|
|
Vliv M1043 na expresi markerů zánětu u myšího modelu NASH - imunohistochemická analýza
Hušková, Eliška ; Němečková, Ivana (vedoucí práce) ; Kovařík, Miroslav (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra: Katedra biologických a lekarských ved Studijní obor: Laboratorní diagnostika ve zdravotnictví Autor: Eliska Huskova Vedoucí práce: RNDr. Ivana Nemeckova, Ph.D. Název práce: Vliv M1043 na expresi markeru zanetu u mýsího modelu NASH - imunohistochemicka analýza Úvod a cíl prace: Jatra jsou organem s mnoha dulezitými funkcemi v tele, jako je napríklad detoxikace a regulace lipidoveho metabolismu. Poruchý v techto procesech mohou vest k nealkoholove steatohepatitide (NASH), onemocnení spojenemu s obezitou a metabolickým sýndromem, charakterizovanemu zanetem a nahromadením tukových kapenek v jatrech. Studie zamerene na NASH jsou dulezite pro pochopení patofýziologie a vývoj nových lecebných strategií. Výuzití mýsích modelu umoznuje zkoumat patogenezi a testovat terapeuticke prístupý. Tato studie zkouma vliv anti-endoglinove protilatký M1043 na expresi zanetlivých markeru u mýsího modelu NASH. Metodika: Mýsi býlý krmený dietou vývolavající NASH a rozdelený do dvou skupin, jedne s aplikovanou potkaní protilatkou IgG a druhe s anti-endoglinovou protilatkou M1043. Jatra býla odebrana a zpracovana pomocí imunohistochemicke analýzý. Výsledký a zaver: Výsledký teto studie jsou dulezite pro pochopení ucinku anti- endoglinove protilatký na...
|
|
|
Mining novel terpene synthases from large-scale repositories
Čalounová, Tereza ; Pluskal, Tomáš (vedoucí práce) ; Štáfková, Jitka (oponent)
Terpeny a terpenoidy představují největší a strukturně nejrozmanitější skupinu přírodních látek s využitím v mnoha oborech, včetně farmaceutického průmyslu. Tyto molekuly jsou v přírodě syntetizovány enzymy známými jako terpen syntázy. V této práci byla provedena bioinformatická analýza kurátorované databáze obsahující všech 1125 experimentálně charakterizovaných terpen syntáz se zaměřením na identifikaci vzorců v délkách sekvencí a doménových architekturách těchto enzymů napříč různými říšemi života. Na základě poznatků této analýzy byl proveden sekvenčně založený mining s cílem identifikovat možné nové terpen syntázy. S využitím téměř 5,5 miliard proteinových sekvencí z různých rozsáhlých sekvenčních databází vedl mining k identifikaci více než 600 tisíc potenciálních terpen syntáz. Tyto potenciální terpen syntázy pocházejí převážně z bakterií a metagenomů, tedy ze zdrojů, které byly historicky méně zkoumány. Výsledný dataset, doplněný fylogenetickým stromem, sítí sekvenční podobnosti a dvěma skóre prioritizace, nabízí cenný zdroj pro objevování nových terpenů. Klíčová slova: terpen syntáza, TPS, mining, Pfam, SUPERFAMILY, doména, terpen
|
|
|
Luminiscence minerálů uranylu a možnosti jejího využití jako analytické metody
Cenek, Ondřej ; Goliáš, Viktor (vedoucí práce) ; Zachariáš, Jiří (oponent)
Tato práce se zabývá studiem luminiscence minerálů uranylu v ultrafialovém záření. Studovány byly vzorky minerálů metaautunitu, schröckingeritu, natrozippeitu a saléeitu. Pro výzkum bylo vybráno 20 vzorků a ty byly jednoznačně určeny pomocí rentgenové difrakce a energiově disperzní spektrometrie. Pro každý vzorek bylo pořízeno luminiscenční spektrum při excitačním záření 405 nm. Luminiscenční spektra byla analyzována. Luminiscenční spektra metaautunitu obsahují 6 energetických maxim. Maximum s nejvyšší intenzitou je na pozici průměrně 525,1 nm. Anomální hodnoty vykazují dva vzorky s příměsí metauranocircitu. Luminiscenční spektra saléeitu vykazují posun do nižších vlnových délek oproti metaautunitu, způsobený změnou hlavního kationtu (Ca - Mg). Spektra saléeitu vykazují 5-7 energetických maxim a maximum s nejvyšší intenzitou je na pozici průměrně 521,2 nm. Spektra schröckingeritu obsahují 8-9 energetických maxim a maximum s nejvyšší intenzitou je na pozici průměrně 505,4 nm. Anomální spektrum vykazuje vzorek s příměsí liebigitu. Luminiscenční spektra natrozippeitu jsou oproti ostatním minerálům použitých v této práci odlišná. Spektra nevykazují izolovaná energetická maxima, ale jeden široký asymetrický pás. Tento pás je konvolucí 3 energetických maxim. Maxima na stejné pozici mají znatelně odlišnou...
|
|
|
Měření vertikální profilu T, RH mezní vrstvy atmosféry s pomocí dronu
Fedorenko, Mykhailo ; Hovorka, Jan (vedoucí práce) ; Bendl, Jan (oponent)
Spodních 200 metrů mezní vrstvy atmosféry (ABL) se vyznačuje vysokým množstvím atmosférických znečišťujících příměsí, jejichž rozložení i transport je možné předpovědět na základě vertikálních profilů určitých fyzikálních parametrů. Získání detailních vertikálních profilů v tomto rozsahu je proto nezbytné. Tradiční metody měření vertikálních profilů však nejsou plně použitelné v kontextu SL. Radiosondy nejsou určeny pro časté měření vertikálních profilů v rozsahu 200 metrů a metody dálkového průzkumu často nemají dostatečné časoprostorové rozlišení, pro podrobné měření takovýchto profilů, mohou monitorovat pouze určité parametry, jejich provoz má svá specifika a je spojen s vysokými náklady. Oproti těmto metodám přináší použití dronu jako mobilní platformy výhody ve formě vysokého časoprostorového rozlišení a schopnosti provádět profilování v krátkých časových intervalech, což umožňuje zachycení detailní dynamiky vertikálních profilů v rozsahu 200 metrů. V této práci bylo s využitím dronu DJI Air 2s, vybaveným senzorem iMet-XQ2 (InterMet Systems) prováděno měření vertikálních profilů teploty (T) a relativní vlhkosti (RH). Vertikální rychlost vzestupu dronu byla přibližně 1 m/s, měření profilu do 120m tak trvalo obvykle 120 s, cele měřeni kolem 3-4 minut. Mezi měřením jednotlivých profilů byla...
|
|
|
Manifestace faciální asymetrie v mladší dospělosti: vztah asymetrie faciálních expresí a projevů mozkové laterality
Hřebcová, Eliška ; Velemínská, Jana (vedoucí práce) ; Měšťák, Jan (oponent)
Diplomová práce se zabývá hodnocením longitudinálních změn v obličejové asymetrii neutrálního výrazu a vybraných obličejových expresí u adolescentů a mladých dospělých ve věku od 15 do 18 let a jejich souvislostí s preferencí ruky. Hodnoceny byly tvarové změny u 30 dívek a 27 chlapců, z nichž 3 dívky a 2 chlapci byli levorucí. Pro analýzu bylo využito metody geometrické morfometrie aplikované na 3D povrchové skeny obličejů. Skenování proběhlo celkem třikrát, vždy v ročním intervalu. Pořízeno a zpracováno bylo celkem 1440 skenů, pro samotné analýzy jich bylo využito 453. Výstupem analýz byly barevné mapy zobrazující změny tvaru obličeje. Praváci byli hodnoceni jako jedna průměrná skupina, leváci vzhledem k nízkému počtu pouze jednotlivě. Výsledky longitudinálního sledování u pravorukých jedinců ukázaly velmi podobné výsledky mezi chlapci a dívkami. Ve všech skupinách byla pozorována protruze pravé části čela a také pravostranná protruze oblasti nosu a přilehlých částí maxily, v pozdějším věku došlo k pravostranné protruzi oblasti dolního rtu a mandibuly. Na levé straně byla u obou pohlaví pozorována prominence v oblasti angulus mandibulae. U levorukých jedinců byla pozorována téměř úplná absence zmíněné protruze pravé části čela. Protruze nosu se častěji projevila na levé straně. Asymetrie oblasti...
|
|
|
Vývoj HPLC metody pro kontrolu kvality potravních doplňků na bázi extraktu kozlíku lékařského
Bílková, Veronika ; Šatínský, Dalibor (vedoucí práce) ; Sklenářová, Hana (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra analytické chemie Kandidát: Veronika Bílková Školitel: prof. RNDr. Dalibor Šatínský, Ph.D. Název diplomové práce: Vývoj HPLC metody pro kontrolu kvality potravních doplňků na bázi extraktu kozlíku lékařského V této diplomové práci byla vyvinuta a validována chromatografická metoda pro separaci a stanovení apigenin-7-glukosidu, luteolinu, kyseliny acetoxyvalerenové, kyseliny hydroxyvalerenové, kyseliny valerenové, acevaltrátu a valepotriátu, které se vyskytují v extraktech kozlíku lékařského. Tato chromatografická metoda byla následně použita pro stanovení obsahu daných látek v potravních doplňcích: Advance Calmin, Allnature Kozlík bylinný extrakt, Anxiolan od firmy Green-Swan Pharmaceuticals CR a.s., Barnys HypnoX forte od Biopol GN, Dr. Max Happy Sleep, Epiderma Spi v klidu, Kneipp Kozlík plus, NatureVia Sleepnox forte, Naturvita Antistres, Neospan forte od Simply You Pharmaceuticals a.s. a Terezia Spánek & Relax. Pro porovnání obsahu látek byly analyzovány registrované léčivé přípravky: Kneipp Kozlík 500 mg, Persen forte - Zentiva Group, a.s.. Metoda byla rovněž využita pro kontrolu kvality a obsahu u tekutých lékových forem (kapky, tinktury): Dr. Popov Kozlík lékařský, Green idea Kozlík lékařský extrakt a Tinctura valerianae od...
|
|
|
Vliv mikroplastů na střevní mikrobiom žížal, jejich imunitní systém a metabolom
Flohrová, Tereza ; Cajthaml, Tomáš (vedoucí práce) ; Lišková, Petra (oponent)
Mikroplasty jsou velmi rozšířenými polutanty. Nachází se ve vodném, vzdušném i půdním prostředí. Mikroplasty se uvolňují přímo do půdy kupříkladu z mulčovacích fólií a textilií. V půdě se mikroplasty deponují a mohou mít negativní vliv na půdní mikrofaunu a makrofaunu. Žížaly jako ekosystémoví inženýři a půdní a střevní bakterie hrají významnou roli při biogeochemických cyklech biogenních prvků. Narušení funkce žížal, jejich střevních bakterií nebo bakterií půdních by mohlo mít dopad na celý ekosystém. V rámci této diplomové práce, byly žížaly Apporectodea sp. vystaveny mikroplastům z polypropylenové černé netkané textilie o koncentraci 1 g/kg půdy a 0,0265 g/kg půdy po dobu 14, 28 a 56 dní. Byla sekvenována DNA pro identifikaci bakterií ze střeva žížal, z obsahu žížalího střeva a z chovné půdy. Dále byla provedena necílená analýza metabolitů z žížalího těla a extrakce imunitních buněk z žížal pomocí tří rozdílných metod. Nebyly zjištěny žádné signifikantní změny způsobené přítomností mikroplastů v zastoupení bakterií ze střeva, obsahu střeva a půdy, ale byly detekovány statisticky významné změny v metabolomu. Ze žížal se nepodařilo izolovat dostatečný počet imunitních buněk na další analýzu. Z výsledků není možno jednoznačně prokázat, zda mají mikroplasty vliv na střevní mikrobiotu žížal a jaký...
|
|
|
Analýza protilátek proti HLA antigenům metodou luminex u pacientů před a po transplantaci ledviny
Holoubková, Renata ; Jankovičová, Karolína (vedoucí práce) ; Andrýs, Ctirad (oponent)
Tato práce se zaměřuje na zvládnutí techniky vyšetření anti-HLA protilátek pomocí multiplexové metody Luminex. Cílem bylo osvojit si práci s analyzačním softwarem, který umožňuje vyhodnocování specifit a hladin jednotlivých anti-HLA protilátek v sérech pacientů před a po transplantaci ledviny. Zároveň byly posouzeny cut-off hodnoty pro screeningové vyšetření anti-HLA protilátek u souboru hodnocených pacientů. Dále byla provedena analýza senzibilizace vůči jednotlivým HLA antigenům u skupiny pacientů, kteří měli nízkou hladinou protilátek. V teoretické části této práce jsem se zabývala hlavním histokompatibilitním systémem (HLA systém) a jeho významem v transplantologii. Dále jsem se zaměřila na problematiku transplantační imunity a na principy aloreaktivity a rejekcí. V textu jsem rozebrala vznik a význam HLA protilátek a dále jsem se zabývala různými metodikami analýzy anti-HLA protilátek, zvláště multiplexovou metodou Luminex. V experimentální části, kterou jsem vykonala na oddělení Klinické imunologie a alergologie v Hradci Králové, jsem prováděla analýzu protilátek namířených proti HLA antigenům I. a II. třídy pomocí multiplexové metody Luminex. U obou HLA tříd byly sledovány hodnoty indexů screeningových vyšetření. U pozitivních hodnot indexů byly v následném typizačním vyšetření sledovány...
|
|
|
VYUŽITÍ AUTOMATIZOVANÉHO SBĚRU VLÍCOVACÍCH BODŮ PRO ORIENTACI ARCHIVNÍCH LETECKÝCH MĚŘICKÝCH SNÍMKŮ S POMOCÍ SOUČASNÝCH DATOVÝCH SAD
Berka, Rostislav ; Potůčková, Markéta (vedoucí práce) ; Dušánek, Petr (oponent)
VYUŽITÍ AUTOMATIZOVANÉHO SBĚRU VLÍCOVACÍCH BODŮ PRO ORIENTACI ARCHIVNÍCH LETECKÝCH MĚŘICKÝCH SNÍMKŮ S POMOCÍ SOUČASNÝCH DATOVÝCH SAD Abstrakt Diplomová práce se zaměřuje na automatizované vyhledávání vlícovacích bodů (VLB) za účelem zpracování archivních leteckých měřických snímků (LMS) a vytvoření ortomozaiky. V práci jsou testovány vybrané operátory z oblasti počítačového vidění (SIFT, SURF, ORB a obrazová korelace) a různé přístupy pro vyhledávání a následně párování identických bodů mezi referenčním podkladem (současným ortofotem) a archivními LMS. Díky georeferencím LMS je známa oblast k prohledávání ve starých LMS pro nalezení odpovídajícího bodu k referenčnímu podkladu (současnému ortofotu). Bohužel se ukázalo, že georeference archivních LMS dodané ČÚZK jsou chybně metodicky zpracované (velmi nepřesné), proto musely být před automatizovaným vyhledáváním VLB opraveny. Téma bylo podpořeno vedením Zeměměřického úřadu a datové sady (současné ortofoto, archivní LMS, ZABAGED) byly poskytnuty pro účely zpracování práce zdarma (nad rámec běžné studentské licence). Na základě testování operátorů byla sestavena plně automatizovaná metodika naprogramovaná v jazyce Python založená na obrazové korelaci. Vstupem jsou archivní LMS, současné ortofoto a síť komunikací, přičemž jako spolehlivé a časově invariantní...
|
|
|
Úlohy typu PISA podpořené fyzikálním experimentem
Štyksová, Gabriela ; Kácovský, Petr (vedoucí práce) ; Mandíková, Dana (oponent)
Název práce: Úlohy typu PISA podpořené fyzikálním experimentem Autor: Gabriela Štyksová Katedra / Ústav: Katedra didaktiky fyziky Vedoucí diplomové práce: RNDr. Petr Kácovský, Ph.D., Katedra didaktiky fyziky Abstrakt: V rámci této diplomové práce byla provedena rešerše uvolněných úloh z mezinárodního šetření PISA (Programme for International Student Assessment), které se zaměřuje na ověřování vědomostí patnáctiletých žáků v oblasti čtenářské, matematické a přírodovědné gramotnosti. Na základě rešerše bylo vytipováno několik úloh, k nimž se posléze přidaly nové aktivity navržené autorkou práce. Celkem vzniklo 6 aktivit Domeček pro panenky, Klimadiagram 1, Klimadiagram 2, Radioaktivita, Změny teploty a Stíny. Poslední dvě zmíněné aktivity byly vytvořeny na základě PISA úloh, zbylé čtyři jsou výtvorem autorky. Každá aktivita byla zpracována ve formě pracovních listů jednak pro žáky, jednak s řešením a metodickými komentáři pro učitele. Tyto pracovní listy byly otestovány v reálné výuce na gymnáziu a také zhodnoceny učiteli se zkušenostmi s výukou na základní i střední škole. Klíčová slova: PISA, přírodovědná gramotnost, fyzikální experiment, výuka fyziky
|
host ::
RSS.