|
|
Synthesis and characterization of new insulin derivatives with altered selectivity for insulin and IGF-1 receptors.
Halamová, Tereza ; Jiráček, Jiří (vedoucí práce) ; Dračínská, Helena (oponent)
Receptor insulinu (IR) existuje ve dvou izoformách (IR-A a IR-B) lišících se tkáňovou distribucí a možná i funkcí, tzn. jejich odpovědí na vazbu insulinu. Předpokládá se, že zatímco IR-A spouští zejména mitogenní procesy vedoucí k dělení a proliferaci buněk, IR-B spouští především metabolické procesy vedoucí zejména ke vstupu molekul glukosy z krve do nitra svalových a tukových buněk. Insulin se může slaběji vázat i na receptor pro růstový faktor IGF-1 (IGF-1R), který je zodpovědný hlavně za procesy spojené s vývojem a růstem organismu. Deriváty insulinu vážící se selektivně pouze na jeden z receptorů by měly velký význam pro studium receptorů, ale potenciálně i pro léčbu nemocí jako je cukrovka nebo rakovina. V této práci jsme využili zkušeností ve studiu struktury a aktivity insulinu pro návrh, přípravu a biologickou charakterizaci 4 nových derivátů insulinu s cílem pozměnit selektivitu vůči jednotlivým receptorům. Modifikace v nových analozích spočívaly v amidaci C-konce řetězce B insulinu a postupném prodlužování tohoto řetězce o 1-3 glyciny s amidovaným C-koncem. Pro všechny nové analogy byly určeny jejich vazebné afinity vůči IR-A a IR-B a pro některé z analogů i vůči IGF-1R. Nakonec byly určeny schopnosti analogů aktivovat IR-A a IR-B, tzn. indukovat autofosforylaci vnitrobuněčných...
|
|
|
Experimental study of chemical evolution of biomolecules under early Earth conditions
Knížek, Antonín ; Ferus, Martin (vedoucí práce) ; Adam, Vojtěch (oponent)
Vznik života na Zemi je jedním z prázdných míst lidského vědění. Tato práce je zaměřena na odhalení několika dílků této skládačky. Prezentujeme současný stav poznání zejména ve spojení se syntézou biomolekul za prebiotických podmínek. V této práci jsou předloženy výsledky experimentů, jež naznačují, že neutrální planetární atmosféra obsahující představitele vulkanických plynů (CO2, N2, H2O) může být působením měkkého UV záření v přítomnosti minerálních katalyzátorů přeměněna na relativně reaktivní směs redukovaných plynů (CH4, CO). Ty mohou být dále transformovány vysoce energetickými procesy za vzniku biomolekul. Směs CH4, CO + N2 představuje prototyp běžné redukční atmosféry, jíž podobné lze nalézt např. na Titanu, největším Saturnově měsíci, nebo také v minulosti na naší planetě coby tzv. sekundární atmosféru. V následných experimentech byla ekvimolární směs CH4 : CO : N2 v přítomnosti vodní páry exponována vysoce energetickému plazmatu, jež simuluje dopad asteroidu - jednu ze série impaktních událostí, kterým byla raná Země vystavena během prvních 600 milionů let své existence. Po dodání celkové energie 3250 J v laserových pulzech byla zjištěna přítomnost organických molekul důležitých pro prebiotickou chemii. Mezi nimi jsou např. báze ribonukleové kyseliny (adenin, uracil, guanin, cytosin),...
|
|
|
Syntéza derivátů haemanthaminu
Marková, Jana ; Cahlíková, Lucie (vedoucí práce) ; Kuneš, Jiří (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické botaniky a ekologie Kandidát: Jana Marková Školitel: doc. Ing. Lucie Cahlíková, Ph.D. Název diplomové práce: Syntéza derivátů haemanthaminu Na základě dřívějších studií byl pro práci vybrán alkaloid haemanthamin, který vykazuje zajímavou protinádorovou aktivitu. Účelem této práce byla příprava jeho aktivnějších derivátů, konkrétně jeho esterů. Bylo připraveno následujících pět esterových derivátů (11-O- butanoylhaemanthamin, 11-O-(3,4-dimethoxybenzoyl)-haemanthamin, 11-O-(4- trifluoromethoxybenzoyl)-haemanthamin, 11-O-isobutanoyhaemanthamin) reakcí haeanthaminu s příslušným acylačním činidlem (acylchloridem, popřípadě anhydridem) v prostředí bezvodého pyridinu nebo tetrahydrofuranu za přidání katalyzátoru dimethylaminopyridinu. Většina produktů byla získána ve formě bezbarvého oleje, jedna látka krystalizovala ve formě bílých amorfních krystalů. Bohužel se jeden derivát (3- demethylhaemanthamin) pokusem o otevření dioxolanového kruhu za podmínek reakce nepodařilo připravit. Připravené deriváty byly identifikovány převážně pomocí EI-MS a NMR studií. Všechny látky byly získány v dostatečných výtěžcích v rozmezí 43 - 81 %. Kromě 11-O-isobutanoylhaemanthaminu byly všechny sloučeniny připraveny poprvé. Tyto deriváty byly...
|
|
|
Řešení spojitých systémů evolučními výpočetními technikami
Lang, Stanislav ; Šeda, Miloš (oponent) ; Olehla, Miroslav (oponent) ; Matoušek, Radomil (vedoucí práce)
Práce je věnována problematice řešení spojitých systémů evolučními výpočetními technikami. Evoluční výpočetní techniky spadají do oblasti studia softcomputingu, jedná se o pokročilé optimalizační metaheuristiky, které se s postupným růstem výpočetního výkonu počítačů stávají stále více používanými metodami řešení složitých optimalizačních problémů. Řešení spojitých systémů, potažmo syntéza spojitých regulačních obvodů, je jednou z oblastí, kde tyto pokročilé algoritmy nalézají své uplatnění. Při řešení spojitých systémů se zaměříme na problematiku regulace. Evoluční výpočetní techniky se pak mohou stát nástrojem nejen pro optimalizaci parametrů regulátoru, ale i pro návrh jeho struktury. Pro optimalizaci parametrů regulátoru lze využít mnoho různých algoritmů (genetický algoritmus, diferenciální evoluce, atd.), pro návrh struktury se setkáváme běžně s využitím tzv. gramatické evoluce. Nasazení gramatické evoluce však není nutné, pokud je využito vhodného kódování, jak je navrženo v předložené práci. Práce prezentuje metodu návrhu struktury a parametrů obecného lineárního regulátoru s využitím genetického algoritmu. V rámci polynomiální teorie řízení se též setkáme s označením polynomiální regulátor. Způsob kódování popisu obecného lineárního regulátoru do genetického řetězce je stěžejní, určuje množinu algoritmů použitelných pro optimalizaci a ovlivňuje efektivitu výpočtů. Popsané kódování, efektivní implementace EVT, včetně multikriteriální optimalizace je stěžejním přínosem této práce.
|
|
|
Syntéza a charakterizace topologických krystalových izolátorů třídy SnTe
Chovanec, Jakub ; Uhlířová, Klára (vedoucí práce) ; Prokleška, Jan (oponent)
k bakalářské práci - Český jazyk Syntéza a charakterizace topologických krystalových izolátorů třídy SnTe Jakub Chovanec July 21, 2017 V rámci této práce byla připravena série monokrystalických vzorků PbxSn1−xTe a PbxSn1−xSe. O tyto materiály je v posledníh letech zájem, poté co byly nejprve předpovězeny a následně charakterizovány [4] jako topologické krystalové izolátory (dále jen TCI). TCI je kvantový stav krystalů, ve kterém díky symetri existuje na povrchu kovová vrstva. Vzorky byly připraveny růstem z přesycených roztoků a pomocí Bridg- manové metody. Byly zjíštěny složení a ověřena homogenita krystalů. Monokrystaly PbxSn1−xTe resp. PbxSn1−xTe byly připraveny v kubické soustavě a zařazeny do pros- torové grupy Fm-3m, a potvrzen přechod do Pnma grupy pro PbxSn1−xSe. 1
|
|
|
Synthesis of supramolecular components with positive charges and study of their binding to plasma treated surfaces
Garbárová, Veronika ; Jindřich, Jindřich (vedoucí práce) ; Jelínek, Ivan (oponent)
4 Abstrakt Cieľom tejto práce bolo syntetizovať série nových zlúčenín obsahujúcich skupiny schopné vykazovať supramolekulárne interakcie s cyklodextrínmi (ako napríklad adamantán, ibuprofen) a ktoré tiež obsahujú permanentné kladné náboje. Preto sa dajú elektrostaticky viazať na povrchy obsahujúce záporné náboje. Ako takéto povrchy boli využité plazmované povrchy, ktoré nesú karboxylátové skupiny, a polymér Nafion® 117 obsahujúci sulfonátové skupiny. Príprava týchto nabitých komponentov spočívala v zavedení azido skupiny do molekuly a následnou meďou katalyzovanou azid/alkín cykloadičnou reakciou bol naviazaný linker obsahujúci kladné náboje a propargylovú skupinu. Optimálne podmienky väzby na pevný povrch a závislosť stability väzby vo vodných roztokoch na pH a koncentrácii solí boli vyhodnotené pre vybrané komponenty s využitím UV spektrometrie. Kľúčové slová: syntéza, fluorofóry, kladne nabité zlúčeniny, elektrostatická vazba, plazmované povrchy
|
|
|
Evoluční resyntéza kombinačních obvodů
Kocnová, Jitka ; Sekanina, Lukáš (oponent) ; Vašíček, Zdeněk (vedoucí práce)
Diplomová práce se zabývá resyntézou kombinačních obvodů pomocí evolučních principů. První část se zabývá logickou syntézou a jejími problémy, evoluční syntézou a výhodami evolučního přístupu, a taktéž jsou zmíněny některé existující syntézní nástroje. V druhé části jsou pak přiblíženy vybrané grafové algoritmy a jejich možné využití v navrhovaném programovém rozšíření pro vybraný syntézní nástroj. Zde je také popsán návrh rozšíření a jeho samotná implementace. Třetí část se zabývá testováním vzniklého rozšíření. Čtvrtou částí je závěr shrnující získané poznatky a dosažené výsledky.
|
|
| |
|
|
Fluorescenčně značené ligandy μ-opioidních receptorů
Hadzima, Martin ; Machara, Aleš (vedoucí práce) ; Kohout, Michal (oponent)
Tato bakalářská práce se zabývá přípravou fluorescenčně značených opiátů, které umožňují pomocí fluorescenčních technik detekovat µ-opioidní receptory a blíže prostudovat interakci s jejich ligandy. Jako substráty určené k chemickým modifikacím byly vybrány semi-syntetické opiáty naloxon a naltrexon. Jejich převedení na odpovídající C-6 hydrazony umožnilo sloučeniny dále modifikovat a sledovat, zda-li dojde ke změně jejich schopnosti se vázat na µ-opioidní receptory. Nejprve byly připraveny známé adukty hydrazonů s isothiokyanátem fluoresceinu. Následně byly mezi uvedenou fluorescenční značku a opiátový fragment systematicky vkládány různě dlouhé spojky. Tyto spojky byly připraveny z tetraethylenglykolu s cílem sledovat změnu vazebné konstanty takto upraveného ligandu opioidního receptoru. Nakonec bylo rozhodnuto připravit konjugát, který by byl opatřen spojkou odpovídající svým rozměrem zhruba délce dekaethylenglykolu. K tomu byly navrženy dva syntetické postupy konstrukce požadované spojky. Jeden využil přístup splňující podmínky click chemie a druhý byl založen na klasické tvorbě amidu. Oba úspěšně připravené konjugáty byly převedeny na adukty s fluoresceinem, což umožnilo ověřit jejich vazbu s receptorem. Obě látky byly také poskytnuty druhému spolupracujícímu pracovišti, jež je použije k...
|
|
|
Preparation of bifunctional organocatalysts
Rohaľová, Dominika ; Veselý, Jan (vedoucí práce) ; Trnka, Tomáš (oponent)
Táto bakalárska práca sa zaoberá prípravou bifunkčných tiomočovinových katalyzátorov a východiskových stavebných jednotiek odvodených od sacharidu levoglukozanu. Prvá časť práce je zameraná na prípravu 1,6:2,3-dianhydro-4-azido-4-deoxy- β-D-manopyranózy. Druhá časť práce je zameraná na prípravu bifunkčného katalyzátora. Kľúčové slová Asymetrická syntéza, organokatalýza, sacharidy, bifunkčné katalyzátory, tiomočovina, morfolín.
|
host ::
RSS.