2024-11-26
10:53 |
Fenotyp vaskulární rejekce po transplantaci ledviny a izolovaná v-léze
Novotný, Marek ; Viklický, Ondřej (vedoucí práce) ; Havlín, Jan (oponent) ; Orság, Jiří (oponent)
disertační práce Fenotyp vaskulární rejekce po transplantaci ledviny a izolovaná v-léze Autor: MUDr. Marek Novotný Školitel: prof. MUDr. Ondřej Viklický, CSc Úvod: Intimální arteritida, v léze (v), je morfologickým podkladem vaskulární rejekce. Je současně řazena mezi diagnostická kritéria buňkami zprostředkované rejekce (TCMR), protilátkami zprostředkované rejekce (ABMR) a také může být způsobena ischemicko reperfuzním poškozením s morfologií izolované v-léze (IV). Prognóza transplantovaných ledvin je v těchto případech významně odlišná. Správná diagnostika, ke které přispěly i metody transkriptomické analýzy, je nezbytná pro volbu terapie odpovídající druhu poškození. Metody: Databázovou analýzou jsme identifikovali četnost a prognostický význam jednotlivých fenotypů vaskulární rejekce. V následné prospektivní části byly provedeny kontrolní biopsie ke zhodnocení reakce na terapii. Pomocí microarray analýzy bioptických vzorků jsme porovnávali rozdílně regulované transkripty u IV a TCMRV. Výsledky: Ve dvou postupně analyzovaných souborech pacientů (celkový počet 1896 osob) transplantovaných v letech 2010-2014 a následně 2014-2017 bylo identifikováno 25 pacientů s IV, 44 TCMRV, 36 ABMRV a 65 suspektních z ABMRV. Tříleté přežívání transplantovaných ledvin ve skupině TCMRV bylo více než 90 % a ve...
Úplný záznam
|
2024-11-26
10:53 |
Regulation of canonical Wnt signaling
Šopin, Tijana ; Vacík, Tomáš (vedoucí práce) ; Šeda, Ondřej (oponent) ; Stixová, Lenka (oponent)
Přesná rovnováha kanonické Wnt signalizace je klíčová pro různé biologické procesy a její narušení může vést k vývojovým abnormalitám nebo onemocněním. Naše studie ukazuje, že alternativní izoformy KDM2A a KDM2B lysin demetyláz (KDM2A/B) hrají roli v negativní regulaci kanonické Wnt signalizace. Tyto izoformy (KDM2A-SF a KDM2B-SF) postrádají N- terminální demetylázovou doménu, ale zachovávají si schopnost vázat se na CpG ostrůvky v promotorech a interagovat s jejich proteinovými partnery prostřednictvím jiných funkčních domén. Pozorovali jsme, že KDM2A-SF a KDM2B-SF se vážou na promotory genů AXIN2 a CYKLIND1, dvou cílových genů kanonické Wnt signalizace, a potlačují jejich aktivitu. Kromě toho KDM2A- SF i KDM2B-SF silně potlačují luciferázový reportér kanonické Wnt aktivity. Transkripční represe zprostředkovaná skrze KDM2A-SF a KDM2B-SF je závislá na jejich DNA vazebné doméně, zatímco N-terminální demetylázová doména není pro tento proces nezbytná. Je zajímavé, že KDM2B nedokáže potlačit promotory jak endogenních cílových genů kanonické Wnt signalizace, tak luciferázového Wnt reportéru. Dále jsme ukázali, že jak KDM2A/B, tak jejich krátké izoformy interagují s TCF7L1, jedním ze čtyř transkripčních mediátorů kanonické Wnt signalizace. Navzdory zásadní roli transkripčních faktorů TCF/LEF v kanonické...
Úplný záznam
|
2024-11-26
10:52 |
Integrace molekulární onkologie a in silico metod pro návrh preventivních opatření v chemoterapii nádorů prsu
Kováčová, Mária ; Souček, Pavel (vedoucí práce) ; Anzenbacherová, Eva (oponent) ; Slanař, Ondřej (oponent)
Karcinom prsu, geneticky heterogenní onemocnění, zůstává u žen hlavní příčinou úmrtí, a přestože mortalita postupně ale pomalu klesá, incidence opětovně roste. Terciární a kvartérní prevence se zabývá studiem genetických rozdílů u pacientů a účinků chemoterapie. Základní hypotéza pro tuto práci vychází z předpokladu evolučně, populačně a funkčně odlišných genetických variant v lidském genomu, které jsou veřejně dostupné v celosvětových databázích a využitelné pro další studie. Hypotéza je již využívaná v řadě bioinformatických nástrojů a hlavním cílem této disertační práce bylo studium dostupných databází a bioinformatických nástrojů k usnadnění zpracování velkého množství farmakogenomických dat. Prostřednictvím masivního paralelního sekvenování jsme u českých pacientek s karcinomem prsu vyhodnotili časté zárodečné kódující a nekódující varianty panelu složeného z 509 genů, které mají vztah k metabolismu a eliminaci léčiv, k funkci buněčné smrti či signálních drah v klinické onkologii, za pomoci nových in silico nástrojů a zavedených farmakogenomických databází. Prioritizované varianty byly technicky a klinicky validovány na souboru 805 pacientek. Asociace rs2227291 v ATP7A, rs2293194 v KCNAB1 (u pacientek v časném stadiu) a rs4376673 v DFFB s odpovědí na neoadjuvantní cytotoxickou léčbu poskytují...
Úplný záznam
|
2024-11-26
10:52 |
Variational strategies in material sciences: Analysis & Numerics
Češík, Antonín ; Schwarzacher, Sebastian (vedoucí práce) ; Kružík, Martin (oponent) ; Stefanelli, Ulisse (oponent)
V této práci ukážeme aplikaci metody hyperbolických minimalizujících pohybů na dynamické problémy v mechanice kontinua. V prezentovaných článcích se zabýváme libovolně deformujícími se viskoelastickými pevnými látkami s kolizemi, interakcemi mezi tekutinou a pevnout látkou se smykem, a také kompletní časovou diskretizací tohoto přístupu. Nejprve dokážeme existenční větu pro nelineární viskoelastická tělesa v režimu velkých deformací s libovolnými kolizemi. K tomu zkonstruujeme fyzikálně správnou kontaktní sílu jakožto míru. Tento výsledek je rozšířen i pro tělesa s pouze Lipschitzovsky reugulární hranicí. Dále zkoumáme verzi schématu hyperbolických minimalizujících pohybů, která je plně diskrétní v čase. Zde dokážeme stabilitu a lineární rychlost konvergence. Tento výsledek je prezentován v kontextu nelineární elastodynamiky. Nakonec ukážeme existenci slabých řešení pro nelineární viskoelastickou pevnou látku plné dimenze spojenou s Navier-Stokesovou rovnicí přes podmínkou smyku na rozhraní tekutiny a pevné látky. Poskytneme potřebné třídy testovacích funkcí pro slabé řešení a také ukážeme jeho konzistenci s odpovídající silnou formulací. 1
Úplný záznam
|
2024-11-26
10:52 |
Study of pharmacodynamics and pharmacokinetics of potentially therapeutic substances in an experimental model of non-alcoholic fatty liver disease and steatohepatitis (NAFLD/NASH)
Arora, Mahak ; Canová, Nikolina (vedoucí práce) ; Hodek, Petr (oponent) ; Kučera, Otto (oponent)
Úvod a cíle: Nealkoholické ztukovatění jater a steatohepatitida (NAFLD/NASH), pokud nejsou léčeny, vedou k jaterní fibróze, cirhóze a karcinomu. Vzhledem k absenci specifické farmakologické léčby NASH jsme se soustředili na studium několika molekulárních cílů, jakými jsou mTOR ("mammalian target of rapamycin"), SREBP ("sterol regulatory element- binding protein") a galaninergní systém, potenciálně ovlivňujících energetický metabolismus glukózy a lipidů. Cílem práce bylo prozkoumat možné pozitivní farmakologické účinky inhibitoru mTORC1/C2 - Ku-0063794 (KU), inhibitoru SREBP1/2 - fatostatinu (FAT) a modulátoru galaninergního systému - celastrolu (CEL) v preklinických modelech NAFLD/NASH. Metody a výsledky: KU, FAT a CEL zmírnily in vitro lipotoxicitu indukovanou kyselinou palmitovou v primárních buněčných kulturách hepatocytů. V pilotní farmakokinetické in vivo studii KU vykazoval vyšší biologickou dostupnost po intraperitoneálním (i.p.) než perorálním podání. Ve všech farmakodynamických studiích byli samci myší C57BL/6 krmeni vysokotučnou dietou západního typu (WD) s fruktózou a glukózou (FG) v pitné vodě po dobu 8-16 týdnů, aby se indukovala NAFLD/NASH, a následně jim byly aplikovány jednotlivé látky i přes pokračující WD/FG dietu. KU (5 mg/kg i.p. denně po dobu 3 týdnů nebo 3krát týdně po dobu 16...
Úplný záznam
|
2024-11-26
10:52 |
Krizová připravenost nemocnic v ČR - anylýza stávajícího stavu a vývoj metodického doporučení
Michenka, Petr ; Marx, David (vedoucí práce) ; Cetlová, Lada (oponent) ; Navrátil, Leoš (oponent)
Univerzita Karlova 3. lékařská fakulta Praha Autoreferát dizertační práce Krizová připravenost nemocnic v ČR - analýza stávajícího stavu a vývoj metodického doporučení MUDr. Petr Michenka Praha, 2024 Doktorské studijní programy v biomedicíně Univerzita Karlova a Akademie věd České republiky Obor: Preventivní medicína a epidemiologie Předseda oborové rady: doc. MUDr. Jan Polák, Ph.D. Školicí pracoviště: Kabinet veřejného zdravotnictví 3. lékařské fakulty Univerzity Karlovy Autor: MUDr. Petr Michenka Školitel: MUDr. David Marx, Ph.D. Oponenti: doc. PhDr. Lada Cetlová, Ph.D. prof. MUDr. Leoš Navrátil, CSc., MBA, dr. h. c. Autoreferát byl rozeslán dne: Obhajoba se koná dne: S dizertací je možno se seznámit na děkanátu 3. lékařské fakulty Univerzity Karlovy Abstrakt Dizertační práce je zaměřena na rozbor situace aktuálně panující v oblasti krizové připravenosti u poskytovatelů akutní lůžkové péče v České republice. Opatření v oblasti přípravy na neočekávané scénáře, které mohou negativně ovlivnit chod zdravotnických zařízení, by totiž měly tvořit nedílnou část provozní i organizační struktury zdravotnických zařízení. Tomuto tématu nicméně dosud v České republice nebyl přikládán adekvátní význam. Cílem práce proto bylo zmapovat současný stav a popsat platný legislativní rámec zastřešující krizovou připravenost u...
Úplný záznam
|
2024-11-26
10:51 |
Microbial Genomics for Population Studies of Multiresistant Gram-Negative Bacteria
Finianos, Marc ; Bitar, Ibrahim (vedoucí práce) ; Žemličková, Helena (oponent) ; Lengerová, Martina (oponent)
Karbapenemázy produkující Enterobacterales (CPE) se staly globálním zdravotním problémem, zejména kvůli jejich spojení s infekcemi získanými v nemocnicích, což významně omezuje možnosti léčby, neboť tyto bakterie vykazují rezistenci vůči mnoha antibiotikům. Ve většině případů se tato rezistence šíří enzymy mezi druhy a klony, přičemž zásadní roli v tomto procesu hrají plazmidy a další mobilní genetické prvky. Cílem této práce je proto charakterizovat mechanismus rezistence vůči karbapenemům a identifikovat mechanismy jejího šíření. Použitá metodologie zahrnuje identifikaci bakteriálních druhů a genů kódujících karbapenemázové enzymy, sekvenování krátkých úseků DNA a následné sekvenování dlouhých úseků DNA, které poskytuje kompletní genom s kruhovými plazmidy. To umožňuje detailní analýzu plazmidů a mobilních genetických prvků podílejících se na šíření genů rezistence. Další analýzy zahrnují studium SNPs, tvorbu fylogenetických stromů s genomy dostupnými v databázích a další. Výsledky ukázaly, že šíření některých genů, jako je blaKPC, bylo spojeno s přenosem plazmidů, což je dáno jejich konjugativní povahou. Dále bylo zjištěno, že šíření blaVIM v České republice bylo převážně spojeno s integronem In110, přičemž plazmidy také přispívaly k jeho šíření. Naopak u izolátů s genem blaGES bylo zjištěno,...
Úplný záznam
|
2024-11-26
10:51 |
Estetická syntéza Theodora W. Adorna. Subverzivní aspekt umění a jeho sociální rozměr
Muchová, Sabrina ; Bulvas Stejskal, Jakub (vedoucí práce) ; Ritter, Martin (oponent) ; Hauser, Michael (oponent)
Předmětem této práce je zkoumání problematiky sociálně-kritického významu umění v estetické koncepci Theodora W. Adorna. K tématu přistupuji prostřednictvím rekonstrukce pojmu estetické syntézy; ten se sice v Adornově Estetické teorii i v interpretacích Adornovy estetiky objevuje spíše okrajově, ve své práci však ukazuji, že velmi dobře zastřešuje dvě linie Adornova uvažování o způsobech, jakými se umělecká díla mohou kriticky vymezovat vůči společnosti. Zaprvé jde o Adornovo tvrzení, že umělecká díla kritizují společenský systém skrze svůj vlastní rozum. Zadruhé se jedná o Adornovo přesvědčení, že svého sociálního významu dosahují umělecká díla výhradně skrze své formální, estetické prostředky. Z perspektivy estetické syntézy coby principu vlastního uměleckým dílu pak v práci vysvětluji Adornovo chápání utopického a subverzivního aspektu umění. Klíčová slova Theodor W. Adorno; kritická teorie; estetická syntéza; utopie; umění a společnost
Úplný záznam
|
2024-11-26
10:51 |
Is adolescence a critical period for drug addiction in the laboratory rat?
Čechová, Barbora ; Šlamberová, Romana (vedoucí práce) ; Páleníček, Tomáš (oponent) ; Svoboda, Jan (oponent)
Metamfetamin (MA) je syntetický psychostimulant, který je jednou z nejčastěji zneužívaných drog na světě. Patří do skupiny amfetaminů a jeho obliba je založena na četných rychle nastupujících stimulačních účincích, jako je zvýšená pozornost, zvýšená energie, snížená chuť k jídlu atd. Z dlouhodobého hlediska má však tato droga velmi závažné důsledky pro duševní a fyzické zdraví osob. Dlouhodobé užívání MA způsobuje závažné poškození funkce centrálního nervového systému (CNS) a s tím související změny chování. Na základě své chemické podobnosti s monoaminovými neurotransmitery MA interaguje s jejich příslušnými receptory a transportéry. Tento jev způsobuje trvalé poškození terminálních zakončení neuronů prostřednictvím rozvoje oxidačního stresu, neurozánětu a následně apoptózy. Užívání MA tak způsobuje různé poruchy chování, jako jsou deprese, psychózy, a přispívá ke vzniku Alzheimerovy a Parkinsonovy choroby. Užívání těchto léků může mít velmi závažný dopad v kritických vývojových obdobích, což jsou období, kdy určité části mozku a celého těla procházejí intenzivním vývojem. Narušení těchto procesů může mít nevratné následky. Tyto drogy jsou velmi často zneužívány těhotnými ženami, které si je oblíbily pro jejich stimulační účinky. Bylo zjištěno, že užívání MA těhotnými ženami má negativní vliv na...
Úplný záznam
|
2024-11-26
10:51 |
Preventivní a prediktivní faktory u gynekologických malignit
Grafnetter, Klaudia ; Kubecová, Martina (vedoucí práce) ; Doležel, Martin (oponent) ; Sirák, Igor (oponent)
Preventivní a prediktivní faktory u gynekologických malignit MUDr. Klaudia Grafnetter Abstrakt dizertační práce Onkologie poslední léta postupuje mílovými kroky v diagnostice i léčbě. Gynekologické nádory patří k častým malignitám, které jsou diagnostikovány taktéž u žen v mladém věku. Diskutovaným tématem posledních let se stává také tekutá biopsie a její přínos v klinické praxi. Tekutá biopsie se jeví být vhodným ukazatelem prognostickým i prediktivním. Její výhodou je minimální zátěž pro pacienta a lehká dostupnost - získává se z periferní krve. V naší práci jsme analyzovali cirkulující nádorové buňky (CTC). V naší práci jsme se zaměřili na pacientky s karcinomem hrdla děložního, které podstoupily léčbu radikální radioterapií. Do souboru bylo zařazeno celkem 30 pacientek, všechny podstoupily radioterapii s potenciací chemoterapií a dále byly na naší klinice sledovány. V našem souboru bylo provedeno celkem 167 testů před léčbou, během léčby a dispenzarizace pacientek. Paralelně jsme sledovali také onkomarker SCC. Při sledování pacientek a pravidelných odběrech byly pozorovány změny dynamiky CTC - většina pacientek měla vstupně pozitivní CTC a SCC s poklesem po léčbě, což korelovalo s klinickým obrazem a pozorováním regrese onemocnění. Pacientky, které během sledování neměly progresi onemocnění, měly před...
Úplný záznam
|
|
|
|
host ::
