|
|
Ramanova spektroskopie biologicky aktivních látek a protinádorových léčiv
Třeštíková, Liběna ; Vetterl,, Vladimír (oponent) ; Vrána, Oldřich (vedoucí práce)
SERRS spektra biologických materiálů jsou velmi komplexní, neboť zahrnují dohromady signály všech přítomných molekul. Svoji pozornost jsem zaměřila zejména na SERRS spektra protinádorových látek a jejich komplexů s dvoušroubovicí DNA. Bylo studováno léčivo doxorubicin a jeho deriváty, jenž by mohly být využity při léčbě nádorových onemocnění. Doxorubicin, který patří do skupiny antracyklinových antibiotik, se již používá při potlačování bujení rakovinových buněk, ale hledají se nové možnosti léčby s vyšší efektivitou a s nižší úrovní nežádoucích účinků. SERRS představuje jednu z možností studia těchto látek a jejich interakcí s DNA.
|
|
|
Molekulární mechanismus protinádorového působení nového platinového cytostatika
Jahn, Kamil ; Vrána, Oldřich (oponent) ; doc. RNDr. Jana Kašpárková, Ph.D (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá studiem mechanismů protinádorového působení nového platinového cytostatika. Vlastnosti doposud neznámého dinukleárního komplexu platiny s označením BBR3571 – DACH byly paralelně studovány spolu s klinicky prověřeným a užívaným mononukleárním komplexem DACH. Dřívější studie prokázaly, že cílovým místem působení cytostatik na bázi komplexů platiny je DNA. Po modifikaci DNA výše uvedenými komplexy byly pomocí různých bioanalytických metod (diferenční pulsní polarografie, UV-VIS spektrofotometrie, fluorescenční spektrofotometrie, CD spektroskopie a elektroforézy) sledovány pozměněné vlastnosti této makromolekuly a zkoumán byl také způsob vazby obou komplexů na DNA. Výsledky ukázaly, že se oba studované komplexy vyznačují poměrně rychlou vazbou na DNA. U obou komplexů je také zřejmá tvorba bifukčních aduktů. Stabilizační efekt na DNA byl významný zejména po modifikaci dinukleárním komplexem, zatímco denaturační efekt se vůbec neprokázal.Ukázalo se také, že komplex BBR3571-DACH pravděpodobně nevytváří můstky dlouhého dosahu, tak jako jiné dříve studované polynukleární komplexy platiny.
|
|
|
Tolerance poškození DNA novými, biologicky aktivními komplexy platiny
Vystrčilová, Jana ; Vrána, Oldřich (oponent) ; Nováková,, Olga (vedoucí práce)
Protinádorová aktivita platinových cytostatik je spojována se schopností těchto látek interagovat s DNA. Platinové komplexy mohou změnit strukturu DNA modifikováním bází, zejména quaninů. Biologickým důsledkem takovýchto interakcí jsou změny v replikaci a transkripci. Komplex RNA polymerázy je zastaven v místě poškození DNA a tím označí lézi pro opravné proteiny, které se uplatňují v nukleotidové excizní opravě. Tento mechanismus opravy je spojován s odstraněním objemných DNA poškození z genomu. Hlavním cílem této práce bylo studovat toleranci poškození DNA způsobenými vazbou nových, biologicky aktivních komplexů platiny (II), které obsahují deriváty aromatických cytokininů jako ligandů; cis-[Pt (2-chlor-6-(4-methoxybenzylamino) - 9-isopropylpurin)2Cl2] (PR-001), cis-[Pt (2-chlor-6-(benzylamino)-9-isopropylpurin)2 Cl2 ] (PR-002) a cis-[Pt (2 - (3-hydroxypropylamino) -6 - (benzylamino)-9-isopropylpurin)2 Cl2] (PR-005). Byly připraveny konstrukty DNA, které obsahovaly jednu specifickou DNA lézi a promoterovou sekvenci pro lidskou RNA polymerázu II a bakteriofágovou T7 RNA polymerázu. Metoda přípravy konstruktu využívá polymerázové řetězové reakce (PCR) a biotin-streptavidin interakcí na paramagnetických částicích k purifikaci konečného produktu. Syntetické oligomery (75-mer, 56-mer a 15-mer) jsou ligovány na 5´-biotinovaný pCI-neo-G-less-T7 PCR fragment, kde 15-mer je buď nemodifikován nebo modifikován komlexem PR-005 a cisplatinou. Také byla studována inhibice RNA polymerázové aktivity na globálně modifikovaných plazminech pCI-neo a pUC19 novými platinovými komplexy a cisplatinou. Zjistili jsme, že bifunkční adukty komplexu PR-005 na rozdíl od aduktů PR-001 a PR-002 účinně snižují množství transkriptu plné délky syntetizovaných oběma polymerázami. Tento výsledek lze vysvětlit tím, že vnitrořetězcový můstek a velké aromatické neodstupující ligandy komplexu PR-005 tvoří pro polymerázy výraznou stérickou překážku.
|
|
|
Elektrochemická detekce purinových metabolitů a jejich isosterů
Spružinová, Petra ; Vrána, Oldřich (oponent) ; Jelen,, František (vedoucí práce)
Analýza některých důležitých purinových derivátů katabolického cyklu purinu a allantoinu byla provedena pomocí elektrochemických měření. Stanovení je založeno na tvorbě komplexu purin-Cu (I) na pracovní elektrodě, kterou může být visící rtuťová kapková elektroda nebo uhlíková pastová elektroda. Rozpuštění komplexu vhodnou změnou potenciálu má za následek vznik voltametrického signálu, který je mírou obsahu purinu ve vzorku. Metoda byla optimalizována a byly naměřeny kalibrační křivky pro uvedené látky.
|
|
|
Tolerance poškození DNA novými, biologicky aktivními komplexy platiny
Vystrčilová, Jana ; Vrána, Oldřich (oponent) ; Nováková,, Olga (vedoucí práce)
Protinádorová aktivita platinových cytostatik je spojována se schopností těchto látek interagovat s DNA. Platinové komplexy mohou změnit strukturu DNA modifikováním bází, zejména quaninů. Biologickým důsledkem takovýchto interakcí jsou změny v replikaci a transkripci. Komplex RNA polymerázy je zastaven v místě poškození DNA a tím označí lézi pro opravné proteiny, které se uplatňují v nukleotidové excizní opravě. Tento mechanismus opravy je spojován s odstraněním objemných DNA poškození z genomu. Hlavním cílem této práce bylo studovat toleranci poškození DNA způsobenými vazbou nových, biologicky aktivních komplexů platiny (II), které obsahují deriváty aromatických cytokininů jako ligandů; cis-[Pt (2-chlor-6-(4-methoxybenzylamino) - 9-isopropylpurin)2Cl2] (PR-001), cis-[Pt (2-chlor-6-(benzylamino)-9-isopropylpurin)2 Cl2 ] (PR-002) a cis-[Pt (2 - (3-hydroxypropylamino) -6 - (benzylamino)-9-isopropylpurin)2 Cl2] (PR-005). Byly připraveny konstrukty DNA, které obsahovaly jednu specifickou DNA lézi a promoterovou sekvenci pro lidskou RNA polymerázu II a bakteriofágovou T7 RNA polymerázu. Metoda přípravy konstruktu využívá polymerázové řetězové reakce (PCR) a biotin-streptavidin interakcí na paramagnetických částicích k purifikaci konečného produktu. Syntetické oligomery (75-mer, 56-mer a 15-mer) jsou ligovány na 5´-biotinovaný pCI-neo-G-less-T7 PCR fragment, kde 15-mer je buď nemodifikován nebo modifikován komlexem PR-005 a cisplatinou. Také byla studována inhibice RNA polymerázové aktivity na globálně modifikovaných plazminech pCI-neo a pUC19 novými platinovými komplexy a cisplatinou. Zjistili jsme, že bifunkční adukty komplexu PR-005 na rozdíl od aduktů PR-001 a PR-002 účinně snižují množství transkriptu plné délky syntetizovaných oběma polymerázami. Tento výsledek lze vysvětlit tím, že vnitrořetězcový můstek a velké aromatické neodstupující ligandy komplexu PR-005 tvoří pro polymerázy výraznou stérickou překážku.
|
|
|
Ramanova spektroskopie biologicky aktivních látek a protinádorových léčiv
Třeštíková, Liběna ; Vetterl,, Vladimír (oponent) ; Vrána, Oldřich (vedoucí práce)
SERRS spektra biologických materiálů jsou velmi komplexní, neboť zahrnují dohromady signály všech přítomných molekul. Svoji pozornost jsem zaměřila zejména na SERRS spektra protinádorových látek a jejich komplexů s dvoušroubovicí DNA. Bylo studováno léčivo doxorubicin a jeho deriváty, jenž by mohly být využity při léčbě nádorových onemocnění. Doxorubicin, který patří do skupiny antracyklinových antibiotik, se již používá při potlačování bujení rakovinových buněk, ale hledají se nové možnosti léčby s vyšší efektivitou a s nižší úrovní nežádoucích účinků. SERRS představuje jednu z možností studia těchto látek a jejich interakcí s DNA.
|
|
|
Molekulární mechanismus protinádorového působení nového platinového cytostatika
Jahn, Kamil ; Vrána, Oldřich (oponent) ; doc. RNDr. Jana Kašpárková, Ph.D (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá studiem mechanismů protinádorového působení nového platinového cytostatika. Vlastnosti doposud neznámého dinukleárního komplexu platiny s označením BBR3571 – DACH byly paralelně studovány spolu s klinicky prověřeným a užívaným mononukleárním komplexem DACH. Dřívější studie prokázaly, že cílovým místem působení cytostatik na bázi komplexů platiny je DNA. Po modifikaci DNA výše uvedenými komplexy byly pomocí různých bioanalytických metod (diferenční pulsní polarografie, UV-VIS spektrofotometrie, fluorescenční spektrofotometrie, CD spektroskopie a elektroforézy) sledovány pozměněné vlastnosti této makromolekuly a zkoumán byl také způsob vazby obou komplexů na DNA. Výsledky ukázaly, že se oba studované komplexy vyznačují poměrně rychlou vazbou na DNA. U obou komplexů je také zřejmá tvorba bifukčních aduktů. Stabilizační efekt na DNA byl významný zejména po modifikaci dinukleárním komplexem, zatímco denaturační efekt se vůbec neprokázal.Ukázalo se také, že komplex BBR3571-DACH pravděpodobně nevytváří můstky dlouhého dosahu, tak jako jiné dříve studované polynukleární komplexy platiny.
|
|
|
Elektrochemická detekce purinových metabolitů a jejich isosterů
Spružinová, Petra ; Vrána, Oldřich (oponent) ; Jelen,, František (vedoucí práce)
Analýza některých důležitých purinových derivátů katabolického cyklu purinu a allantoinu byla provedena pomocí elektrochemických měření. Stanovení je založeno na tvorbě komplexu purin-Cu (I) na pracovní elektrodě, kterou může být visící rtuťová kapková elektroda nebo uhlíková pastová elektroda. Rozpuštění komplexu vhodnou změnou potenciálu má za následek vznik voltametrického signálu, který je mírou obsahu purinu ve vzorku. Metoda byla optimalizována a byly naměřeny kalibrační křivky pro uvedené látky.
|
|
| |
|
| |
host ::
RSS.