|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
|
|
The Biochemistry of Zine and Iron Proteomic Studies
Babušiak, Marek ; Vyoral, Daniel (vedoucí práce) ; Hrkal, Zbyněk (oponent) ; Černý, Jan (oponent)
This thesis, The Biochemistry of Zinc and Iron - Proteomic Studies, consists of five sections. We were studying the biochemistry of two different metal elements - iron and zinc, therefore the thesis has two main aims (iron and zinc related) and each of the experimental sections are divided into two logical subsections A and B. The first section - Introduction includes a general introduction reviewing the current knowledge about the biochemistry of iron and zinc and it also specifies the objectives of this study. The first part of the Introduction is a review of iron biochemistry. It has following seven chapters: General properties of iron; Iron absorption, storage and toxicity in human; Iron transport and homeostasis; Iron regulatory proteins - IRP/IRE system; Mitochondrial iron metabolism; Liver and iron and Iron disorders. In the second part of the Introduction, the biochemistry of zinc is reviewed in these eight chapters: Zinc - general properties; Zinc transporters; Zinc finger proteins; The role of zinc fingers in leukemogenesis; Functions of zinc in cellular signalling; Regulatory functions of zinc in cell proliferation; Role for Zinc in cell differentiation and apoptosis; Zinc - remarks and perspectives. The third part of the Introduction introduces the specific objectives of this thesis. It gives a...
|
|
|
Městské knihovny ve Finsku
Černý, Jan ; Drobíková, Barbora (vedoucí práce) ; Novák, Petr (oponent)
Práce charakterizuje vznik, vývoj a současný stav finského veřejného knihovnictví se zaměřením na služby. Úvodní část pojednává o historii finských knihoven od 18. století. Důraz je přitom kladen na vznik prvních veřejných knihoven, situaci mezi dvěma světovými válkami, vývoj legislativy, rozvoj knihoven po roce 1960 a nástup automatizace a internetu. Druhá část se týká hierarchie a služeb městských knihoven ve Finsku. Vedle základních služeb jsou zmíněny také virtuální referenční služby, marketingové aktivity a centrální on-line rozhraní veřejných knihoven. Rovněž jsou zde analyzovány problémy a nedostatky finského knihovnictví. Třetí část představuje služby Městské knihovny v Helsinkách, která je pověřena funkcí centrální knihovny. Kapitola obsahuje i rozhovor s ředitelkou knihovny Maijou Berndtson týkající se pozitivních a negativních stránek knihovny včetně jejího budoucího vývoje. Čtvrtá část charakterizuje budoucnost veřejného knihovnictví ve Finsku podle dokumentů schválených Ministerstvem školství Finska. Nastíněna je i zatím neoficiální strategie, která bude platit až do roku 2015. Závěr práce uvažuje nad klady a zápory progresivního vývoje veřejných knihoven ve Finsku v kontextu českých knihoven.
|
|
|
Nástroje pro studium cholesterolu v biologických membránách
Koukalová, Alena ; Nováková, Olga (oponent) ; Černý, Jan (vedoucí práce)
Cholesterol je jednou z hlavních složek buněčných membrán většiny eukaryotických buněk, v nichž plní mnoho funkcí. Reguluje tekutost membrán, ovlivňuje aktivitu mnoha membránových proteinů a představuje prekurzor mnoha steroidních hormonů a žlučových kyselin. Protože cholesterol není sám o sobě barevný nebo fluorescenční, pro studium jeho lokalizace a distribuce v buňce je nutné ho vizualizovat například pomocí takzvaných reporérových molekul. Ty lze rozdělit do dvou skupin: sondy specificky vázající cholesterol a analogy cholesterolu. Mezi sondy řadíme enzym cholesterol oxidázu, který katalyzuje reakci cholesterolu s kyslíkem za vzniku produktu cholest-4-en-3-on a peroxidu vodíku a využívá se ke studiu organizace membrány a kinetiku flip-flop cholesterolu v plasmatické membráně, polyen filipin, tvořící fluorescenční komplexy s cholesterolem, které podávají informace o distribuci a lokalizaci cholesterolu v buňce. Thiolem aktivované cytolysiny a derivát perfrigolysinu O - BCθ-toxin - jsou vhodné ke studiu na cholesterol bohatých oblastí a lokalizace cholesterolu v membráně. Cyklodextriny (hlavně methyl- β-cyklodextrin) specificky vážou cholesterol i jeho analogy, díky tomu mohou sloužit jak k odstranění cholesterolu z membrány, tak i k efektivnímu vnášení jeho analogů do membrán. U fluorescenčních analogů...
|
|
|
Biochemická a funkční charakterizace nového transmembránového adaptorového proteinu NVL
Vonková, Ivana ; Černý, Jan (oponent) ; Brdička, Tomáš (vedoucí práce)
Signalizační dráhy spouštěné v imunologické synapsi z T buněčného receptoru (TCR) již byly v minulosti podrobně studovány. Oproti tomu o dráhách účastnících se přenosu signálů spouštěných v této struktuře z MHCII na profesionálních antigen prezentujících buňkách (APC) se toho ví stále velmi málo. Transmembránové adaptorové proteiny (TRAP) jsou rodinou proteinů, která hraje důležitou roli v signalizaci iniciované T receptorem a jinými imunoreceptory. Dosud však nebyl popsán žádný TRAP účastnící se signalizace přes MHCII. Tato práce popisuje nový TRAP nazvaný Nvl, který je vysoce obohacen v imunologické synapsi na straně antigen prezentujících buněk a účastní se regulace přenosu signálu z MHCII a FcR. Nvl je přítomný výlučně v profesionálních antigen prezentujících buňkách - B buňkách, monocytech/makrofázích a dendritických buňkách, a míra jeho exprese pozitivně koreluje s expresí MHCII. Nvl se nachází v tetraspanových mikrodoménách a spolu s tetraspany je lokalizován v polarizovaných buněčných strukturách, včetně uropodu, zaškrcení při buněčném dělení (cleavage furrow) a též do imunologické synapse. Přítomnost Nvl v imunologické synapsi naznačuje možnou účast Nvl na přenosu signálů spouštěných z MHCII. Nvl je skutečně fosforylován po stimulaci přes MHCII, avšak silná fosforylace Nvl byla pozorována...
|
|
|
Analýza kandidátních transmembránových adaptorových proteinů
Šulcová, Jitka ; Černý, Jan (oponent) ; Drbal, Karel (vedoucí práce)
Transmembránové adaptorové proteiny (TRAP) fungují jako kotvící místa pro různé signalizační molekuly a umožňují tak vznik velkých signalizačních komplexů v blízkosti plasmatické membrány. Časově a prostorově regulují signalizační události, a tím napomáhají rychlému a efektivnímu přenosu signálu z receptorů na povrchu buněk do buněčného nitra. Důležitá role známých TRAP v závislosti na jejich lokalizaci v lipidových raftech pro správný vývoj a funkci buněk imunitního systému je stále diskutována. Důvodem je absence výrazného fenotypu u knock-out myší. Jedinými výjimkami jsou deficience ITAMobsahujících adaptorů imunoreceptorů a adaptoru Lat asociovaného s lipidovými rafty, které vedou k poruchám ve vývoji T-lymfocytů a jejich snížené TCR signalizaci. Cílem mé diplomové práce bylo bioinformaticky vyhledat, provést filtrování kandidátních genů na základě predikovaných a publikovaných dat a vybrané kandidátní TRAP poté částečně funkčně charakterizovat. Zjišťovala jsem jejich přítomnost na plasmatické membráně a zda-li jejich ektopická zvýšená exprese uvnitř buněk bude mít roli na expresi povrchového aktivačního znaku T-lymfocytů CD69. Ze 14 kandidátních TRAP může být pouze jediný protein Pdzk1ip1 lokalizován na plasmatické membráně, avšak jeho zvýšená exprese nemá vliv na expresi CD69 v buňkách po TCR...
|
host ::
RSS.