|
|
Temporal gravity changes related to geodynamic phenomena and geomechanical processes
Mrlina, Jan ; Blecha, Vratislav (vedoucí práce) ; Novotný, Oldřich (oponent) ; Pašteka, Roman (oponent)
My Thesis is based on five papers dealing with gravity changes related to various geodynamic, geomechanical and hydrological processes and phenomena. In the first part of the Thesis the gravity changes are defined as a geophysical quantity. The two principal causative parameters are highlighted - variation in elevation of the earth surface, and temporal excess of mass (negative or positive) in the subsurface. I also discuss different groups of parameters and environmental phenomena disturbing the gravity measurements, as the data accuracy is an essential condition of gravity monitoring (4D gravity). I performed a special test with the LaCoste&Romberg D-188 gravimeter in a pressure chamber with notable result showing negligible impact of small and medium size air-pressure variations on this instrument. The calibration stability was proved during two world comparison/calibration campaigns of absolute and relative gravimeters in Sevres, France. The instrument's repeatability was evaluated as 2 μGal (0.02 μm/s 2 ). As well, calibration is being controlled by measurements on the Czech latitude calibration line between Prague and Dolní Dvořiště in South Bohemia. In order to achieve best accuracy we developed special software Drift to control the gravimeter's drift. In principle the software provides a...
|
|
|
Uncoupling of DNA restriction and DNA translocation functions of the Type I restriction modification enzyme EcoR124I
Šišáková, Eva ; Weiserová, Marie (vedoucí práce) ; Janeček, Jiří (oponent) ; Janščák, Pavel (oponent)
4 Lívery l. Miestne cielenou mutagerÉzousme pripravili kolekciu Ínutantovsjednou substitrlciou konzervovanýchaminokyselinových zvyškov v motívochII a III v N.ÍerminálnejónÉne podjednotkyHsdRenzymuEcoRl24I:Dl5lA, El65A, El65D, EI65IIadK167A. r Pozitívnym a negativnym komplementďným tostonrilr ylvo sme zistili' Že všet$ mutantyprejavili fenoýp ťď. r Test restrikcie DNA ',?vjrro potvrdil výsledky in vivo testov,Že Žiadnyz mutantov nebolschopníštiepiťplazmidovúDNA nalineá'muforrnu. r TestviizbovostiDNA (EMSA) neodhalilžiadnevýznamrÉrozďely medzidivolcým a mutantnýmienzýmamiv schopnostiviazaťDNA. r Metóda na meranieATPázovej aktivity,zaloŽeruínapoužitíproteínuviaŽúcehgfosfáL ukázalu Že substituciev motíveII a Itr u váčšinymutantovspÓsobila virc než2. nrásobnúredukciu hydrolýzy ATP. Mutant Kl67A bol jeďný' ktoý prejavil aktivifu porovnatelhús divolcýmenzýmom. r Translokačnýprocesbol analyzovanýdisociácioutriplexu na stopped.fbw fluorimetri a pornocoumagnetickejpinzeý. obe techniky ukázali zntženétranslokďnérýchloati mutantov,rozdiely medzi mutantamia divohým enzýmom boli ešteýraznejšie pri merani na magrretickej pinzete. Pozorovali sme takztiez zmenerrú procesivih1iniciáciua bimoďílnudistribúciuRl ýchlostí. 2. Aminokyselinovézvyšlry Q a Y v motíveQxxxY podjednotkyHsdR boli substituované...
|
|
|
Study of Coniferous Needles in Relation to Environmental Factors Using Approaches of Quantitative Anatomy and Laboratory Spectroscopy
Lhotáková, Zuzana ; Albrechtová, Jana (vedoucí práce) ; Šantrůček, Jiří (oponent) ; Lukac, Martin (oponent)
ZÁVĚRY: Hlavním přínosem práce je kombinace dvou metodických přístupů pro zjištění vlivu faktorů prostředí na různých hierarchických úrovních rostlinné ekologické fyziologie, které jsou využitelné pro terénní studie za účelem porozumění koloběhu uhlíku v lesním ekosystému, s důrazem na jehličnanové porosty. Kvantitativní anatomie reprezentuje první přístup na úrovni lisu. Geometrické parametry mezofylu odhadnuté pomocí nevychýlených stereologických metod se ukázaly jako citlivé indikátory ke sledování změn ve struktuře jehlic vyvolaných podmínkami prostředí jako např. atmosférické znečištění (simulace kyselého deště) nebo diferenciace slunných a stinných jehlic. S využitím systematicky rovnoměrně náhodného výběru zkoumaných řezů jehlicemi byl potvrzen předpoklad, že střední část jehlice mohla být použita jako reprezentativní vzorek pro anatomické analýzy smrkových jehlic. Laboratorní spektroskopie - měření odrazivosti výhonů v laboratorních podmínkách - reprezentuje druhý použitý přístup rostlinné ekologické fyziologie, který je důležitým krokem při kalibraci a ověřování vztahů mezi biochemickým složením listoví a jeho optickými vlastnostmi. Tyto vztahy mohou být následně použity ke sledování fyziologického stavu lesních porostů, chemického složení listoví či půdy pomocí metod dálkového průzkumu Země. V...
|
|
|
Vertebrates of the Lower Palaeozoic from the Barrandian area (Bohemian Massif) and their comparison with faunas of adjacent areas
Vaškaninová, Valéria ; Kraft, Petr (vedoucí práce) ; Přikryl, Tomáš (oponent) ; Trinajstic, Kate (oponent)
Predkladaná dizertácia sa zameriava na fosílne zvyšky raných stavovcov pochádzajúce zo spodnopaleozoických vrstiev barrandienskej oblasti (Český masív). Dizertácia je kompiláciou štyroch vedeckých článkov publikovaných alebo odoslaných k publikácii v recenzovaných časopisoch s impakt faktorom. Všetky publikácie, ktoré tvoria jadro dizertačnej práce, sa zameriavajú na najhojnejšiu a najdiverzifikovanejšiu skupinu stavovcov z barrandienskej oblasti - plakodermy (panciernaté ryby). Plakodermy sú rané rybovité stavovce charakteristické prítomnosťou artikulovaného hlavového a hrudného panciera zloženého z dermálnych kostných dosiek. V barrandienskej oblasti sa vyskytujú výhradne v devóne pražskej panvy. Hlavnými cieľmi dizertácie sú moderné taxonomické revízie taxónov plakoderm z pražskej panvy ako aj diskusie o trendoch v početnosti, diverzite a distribúcii fosílií v čase a priestore, ich tafonómii a evolučných a fylogenetických aspektov ich morfológie. Rozlišujeme dve typické asociácie plakoderm. V lochkove a pragu prevládajú zástupcovia bazálnej skupiny plakoderm Acanthothoraci. Acanthothoraci patria medzi najbazálnejšie čeľustnaté stavovce, a preto má detailné štúdium ich morfológie veľký potenciál osvetliť vzťahy a evolučné vzorce v stem group čeľustnatých stavovcov. Najhojnejšie sú zastúpené v...
|
|
|
Dynamická enantioseparace v kapilární zónové elektroforéze
Dubský, Pavel ; Gaš, Bohuslav (vedoucí práce) ; Kašička, Václav (oponent) ; Gebauer, Petr (oponent)
32 4. ZÁVĚR V rámci diplomové práce byly vytvořeny programy EvalChir pro automatické vyhodnocení elučních profilů s platem a SimulChir pro nalezení zdánlivé rychlostní konstanty interkoncerze počítačovou simulací. Oba programy tak tvoří komplexní řešení pro rychlé a jednoduché vyhodnocení experimentálních dat získaných metodami dynamické enantioseparace. Byla vyvinuta nová metoda pro rozlišení všech čtyř lokálních konstant interkonveze zvlášť v achirální i chirální fázi systému (Obr. 1A). Metoda poskytuje novou možnost studia vlivu CS na rychlost interkonverze. Navržený postup byl úspěšně ověřen experimentálně. Byl navržen nový model popisující interakci analytu s libovolnou směsí CS, včetně interkonverze. Z modelu vyplývá, že jakýkoli multi-CS systém lze popsat vztahy formálně shodnými s popisem single-CS systémů (s jediným CS), pomocí souhrnné distribuční konstanty, souhrnné limitní mobility a souhrnné rychlostní konstanty interkonverze v chirálním prostředí směsi jako celku. Popis je možný dokonce i bez znalosti přesného složení směsi. Na druhou stranu model umožňuje předpovědět chování analytu ve směsi o známém složení. Model byl ověřen experimentálně a získané výsledky potvrdily tyto úvahy. V rámci tohoto modelu byla rovněž vysvětlena značná účinnost multi-CS enantioseparačních systémů mnohdy...
|
|
|
Nové postupy v metabolomické analýze biotekutin
Řimnáčová, Lucie ; Čabala, Radomír (vedoucí práce) ; Feltl, Ladislav (oponent) ; Sýkora, David (oponent)
Předmětem této práce bylo studium reaktivity protických metabolitů s chlormravenčany a jejich využití v metabolomické GC-MS analýze biotekutin. Tento výzkum byl veden ve třech samostatných studiích a jeho výsledkem jsou tři nové, originální metody pro GC-MS stanovení protických nízkomolekulárních metabolitů v biologickém materiálu, především biotekutinách. První studie zkoumá objev rychlé derivatizace alicyklických hydroxylových skupin fluoralkylchlormravenčany (FCF) v bezvodém prostředí [1]. Působením FCF dochází k okamžité přeměně této hydroxylové skupiny na karbonát a tento krok lze snadno spojit s mikroextrakcí kapalina- kapalina (LLME) vznikajících derivátů do organické fáze. Reakce alicyklické hydroxy skupiny s FCF byla testována celkem na 12 klinicky významných steroidech a 4 tokoferolech. Byly popsány analytické vlastnosti zkoumaných analytů a metoda byla validována pro stanovení 6 diagnostických sterolů a 4 tokoferolů v lidském séru a plodové vodě. Nová metoda byla dále úspěšně použita k identifikaci a stanovení sterolů a tokoferolů ve tkáních hmyzu, ruměnice pospolné (Pyrrhocoris apterus) [2]. Druhá studie byla zaměřena na zkoumání reaktivity protických, zejména kyselých močových metabolitů s FCF, především s heptafluorbutylchlormravenčanem (HFBCF). Technikami GC-MS a LC- HRMS byly...
|
|
|
Physiology and ecology of saprotrophic basidiomycetes degrading dead plant biomass
Valášková, Vendula ; Baldrian, Petr (vedoucí práce) ; Tomšovský, Michal (oponent) ; Koukol, Ondřej (oponent)
Souhrn Práce se zabýví saprotrofními basidiomycety rozklrádajícímiodumřelou rostlinou biomasu, ktere se qýraznou měrou podílí na rozkladu orgarricke hmoty v půdě a tím i na koloběhu uh]ftu a minerráJníchlátek v prostředí. Pozornost je věnována jejich roli při degradaci opadu a dřeva a jejich vlivu na mikrobirí.lníspolďenstvo. V experimentech byly pouŽity tři basiďomycete izolovarréz opadu dubového |esa: Hypholomo fascicularc, Rhodocolly- bi'a butyracca a Gwnoplls sp. Ačkoli všechny tři kmeny degradovaly duboqý opad za sterilních i nesterilních podmínek, rychlost degradace a produkce extracelulárních enzymů zodpovědných za degradaci se mezi jednotliqimi izoláty qý'razně lšila. Všeobecně však bylo možno rozklad způsobenýtěmito houbami přirovnat k typu rozkladu způsobeného houbami bíléhniloby. Všechny izoláty produkovaly lakáau, ma.nganovou perofdázu, en. doglukarrázu, endoxylanáa, y'.glukozidrízu a B-rylozidrázu' Díky lokráJnímuvýskytu mohly tyto houby způsobit prostorovou variabilitu širokéhospektra produkovaných enzymových aktivit. Prostorovi{ variabilita enzymových aktivit byla v ruzných hloubkrích horizontu pozorována současněs mlrožstvímhoubové biomasy a rovněž se složenímmikrobiálního společenstva. Gradient těchto veličin byl pozorovatelný v měřítku menšímnežjsou jed. notlivé půdníhorizonty' Houby během...
|
|
|
Bordetella Adenylate Cyclase: Molecular mechanism of Action and Its Use for Antigen Delivery
Kamanová, Jana ; Šebo, Peter (vedoucí práce) ; Dráber, Petr (oponent) ; Černý, Jan (oponent)
(Czech) 6 SUMMARY (Czech) První část této dizertační práce se věnuje molekulárnímu mechanismu působení adenylát-cyklázového toxinu (CyaA). Tento protein z rodiny RTX toxinů je sekretovaný gramnegativní bakterií Bordetella pertussis, která způsobuje infekční onemocnění nazývané černý kašel. CyaA hraje klíčovou roli ve schopnosti tohoto patogena kolonizovat sliznice horních cest dýchacích a to díky schopnosti potlačovat baktericidní funkce myeloidních fagocytujících buněk imunitního systému hostitele. CyaA se váže na integrin CD11b/CD18 (označovaný také jako CR3 nebo αMβ2) těchto buněk, vytváří v jejich buněčných membránách malé kation-selektivní kanály, a dopravuje do jejich cytozolu N-koncovou adenylát- cyklázovou (AC) doménu. Ta je po svém průniku do buněčného cytozolu aktivována navázáním eukaryotického kalmodulinu a katalyzuje velmi efektivní přeměnu ATP na cAMP, jednu z klíčových molekul buněčné signalizace. Tím dochází v napadených buňkách k nárůstu hladiny cAMP, což vyvolá rychlou ztrátu schopností fagocytózy pomocí Fc-receptorů a oxidativního vzplanutí těchto buněk. CyaA má unikátní schopnost přenášet svou AC doménu do cytozolu buněk přímo z cytoplazmatické membrány. Celý proces je velmi pravděpodobně poháněn membránovým potenciálem, a vyžaduje strukturní integritu a kooperaci všech domén RTX...
|
|
|
Magmatic and Volcanic Evolution of the Doupovské hory Volcanic Complex
Rapprich, Vladislav ; Holub, František (vedoucí práce) ; van Wyk de Vries, Benjamin (oponent) ; Renno, Axel D. (oponent)
Magmatický a vulkanický vývoj vulkanického komplexu Doupovských hor Abstrakt Vulkanický komplex Doupovských hor (DHVC) se nachází v západní části oherského riftu. Ten probíhá ve směru severovýchod-jihozápad severozápadní částí českého masivu. Oherský rift sleduje variskou suturu mezi saxothuringikem a tepelsko-barrandienskou oblastí. DHVC tvoří alkalické horniny složením a pozicí podobné dalším komplexům kenozoického vnitrodeskového vulkanizmu střední a západní Evropy (CIMACi). Vulkanická aktivita komplexu Doupovských hor začala v nejspodnějším oligocénu a trvala až do spodního miocénu. Vulkanická aktivita byla opakovaně přerušována periodami rozpadu sopečného horstva. Magmatická aktivita trvala zhruba 14 milionů let a vytvořila vulkanický komplex o mocnosti 600-1000 m. Erupční sty rané explozivní aktivita DHVC je klasifikován jako strombolský až subpliniovský a freatomagmatický. Erupce uložily asi 80 m vulkanoklastik. Stáří této počáteční aktivity je datováno paleontologicky do nejspodnějšího oligocénu. Následná vulkanická aktivita byla mnohem klidnější a převažovaly výlevy láv nad pyroklastiky. Růst raného sopečného masivu kulminovala intruzí doupovského intruzivního komplexu před 30-29 miliony let. Intruzi tvoří essexit, foidový mikrosyenit, melteigit, ijolit, urtit a další podobné horniny. Tento raný...
|
|
|
Organellar DNA diversity in some ornamental plants related to reproduction system and life strategy
Osama Mohamed Elansary, Hosam ; Štorchová, Helena (vedoucí práce) ; Bureš, Petr (oponent) ; Chrtek, Jindřich (oponent)
124 7. Conclusions The purpose of this Ph.D. work was oriented towards two points. 1. The analysis of organellar diversity among three plant species (Silene vulgaris, Silene latifolia and Aldrovanda vesiculosa). The three plant species had different morphological and physiological characters. The focus here was on two physiological points. 1.1. The reproduction system which is directly correlated with the mitochondrial DNA (in the case of CMS). This point was presented in the comparison between Silene vulgaris and Silene latifolia. 1.2. The different life strategy which is directly correlated with the organellar DNA diversity. This point was presented by the comparison between the two Silene species from one side and Aldrovanda vesiculosa from the other side. The later usually propagate vegetatively and live in different media (water), it present different life strategy under the umbrella of angiosperms. 2. The analysis of the inheritance of mitochondrial and chloroplast genome in Silene vulgaris. The study of this inheritance was facilitated by the high polymorphism available in the organellar DNA. This polymorphism could be detected by the different molecular markers used in this study. These molecular markers included either, gene coding regions markers previously used by D.E.McCauley and his team...
|
host ::
RSS.