|
|
Studium prekurzorových forem SARS-CoV-2 3-CL proteázy
Nováková, Veronika ; Majerová, Taťána (vedoucí práce) ; Novotný, Marian (oponent)
Virus SARS-CoV-2 (z angl. Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2), původce onemocnění COVID-19 (z angl. coronavirus disease 2019), je obalený virus s pozitivním RNA genomem. Po vazbě viru na receptor buňky a po uvolnění genomu do cytoplazmy dochází k okamžité translaci virového genomu. Překládá se do polyproteinu skládajícího se z nestrukturních proteinů nezbytných pro replikaci viru. Součástí tohoto polyproteinu je také proteáza 3-CL, která se z tohoto polyproteinu autokatalyticky vyštěpuje a dále uvolňuje (a tím aktivuje) jednotlivé proteiny. Vzhledem k této klíčové funkci v replikaci viru se stala proteáza 3-CL významným cílem pro návrh specifických antivirotik. V rámci předložené diplomové práce jsme se zaměřili na studium prekurzorové formy této proteázy, tedy proteázy, která je stále součástí polyproteinu. Prekurzorová forma proteázy 3-CL byla napodobena připojením extramembránového C-koncového fragmentu sousedního proteinu nsp4 o velikosti sto aminokyselin na N-konec maturované formy proteázy. Cílem bylo zjistit, jakým způsobem sekvence přidaná na N-konec maturované proteázy ovlivňuje její enzymové charakteristiky. V rámci práce byly identifikovány mutace N-koncového štěpného místa, které zabrání rozštěpení prekurzoru na maturovanou formu, což umožňuje získání purifikované...
|
|
|
Syntéza a hodnocení duálně působících potenciálních léčiv neurodegenerativních chorob
Miffek, Dominik ; Krátký, Martin (vedoucí práce) ; Vinšová, Jarmila (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra organické a bioorganické chemie Autor práce: Dominik Miffek Vedoucí diplomové práce: doc. PharmDr. Mgr. Martin Krátký, Ph.D. Název diplomové práce: Syntéza a hodnocení duálně působících potenciálních léčiv neurodegenerativních chorob Alzheimerova (AD) a Parkinsonova choroba (PD) jsou neurodegenerativní onemocnění, postihující zejména populaci vyššího věku. Incidence těchto onemocnění stále roste po celém světě a ani jedna z těchto nemocí nemá v současné době léčbu, která by byla schopná pacienty trvale vyléčit. Dosavadní léčiva cílí převážně na zpomalení progrese těchto onemocnění. Cílem je u těchto neurodegenerativních onemocnění zlepšit dostupnost léčby, zamezit progresi nebo úplně vyléčit pacienty trpící AD a PD. Tímto směrem se i vyvíjí nová potencionální léčiva, která by mohla vykazovat uspokojivý účinek v inhibici cholinesteráz. Acetylcholinesteráza (ACh) a butyrylcholinesteráza (BuChE) hrají totiž významnou roli v patogenezi těchto onemocnění. Zejména u AD dochází k poklesu acetylcholinu coby neuromediátoru zajišťujícího homeostázu a správný chod centrální nervové soustavy (CNS). V léčbě AD se používají inhibitory (AChE), které zvyšují hladinu acetylcholinu (ACh) v mozku. Mezi využívané zástupce patří, rivastigmin,...
|
|
|
Vliv vybraných parfémů na aktivitu aromatasy
Drejslarová, Iva ; Hodek, Petr (vedoucí práce) ; Smrček, Stanislav (oponent)
Cytochromy P450 jsou enzymy zapojené do mnoha fyziologických procesů v organismu, kromě metabolismu xenobiotik také do biosyntézy a katabolismu endogenních látek, jako jsou hormony a steroidy. Cytochromy P450 zodpovědné za přeměny endogenních sloučenin mohou být ovlivněny xenobiotiky, které různými mechanismy zasahují do sekrece, metabolismu, transportu či eliminace endogenních hormonů. Tyto látky se také označují jako endokrinní disruptory a řadí se mezi ně například pesticidy, insekticidy, některá léčiva, nebo sloučeniny obsažené kosmetických prostředcích. Jedním z mechanismů jejich působení je zásah do biosyntézy steroidních hormonů prostřednictvím interakcí se steroidogenními enzymy. Takovým enzymem je cytochrom P450 19, aromatasa, který v posledním kroku biosyntézy steroidních hormonů katalyzuje konverzi testosteronu na ß-estradiol. Následkem narušení aktivity tohoto enzymu endokrinními disruptory je nerovnováha hladiny estrogenů v organismu, která může vést k poškození reprodukčních funkcí, vzniku osteoporózy, aterosklerózy, demence, či rozvoji některých typů karcinomů. V této souvislosti byl zkoumán vliv komerčně dostupných parfémů na konverzi testosteronu na ß-estradiol, jenž je katalyzována aromatasou. Ovlivnění aktivity tohoto enzymu bylo stanoveno pomocí HPLC a HPLC ve spojení s...
|
|
|
Studium inhibice mikroorganismů ve vinařské technologii
Vavřiník, Aleš
Diplomová práce se zabývá studiem inhibice mikroorganismů, které jsou spojeny s vinařskou technologií. Důraz je kladen především na bakterie octového a mléčného kvašení. Jsou v ní rešeršním způsobem zpracovány data pojednávající o charakteristice, taxonomii a metabolismu obou zmíněných skupin bakterií. Jsou v ní taktéž podrobně popsáni nejdůležitější zástupci octových a mléčných bakterií. V experimentální části byly studovány inhibiční vlastnosti stříbrných částic, které byly vyrobeny tzv. zelenou syntézou. Antibakteriální vlastnosti se zkoumaly pomocí plotnové metody a pomocí studia růstových křivek na dvou zástupcích bakterií octového kvašení (Gluconobacter oxydans CCM 3618 a Acetobacter aceti CCM 3620T) a dvou zástupcích bakterií mléčného kvašení (Lactobacillus brevis CCM 1815 a Pediococcus damnosus CCM 2465). Experimenty prokázaly inhibiční schopnost stříbrných částic vůči všem testovaným bakteriím, přičemž větší citlivost byla zaznamenána u bakterií octového kvašení.
|
|
|
Studium inhibice vinařských kvasinek
Koublová, Vendula
Teoretická část práce shrnuje základní mikrobiologické a enologické poznatky o významných vinařských kvasinkách. Zabývá se rody kvasinek, které jsou součástí mikrobiomu vinné révy a mohou se účastnit fermentace. Shrnuje přínosy a zápory autochtonních kvasinek při fermentaci a zmiňuje některé komerční preparáty s non-Saccharomyces kvasinkami, které jsou dostupné na trhu s vinařskými potřebami. Experimentální část práce hodnotí vliv použití pyrosulfitu in vitro na dva vybrané kmeny Saccharomyces cerevisiae a tři kmeny Saccharomyces bayanus. Dále byl vliv pyrosulfitu in vitro testován na třech kmenech vinařsky významných bakterií: Lactobacillus brevis, Pediococcus damnosus a Acetobacter aceti. Byla použita disková difuzní metoda, metoda růstových křivek v plném médiu a metoda růstových křivek biochemických testů.
|
|
|
Parazitární cystatiny jako inhibitory cysteinových proteas: strukturní aspekty funkční specifity a evoluce
Buša, Michal ; Mareš, Michael (vedoucí práce) ; Hudeček, Jiří (oponent) ; Kukačka, Zdeněk (oponent)
Proteiny z rodiny cystatinů jsou důležitými inhibitory cysteinových proteas typu katepsinů a účastní se řady patologií. Parazitární cystatiny jsou atraktivní cílové molekuly pro regulaci parazitů, ale je o nich dosud málo informací. Tato práce se zaměřuje na cystatiny dvou významných krevsajících parazitů: klíštěte obecného (Ixodes ricinus) jako hlavního vektoru lymské boreliózy a klíšťové encefalitidy, a motolice jaterní (Fasciola hepatica), původce fasciolózy. Byla provedena funkční a rentgenostrukturní charakterizace čtyř nových cystatinů, která umožnila určit strukturní příčiny inhibiční specifity a vysvětlit je v kontextu evoluce cystatinů a jejich fyziologické role. Cystatin FhCyLS-2 z F. hepatica má širokou inhibiční specifitu a hraje pravděpodobně duální roli při regulaci proteolytických systémů v tkáni hostitele a ve střevu parazita. FhCyLS-2 kombinuje unikátním způsobem charakteristiky dvou podrodin cystatinů a představuje modelového zástupce nové evoluční skupiny cystatinů identifikované u několika řádů parazitických motolic. Ricistatin a iristatin jsou cystatiny ze slin I. ricinus, jejichž imunomodulační působení na hostitele je způsobeno výjimečně úzkou inhibiční specifitou. Ta byla vysvětlena strukturními modifikacemi ve vazebných segmentech inhibitorů. Modifikace mají jiný charakter u...
|
|
|
HSP90 jako cíl protinádorové terapie
Drápalová, Kateřina ; Zatloukalová, Pavlína (vedoucí práce) ; Dibus, Nikol (oponent)
Pro zachování buněčné homeostázy je důležitá stabilita a správná terciární struktura proteinů. K tomu buňka využívá molekulární chaperony, mezi které patří Hsp90. Hsp90 je nezbytným proteinem pro život zdravé, ale i nádorové buňky. Zvýšená exprese tohoto chaperonu je pozorována u mnoha nádorových onemocnění. V této práci jsou shrnuty poznatky týkající se proteinu Hsp90 a jeho role v procesu kancerogeneze. Ačkoli se protein Hsp90 stal cílem protinádorové terapie již v 90. letech minulého století, jeho inhibice, ač docela úspěšná v nespočtu studií, prozatím nedosáhla uspokojivých výsledků v klinické praxi. Neúspěch terapie je dán hlavně vysokou hepatotoxicitou a dalšími vedlejšími účinky provázející terapii, ale také nedostatečným protinádorovým efektem. Přesto inhibice Hsp90 proteinu představuje zajímavý přístup v protinádorové terapii a neustále dochází k vývoji nových inhibitorů a jejich testováni v monoterapii či při kombinované terapii, která prokazuje výrazně vyšší účinnost a díky synergickému efektu umožňuje aplikaci nižší koncentrace terapeutik.
|
|
|
Amaryllidaceae alkaloidy jako inspirace pro přípravu selektivních inhibitorů butyrylcholinesterasy I
Wisura, Matěj ; Cahlíková, Lucie (vedoucí práce) ; Kučerová, Marta (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické botaniky Kandidát: Matěj Wisura Školitel: prof. Ing. Lucie Cahlíková, Ph.D. Název diplomové práce: Amaryllidaceae alkaloidy jako inspirace pro přípravu selektivních inhibitorů butyrylcholinesterasy I Čeleď Amaryllidaceae je považována za velice významný zdroj biologicky aktivních přírodních látek, alkaloidů. Tyto látky jsou intenzivně studovány kvůli jejich vlastnostem antivirovým, antifungálním, antiparazitickým, antioxidačním, protizánětlivým a především také jejich schopnosti inhibovat cholinesterázy. O tom, že tento zdroj stále není ani zdaleka vyčerpán, svědčí nedávná izolace zcela nového strukturního typu Amaryllidaceae alkaloidů, karltoninů, z Narcissus pseudonarcissus cv. Carlton, které vykázaly významnou inhibiční aktivitu vůči BuChE. Izolace karltoninů se stala inspirací pro syntézu vysoce selektivních inhibitorů BuChE vycházejících z norbelladinového strukturního typu. Na přípravu pilotní série látek navazuje tato diplomová práce, při které bylo připraveno dalších 21 látek rozšiřujících portfolio a prohlubujících poznání vztahu struktury a účinku ve skupině selektivních inhibitorů BuChE. Připravené látky byly identifikovány pomocí NMR a ESI-HMRS. Všechny látky byly testovány na inhibiční aktivitu vůči AChE a...
|
|
|
Studium slepičích protilátek proti S proteinu viru SARS-CoV-2
Křížová, Tereza ; Hodek, Petr (vedoucí práce) ; Svášková, Dagmar (oponent)
Začátkem roku 2020 světová zdravotnická organizace WHO vyhlásila pandemii v souvislosti šíření nové nákazy. Nemoc Covid-19 se projevuje především respiračními problémy způsobenými virem SARS-CoV-2. Do hostitelské buňky vstupuje přes receptor ACE2, na který se váže RBD doménou povrchového "spike" proteinu. Možným způsobem, jak se před virovou infekcí bránit, je očkování např. mRNA vakcínou, čímž je navozena produkce "spike" proteinu k vyvolání imunitní odpovědi a produkci protilátek. Další možnou alternativou ochrany je pasivní imunoterapie. V této práci byly zvoleny protilátky ze slepičích vajec, které mají široké využití v prevenci různých virových a bakteriálních onemocnění. Vyznačují se velkou vazebnou afinitou k antigenům, jsou ekonomicky nenáročné a jsou považovány za rychlý, jednoduchý a bezpečný způsob pasivní ochrany. Z vaječných žloutků slepic vakcinovaných mRNA vakcínou kódující "spike" protein byly připraveny protilátky IgY. Pomocí ELISA byla testována reaktivita připravených protilátek s celým "spike" proteinem (exprimovaný v hmyzích buňkách), kde byla prokázána schopnost protilátek se vázat na antigen s vysokou afinitou. Následně byla ověřována jejich schopnost interakce se samotnou RBD doménou (exprimovaná v E. coli). Technikou ELISA byla prokázána jen malá reaktivita protilátek...
|
|
|
Modulation of cytochrome P450 activity by the anticancer drug lenvatinib
Ivančík, Martin ; Dračínská, Helena (vedoucí práce) ; Mrízová, Iveta (oponent)
Lenvatinib, obchodně prodávaný jako Lenvima®, je perorální léčivo schválené k léčbě rakoviny štítné žlázy, hepatocelulárního karcinomu a karcinomu ledvinových buněk, které působí jako inhibitor tyrosinkinas. Studie in vitro a in vivo prokázaly, že metabolismus lenvatinibu v lidském těle probíhá v játrech a ledvinách, přičemž jeho přeměnu zajišťuje systém cytochromů P450 a aldehydoxidasa. Právě proto bylo cílem této bakalářské práce stanovit vliv lenvatinibu na aktivitu jednotlivých isoforem lidského cytochromu P450. Mezi studované isoformy byly vybrány ty, které zajišťují metabolismus většiny cizorodých látek v lidském těle. Měření byla provedena in vitro za použití rekombinantních CYP exprimovaných v SupersomechTM pomocí markerových reakcí, které jednotlivé isoformy cytochromu P450 zajišťují. Aktivita enzymu v reakčních směsích obsahujících lenvatinib v koncentraci, která odpovídala koncentraci daného substrátu nebo byla desetinásobně vyšší, byla porovnána s aktivitou enzymu v reakčních směsích, kde bylo místo lenvatinibu přidáno pouze rozpouštědlo DMSO. Na základě těchto měření byla vypočtena procentuální aktivita isoforem 1A1, 1A2, 1B1, 2B6, 2C8, 2C9, 2E1 a 3A4 cytochromu P450 v přítomnosti lenvatinibu. K poklesu aktivity došlo u isoforem CYP1B1, CYP1A1 a CYP3A4. K nejvýraznější inhibici došlo u...
|
host ::
RSS.