|
Solvent Relaxation in Biomembranes: Application in the Development of Non-Viral Gene Transfection Carriers
Olžyňska, Agnieszka ; Hof, Martin (vedoucí práce) ; Obšil, Tomáš (oponent) ; Michl, Martin (oponent)
Re|axace rozpouštědla V biomembránách: použitípro studium nosičůurčenýchpro non.viriální genovou transfekci ABSTRAKT Pro charakterizaci vlastností lipidové membrány byla v této práci použita fluorescenční metoda ..relaxace rozpouštědla,,, která umožňuje získat poznatky o stupni hydratace a pohyblivosti hydratovaných molekul lipidů.Pomocí tÍirizných fluorescenčníchderivátů naftalenu (Patmanu Laurdanu a Prodanu) byly zkoumány rtnné částioblasti polárních lipidoqých hlav ve fosfolipidové membráně. Nejprve byla přesně určena pozice výše zmíněných sond Patmanu a Laurdanu metodou paralaxového zhášeníve dvojvrstvě složenéz DoPC. Vedle toho byla lokalizace výše zmíněných značekmapována v závislosti na obsahu kladně nabitého lipidu DoTAPu metodou arylamidového zhášenía byla zjištěna změna pozice v případě nabitésondy Patmanu. Dvojvrstvy tvořené lipidy s fosfatidylcholinovými hlavami obsahujícíruznémastné kyseliny (DOPC, POPC' OPPC and PCA6) byly také sfudovány a výsledky ukáza|y rozdi|y jak v hydrataci tak v mobilitě fosfolipidoqých hlav v závislosti na typu alifatických řetězců. Závěrečným projektem byla charakterizace vlastností liposomů, kterénacházejí využitív cílenémtransporfir genů do buněk in vitro a in vivo. Tyto liposomy jsou tvořeny neutrálním lipidem DoPC a ruzným podílem kladně nabitého DoTAPu. Měření...
|
|
Strategie spermií hlodavců
Šandera, Martin ; Stopka, Pavel (vedoucí práce) ; Macholán, Miloš (oponent) ; Sedláček, František (oponent)
Souhrn Různé druhy hlodavců se liší způsobem života, párovacími systémy a liší se i v morfologii spermií. U hlodavců se vyskytují různé úrovně kompetice spermií. Obecně u živočichů se má za to, že díky kompetici spermií dochází k prodlužování bičíků spermií. Jak přesně působí kompetice spermií u hlodavců? Druhově specifický sexuální výběr může optimalizovat morfologii spermií. Fyziologii, morfologii a kompetici spermií můžou ovlivňovat i environmentální faktory. Disertační práce byla zaměřena na reprodukční strategie hlodavců na úrovni spermií a to na základě morfologických a behaviorálních vlastností spermií. Práce obsahuje tři publikace (včetně jednoho odeslaného rukopisu) a v příloze jeden článek, který okrajově souvisí s tématem práce. Morfologie spermií u hlodavců hraje důležitou roli v kompetici spermií. Delší bičíky a apikální háčky jsou u druhů s relativně většími varlaty a vyšším procentem násobného otcovství (multiple paternity), tedy u druhů s vyšší mírou promiskuity a vyšší mírou kompetice spermií. Jedním z cílů bylo zjistit vztahy délky apikálních háčků a bičíků spermií a variability v těchto znacích s relativní hmotností varlat. Výsledky této práce ukázaly, že průkazně delší apikální háčky byly u druhů s vyšší relativní hmotností varlat (tzn. vyšší mírou kompetice spermií), což poukázalo na...
|
|
Fotoperiodická modulace centrálních cirkadiánních hodin v suprachiasmatických jádrech a periferních hodin v játrech
Parkanová, Daniela ; Doležel, David (oponent)
Většina fyziologických procesů se v organismech opakuje v denních intervalech stále znovu a znovu tak, že vykazují cirkadiánní rytmy. Tyto rytmy jsou u savců řízeny centrálními hodinami uloženými v suprachiasmatických jádrech (SCN) hypotalamu. Signalizace z SCN ovlivňuje periferní hodiny, které se nacházejí ve většině tkání těla. V gastrointestinálním systému je běh periferních hodin úzce propojen s metabolismem. Mechanismus tvorby cirkadiánních oscilací je založen na transkripčně-translačních zpětnovazebných smyčkách, díky kterým dochází k rytmické expresi hodinových genů. Cirkadiánní hodiny jsou každodenně seřizovány s vnějším prostředím. Pro synchronizaci centrálních hodin v SCN je důležité především střídání světla a tmy. Perifení hodiny jsou seřizovány jak signály z SCN, tak dalšími faktory, například příjmem potravy. Délka světlé části dne, neboli fotoperioda, se v našich zeměpisných šířkách v průběhu roku mění a cirkadiánní hodiny se tak musí těmto změnám neustále přizpůsobovat. Mechanismus, jakým se cikadiánní systém přizpůsobuje změně fotoperiody, není dosud přesně znám. Cílem této práce bylo objasnit vliv změny fotoperiody na centrální hodiny v SCN a na periferní hodiny v játrech. Specifickým cílem bylo zjistit dynamiku s jakou se tyto hodiny přizpůsobují ke změně z dlouhé fotoperiody s...
|
|
Stability biomarkerů využívaných v populačních studiích
Vrzáková, Radana ; Kučera, Radek (vedoucí práce) ; Racek, Jaroslav (oponent) ; Lochman, Jan (oponent)
Slovo biomarker pochází z angličtiny a přesný překlad znamená biologická značka nebo také biologický ukazatel. National Institutes of Health definuje "biomarker" jako vlastnost, která je objektivně měřena a hodnocena jako indikátor normálních biologických procesů, také procesů patogenních nebo indikátor farmaceutické odpovědi na terapeutickou intervenci. Všechny biologické vzorky podléhají postupné degradaci. Je proto potřebné znát podmínky, za kterých je molekula biomarkeru stabilní, což je důležité pro potřeby správné interpretace laboratorních výsledků. Stabilita jednotlivých biomarkerů je velmi variabilní a je charakterizovaná jako doba, za kterou se počáteční obsah analytu ve vzorku nemění při zachování přesně definovaných podmínek. V této práci jsou podrobně popsány preanalytické vlivy na výsledek laboratorního vyšetření. Práce také shrnuje dosavadní obecné poznatky o stabilitě biomarkerů, je zde zmíněna důležitá role biobank a vysvětlena potřeba testování stability biomarkerů podle doporučení světové špičky v biobankingu - mezinárodní společnosti ISBER. Praktická část práce je zaměřena na studie stability biomarkerů běžně používaných k diagnostice vzácných nádorů ovárií, k diagnostice syndromu polycystických ovárií, také k odhadu ovariální odpovědi na hormonální stimulaci během in vitro...
|
|
Nakladatelství ODEON a jeho proměny mezi lety 1948-1969
Dvořáková, Aneta ; Šmejkalová, Jiřina (vedoucí práce) ; Šípek, Richard (oponent)
Novým tiskovým zákonem z 24. března 1949 byly prakticky z nakladatelské sféry vyloučeny soukromé podniky a byla zakládána kolektivní nakladatelství s přesně definovanou oblastí vydávání. Bakalářská práce se zabývá fungováním a proměnami jednoho z takových nakladatelství, a to Státního nakladatelství krásné literatury, hudby a umění v poválečných letech 1948-1969. Cílem práce je přiblížit a osvětlit postavení nakladatelství na trhu ve sledovaném období. Zároveň se pokouší odpovědět na otázku, kdo toto postavení mohl ovlivňovat. Část textu je vyhrazena i organizačním změnám, kterými nakladatelství prošlo, například změnou názvu na více známý Odeon. Práce je zpracována pomocí analýzy primárních a sekundárních zdrojů. Klíčová slova Nakladatelství, státní moc, SNKLHU, Odeon, Československo
|
|
"And thus the heart will break, yet brokenly live on": The Layers of Intimacy in Childe Harold's Pilgrimage
Balažíková, Alice ; Horová, Miroslava (vedoucí práce) ; Beran, Zdeněk (oponent)
Lord Byron je bezpochyby jedním z nejvýznamnějších představitelů britského i evropského romantismu. Proslavil se zejména svým okázalým životní stylem, vzpurnými hrdiny a vášnivou poezií. Jeho díla, která se vyznačují pozoruhodnou citovou intenzitou a intelektuální hloubkou, přesně vystihují ducha romantické éry. Lord Byron ovšem neovlivnil pouze literaturu, ale také svět výtvarného umění, hudbu, kulturu či politická hnutí. Báseň Childe Haroldova pouť, která byla publikována mezi lety 1812 až 1818, zaujímá výjimečné místo mezi Byronovými díly. Právě tato báseň naprosto změnila životní dráhu básníka a katapultovala ho k okamžité slávě. Byron započal kompozici tohoto díla během své kavalírské cesty, která probíhala v letech 1809 až 1811. Ačkoliv kavalírská cesta byla již léta nedílnou součástí vzdělávání mladých aristokratů, Byronova volba vydat se na cestu v době, kdy v Evropě zuřily napoleonské války způsobila, že jeho cesta byla v mnoha ohledech skutečně výjimečná. Můžeme identifikovat zejména dva klíčové prvky, které nejvíce přispěly k jedinečnosti této básně: vylíčená místa a intimita básnického hlasu. Domnívám se, že zejména druhý z těchto faktorů nejvýznamněji přispěl k obrovskému úspěchu básně. Tato bakalářské práce se tedy bude soustředit na rozmanité projevy intimity prezentované ve čtyřech...
|
|
Loop Analysis for LLVM IR Translation Validation Framework
Kubík, Jakub ; Kofroň, Jan (vedoucí práce) ; Parízek, Pavel (oponent)
Chyby v překladačích programovacích jazyků mohou mít vážné následky. Kromě tradičních metod, jako je testování, je jedním ze způsobů zajištění správnosti překladačů translation validation, technika zajišťující sémantic- kou správnost optimalizací v překladačích, která se prosadila teprve v po- sledních pár letech. Alive2 je open-source translation validation framework pro LLVM, který je v současnosti široce používán vývojáři LLVM. Pro za- jištění použitelnosti statických analyzátorů je potřeba minimalizovat četnost falešných pozitiv. Alive2 je navržen tak, aby neměl žádná falešná pozitiva a byl v tomto ohledu velmi úspěšný až na některé programy se smyčkami. Na- ším cílem v této práci je analyzovat algoritmy Alive2 pracující se smyčkami se záměrem identifikace příčiny falešných pozitiv. Naše práce byla motivo- vána komunikací s autory Alive2, kteří považovali problematiku falešných poplachů ve smyčkách jako jeden z náročnějších a závažnějších problémů v Alive2. Podařilo se nám přesně určit podstatu problému falešných poplachů a dokonce i opravit tento problém. Naše řešení je aktuálně součástí Alive2. Kromě toho jsme v Alive2 identifikovali další potenciální problémy, o kterých v této práci také pojednáváme.
|
|
Dense zeros
Hanousek, Jan ; Pešta, Michal (vedoucí práce) ; Cipra, Tomáš (oponent)
Tento výzkum se zaměřuje na speciální typ dat časových řad, kde je významný podíl hodnot rovných nule. Cílem je vytvořit statistický model, který přesně zachycuje chování těchto dat. Prostřednictvím zkoumání stávajících teorií o GARCH a MEM modelech jsou navrženy nové modely spolu s odvozením jejich důležitých teoretických vlastností. Pro posouzení jejich účinnosti jsou tyto modely testovány na reálných datech. Toto hodnocení odhaluje, že každý model má své vlastní silné a slabé stránky. Celkové výsledky jsou však nadějné, prokazují platnost modelů a jejich využitelnost v praxi a otevírají dveře pro další výzkum v této oblasti. 1
|
|
Hodnocení farmakologických vlastností nových potenciálních léčiv Alzheimerovy choroby
Čechová, Pavlína ; Šorf, Aleš (vedoucí práce) ; Urbánková Rathouská, Jana (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra sociální a klinické farmacie Studentka: Pavlína Čechová Vedoucí práce: PharmDr. Aleš Šorf, Ph.D. Konzultant práce: mjr. PharmDr. Vendula Hepnarová, Ph.D. Název diplomové práce: Hodnocení farmakologických vlastností nových potenciálních léčiv Alzheimerovy choroby Alzheimerova choroba je neurodegenerativní onemocnění s progresivním a ireverzibilním průběhem. Příčina této nemoci není doposud přesně známa. V současnosti jsou dostupná čtyři léčiva, která byla schválena Státním ústavem pro kontrolu léčiv. Tři z nich působí jako inhibitory cholinesteras (donepezil, rivastigmin, galantamin) a čtvrté jako antagonista N-methyl-D- aspartátových (NMDA) receptorů (memantin). Bohužel tato léčiva neovlivňují průběh nemoci a poskytují pouze dočasnou symptomatickou úlevu. Důležitou oblastí současného výzkumu jsou MTDLs (Multi-Target Directed Ligands), které působí na více cílových struktur souvisejících s patofyziologií nemoci. Tyto látky představují slibnou terapeutickou strategii. Cílem této práce bylo změřit schopnost inhibovat lidskou acetylcholinesterasu (AChE) a butyrylcholinesterasu (BuChE) u 58 nových potenciálních MTDLs vzniklých substitucí bifenylu a benzhydrylu s použitím Ellmanovy metody a zároveň u vybraných sloučenin spektorfotometricky...
|
|
Learning in public goods game: alternative model performance
Grohmannová, Klára ; Červinka, Michal (vedoucí práce) ; Gregor, Martin (oponent)
V průběhu posledních padesáti let se výzkum hry veřejných statků stal čím dál tím více komplexním. Zejména v oblasti modelů učení se, které se pok- oušejí vysvětlit experimentální data, bylo navrženo a studováno velké množství modelů. Nícméně, co se týče porovnání výkonnosti těchto modelů vůči jiným, nebylo dosaženo mnoho závěrů. Tato práce se pokouší rozšířit komparativní analýzu provedenou v Cotla (2015). Za pomocí softwaru R, jsou tři modely učení se posouzeny na základě jejich schopnosti přesně předpovídat experi- mentální výsledky. Mezi těmito modely je K-strong equilibrium model tím nejúspěšnějším v předvídání všech výsledků experimentu hry veřejných statků, které jsou v této práci brány v potaz. Klasifikace JEL C71, C73, C87, C92, D64, D90 Klíčová slova hra veřejných statků, behavioralní teorie her, učení se Název práce Veřejné statky: učení se a přesnost alterna- tivních modelu
|