|
| |
|
| |
|
|
Molekulární charakterizace nového subtypu dětské Akutní lymfoblastické leukémie s liniovým přesmykem v časné fázi léčby onemocnění
Dobiášová, Alena ; Fišer, Karel (vedoucí práce) ; Novotný, Marian (oponent)
Leukémie jsou nejčastěji se vyskytujícím nádorovým onemocněním u dětských pacientů. Na našem pracovišti (CLIP) byl nedávno zdokumentován nový subtyp dětské akutní B-prekurzorové leukémie (preB-ALL) s liniovým přesmykem během časné fáze léčby do myeloidní linie, jehož in- cidence mezi preB-ALL tvoří téměř 4 % (Slámová et al., 2014). Methylace DNA (přítomnost 5-methylcytosinu), patří společně s post-translačními úpravami histonů a nekódujícími RNA mezi epigenetické mechanismy, které regulují genovou expresi bez nutnosti změny genetické informace. Mimoto je methylace DNA snadno detekovatelná konverzí bisulfitem sodným a následnou sekve- nací. Cílem této práce bylo porovnat methylaci DNA na celogenomové úrovni (tzv. methylační vzory) mezi pacienty s preB-ALL s liniovým přesmykem a kontrolními preB-ALL. Nejprve bylo třeba revidovat a zlepšit bioinformatický protokol na zpracování dat získaných metodou eRRBS využívající masivně paralelní sekvenování. V rámci zlepšení protokolu jsem porovnala čtyři bioinformatické nástroje na ořez adapterových sekvencí - FAR, cutadapt, Trimmomatic a fastx_clipper. Nejrychlejší a nejúčinnější z nich, program Trimmomatic, jsem následně zařadila do protokolu. Dále jsem získaná data zpracovala vylepšeným protokolem a následně zanalyzovala v prostředí programovacího jazyka R....
|
|
|
In silico predikce posttranslačních modifikací
Basíková, Iveta ; Novotný, Marian (vedoucí práce) ; Fišer, Karel (oponent)
Posttranslační modifikace mají důležitou úlohu v regulaci buněčných pochodů včetně metabolismu, růstu, diferenciace, transkripční aktivace, membránového přenosu a buněčného stárnutí. Experimentální detekce PTM (zejména fosforylace) za použití protilátek je stále časově i finančně náročná. Rozvoj in silico metod pro predikci fosforylace byl v posledních letech ovlivněn velkým nárůstem sekvenčních dat, které jsou vhodným zdrojem pro "trénink", zpracování a výslednou interpretaci predikčních výsledků. In silico predikce PTM může tedy usnadnit identifikaci potencionálních fosforylačních míst a urychlit tím základní výzkum.
|
|
|
Moderní implementace LALR(1) konstruktoru
Fišer, Karel ; Bednárek, David (vedoucí práce) ; Hnětynka, Petr (oponent)
Cílem této práce je navrhnout moderní design konstruktoru parserů a návrh poté realizovat. Výsledkem práce je programátorské dílo sestávající z programu, který ze vstupního souboru čte popis bezkontextové LALR(1) gramatiky a sémantických akcí. Do výstupních souborů generuje zdrojový kód syntaktického analyzátoru, který při parsování jazyka odpovídajícího dané gramatice vykonává dané sémantické akce. Součástí jsou šablony zdrojových kódů pro implementaci výsledného analyzátoru, a to pro několik cílových moderních objektových programovacích jazyků. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
|
|
|
Bombič 2
Fišer, Karel ; Jelínková, Eva (oponent) ; Lidický, Bernard (vedoucí práce)
Název práce: Bombič 2 Autor: Karel Fišer Katedra: Katedra aplikované matematiky Vedoucí bakalářské práce: RNDr. Bernard Lidický E-mail vedoucího: bernard@kam.mff.cuni.cz Abstrakt: Cílem práce bylo analyzovat nedostatky první verze hry Bombič a navrhnout hru a editor map odstraňující tyto nedostatky. Návrh poté realizovat, vytvořit programátorskou a uživatelskou dokumentaci. Výsledkem práce je programátorské dílo, které sestává ze dvou programů. V textu této práce jsou popsané zjištěné nedostatky první verze hry, koncepci uložení dat a architekturu obou programů. V kapitole 6. se nachází uživatelská dokumentace. Obsahuje popis ovládání hry i editoru map. Klíčová slova: Bombič, plošinová hra, arkáda, souboj
|
|
|
Zásobník krmných směsí
Frydrych, Martin ; Fišer, Karel (oponent) ; Škopán, Miroslav (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá návrhem a konstrukcí zásobníku krmných směsí ve dvou variantách. Varianta 1: objem 53 m3, výsypný úhel 60°, varianta 2: objem 45 m3, výsypný úhel 45°. Podle parametrů zadání a odborné literatury byl vypracován návrh obou variant zásobníků krmných směsí. Dále byl proveden výpočet zatížení od větru, sněhu a síly působící na nosnou konstrukci zásobníku ve směru průjezdu. Výkresová dokumentace se skládá ze sestav varianty 1 a 2, vybraných svařovacích podsestav a detailů částí varianty 1 zásobníku krmných směsí.
|
|
| |
|
|
Ocenění společnosti LINET spol. s.r.o.
Fišer, Karel ; Sieber, Patrik (vedoucí práce) ; Špička, Jindřich (oponent)
Diplomová práce se zabývá oceněním společnosti LINET spol. s.r.o. k datu 08. 12. 2012. Ocenění společnosti je provedeno výnosovou metodou diskontovaného peněžního toku pro vlastníky a věřitele. Kromě hodnoty podniku je stanovena i vnitřní hodnota vlastního kapitálu. Při procesu oceňování je provedena strategická a finanční analýza. Ocenění společnosti vychází z finančního plánu a dalších vstupních proměnných jako třeba průměrné náklady na kapitál. Po ocenění následuje výrok o hodnotě podniku. Dále je provedena jednofaktorová analýza citlivosti, která se zaměřuje na jednotlivé faktory, které ovlivňují výslednou hodnotu společnosti.
|
|
|
Finanční analýza společnosti LINET spol. s r. o.
Fišer, Karel ; Vochozka, Marek (vedoucí práce) ; Boukal, Petr (oponent)
Cílem bakalářské práce je provést finanční analýzu společnosti LINET spol. s r.o. a zaměřit se na finační situaci společnosti. Analýza byla provedena za hospodářské roky 2003/2004-2007/2008. V úvodu práce je popsán postup finanční analýzy,v teoretické části jsou popsány použité nástroje a metodiky jejich výpočtu a v praktické části jsou výpočty jednotlivých nástrojů. Dosažené výsledky jsou vždy slovně okomentovány a porovnány s průměrnými výsledky v oboru.V závěru práce je zhodnocena celková situace společnosti a návrhy na její zlepšení.
|
host ::
RSS.