|
|
Deposition and analysis of DLC thin films
Rudolf, Miroslav ; Čech, Vladimír (referee) ; Šikola, Tomáš (advisor)
Diplomová práce nastiňuje problémy spojené s výrobou a analýzou tenkých vrstev DLC:H. Tyto vrstvy jsou ve středu zájmu mnoha vědeckých pracovníků již po několik desetiletí. V současné době existuje mnoho technik pro přípravu a analýzu. Příprava DLC vrstev má zásadní vliv na jejich vlastnosti a možnosti použití. Je zde mnoho kritérií jak vrstvy posuzovat. V této práci jsou studovány vlastnosti DLC:H vrstev připravených na substrát krystalického křemíku metodou RF-PECVD a následně jsou studovány mechanické, tribologické a optické vlastnosti. Jsou zde využity techniky jako XPS, Ramanova spektroskopie, reflektometrie, měření tvrdosti a adheze. Část práce se zabývá modelováním DLC z prvních principů. Pro tento účel je využito prvoprincipiálního programu Abinit který je šířen pod GPL. Je studována otázka přípravy vstupních dat s ohledem na konvergenci výsledků. Pozornost je také věnována výpočtu vibračních spekter ve středu Brillouinovy zóny ( bod) a celkové hustotě elektronových stavů clusteru DLC v supercele tvaru krychle. Tyto výsledky mohou být porovnány s experimentálně získanými daty z Ramanovy spektroskopie, respektive z XPS spektra valenčního pásu
|
|
|
Analysis of biological significant substances
Maděránková, Denisa ; Rychtárik, Milan (referee) ; Roleček, Jiří (advisor)
Selected methods of Raman spectroscopy, like surface-enhanced Raman spectroscopy and single molecule Raman spectroscopy, are described in this diploma work. The basis of two methods for numerical modelling of optical properties of micro- and nanoparticles are prefaced. The methods are Discrete Dipole Approximation and Finite Difference Time Domain. Micro- and nanoparticles are used in surface enhanced Raman spectroscopy and other nanospectroscopic methods. Further, the main instrumentation needed for Raman spectroscopy is described. The first part of experimental section of this work is numerical modelling of photonic nanojet that occures behind dielectric microparticles. This phenomenon leads to a new technique of confocal microscopy with Raman spectra measuring. The second experimental section contains results of Raman spectra measurement with beta-carotene and surface-enhanced Raman spectra of beta-carotene in silver-sol solution.
|
|
|
Molecular modelling - Structure and Properties of carbene-based catalyst
Kulovaná, Eva ; Hermanová, Soňa (referee) ; Richtera, Lukáš (advisor)
Pomocí molekulového modelování je možné předpovídat chování nových látek a napomáhá při jinak obtížné interpretaci experimentálních dat. Cílem práce byla predikce vybraných vlastností polymeračních katalyzátorů na bázi karbenů, predikce jejich struktur a spektrálních charakteristik a studie mechanismu polymerace za otevření kruhu laktidu. K ověření chování karbenů a jejich prekurzorů ve formě chloridů byly studovány vybrané charakteristiky molekuly. Byl proveden výpočet vybraných molekulových orbitalů a elektrostatických map. Následně pomocí počítačových programů byly získány teoretické vazebné délky a úhly vybraných imidazolových a imidazolinových sloučenin, karbenů a jejich možných produktů hydrolýzy. Data strukturně podobných, již charakterizovaných sloučenin, byla získána z CCDC (Cambridge Crystallographic Data Centre) a následně byla konfrontována s vypočítanými daty. Byla změřena infračervená a Ramanova spektra imidazolové soli a infračervené spektrum příslušného karbenu. Tato spektra byla konfrontována s napredikovanými. Pro lepší interpretaci spekter byla spočítána spektra možných produktů hydrolýzy. Následně byl studován mechanismus polymerace za otevření kruhu laktidu. Na základě spočítaných energií stacionárních bodů byl navržen nový mechanismus polymerace.
|
|
|
Raman spectroscopy of biologically active species and antitumor drugs
Třeštíková, Liběna ; Vetterl,, Vladimír (referee) ; Vrána, Oldřich (advisor)
SERRS spektra of biological materials are very komplex, because they consist of signals from all molecules present in cells. In this text are presented SERRS spektra of antitumor drugs and its komplex with DNA. Experimental are rated on doxorubicin and another antitumor druha and on study of theirs potential by treatment for tumors. Doxorubicin belong to clase antracycline antibiotics and is used for stop of tumor cells reproduction. Scientists found still new ways, new drugs. SERRS is one of possibilities for study of this drugs and theirs interaction with DNA.
|
|
|
Preparation of graphene samples for experiments under UHV conditions
Mareček, David ; Mach, Jindřich (referee) ; Čechal, Jan (advisor)
This bachelor thesis deals with electrical conductivity of a graphene sample and preparation of a graphene field-effect transistor. In the theoretical part of the thesis, we describe electronic properties of graphene, preparation of graphene by CVD and its transfer to SiO_2. Experimental part of this thesis is focused on the preparation of a graphene field-effect transistor with long distance between Source and Drain electrodes. Thesis deals with a design of a chip expander for contact of graphene in UHV conditions. The last part describes measurement of dependency of graphene layer conductivity on the gate voltage with emphasis on the position of Dirac point during adjustments of the sample in UHV conditions.
|
|
|
Preparation and characterization of MoS2 thin films
Tomková, Renáta ; Zahradníček, Radim (referee) ; Bartoš, Miroslav (advisor)
This thesis deals with topological insulators, which are described by the quantum spin Hall effect, as well as on semiconductors, where the band structure of semiconductors and more specifically mentioned unipolar transistor MOSFET is explained. There are also mentioned primarily 2D materials and in particular of MoS2. Topic focuses on its structure, the electric properties, the use and preparation by using micromechanical exfoliation. In the last chapter it is described how to prepare MoS2 structures and their analysis. Structural properties of this material were measured by the AFM and Raman spectroscopy. The experimental part there are illustrative photograph of MoS2 taken with an optical microscope and spatial structures created by AFM.
|
|
|
Preparation of graphene layers by various methods and characterization of their properties
Zahradníček, Radim ; Bartošík, Miroslav (referee) ; Lišková, Zuzana (advisor)
This bachelor's thesis deals with the production of graphene by different methods. Graphene was prepared by mechanical exfoliation and chemical methods. Graphene oxide (GO) was first prepared by modified Hummers method and disolved the solution in isopropyl alcohol. It was subsequently reduced by photoreduction, UV radiation and thermal reduction. Produced graphene samples were characterized using optical microscopy, electron microscopy, atomic force microscopy, Raman spectroscopy and X$-$ray photoelectron spectroscopy. Measurement results and evaluation of production quality of graphene are shown in this work.
|
|
|
Molecular modelling - Structure and Properties of carbene-based catalyst
Kulovaná, Eva ; Zmrzlý, Martin (referee) ; Richtera, Lukáš (advisor)
Molekulové modelování umožňuje předpovídat chování nových látek a napomáhá při jinak obtížné interpretaci experimentálních dat. Záměrem našeho studia byla predikce vybraných vlastností polymeračních katalyzátorů na bázi karbenů, predikce jejich struktur a spektrálních charakteristik. K ověření chování karbenů a jejich prekurzorů ve formě chloridů byly studovány vybrané charakteristiky molekuly. Byla provedena vizualizace vybraných molekulových orbitalů a map elektrostatických potenciálů a elektronových hustot. Následně pomocí počítačových programů byly získány teoretické vazebné délky a úhly vybraných imidazolových a imidazolinových sloučenin a z nich připravených karbenů. Data strukturně podobných, již charakterizovaných sloučenin, byla získána z CCDC (Cambridge Crystallographic Data Centre) a následně konfrontována s námi vypočítanými daty. Byla změřena infračervená (IČ) a Ramanova spektra imidazolové soli a IČ spektrum příslušného karbenu. Tato spektra byla konfrontována s napredikovanými.
|
|
|
Portable devices for infrared and Raman spectroscopy: methodology of their use within non-invasive survey of paintings in situ
Čermáková, Zdeňka ; Košařová, Veronika
Aim of the methodology is to determine the limits of use of currently available portable IR and Raman spectrometers for the analysis of painted artworks, describe the complicating factors during the measurement and especially within the subsequent interpretation of spectra, which is critical for the overall process. As a result, a practical guidance for the inclusion of non-invasive spectroscopic methods to standard survey of paintings is provided. The methodology is focused on easily portable spectrometers which can be introduce for the analysis of cultural heritage objects directly on-site, and which thereby achieve high flexibility of use.
Fulltext:  PDF; PDF
|
|
|
Structural analysis of extrinsic proteins from the oxygen-evolving complex of photosystem II from higher plants
KOHOUTOVÁ, Jaroslava
All life on earth depends mainly on the presence of oxygen. Largest producers of oxygen are green plants, cyanobacteria and algae. Oxygen is released from the oxygenevolving complex of photosystem II during photosynthesis and it is used in cellular respiration of all life complexes. The oxygen-evolving complex of photosystem II has the same function in each photosynthetic organism, but it has a different composition and organization of extrinsic proteins; only PsbO protein is ubiquitous in all known oxyphototrophs. Until now only low resolution electron microscopy structural models of plant PSII and crystal structures of cyanobacterial PSII are available. Higher plant extrinsic proteins (PsbP, PsbQ and PsbR) are structurally unrelated, non-homologues to the cyanobacterial extrinsic proteins (PsbO, PsbU and PsbV) and this is the reason why it is not possible to predict arrangement of these proteins on the lumenal site of higher plant PSII. Recently, models differ mainly in the structure of the oxygen-evolving complex, which could be resolved by determination of the exact binding sites for extrinsic proteins. An other question evolves: if the difference in the oxygen-evolving complex composition is the result of evolution or adaptation of photosynthetic organisms to their environment. Structural knowledge of extrinsic proteins that could help to resolve the location and subsequently the function of extrinsic proteins is still incomplete. From this case,structural analysis, interactions and probably arrangement of proteins PsbP and PsbQ was studied and is described in detail in this thesis.
|
guest ::
