|
Mechanisms of the induction of taxane resistance in breast cancer cells
Daniel, Petr ; Kovář, Jan (vedoucí práce) ; Vodička, Pavel (oponent) ; Macůrek, Libor (oponent)
Zhruba jeden ze tří lidí čelí v průběhu života nádorovému onemocnění a zhruba každý šestý člověk nádorovému onemocnění podlehne. Nejčastěji diagnostikovaný typ nádoru u žen v celosvě- tovém měřítku je nádor prsu, přibližně postihne 2,2 milionů žen a má na svědomí 685 tisíc úmrtí ročně. Navzdory pokrokům v diagnostice, molekulární biologii a vývoji nový léčiv za účelem per- sonalizované medicíny, úmrtnost způsobená nádory prsu zůstává stejná. Pacienti neodpovídají na léčbu v důsledku rezistence na použitá léčiva. Obecně rozeznáváme mezi nádory již primárně re- zistentními vůči léčbě medikamenty (přirozená rezistence) anebo se může rezistence vyvinout u ná- doru, který byl na danou léčbu původně odpovídající (získaná rezistence). Tato dizertační práce se zabývá mechanismy získané rezistence k taxanům u buněk nádorů prsu. Pokusili jsme se objasnit mechanismy účastnící se rezistence k paclitaxelu a derivátu pacli- taxelu Stony Brook Taxane 0035 (SB-T-0035) a jak tyto mechanismy můžeme překonat. Podařilo se nám identifikovat suspektní geny s rozdílnou expresí na úrovni proteinu mezi buňkami nádorů prsu senzitivními a rezistentními k taxanům. Mezi těmito geny jsme objevili uni- verzální transportér P-glykoprotein (kódovaný genem ABCB1) asociovaný s mnohočetnou lékovou rezistencí. P-glykoprotein se ukázal být...
|
|
Vliv mechanické trombektomie na osud nemocných po ischemické cévní mozkové příhodě
Křivánková, Jana ; Widimský, Petr (vedoucí práce) ; Kováč, Jan (oponent) ; Procházka, Václav (oponent)
Vliv mechanické trombektomie na osud nemocných po ischemické cévní mozkové příhodě Východiska: Mechanická trombektomie je efektivní revaskularizační terapií akutních ischemických iktů způsobených uzávěrem velké mozkové tepny. Cílem mé studie bylo porovnat klinické výsledky pacientů s různými typy uzávěrů velkých mozkových tepen, kteří podstoupili mechanickou trombektomii na Kardiologické klinice Fakultní nemocnice Královské Vinohrady. Metody: Vlastní práce vycházela z monocentrické prospektivní studie PRAGUE-16. Do registru bylo zařazeno celkem 214 pacientů v období 2012 až 2018. Všechny neurointervence byly provedeny na kardiologickém katetrizačním sále za použití stent retrieverů nebo pomocí aspiračních systémů. Klinický výsledek byl kvantifikován pomocí modifikované Rankinovy škály (mRS) s odstupem 3 měsíců. Výsledky: Devadesát tři pacientů (44 %) mělo uzávěr arteria cerebri media (MCA), 28 pacientů (13 %) mělo proximální uzávěr arterie carotis interna (ICA), 27 pacientů (13 %) mělo tandemovou okluzi (ICA+MCA), 39 pacientů (18 %) mělo terminální ICA (T-typ) uzávěr a 26 pacientů (12 %) utrpělo iktus ve vertebrobasilárním povodí (VB). Příznivého klinického výsledku (mRS≤2) ve tříměsíčním sledování dosáhlo 58 % pacientů s uzávěrem MCA a 56 % pacientů s izolovaným uzávěrem ICA. Naopak u pacientů s...
|
| |
|
Úloha signální dráhy oxysterolů v rozvoji solidních nádorů
Spálenková, Alžběta ; Souček, Pavel (vedoucí práce) ; Hodek, Petr (oponent) ; Vondráček, Jan (oponent)
Oxysteroly jsou oxidované deriváty cholesterolu, které hrají významnou roli v patogenezi řady onemocnění, včetně nádorových. Ovlivňují procesy jako je buněčná proliferace, apoptóza, či migrace buněk a mohou také ovlivňovat účinnost některých protinádorových léčiv. Jejich hladina může být rovněž asociována s prognózou onkologických pacientů. Předkládaná dizertační práce shrnuje studie, které na různých úrovních rozšiřují znalosti o významu oxysterolů u karcinomu prsu. V první studii jsme se zaměřili na analýzu genové exprese klíčových faktorů signální dráhy oxysterolů na prognózu pacientek s estrogen receptor (ER) pozitivním typem karcinomu prsu. V rámci výsledků této analýzy jsme odhalili souvislost exprese některých genů s klinicko- patologickými daty pacientek, jako je například stádium dle TNM klasifikace, či stupeň diferenciace onemocnění. Dále jsme odhalili asociaci mezi expresí genu ABCG2 a bezpříznakovým přežíváním pacientek. Avšak pro ostatní geny bude jejich případný prognostický potenciál vyžadovat ověření na rozsáhlejší kohortě pacientek. Druhá studie měla za úkol stanovení hladiny sedmi oxysterolů v plasmě pacientek s ER pozitivním karcinomem prsu. Výsledkem této studie byla asociace hladiny některých oxysterolů s velikostí, či stádiem nádoru. Vyšší hladina cholestan-3β,5α,6β-triolu...
|
|
Mapping of packet processing from P4 Language to FPGA Technology
Kekely, Michal ; Fišer, Petr (oponent) ; Zilberman, Noa (oponent) ; Kořenek, Jan (vedoucí práce)
This thesis deals with the design of novel hardware architectures for packet classification. The main goal is to propose general and flexible hardware approaches capable of classifying packets on high-speed computer networks. The approaches need to be configurable via P4 language description and need to be scaleable to 100 Gbps and faster networks. The thesis starts with an analysis of the current state of the art in packet classification on high-speed networks. Based on the analysis, new architectures for packet classification are proposed. The architectures are designed with scalability, flexibility, and memory efficiency in mind. The goal is to achieve high throughput while maintaining P4-programmability and the ability to carry out general packet classification. Proposed approaches are further optimized and extended to be as efficient as possible. The first architecture uses the DCFL algorithm extended by a parallel TCAM memory, memory duplication and ruleset analysis. The goal is to achieve general packet classification, which has small memory requirements and offer a trade-off between the achieved throughput and the memory requirements. The second proposed approach is more specialized. It optimizes exact match packet classification by leveraging the distributed memories on FPGAs to speed up the Cuckoo hashing algorithm. The main goal is to achieve very high throughputs efficiently. Both approaches are further extended by proposing a caching mechanism that enables efficient external memory usage. Finally, all of the proposed mechanisms are evaluated on real network data, and the achieved results are shown.
|
|
Materiálová analýza vzorků malt z archeologického kontextu baziliky sv. Václava ve Staré Boleslavi
Válek, Jan ; Kozlovcev, Petr ; Svorová Pawełkowicz, Sylwia ; Kotková, Kristýna
Vzorky malt byly popsány pomoci optické mikroskopie a SEM-EDS. Cílem studie bylo jejich vzájemné porovnání. Všechny tři vzorky mají podobnou strukturu i materiálové složení. Surovinou pro výrobu vápna byl jemnozrnný sedimentární vápenec s vysokým obsahem CaCO3. Vápenná matrice má charakter vzdušného vápna. Kromě vápenného pojiva se vyskytuje též prachovojílové pojivo. To je odděleno od vápenného. Zrna písku jsou obalena vápenným pojivem a v meziprostoru je prachovojílová výplň, což ukazuje na přidání této složky jako příměsi do malty až během použití při stavbě. Použitý písek odpovídá místním poměrům, a to jak eolickým pískům (spraším a sprašovým sedimentům) s dominantním výskytem opracovaných křemenných klastů, tak částečně i sedimentům fluviálního původu (zde se jedná především o litoklasty transportované na větší vzdálenost).
|
| |
|
Studium dynamiky snovacího aparátu vybraných zástupců slíďáků (Araneae: Lycosidae) v průběhu jejich životního cyklu
Dolejš, Petr ; Smrž, Jaroslav (vedoucí práce) ; Žďárek, Jan (oponent) ; Hajer, Jaromír (oponent)
Současné znalosti o snovacím aparátu pavouků vycházejí zejména ze studia křižáků a příbuzných čeledí, zatímco snovací aparát slíďáků stál dosud v pozadí zájmu. Proto byl pro studium dynamiky snovacího aparátu v průběhu životního cyklu zvolen právě snovací aparát čtyř zástupců slíďáků. Životní cyklus každého z nich je stenochronní, s podobným počtem instarů (7-10), ale odlišnou délkou životních cyklů (1-3 roky). Všechny čtyři druhy se rozmnožují na jaře nebo v létě. Spermie se začínají tvořit ihned po adultní ekdyzi, přičemž u dvou druhů byl pozorován nezvyklý průběh diplotene. Epigamní chování odpovídá tomu, jaké prostředí ten který druh obývá, průběh kopulace je druhově specifický. Následně byla pozorována ontogeneze snovacího aparátu vyvíjejících se mláďat: Snovací aparát začíná být funkční v prvním instaru. Spigoty sekundárních ampulátních, piriformních a téměř všech aciniformních žláz se nesvlékají in situ, ale střídají s "tartipores", což jsou nefunkční útvary vzniklé po ekdyzi ze spigotu funkčního během předchozího instaru. Objevují se proto až od druhého instaru. Žlázy, jejichž spigoty se střídají s "tartipores", fungují během proekdyze a jejich evoluce souvisí s tím, jak se pavouci během svlékání zajišťují pavučinovými vlákny. Tímto zjištěním byla objasněna dosud sporná funkce aciniformních...
|
|
Regulace exprese biotransformačních enzymů a transportérů placentární bariéry
Stejskalová, Lucie ; Pávek, Petr (vedoucí práce) ; Modrianský, Martin (oponent) ; Vondráček, Jan (oponent)
Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra Farmakologie a toxikologie Kandidát Mgr. Lucie Stejskalová Školitel Doc. PharmDr. Petr Pávek, Ph.D. Název disertační práce Regulace exprese biotransformačních enzymů a transportérů placentární bariéry Placenta je jedinečný orgán komunikace mezi matkou a plodem. Je nezbytná pro udržení těhotenství, vývoj plodu, ochranu plodu a zajišťuje řadu funkcí, především pak výměnu látek a plynů mezi matkou a plodem. Významná je také její endokrinní a metabolická funkce. Klíčovou roli v ochraně plodu hraje vrstva syncytiotrofoblastu, která funguje nejen jako fyziologická bariéra, ale také jako metabolická bariéra díky expresi mnoha biotransformačních enzymů a transportérů. Hladina jednotlivých biotransformačních enzymů se v průběhu těhotenství mění. Většina enzymů má velmi nízké množství mRNA a v některých případech nebyla zjištěna ani jejich významná hladina proteinu či enzymová aktivita. Cytochrom CYP1A1 je jediný placentární enzym metabolizující xenobiotika, jehož exprese a aktivita je signifikantní po celou dobu těhotenství. Navíc se zjistilo, že exprese a aktivita placentárního CYP1A1 je silně indukována u matek kuřaček a v choriokarcinomových buněčných liniích BeWo a JEG-3 při jejich kultivaci s ligandy arylhydrokarbonového...
|
|
Synthesis of photoactive derivatives of phthalocyanines and study of their biological activity
Rychvalská, Lucia ; Zimčík, Petr (vedoucí práce) ; Vícha, Robert (oponent) ; Zitko, Jan (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra: Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Kandidát: Mgr. Lucia Rychvalská Školiteľ: prof. PharmDr. Petr Zimčík, PhD. Dizertačná práca: Syntéza fotoaktívnych derivátov ftalocyanínov a štúdium ich biologickej aktivity Ftalocyaníny (Pc) sú makrocyklické látky s konjugovaným systémom dvojitých väzieb, vďaka ktorému absorbujú svetlo z oblasti 650 - 750 nm. Vyznačujú sa aj vysokou produkciou singletového kyslíka, a preto sú vhodné na použitie pri fotodynamickej terapii ako fotosenzitizéry. Majú ale planárne aromatické jadro, a preto tvoria vo vodnom prostredí neúčinné agregáty. Existuje niekoľko stratégií na zamedzenie agregácie Pc, pričom táto dizertačná práca je zameraná na zamedzenie agregácie pomocou supramolekulárnych interakcií s kukurbiturilom (CB). Subftalocyaníny (SubPc) sú podobné makrocyklické látky zložené z troch (namiesto štyroch) izoindolových podjednotiek s centrálnym atómom bóru, ktorý viaže aj axiálny substituent. Vďaka ich kužeľovitému tvaru a axiálnej substitúcii sú síce vo vode menej agregované, ale často nerozpustné a interakcia s CB by mala spôsobiť zlepšenie týchto vlastností. Prvá časť dizertačnej práce je venovaná syntéze Pc s aminoadamantylovými substituentmi na makrocyklickom jadre v α alebo ...
|