2025-04-20
01:12 |
Studium struktury a interakcí proteinů pomocí hmotnostní spektrometrie - vývoj metod a jejich aplikace.
Slavata, Lukáš ; Man, Petr (vedoucí práce) ; Hernychová, Lenka (oponent) ; Nováková, Zora (oponent)
Studium struktury, dynamiky a mechanismů interakce komplexů proteinů a nukleových kyselin je i přes významný rozvoj metod strukturní biologie velmi náročným procesem, což ilustruje i stále relativně malý počet publikovaných struktur, který neodpovídá jejich biologickému významu, stejně jako jejich roli v biologii nádorového bujení. Strukturní hmotnostní spektrometrie ve spojení s molekulárně dynamickým modelováním se jeví jako technika s vysokým potenciálem některé chybějící informace doplnit. V této disertační práci se zabývám možností synergické aplikace palety strukturně proteomických technik kombinující vodík-deuteriovou výměnu, kvantitativní protein- proteinové sítění, protein-DNA sítění a homologního modelování za účelem získání strukturní informace a mechanismech vazby v komplexech rozpoznávané DNA a transkripčních faktorů FOXO4 a TEAD1. Paralelně s vývojem experimentálních technik byl vyvíjen i program LinX, určený ke zpracování dat získaných z experimentů kvantitativního sítění, jehož použitelnost byla rozšířena o možnost zpracování dat ze sítění nukleových kyselin a jejich komplexů s proteiny, a ověřena na modelovém systému komplexu DNA vazebné domény FOXO4 s DNA. Výsledky potvrdily charakteristickou strukturu DNA vazebné domény FOXO4, typickou pro faktory rodiny FOX, avšak naznačily, že...
Detailed record
|
2025-04-20
01:12 |
Hormonal and developmental regulation of sex-specific traits in squamate reptiles
Bauerová, Anna ; Kubička, Lukáš (vedoucí práce) ; Vrtílek, Milan (oponent) ; Kupfer, Alexander (oponent)
Otázka mechanismů pohlavního dimorfismu - zejména pokud jde o rozdíly ve velikosti těla specifické pro jednotlivá pohlaví a typicky samčí znaky, jako jsou zbarvení a chování - neustále přitahuje pozornost vědců. Tato disertační práce zkoumá jednotlivé prvky pohlavního dimorfismu u plazů pomocí hormonálních experimentů na modelových druzích šupinatých plazů, jako jsou chameleon jemenský (Chamaeleo calyptratus) a hroznýšek pestrý (Eryx colubrinus) a pomocí růstového experimentu na gekonovi madagaskarském (Paroedura picta), kde byl zkoumán vliv hormonů a maternálního efektu na pohlavní dimorfismus ve velikosti těla. V případě Chamaeleo calyptratus naše výsledky naznačují, že vývoj pohlavního dimorfismu je řízen spíše feminizací ovariálními hormony než maskulinizací prostřednictvím androgenů. U gekona Paroedura picta se ukázalo, že i když je růst z počátku výrazně ovlivněn maternálním efektem, výsledná konečná velikost těla není tímto efektem nijak determinována. Dále se ukázalo, že potravní chování může být ovlivněno pohlavními hormony a významně tak přispět k pohlavnímu dimorfismu ve velikosti těla, což potvrzují nedávná zjištění u Eryx colubrinus. V neposlední řadě naše hormonální manipulace s Chamaeleo calyptratus odhalily, že testosteron významně ovlivňuje agresivní a námluvní chování, stejně jako...
Detailed record
|
2025-04-20
01:12 |
Early evolution of land plants in the Silurian with special respect to the Prague Basin (Barrandian area, Czech Republic)
Uhlířová, Monika ; Pšenička, Josef (vedoucí práce) ; Krings, Michael (oponent) ; Wellman, Charles (oponent)
Předkládaná disertační práce je zaměřena na výzkum fosilních dokladů suchozemských rostlin v období siluru ze sedimentů pražské pánve, která v kontextu dokumentace vývoje rané flóry představuje lokalitu světového významu. Podstatnou část práce tvoří úvodní pojednání seznamující s daným tématem, na jehož závěru jsou shrnuty dosavadní výsledky studie ze čtyř recenzovaných publikací. Vznik suchozemských rostlin představoval zásadní událost, která přispěla k utváření globálního ekosystému a umožnila rozvoj terestrických forem života. K přechodu rostlin na souš došlo s jistotou nejpozději v průběhu ordoviku, kdy si řasoví předci vytvořily nezbytné adaptace, které jim umožnily úspěšnou kolonizaci pevniny. Jednotlivé etapy procesu terestrializace a vývoje této rané suchozemské flóry jsou rekonstruovány na základě dochovaného mikro- a makrofosilního záznamu. Nálezy makrofosilií z období siluru poskytují již jistou představu o podobě zástupců těchto rostlin, přičemž vůbec nejstarší pochází z paleontologicky významné oblasti pražské pánve. Předmětem této disertační práce je zmapování raných dokladů evoluce suchozemských rostlin prostřednictvím studia rostlinných makrofosilií ze silurských uloženin pražské pánve. Předmětem tří publikovaných studií (Přílohy 2 až 4) jsou detailní morfologické popisy dvou...
Detailed record
|
2025-04-20
01:12 |
Predictors and correlates of altruism in humans from the evolutionary viewpoint
Nekola Nováková, Julie ; Flegr, Jaroslav (vedoucí práce) ; Frynta, Daniel (oponent) ; Lindová, Jitka (oponent)
Prediktory a koreláty altruismu u lidí z evolučního hlediska Julie Nekola Nováková ABSTRAKT Altruismus již dlouho představuje svého druhu evoluční záhadu, jelikož toto chování - kdy jedinec pomáhá druhému na vlastní náklady - se z hlediska přírodního výběru jevilo jako nevýhodné. Otázka zní: jak mohou jedinci (nebo jejich alely) altruismem maximalizovat svou fitness, aby se toto chování mohlo v populaci dlouhodobě udržet? Evoluci altruismu se snaží vysvětlit více hypotéz, přičemž nejčastěji se uvažuje o příbuzenském výběru, reciprocitě, pohlavním výběru a interdemickém/víceúrovňovém výběru. Každá z těchto hypotéz poskytuje různé předpovědi, co by mělo ovlivňovat výskyt a rozsah altruistického chování v dané populaci a u konkrétních jedinců. Přestože kolem těchto teorií existuje rozsáhlá literatura, jen málo prací se je pokusilo navzájem přímo porovnat prostřednictvím experimentálního testování. Cílem této práce je zaplnit tuto mezeru a prostřednictvím několika studií provedených mnou ve spolupráci s kolegy(němi) otestovat různé předpovědi, které s sebou nesou teorie recipročního altruismu, nákladné signalizace v kontextu pohlavního výběru a manipulační hypotézy. Studie byly provedeny jako laboratorní experimenty i rozsáhlejší online průzkumy a převážně zahrnovaly experimentální hry (hry na diktátora a...
Detailed record
|
2025-04-20
01:12 |
Náhrada nemajetkové újmy v případě zásahu do tělesné a duševní integrity člověka
Široká, Lucie ; Salač, Josef (vedoucí práce) ; Holčapek, Tomáš (oponent) ; Psutka, Jindřich (oponent)
Náhrada nemajetkové újmy v případě zásahu do tělesné a duševní integrity člověka Odčinění dalších nemajetkových újem Abstrakt Disertační práce se soustředí na náhradu nemajetkové újmy v případě zásahu do tělesné a duševní integrity člověka. Konkrétně se zabývá problematickou odčinění dalších nemajetkových újem. Další nemajetkové újmy představují kategorii nemajetkové újmy, která byla do českého právního řádu zavedena s účinností zákona č. 89/2012 Sb., občanský zákoník, od 1. 1. 2014. Hlavním záměrem práce je analyzovat koncept dalších nemajetkových újem, objasnit jejich postavení vedle tradičních kategorií, kterými jsou bolesti a ztížení společenského uplatnění, a poskytnout vodítka pro určení jejich obsahu a správné uplatňování a posuzování souvisejících nároků. Práce je strukturována do tří hlavních kapitol. První kapitola se věnuje obecnému pojetí zdraví, definici zdraví, vymezení zdraví jakožto osobnostního práva, resp. statku chráněného všeobecným osobnostním právem. Druhá kapitola se zaměřuje na hypotézu § 2958 zákona č. 89/2012 Sb., občanský zákoník, resp. na naplnění hypotézy. Vznik práva na náhradu dalších nemajetkových újem totiž předpokládá ublížení na zdraví. Třetí, stěžejní kapitola, se pak detailně zabývá dalšími nemajetkovými újmami jakožto samostatnou kategorií újmy na zdraví. Disertační...
Detailed record
|
2025-04-20
01:12 |
Detailed record
|
2025-04-20
01:12 |
O původu organických aerosolů v ČR
Lhotka, Radek ; Schwarz, Jaroslav (vedoucí práce) ; Hovorka, Jan (oponent) ; Navrátil, Tomáš (oponent)
V průběhu let se ukazuje, že chemické složení atmosférického aerosolu (AA) má zásadní vliv jak na lidské zdraví, tak na celou řadu jevů probíhajících v atmosféře. Snaha o popis chování AA proto neustále roste, avšak celé řadě procesů stále nerozumíme tak, abychom byli schopni osud AA a zejména organického aerosolu (OA) v atmosféře dostatečně předpovídat. Tato dizertační práce popisuje zejména chemické složení, velikostní distribuci a zdroje jemného aerosolu měřeného pomocí aerosolového hmotnostního spektrometru (AMS) a aethalometeru. Dále je zaměřena na studium vlivu meteorologických parametrů na chování AA a na určování zdrojů OA. Za účelem identifikace zdrojů OA s ohledem na sezónnost na pozaďové venkovské stanici Národní atmosférické observatoři Košetice (NAOK - 49ř34'24"N, 15ř4'49"E, 534 m n. m.) probíhala měření AA v roce 2019. Zimní kampaň od 8.1. do 6.3, jarní od 12.3. do 31.5., letní od 4.7. do 23.8. a podzimní od 1.9. do 14.10. Za účelem rozdělení OA na různé faktory byla aplikována metoda pozitivní maticové faktorizace (PMF) spolu s multilineární metodou (ME-2) a metoda rolování (Rolling PMF). Výsledky tohoto modelování jsou hlavní částí předkládané práce (Publikace č. 1 a 2). Třetí publikace se zabývá literární rešerší metody aerosolové hmotnostní spektrometrie a aplikačními možnostmi...
Detailed record
|
2025-04-20
01:12 |
Detailed record
|
2025-04-20
01:12 |
Metabolic changes in first episode of psychosis: Effects of antipsychotic medications
Vochosková, Kristýna ; Hájek, Tomáš (vedoucí práce) ; Vevera, Jan (oponent) ; Papežová, Hana (oponent)
Úvod: Velké množství jedinců s diagnózou schizofrenie v současné době umírá na komplikace kardiovaskulárních onemocnění, které jsou úzce spojené s metabolickým syndromem a obezitou. Pro lepší porozumění vztahu antipsychotik k časným změnám hmotnosti a metabolických parametrů jsme se zaměřili na pacienty s FEP v prvních dnech jejich hospitalizace a systematicky kvantifikovali jejich denní expozici antipsychotické medikaci (AP) v prostředí českých psychiatrických nemocnic. Metody: Do studie jsme zařadili pacienty s první epizodou psychózy (FEP, N=173) během jejich první psychiatrické hospitalizace a porovnali je se zdravými kontrolami (N=204). V prospektivním sledování jsme sbírali data o hmotnosti, BMI, metabolických parametrech a denní expozici AP při přijetí a během výzkumné vizity v průběhu téže hospitalizace. Při detailní analýze léčby jednotlivých pacientů jsme prostřednictvím kvantifikace různých léčebných scénářů hledali další potenciální faktory, které by mohly mít vliv na změny BMI. Výsledky: Během prvních 44,6 dnů hospitalizace jsem u pacientů s FEP zaznamenali průměrný příbytek na váze o 0,97 ± 2,26 BMI bodů/ 3,46 ± 7,81 kg. Vyšší expozice AP byla spojena s vyšším přírůstkem BMI, avšak pouze u osob s normálním/nižším výchozím BMI. Dále byly identifikovány další faktory ovlivňující nárůst...
Detailed record
|
2025-04-20
01:12 |
Studium genetického pozadí solidních tumorů
Hálková, Tereza ; Bendlová, Běla (vedoucí práce) ; Eckschlager, Tomáš (oponent) ; Souček, Pavel (oponent)
Abstrakt Disertační práce pojednává o rozdílných metodických přístupech detekce různých genetických alterací u tří typů solidních nádorů: štítné žlázy, kolorekta a slinivky břišní. Moderní onkologický výzkum se na znalosti somatických genetických alterací v nádorovém ložisku zakládá. Tato znalost, krom toho, že vědcům poskytuje představu o příčině vzniku nádorů, má největší přínos v tom, že může významně ovlivnit léčbu konkrétního nádoru, respektive pacienta. Specifické genetické alterace dokážou totiž předpovědět prognózu pacienta nebo umožňují využít k terapii molekulárně cílenou léčbu, tzv. biologickou léčbu, nejčastěji ve formě inhibitorů onkoproteinů vzniklých expresí mutovaných genů. Další úrovní je pak využití konkrétních genetických alterací pro detekci tzv. volné nádorové DNA (ctDNA, z angl. circulating tumor DNA), která se vyskytuje v krvi onkologických pacientů. Analýza ctDNA v periferní krvi pacientů, označovaná také jako "tekutá biopsie", je aktuálně velmi atraktivním přístupem, který umožňuje neinvazivní sledování průběhu léčby pomocí stoupajících či klesajících hladin ctDNA, a to prakticky kdykoliv je potřeba. V této práci se zaměřuji pouze na nejdůležitější poznatky a výsledky získané během svého působení v onkologickém výzkumu solidních nádorů, které dokládám příslušnými...
Detailed record
|
|
|
|
guest ::
