| |
| |
| |
|
Detection of repetitive sequences in genomes
Puterová, Janka ; Jedlička, Pavel (oponent) ; Kléma, Jiří (oponent) ; Zendulka, Jaroslav (vedoucí práce)
Repetitive sequences can make up a significant part of the genome, in some cases more than 80%, but scientists have often overlooked them. Today we know that repeats have various functions in the genomes and are divided into two main groups: interspersed and tandem repeats. This work aimed to develop bioinformatics tools to detect repetitive sequences, either directly from sequencing data generated by sequencers or assembled genomes. In the introductory part, the work provides an insight into the issue and an overview of the repeat types occurring in genomes. Furthermore, the work deals with existing approaches and tools with an aim to detect repeats directly from the assembled sequences. The main contribution to this area was developing the digIS tool, which aims to detect insertion sequences that represent the most abundant interspersed repeats in prokaryotes. digIS is based on the principle of profile hidden Markov models constructed for the catalytic domains of transposases, representing the most conserved part of the insertion sequences and retaining a secondary structure within the family. Subsequently, the work provides an overview of sequencing technologies and discusses existing methods for detecting repeats directly from sequencing data without the need for prior genome assembly. A novel approach for a detailed analysis of tandem repeats is presented. This approach extends the primary analysis of RepeatExplorer, which detects and characterizes repeats directly from sequencing data. The work further discusses the applications of repeat detection in biological research, especially from the point of view of comparative repeatome studies and the evolution of sex chromosomes. Finally, the work summarizes the research results in the form of four articles published in international journals, the full text of which is available in the appendices, and provides a general summary of the work together with possibilities for future research.
|
|
Komparativní analýza: Faktory úspěchu etablace teroristických skupin FARC a ETA
Kopečný, Ondřej ; Ditrych, Ondřej (vedoucí práce) ; Svitková, Katarína (oponent)
Práce se zabývá historiografickým rozborem kontextu vzniku a etablace teroristických skupin ETA a FARC, přičemž se zaměřuje na identifikaci a analýzu sady faktorů, které k této etablaci vedly. Tyto faktory jsou v práci dále zkoumány a komparovány, na základě čehož autor uvozuje jejich obecný, připadně kontextuální charakter. Zkoumané skupiny vycházejí z maximálně rozdílných kontextů, což přispívá k možnosti vysledování generálních platností. Důraz je kladen zejména na politické, socioekonomické a identitární předpoklady vzniku skupin.
|
|
Komparativní analýza zahraničního zpravodajství v hlavních zpravodajských pořadech ČT 1, TV Nova a Prima TV v roce 2010
Kučerová, Kateřina ; Trampota, Tomáš (vedoucí práce) ; Nečas, Vlastimil (oponent)
Diplomová práce "Komparativní analýza zahraničního zpravodajství v hlavních zpravodajských pořadech ČT1, TV Nova a Prima TV v roce 2010" zkoumá způsob, jakým české televizní stanice informovaly o dění v zahraničních státech v roce 2010. Kromě způsobu zpracování zahraničního zpravodajství se práce soustředí také na to, jaké státy se ve zpravodajství objevily. V úvodní části práce za využití české a zejména zahraniční literatury shrnuje poznatky o televizním zpravodajství, mezinárodních tocích komunikace a vlivech působících na produkci zahraničního zpravodajství. Úvodní kapitola představuje také pořady Události, Televizní noviny a Zprávy TV Prima, které jsou předmětem analýzy. Kapitola věnovaná metodologickým východiskům formuluje výzkumné otázky a hypotézy a tvoří východisko pro následující kvantitativní analýzu. Analytická kapitola je rozdělena do dvou částí, z nichž první je věnována způsobu zpracování a prezentace zahraničního zpravodajství, druhá se pak zaměřuje na zastoupení zahraničních států ve zkoumaných pořadech a analyzuje charakteristiky těchto zemí, které mohou ovlivňovat výběr zpráv českými televizními stanicemi. Protože je práce komparativní analýzou, postihuje rozdíly mezi zkoumanými hlavními zpravodajskými pořady. Závěrečná část práce shrnuje poznatky získané komparativní analýzou a...
|
|
Comparison of English and French Vocalic Systems
Havránková, Anna ; Červinková Poesová, Kristýna (vedoucí práce) ; Vít, Radek (oponent)
Tato práce zkoumá vokalické systémy anglického a francouzského jazyka. Teoretická část se zabývá popisem a srovnáním kvality a kvantity anglických a francouzských vokálů a také jejich grafickými korespondencemi. V praktické části je prezentována komplexní analýza nahrávek dvanácti francouzských mluvčích, kteří nahráli seznam pečlivě vybraných anglických slov. Cílem práce je identifikovat nejběžnější chyby ve výslovnosti vokálů, které mohou přispět k vnímání francouzského přízvuku a pochopit jejich výskyt na bázi předchozí komparace. Výsledky ukazují rozličnost chyb zapříčiněných částečně komplikovanou graficko-fonémickou korespondencí v angličtině, částečně rozdílnými korespondencemi francouzštiny a částečně existencí velkého množství společné slovní zásoby obou jazyků. Všechna získaná data jsou zanesena v grafech.
|
|
Financování sportu z veřejných rozpočtů v Dánsku v porovnání s ČR
Štrbíková, Barbara ; Šíma, Jan (vedoucí práce) ; Procházka, Jan (oponent)
Financování sportu z veřejných rozpočtů v Dánsku v porovnání s Českou republikou Cíl: Hlavním cílem této bakalářské práce je podat ucelený pohled na strukturu financování sportu z veřejných rozpočtů v Dánsku. Dalším cílem je vytyčení hlavních rozporů v dánském a českým způsobu financování. Metody: V této práci byla použita analýza dokumentů ke zjištění způsobů financování sportu v Dánsku. Byl rozebrán systém finančních toků z veřejných rozpočtů do konkrétních programů, sportovních klubů a sdružení pomocí popisné analýzy. Tento systém byl dále podroben komparaci se systémem českým. Výsledky: Výsledkem této práce je přesný pohled na financování sportu z veřejných rozpočtů v Dánsku a vytyčení největších rozdílů mezi českým a dánským systémem financování. Klíčová slova: veřejný sektor, veřejné finance, veřejná ekonomie, analýza dokumentů, komparativní analýza, sportovní orgány ČR, sportovní orgány Dánsko, financování sportu Dánsko, financování sportu ČR
|
|
Vybrané demografické charakteristiky obyvatelstva strukturálně postižených okresů ČR na konci 20. a počátkem 21.století
Valterová, Aneta ; Bartoňová, Dagmar (vedoucí práce) ; Šídlo, Luděk (oponent)
Vybrané demografické charakteristiky obyvatelstva strukturálně postižených okresů ČR na konci 20. a počátkem 21. století Abstrakt Hlavním cílem práce je prostřednictvím demografických ukazatelů a metod analyzovat a zhodnotit strukturu obyvatelstva vybraných strukturálně postižených okresů. Pomocí komparativní metody ověříme oprávněné zařazení těchto okresů mezi tzv. strukturálně postižené regiony. První část tvoří teoretický rámec celé práce, obsahuje definice a legislativní prvky z oblasti regionálního rozvoje. Hlavní část práce se zabývá samotnou analýzou, kde si ověříme, že vybrané strukturálně postižené okresy zaostávají za celostátním průměrem České republiky u vybraných charakteristik obyvatelstva. V práci jsou popsány i aktuální trendy v demografickém chování obyvatelstva České republiky. Tyto trendy jsou následně porovnány s demografickým vývojem ve strukturálně postižených okresech za posledních 20 let. Klíčová slova: strukturálně postižený region, transformace průmyslu, demografické charakteristiky, komparativní analýza, struktura obyvatelstva
|
|
Příspěvek k poznání způsobu obživy na přelomu neolitu a eneolitu (srovnávací studie západního kulturního okruhu s oblastí Čech a Moravy)
Mattová, Sabina ; Popelka, Miroslav (vedoucí práce) ; Neustupný, Evžen (oponent) ; John, Jan (oponent)
Předkládaná studie se zabývá řešením otázky fenoménu zvýšené lovecké aktivity na přelomu neolitu a eneolitu, jehož příčiny byly dosud řešeny pouze s ohledem na environmentální podmínky na lokalitách. Fenomén je sledován na lokalitách poměrně velkého prostoru střední Evropy, nicméně současně existují lokality s převládajícím zemědělským způsobem hospodaření. Studie se snaží na základě podrobné komparační analýzy hmotné kultury lokalit západního kulturního okruhu a Čech a Moravy zachytit odraz tohoto fenoménu na archeologickém materiálu, sledovat rozdíly mezi lokalitami s převahou domácích produktů a lokalitami převahou zdrojů divokých. Zároveň registruje možný vliv přírodního prostředí lokalit na vzrůstající tendenci lovu. Pro účely vytvoření databáze je vypracován podrobný katalog lokalit zachycující nejdůležitější informace o hmotné kultuře s ohledem na předpokládaný způsob hospodaření. Katalog rovněž slouží jako vodítko pro vytvoření jednotlivých ukazatelů do databáze, které setřídí požadovaná data do srovnatelné podoby. Následně je vytvořena popisná databáze zachycující odraz hospodářské základny jednotlivých lokalit. Na základě filtrační analýzy jsou data porovnávána s ohledem na dva odlišné regiony a dva různé způsoby subsistence. Výsledkem jsou podrobné srovnávací tabulky ve stati...
|