|
|
The Overlooked Fact: the Critical Role of Bioinformatics Pipeline in Microbiome Analysis
Polakovičová, Petra
The research on the human microbiome has gained significant popularity over the past couple of years across both scientific and public communities. This area has revealed considerable knowledge, mainly thanks to next-generation sequencing. Even though technology possibilities evolve faster than ever, and there is an enormous amount of publicly available data, there are not yet precise procedures, methods, and bioinformatics tools to work accurately enough with microbiome data, and there are no standardized recommendations for bioinformatics pipelines to assess the most accurate results. Here, we demonstrate the potential inaccuracies that can arise from various bioinformatics processing of amplicon 16S RNA sequencing data by performing a comparative analysis of diverse pipeline configurations using mock community samples and biological material originating from biopsy samples obtained during regular colonoscopy from patients with primary sclerosing cholangitis.
|
|
|
Schistosoma mansoni (Trematoda): Differences in the biology of geographical strains
Žirovnická, Tereza ; Macháček, Tomáš (advisor) ; Peterková, Kristýna (referee)
This bachelor thesis discusses the geographical strains of the fluke Schistosoma mansoni and summarizes the knowledge of their differences. The thesis aims to conduct literature research of comparative studies mentioning descriptions of specific strains of S. mansoni and then to identify differences across those geographic strains. Among the relevant data subjected to comparisons, besides morphological and anatomical differences, the prepatent period, the distribution of eggs in the host and the caused pathology, including the granuloma formation, were mentioned too. The results of this work confirm that the specific geographical isolates differ from each other in various aspects, often even within the same strain. Geographic strains are unevenly represented in studies, and this may bias our view of selected aspects of schistosome biology through the results of dominant strains. It is therefore important to encourage further, diversified research that considers all experimental factors. The obtained knowledge about the characteristics of geographic strains can provide important information for the development of strategies to control schistosomiasis and benefit negatively affected populations worldwide. Keywords: Schistosoma mansoni, schistosomiasis, geographical strain, comparative analysis,...
|
|
|
Transfer Pricing Documentation for a Manufacturing Company
Půčková, Zuzana ; Solilová,, Veronika (referee) ; Brychta, Karel (advisor)
The diploma thesis focuses on the creation of transfer pricing documentation for a company acting as a contract manufacturer with the aim of creating an instrument that will make it easier for the taxpayer to bear the burden of proof. The theoretical part of the thesis defines the basic conceptual apparatus together with the basic principles and legal regulation of transfer pricing. The second part deals with the compilation of a detailed framework for the creation of transfer pricing documentation. The last part of the thesis is devoted to the creation of documentation using the created instructions in the analytical part.
|
|
|
Application of Multi-Criteria Decision Making Methods in a Selected Company
Babela, Viliam Igor ; Dostál, Petr (referee) ; Doskočil, Radek (advisor)
Tato diplomová práce aplikuje vybrané metody multikriteriálního rozhodování k výběru optimální země pro expanzi slovenské společnosti situované na trhu hygienických a papírenských výrobků. Prostřednictvím zaměřené komparativní analýzy se hodnotí vybrané země na základě kritických kritérií, jako jsou velikost trhu, regulační prostředí, logistické schopnosti a náklady na práci. Výsledky poskytují strategická doporučení, která mají společnosti pomoci učinit informované a na datech založené rozhodnutí o mezinárodní expanzi.
|
|
|
Computational Methods for Comparative Music Performance Analysis
Ištvánek, Matěj ; Róka,, Rastislav (referee) ; Jirásek, Ondřej (referee) ; Smékal, Zdeněk (advisor)
Zvyšující se dostupnost digitálního hudebního obsahu a různých interpretací hudebních děl zároveň podněcuje vývoj výpočetních metod oboru získávání hudebních informací (MIR). Tento rozvoj ale nemusí být vždy reflektován v souvisejících oblastech – například v analýze interpretačního výkonu (MPA). Hlavním tématem této disertační práce je využití výpočetních metod a digitálního zpracování hudby pro cíle MPA. Tato práce se zabývá principy MIR pro analýzu a porovnání rozdílů hudebních výkonů a jejich parametrů. Práce analyzuje limitace detektorů nástupů tónů a dob založených na konvenčních přístupech a na strojovém učení, při degradaci vstupního signálu, snížení vzorkovací frekvence, nebo v komplexnějších hudebních strukturách. Dále ukazuje možnosti použití hudební synchronizace, extrakce parametrů a výběru příznaků na originálních datech smyčcových kvartetů pro binární klasifikaci původu interpretů. Na závěr demonstruje vyvíjený software pro komparativní analýzu hudby, který kombinuje přívětivé uživatelské prostředí pro přehrávání, navigaci a vizualizaci dat hudebního výkonu s výpočetními metodami MIR.
|
|
|
Comparative analysis of professional texts on computer science
Chufarov, Evgeny ; Sučková, Magda (referee) ; Zmrzlá, Petra (advisor)
Cílem této bakalářské práce je srovnávací analýza odborných textů z oblasti informatiky. Jako téma pro materiály byla zvolena technologie VxLAN, která je nejčastěji používána v datových centrech. Prvním textem pro analýzu je článek z webového časopisu, druhým je technická dokumentace Request for Comments (RFC), třetím je video přednáška. Hlavním cílem této práce je prozkoumat vybrané materiály z různých pohledů a určit, do jaké míry se texty, psané a mluvené, liší v použití jazyka a jaké jsou jejich společné rysy. K dosažení tohoto cíle jsou materiály zkoumány z hlediska několika diskurzních rysů, mezi které patří funkce jazyka, styl a žánr, koheze, koherence a deixe. Práce se také zaměřuje na zjištění, zda jsou analyzované materiály typickými představiteli svých žánrů a stylů.
|
|
|
Commented translation III
Klouda, Adam ; Kotásek, Miroslav (referee) ; Krhutová, Milena (advisor)
Cílem semestrální práce “Elektrotechnika – komentovaný překlad” je překlad českého odborného textu do angličtiny, který slouží jako studijní materiál pro studenty elektrotechnologie, a provést komparativní analýzu originálu a přeloženého textu. Zdrojový text je rozdělen do devíti kapitol, z kterých bylo vybráno několik výňatků na nichž byla následně provedena analýza z lingvistického hlediska. Každý z nich se zabývá jinou oblastí elektrotechniky a použivá k tomu odlišnou škálu odborných výrazů. Tato bakalářská práce take nabízí základní teorii zabývající se překladem textů psaných ve stylu vědy a techniky.
|
|
|
Information System Selection
Kornelly, Roman ; Minařík, Luděk (referee) ; Koch, Miloš (advisor)
The thesis aims to describe the selection of a new information system, which should lead to process streamlining and a boost in the number of customers at Rumburak s.r.o. The first chapter lays out the theoretical knowledge needed to tackle the task at hand. The following section analyzes the internal and external environment of the company and the implications thereof. The proposal portion contains a comparison of the available information systems and selects the best among them. It develops a schedule for the implementation of the new IS, along with identifying the benefits and economic evaluation of the entire proposal.
|
|
|
Comparative analysis of professional texts
Mošnerová, Tereza ; Krhutová, Milena (referee) ; Zmrzlá, Petra (advisor)
Tato bakalářská práce analyzuje tři odborné texty z oblasti elektrotechniky. Prvním textem, který byl pro tuto analýzu zvolen, je vysokoškolská učebnice, druhým je populárně naučný vědecký článek a třetím technická přednáška. Všechny texty seznamují čtenáře s tématem operačních zesilovačů. Tato práce komentuje zmíněné žánry a jejich typické znaky, avšak jejím hlavním záměrem je analýza kohezních řetězců. Analyzována je jak gramatická a lexikální koheze, tak výskyt a užití klíčových výrazů v kohezních řetězcích. Všechny položky kohezních řetězců jsou vloženy do několika tabulek a je zjištěn procentuální výskyt jednotlivých kategorií. Vychází najevo, že v každém z vybraných textů lexikální koheze značně převažuje nad gramatickou, přičemž zajímavé rozdíly jsou dány srovnáním jednotlivých textů a kohezních prostředků v nich se vyskytujících.
|
|
|
Comparative analysis of the use of methodologies for properties evaluation in Germany for expert practice in the Czech Republic
Imrišová, Ivana ; Korytárová, Jana (referee) ; Hyánek,, Vladimír (referee) ; Kledus, Robert (advisor)
The subject of the dissertation is the analysis of conditions for the work of real estate appraisers in the Federal Republic of Germany in comparison with the conditions in the Czech Republic with the aim of finding suitable practices that could be used for the work of experts in the Czech Republic. The thesis also includes proposals for suitable measures that can contribute to the development of expert activities in the Czech Republic, focusing on solving problems related to the determination of the exchange value of immovable property. This analysis includes the analysis of real estate types that are subject to assessment in the given area, approaches to solving valuation problems, methods that are used in valuing immovable assets, entities that are authorized to submit expert opinions, as well as content requirements of expert opinions.
|
guest ::
