|
Mechanismy rezistence k metronidazolu u bakterií a anaerobních eukaryot
Pilařová, Kateřina ; Kulda, Jaroslav (oponent) ; Hrdý, Ivan (vedoucí práce)
Tato práce se snaží popsat mechanismy rezistence k metronidazolu u různých skupin organismů, na jejichž léčbu se metronidazol používá. Jsou to jak bakterie (rody Bacteroides, Helicobacter, Clostridium), tak anaerobní eukaryota (rody Trichomonas, Tritrichomonas, Entamoeba, Giardia). Důležité je to, že metronidazol působí selektivně pouze na buňky žijící v anaerobním nebo mikroaerofilním prostředí. Do buňky se metronidazol dostává pasivní difuzí a je poté redukován na cytotoxický meziprodukt, který poškozuje buňku na různých úrovních. U buněk s aerobním metabolismem sice dojde k průniku léčiva do buňky, může dojít i k redukci metronidazolu, eventuální radikál je pak ale v tzv. jalovém cyklu díky přítomnosti kyslíku přeměněn zpět na metronidazol. Z kyslíku pak vzniká superoxid, O2-. U anaerobů či mikroaerofilů k takto kyslíkem podmíněné detoxifikaci nitroradikálu nedochází a tak vyvinuli jiné způsoby, jak buňku ochránit před jeho škodlivými ůčinky. Vnímavost těchto patogenů k metronidazolu koreluje se změnami v jejich enzymatickém složení. Asi nejzákladnější mechanismus, jak patogeni bojují proti metronidazolu, je zamezení redukce metronidazolu. To, jakým způsobem organismy zamezují redukci, se druh od druhu liší. Je tu vzájemný vztah mezi rezistencí k metronidazolu a neefektivní aktivací antibiotika, což...
|
|
Korelace morfologických a molekulárně genetických vlastností vybraných nádorů
Šíma, Radek ; Skálová, Alena (vedoucí práce) ; Boudová, Ludmila (oponent) ; Ehrmann, Jiří (oponent)
1 Univerzita Karlova v Praze, Lékařská fakulta v Plzni Šiklův patologicko anatomický ústav Korelace morfologických a molekulárně genetických vlastností vybraných nádorů Radek Šíma Autoreferát doktorské dizertační práce Plzeň 2010 2 Dizertační práce byla zpracována v rámci kombinované formy doktorského studijního programu na Šiklově patologicko-anatomickém ústavu LF UK v Plzni v letech 2006-2010. Uchazeč: Radek Šíma Šiklův patologicko anatomický ústav LF UK v Plzni Školitel: Prof. MUDr. Alena Skálová, CSc. Šiklův patologicko anatomický ústav LF UK v Plzni Oponenti: Doc. MUDr. Ludmila Boudová, PhD. Šiklův patologicko anatomický ústav LF UK v Plzni Prof. MUDr. Jiří Ehrmann, PhD. Ústav histologie a embryologie LF UP v Olomouci Stanovisko k dizertační práci vypracoval vedoucí školícího pracoviště: Prof. MUDr. Michal Michal, Šiklův patologicko anatomický ústav LF UK v Plzni Autoreferát byl rozeslán dne: Obhajoba se koná na Šiklově patologicko-anatomickém ústavu, Dr. E. Beneše 13, Plzeň, před komisí pro obhajoby doktorských dizertačních prací v oboru patologie dne 27.4.2010 ve 14:00. S dizertační prací je možné se...
|
|
Biochemická a funkční charakterizace nového transmembránového adaptorového proteinu NVL
Vonková, Ivana ; Černý, Jan (oponent) ; Brdička, Tomáš (vedoucí práce)
Signalizační dráhy spouštěné v imunologické synapsi z T buněčného receptoru (TCR) již byly v minulosti podrobně studovány. Oproti tomu o dráhách účastnících se přenosu signálů spouštěných v této struktuře z MHCII na profesionálních antigen prezentujících buňkách (APC) se toho ví stále velmi málo. Transmembránové adaptorové proteiny (TRAP) jsou rodinou proteinů, která hraje důležitou roli v signalizaci iniciované T receptorem a jinými imunoreceptory. Dosud však nebyl popsán žádný TRAP účastnící se signalizace přes MHCII. Tato práce popisuje nový TRAP nazvaný Nvl, který je vysoce obohacen v imunologické synapsi na straně antigen prezentujících buněk a účastní se regulace přenosu signálu z MHCII a FcR. Nvl je přítomný výlučně v profesionálních antigen prezentujících buňkách - B buňkách, monocytech/makrofázích a dendritických buňkách, a míra jeho exprese pozitivně koreluje s expresí MHCII. Nvl se nachází v tetraspanových mikrodoménách a spolu s tetraspany je lokalizován v polarizovaných buněčných strukturách, včetně uropodu, zaškrcení při buněčném dělení (cleavage furrow) a též do imunologické synapse. Přítomnost Nvl v imunologické synapsi naznačuje možnou účast Nvl na přenosu signálů spouštěných z MHCII. Nvl je skutečně fosforylován po stimulaci přes MHCII, avšak silná fosforylace Nvl byla pozorována...
|
|
Interakce umělé fotosyntetické antény s akceptory elektronů
Dostál, Jakub ; Pšenčík, Jakub (vedoucí práce) ; Fejfar, Antonín (oponent)
The use of bacteriochlorophyll aggregates as a sensitizer for dye-sensitized cell has been studied in this work. Bacteriochlorophyll aggregates exhibit unique light-harvesting properties combining high optical density, long-term stability and exciton delocalization. Preparation of the GrÄatzel type photovoltaic cells has been successfully managed during this research. The cells were sensitized by bacteriochlorophyll c both in monomeric and aggregated form, and were characterized by measuring photoinduced current, voltage and other properties. As a part of this work a theoretical model of reversible two-level photovoltaic cell was derived from the thermodynamic principles. Predictions of this model are compared with experimental data and with published results.
|
|
Klinicko-patologický korelát komplikací intenzivně léčených hemato-onkologických pacientů s cíleným zaměřením na postižení dutiny ústní a případ raritní sekundární neoplázie
Vokurka, Samuel ; Boudová, Ludmila (vedoucí práce) ; Chlumská, Alena (oponent) ; Faber, Edgar (oponent)
Univerzita Karlova v Praze Lékařská fakulta v Plzni Klinicko-patologický korelát komplikací intenzivně léčených hemato-onkologických pacientů s cíleným zaměřením na postižení dutiny ústní a případ raritní sekundární neoplázie MUDr. Samuel Vokurka Autoreferát doktorandské dizertační práce Plzeň 2008 2 Univerzita Karlova v Praze Lékařská fakulta v Plzni Obor: patologie Klinicko-patologický korelát komplikací intenzivně léčených hemato-onkologických pacientů s cíleným zaměřením na postižení dutiny ústní a případ raritní sekundární neoplázie MUDr. Samuel Vokurka (Hematologicko-onkologické odd., Fakultní nemocnice v Plzni) Autoreferát doktorandské dizertační práce Plzeň 2008 Dizertační práce byla vypracována v rámci kombinované formy doktorského studijního programu Šiklova patologicko-anatomického ústavu Lékařské fakulty Univerzity Karlovy v Plzni 3 Uchazeč: MUDr. Samuel Vokurka Hematologicko-onkologické odd., Fakultní nemocnice v Plzni, Alej Svobody 80, Plzeň Školitel: Doc.MUDr.Ludmila Boudová, Ph.D. Šiklův patologicko-anatomický ústav, Lékařská fakulta v Plzni, Univerzita Karlova v Praze Oponenti: Doc. MUDr. Edgar Faber, CSc., Hematologicko-onkologická klinika Lékařské fakulty Univerzity Palackého a Fakultní nemocnice v Olomouci, Fakultní nemocnice, I. P. Pavlova 6, Olomouc. Doc.MUDr.Alena Chlumská, CSc,...
|
|
Metabolomic analysis of plasma samples using ultra performance liquid chromatography and high resolution mass spectrometry
Machová, Karolína ; Solich, Petr (vedoucí práce) ; Kujovská Krčmová, Lenka (oponent)
Univerzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra analytické chemie Kandidát: Karolína Machová Konzultant: Prof. RNDr. Petr Solich, CSc. Název diplomové práce: Využití ultraúčinné kapalinové chromatografie ve spojení s hmotností spektrometrií v metabolomické analýze plasmy Metabolomika je nová věda popisující komplexní metody pro určování a měření metabolitů v biologických vzorcích především tělních tekutinách jako je plasma, moč, sérum, sliny, cerebrospinální tekutina, sperma. Popisuje děje probíhající v buňkách a nachází široké uplatnění v diagnostice onemocnění, určování biomarkerů, patofyziologii nemocí a klinické praxi. Hladiny metabolitů jsou v nízkých koncentračních rozmezích, a proto je kladen důraz na vysokou citlivost metody. Důležitá je reprodukovatelnost analytické metody a také příprava vzorku. Metabolomická analýza využívá pro stanovení metabolitů především vysokoúčinnou kapalinovou chromatografii v kombinaci s hmotnostním detektorem. Další běžné analytické metody jsou nukleární magnetické rezonance a plynová chromatografie. Následující projekt je zaměřen na standardizaci metody identifikace nalezených metabolitů pomocí ultra-účinné kapalinové chromatografie v kombinaci s hmotnostním spektrometrem s využitím počítačového vyhodnocení pomocí databáze známých látek.
|
|
Vliv inhibitoru histondeacetylas valproátu na aktivity a expresi cytochromů P450 a peroxidas oxidujících ellipticin
Göttlicherová, Markéta ; Souček, Pavel (oponent) ; Stiborová, Marie (vedoucí práce)
Ellipticin je účinné protinádorové léčivo, jehož mechanismus působení je založen především na interkalaci do DNA a inhibici topoisomerasy II. V naší laboratoři pak bylo zjištěno, že ellipticin tvoří kovalentní adukty s DNA po jeho enzymové aktivaci cytochromy P450 (CYP) a peroxidasami. V další studii byla pozorována zvýšená tvorba těchto aduktů ellipticinu s DNA neuroblastomových buněk, která korelovala se zvýšenou cytotoxicitou ellipticinu vyvolanou inhibitorem histondeacetylas valproátem (VPA). Toto pozorování lze vysvětlit několika mechanismy. Jedním z nich může být rozvolnění struktury chromatinu, a tím zpřístupnění DNA pro modifikaci. Druhým pak možnost ovlivnění aktivit a exprese enzymů metabolizujících ellipticin působením VPA. Tato diplomová práce se zaměřila na testování druhé hypotézy. Vzhledem k tomu, že VPA je metabolizován podobnými enzymy jako ellipticin, zaměřili jsme se na sledování vlivu VPA (i) na oxidaci ellipticinu cytochromy P450 a peroxidasami, (ii) na aktivity CYP, které významně participují na oxidaci ellipticinu (CYP1A, CYP3A) a (iii) na expresi enzymů oxidujících ellipticin (CYP1A1, CYP3A4, laktoperoxidasa). Oxidace ellipticinu modelovou peroxidasou in vitro (křenovou peroxidasou) na detoxikační metabolit, dimer ellipticinu, byla signifikantně stimulována VPA, zatímco na...
|
|
Diferenciální diagnostika vřetenobuněčných lézí trávicího traktu
Daum, Ondřej ; Hes, Ondřej (vedoucí práce) ; Mandys, Václav (oponent) ; Ehrmann, Jiří (oponent) ; Zámečník, Josef (oponent)
MUDr. Ondřej Daum DIFERENCIÁLNÍ DIAGNOSTIKA VŘETENOBUNĚČNÝCH LÉZÍ TRÁVICÍHO TRAKTU DIFFERENTIAL DIAGNOSTICS OF SPINDLE CELL LESIONS OF THE DIGESTIVE TRACT UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE LÉKAŘSKÁ FAKULTA V PLZNI Šiklův ústav patologie FN a LF UK Plzeň, 2006 1 Dizertační práce byla zpracována v rámci kombinované formy postgraduálního studia na Šiklově ústavu patologie FN a LF UK v Plzni v letech 2004-2006. Doktorand: MUDr. Ondřej Daum Školitel: Doc. MUDr. Ondřej Hes, PhD. docent Lékařské fakulty UK, Šiklův ústav patologie FN a LF UK v Plzni Oponenti: Prof. MUDr. Václav Mandys, CSc. přednosta Ústavu patologie FN Královské Vinohrady a 3. LF UK v Praze Doc. MUDr. Jiří Ehrmann, PhD. docent Lékařské fakulty UP, Ústav patologie FN a LF UP v Olomouci Doc. MUDr. Josef K. Zámečník, PhD. docent Lékařské fakulty UK, Ústav patologie FN Motol a 2. LF UK v Praze Stanoviska k dizertaci vypracovala Lékařská fakulta UK v Plzni. Autoreferát byl odeslán dne .......................................................... Obhajoba se koná dne .................................... 2007 v ....................... hod. před komisí pro obhajoby doktorských dizertací v oboru patologická anatomie v...................................................................................................... S dizertační prací je možné se seznámit na...
|
|
Úloha transportních systémů pro draselné kationty ve fyziologii kvasinky Saccharomyces cerevisiae
Marešová, Lydie ; Sychrová, Hana (vedoucí práce) ; Pácha, Jiří (oponent) ; Janderová, Blanka (oponent)
V rámci této disertační práce se podařilo objasnit některé dříve publikované nesrovnalosti (Ramírez et al., 1998) v souvislosti s domnělým K+/H antiporterem plasmatické membrány kvasinky S cerevisiae. Bylo prokázáno, že Kha I p nezprostředkovává transport draselných kationtů z buněk přes plasmatickou membránu a že mutanty s delecí khal nemají změněný vnitorbuněčný obsah K+ ani zvýšený membránový potenciál. Byly nalezeny a ověřeny nové fenotypy delece khal (citlivost k zvýšenému pH růstového média a k hygromycinu B) což (1) napovídá o funkci proteinu Kha l v regulaci vnitrobuně čného a vnitroorganelového pH a následně v regulaci homeostáze kationtů alkalických kovů v cytosolu a uvnitř buněčných organel; a (2) umožňuje heterologní xpresi a charakterizaci příbuzných proteinů z vyšších eukaryot v S cerevisiae. První z nich, protein Chx 17 z A. thaliana, byl v delečních mutantech exprimován a ukázalo se, že je schopen komplementovat fenotypové projevy delece khal, takže jeho role v buňkách A. thaliana by mohla být podobná funkci proteinu Kha 1 v S. cerevisiae. Jeden z vytyčenýc h cílů disertační práce se nepodařilo splnit docela: Bylo sice správně určeno, že protein Khal není lokalizován v plasmatické membráně kvasinky, a jeho lokalizace byla odhadnuta do membrány Golgiho aparátu, než se však podařilo nalézt...
|
| |
host ::
