatá) a především keříky, zejména borůvkou, pozvolna se také posouvá horní hranice lesa. Se sukcesí neoddělitelně souvisí atmosférické depozice reaktivního dusíku a síry, jež dlouhodobě ovlivňují půdní chemismus a podporují růst konkurenčně silných druhů. Druhým hlavním faktorem je klimatická změna. Především suché a horké jarní období, které může být bezprostředním spouštěčem plošného odumírání alpínských trávníků. Ověření předběžných zjištění si vyžádá důkladnější analýzu. Můžeme shrnout, že na základě aktuálních znalostí je pravděpodobnou příčinou zkoumaného jevu kombinace ekologické sukcese (opuštění pastvy, atmosférické depozice) a klimatických extrémů (vysoké teploty a sucho).
Detailed record
|
2026-02-22 00:02 |
Emergent eco-hydrological (loss of) function of vegetation in a drying climate
Bouda, Martin ; Liu, Qi ; Kučera, J. ; Weger, J. ; Doležal, Jiří ; Treml, V. ; Šípek, Václav
In early June 2021, we instrumented a beech (Fagus sylvatica) stand in Průhonice to measure sapflow and growth increment on eight trees as well as soil water content and potential at eight depths down to two metres in four profiles status. We registered an unexpected phenomenon immeadiately following the start of observations: the combined transpiration rate of the stand increased over time even as potential evapotranspiration (PET) declined and soil moisture levels remained high through the summer of 2021. We confirmed that transpiration rates in 2021 were only weakly explained by PET (generalised additive model: R2=0,10, p<0,05) and not correlated to soil water potential (linear fit: R2=0,01, p>0,05). This contrasts with the year 2022, when PET (R2=0,42, p<0,001) and soil water potential (R2=0,39, p<0,001) together explained most of the variation in stand transpiraiton, as would be expected. Our results suggest stand transpiration was limited by xylem insufficiency following the severe multi-year drought 2018-2019 and took until 2021 to fully recover. If future climate conditions frequently expose forested catchments to significant loss of xylem function, placing forests in drought-recovery for extended periods of time, this may reduce ET and increase runoff from forested catchments in wet years following drought compared to our previous expectations.
Detailed record
|
2026-02-22 00:02 |
Vegetační dynamika (sub)alpínských krátkostébelných trávníků a návrh opatření k jejich obnově a dlouhodobému udržování v příznivém stavu
Fabšičová, Martina ; Bobek, Přemysl ; Dudová, Lydie ; Hédl, Radim ; Szabó, Péter ; Houška, J. ; Kachalova, O. ; Skokanová, H. ; Vymazalová, M. ; Bilošová, H. ; Látal, O. ; Mrázková, M.
Publikace prezentuje základní informace o biotopech (sub)alpínských krátkostébelných trávníků a jsou v ní shrnuty poznatky získané na základě komplexního studia historického vývoje využívání subalpínského bezlesí Hrubého Jeseníku, recentní dynamiky vegetace subalpínských krátkostébelných trávníků a víceletého hodnocení managementových experimentů založených na třech lokalitách v horských polohách Hrubého Jeseníku. Metodika poskytuje detailní a ucelený pohled na dynamiku a regeneraci subalpínských krátkostébelných trávníků po dosud výjimečných událostech jejich odumírání a popisuje implementaci některých opatření k obnově a dlouhodobému udržování těchto evropsky významných stanovišť v příznivém stavu. Metodika také umožňuje formulovat strategii péče o příslušná přírodní stanoviště. Metodiku bude státní ochrana přírody bezprostředně aplikovat při obnově struktury a druhového složení recentně odumírajících subalpínských trávníků v NPR Praděd, NPR Šerák-Keprník a PR Břidličná. Metodika také umožní aplikovat dosažená řešení obecněji, v analogických typech situací a ekosystémů.
Detailed record
|
2025-12-16 16:40 |
Xenobiotics impact on cyanobacterial biomass viability and further usability as bioaccumulators of rare earth elements
Samson, S. O. ; Serafin-Lewańczuk, M. ; Żymańczyk-Duda, E. ; Čížková, Mária ; Vítová, Milada
The growing environmental and industrial demand for rare earth elements (REEs) necessitates innovative and effective recovery methods, particularly the use of biological systems. In this study, we systematically evaluate the dual role of cyanobacterial cells in both biotransformation of xenobiotics and bioaccumulation of REEs, specifically gadolinium (Gd) and europium (Eu). Four cyanobacterial strains: Limnospira indica, Limnospira maxima, Synechococcus bigranulatus and Leptolyngbya foveolarum were employed for this purpose. Two xenobiotics: epoxymethyl dimethyl phosphonate and 1-phenylethyl acetate were selected to induce bioconversion in these strains. Ecotoxicity assays were performed to assess the impact of Gd and Eu on both pre- and post-bioconversion biomasses. Sub-lethal concentrations of REEs were determined using 96-well plate growth inhibition assays. After ecotoxicity tests, cyanobacterial biomasses were exposed to selected concentrations of Gd and Eu for 3 days. The experiments were conducted under controlled conditions in photobioreactors, monitored biomass growth (OD720) and dry weight over 72 hours. Inductively coupled plasma mass spectrometry analysis was used to quantify the accumulated REEs. The ecotoxicity test results showed strain-specific variations in REE tolerance, with all strains demonstrating higher resilience. Dry weight analysis showed increased biomass in the REE-treated cultures, suggesting that REEs can enhance cyanobacteria growth and subsequently increase resource recovery. Microscopic analyses confirmed no significant morphological changes between pre- and post-bioconversion biomasses. These findings highlight the potential of cyanobacteria to not only thrive under xenobiotic exposure but also to sequester REEs, benefiting applications such as the synthesis of high-value bioproducts (e.g., dimethyl (1E)-3-hydroxyprop-1-enylphosphonate and enantiomerically pure phenyl ethanol), resource recovery, and biofertilizer production.
Detailed record
|
2025-12-16 16:40 |
Metodika práce s časovými řadami klimatických dat a s mikroklimatickými mapami
Brůna, Josef ; Klinerová, Tereza ; Kopecký, Martin ; Macek, Martin ; Man, Matěj ; Růžičková, Anna ; Wild, Jan
Cílem této metodiky je usnadnit využití mikroklimatických dat v praxi ochrany přírody a zajistit reprodukovatelnost výsledků, a to za pomoci praktických ukázek a ověřených postupů. Cílovou skupinou uživatelů jsou především pracovníci správ NP a CHKO, ale též pracovníci Agentury ochrany přírody a krajiny. Metodika popisuje postupy pro získání a zpracování mikroklimatických měření z autonomních dataloggerů (instalace, správa dat, kontrola kvality dat, zpracování a vizualizace naměřených hodnot, základní analýzy dat) kompletně v open-source programovém prostředí R. Věříme, že absence vazeb na komerční software usnadní její využití. Výhodou zpracování dat v prostředí R je rovněž reprodukovatelnost postupů a výsledků, protože veškeré operace s daty zůstávají zdokumentovány ve zdrojovém kódu.
Detailed record
|
|
|
|