|
Vyšetření specifických IgG pomocí metody ELISA
ŠANTRŮČKOVÁ, Kamila
Cílem této práce je stanovit hodnoty specifických IgG anti-SARS-CoV-2 pomocí metody ELISA u vybraných osob a zhodnotit, zdali je kit QuantiVac ELISA (IgG) vhodný ke stanovení. V teoretické části je bakalářská práce zaměřena na imunochemické metody. Imunochemické metody jsou založené na vzájemné interakci antigenu a protilátky. Díky imunochemickým metodám můžeme stanovit přítomnost specifických protilátek. Jednou z významných imunochemických metod je ELISA neboli Enzyme-linked immunosorbent assay. ELISA je speciálním druhem enzymové imunoanalýzy. Základním principem je interakce antigenu a protilátky za vzniku imunokomplexu. Aby byl tento imunokomplex měřitelný, musí se přidat konjugát, který způsobí barevnou reakci. Praktická část je zaměřená na vyšetření specifických protilátek třídy IgG proti SARS-CoV-2. Bylo vyšetřováno šestnáct vzorků lidského séra. Vyšetřované sérum bylo od osob různých věkových skupin. Séra byla od osob s očkováním, s očkováním a prodělaným onemocněním Covid 19, neočkovaných s prodělaným onemocněním Covid 19 anebo od neočkovaných osob co neprodělaly onemocnění Covid 19. Dále bylo měřeno šest kalibrátorů, pozitivní a negativní kontrola. Celkem bylo obsazeno 24 mikrotitračních jamek. Byla použita testovací sada Anti-SARS-CoV-2 QuantiVac ELISA od firmy EUROIMMUN. Vše bylo měřeno pomocí fotometru DYNAREAD a zpracováno pomocí softwaru AlaDYN. Výsledkem byly různé hladiny protilátek. Z šestnácti vzorků sér vyšly 2 vzorky jako negativní, jeden vzorek vyšel jako hraniční a 13 vzorků vyšlo pozitivně.
|
|
Příprava tablet selektivním laserovým sintrováním.
Ficek, Lukáš ; Mužíková, Jitka (vedoucí práce) ; Šnejdrová, Eva (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra: Farmaceutická technologie Školitel: doc. PharmDr. Jitka Mužíková, Ph. D. Konzultant: Mgr. Thao Tranová Posluchač: Lukáš Ficek Název diplomové práce: Příprava tablet laserovým sintrováním Práce se zabývá přípravou tablet dispergovatelných v ústech pomocí selektivního laserového sintrování (SLS). Jedná se o pilotní studií prováděnou na 3D tiskárně Sintratec Kit na katedře Farmaceutické technologie. SLS je metoda 3D tisku založená na slinování částic prášku pomocí laserového paprsku, který jednotlivé částice spéká do vrstev materiálu. V práci byl použit matrici tvořící polymer Kollidon® VA64, který byl kombinován se dvěma pigmenty, a to Candurin® Gold Sheen a NTX Ruby Red. Dále byly použity směsi tohoto polymeru s koprocesovaným suchým pojivem Prosolv® ODT G2 a fyzikální směsí mannitolu, silicifikované mikrokrystalické celulózy a krospovidonu v koncentracích 20 %, 40 % a 60 %. Testován byl vliv parametrů tisku, zejména rychlosti laseru, na kvalitativní vlastnosti tablet. Pro finální tisk tablet byl vybrán pigment NTX Ruby Red. Nejlepší práškovou formulací pro optimální průběh tisku a kvalitativní vlastnosti tablet dispergovatelných v ústech byla směs Kollidonu® VA64 s přídavkem 40 % Prosolvu® ODT G2 nebo fyzikální směsi. Bylo...
|
|
Test benches for microcontroller kits
Žaludek, Ivo ; Arm, Jakub ; Bradáč, Zdeněk
This paper deals with the design of a test bench for modules used in educational labs. The first section outlines the requirements for the tester, followed by a description of the printed circuit board design process. Implementation details of the software are then examined, including a graphical user interface based on Model-View-Controller (MVC) architecture that allows for easy result printing. The obtained results are presented, and further work is discussed.
|
|
Srovnání podobností hmotnostních spekter a struktur malých molekul
Malíčková, Viktorie ; Galgonek, Jakub (vedoucí práce) ; Škrhák, Vít (oponent)
Metody pro měření podobnosti hmotnostních spekter a struktur malých molekul jsou důležité pro pokroky v lékařské chemii, farmakologii a metabolomice. Mezi běžně využívané metody pro porovnání hmotnostních spekter molekul patří kosinová podobnost. Jedná se o míru podobnosti mezi dvěma nenulovými vektory, která měří kosinus úhlu mezi nimi. Porovnání hmotnostních spekter molekul umožňuje vyhledávání v databázích molekul, klastrování spekter a vyhledávání ve spektrálních knihovnách. Strukturní podobnost se pak měří na základě nejrůznějších molekulárních fungerprintů, jako jsou například Daylight fingerprint, RDKit fingerprint, Atom-Pair Fingerprint, Topological Torsion Fingerprint, Extended-Connectivity Fingerprint a další. Tyto fingerprinty jsou pak porovnávány pomocí koeficientů podobnosti. Zmíněné metody pro porovnávání struktur a hmotnostních spekter molekul lze aplikovat pomocí bioinformatických knihoven RDKit a CDK pro generování a analýzu strukturních fingerprintů a knihovny matchms pro porovnání hmotnostních spekter. Práce poskytuje teoretický přehled jak molekulárních deskriptorů, zahrnující rozmanité typy molekulárních fingerprintů a techniky pro měření strukturní podobnosti, tak principu hmotnostní spektrometrie a přístupu k porovnání hmotnostních spekter. Praktická část práce je zaměřena na...
|
|
Zkoumání změn v epigenetických modifikacích v mozku potkana vyvolaných působením morfinu
Hronová, Anna ; Novotný, Jiří (vedoucí práce) ; Roubalová, Lenka (oponent)
Tato práce se zabývala vlivem různě dlouhých abstinenčních období na epitran- skriptomickou modifikaci m6 A a enzymy účastnící se této modifikace, stejně jako na transkripční faktory v mozku potkanů závislých na morfinu. Použité metody zahrnovaly využití kolorimetrického kitu pro určení hladin m6 A a Western blot metodu pro kvantifikaci hladin enzymů a transkripčních faktorů. Výsledky ukázaly, že různě dlouhé úseky morfinové abstinence neměly významný vliv na m6 A modi- fikaci, což naznačuje, že tato dráha pravděpodobně nebyla ovlivněna morfinovou abstinencí. Nicméně byly pozorovány signifikantní změny v hladinách enzymů, které jsou zapojené do regulace m6 A, které byly místně a časově specifické, bez jasného trendu. Zkoumání transkripčních regulátorů ∆FosB a MeCP2 taktéž odha- lilo signifikantní změny jen v některých částech mozku a v určitých časech, ale bez jasného trendu ve změnách hladin. Výsledkem této práce je, že dynamika hladin transkripčních regulátorů, N6 6-metyl-adenosinu a enzymů, které se účastní m6 A modifikace je místně a časově specifické a otevírá nové otázky ohledně mechanismů, které řídí neurobiologické pochody během abstinenčního období.
|
|
Laboratorní diagnostika microRNA u různých diagnostických skupin
Hrachovcová, Eliška ; Urbánková Rathouská, Jana (vedoucí práce) ; Tripská, Katarína (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biologických a lékařských věd Student: Bc. Eliška Hrachovcová Vedoucí diplomové práce: PharmDr. Jana Rathouská, Ph.D. Konzultant diplomové práce: doc. RNDr. Pavlína Kušnierová, Ph.D. Název diplomové práce: Laboratorní diagnostika microRNA u různých diagnostických skupin Cíl práce: Identifikace potenciálních miRNA cílů pro diferenciální diagnostiku pacientů s aterosklerózou a demencí. Porovnání exprese a záchytu miRNA ve vzorcích séra se vzorky mozkomíšního moku. Výběr vhodných miRNA v rámci diferenciální diagnostiky u pacientů s aterosklerózou a s demencí. Dále také výběr miRNA cílů s co nejvýraznější fold-change a zároveň co nejnižší p-hodnotou pro následnou validační studii. Metody: Pro identifikaci potenciálních miRNA byly přijaté vzorky centrifugovány, alikvotovány a skladovány při - 80C. miRNA byla izolována pomocí kitu iCatcher Circulating cfRNA 1000 kit a izolátoru CatchGene. Poté byla provedena reverzní transkripce a amplifikace s detekcí. Data byla zpracována v Excelu a následně statisticky zpracována v programu GenEx pomocí Mann- Whitney testu. Výsledky: Výsledky byly hodnoceny pro 2 skupiny pacientů: skupinu A (vzorky pacientů s Parkinsonovou nemocí a demencí) a skupina B (s aterosklerózou a demencí). Byla hodnocena...
|
|
Komplexní molekulární diagnostika gastrointestinálních stromálních nádorů
Kalfusová, Alena ; Kodet, Roman (vedoucí práce) ; Mandys, Václav (oponent) ; Vaněček, Tomáš (oponent)
Komplexní molekulární diagnostika gastrointestinálních stromálních nádorů ABSTRAKT Většina gastrointestinálních stromálních nádorů (GIST) je charakterizována přítomností aktivačních mutací v genech KIT a PDGFRA (80 - 85 %). Ve skupině KIT/PDGFRA nemutovaných GIST (10 - 15 %) byly detekovány mutace v genech BRAF, KRAS, defekty v komplexu SDH nebo fúze FGFR1::TACC1, ETV6::NTRK3. Cílená terapie Imatinib mesylátem (IM) znamenala významný průlom v terapii GIST. Výrazným problémem cílené terapie je vznik primární nebo sekundární rezistence. Biologické chování GIST je nepředvídatelné. Stanovení proliferační aktivity vybraných markerů proliferace a senescence umožní objektivizovat riziko agresivního chování nádoru. Cílem první části naší práce byla mutační analýza genů KIT a PDGFRA a detekce sekundárních mutací u pacientů s progresí onemocnění. V 83.5 % vzorků jsme detekovali primární mutace v genech KIT a PDGFRA. U 16 pacientů s progresí onemocnění jsme prokázali přítomnost sekundárních mutací (v 29 progresivních ložiscích - 69 %). Potvrdili jsme výraznou intranádorovou a rovněž internádorovou heterogenitu sekundárních mutací. Cílem druhé části práce byla analýza alterací ve skupině KIT/PDGFRA nemutovaných GIST. V této skupině GIST jsme prokázali defekty v podjednotkách SDH komplexu, mutace v genech BRAF a NF1 a...
|
|
Generace trombinu u patofyziologických stavů
Malíková, Ivana
Úvod: Trombofilní stavy mohou být provázeny zvýšenou generací trombinu, zvláště pak v těhotenství, kdy nárůst generace trombinu vyplývá z řady změn v hemostatickém systému. Při podávání antikoagulační léčby je žádoucí nárůst generace trombinu snížit. Cíle studie: Jedním z cílů naší studie bylo porovnat generaci trombinu u jedinců s prokázanou mutací faktoru V Leiden a jedinců se zvýšenou hladinou faktoru VIII. Dalším úkolem bylo porovnat pacienty s VTE s prokázanou mutací faktoru V Leiden (nebo bez ní) a užívající rozdílnou antikoagulační léčbu. Posledním cílem bylo posoudit generaci trombinu u těhotných žen a jejich odpovědi na podávání LMWH při závažném trombofilním stavu. Soubor pacientů a metody: Do kontrolní skupiny bylo zařazeno 170 zdravých dárců krve, do skupiny vrozené a získané trombofilie bylo zahrnuto 44 jedinců s mutací faktoru V Leiden a 38 jedinců s hladinou faktoru VIII >150 % bez další prokázané trombofilie. Do skupiny s antikoagulační léčbou bylo zařazeno 347 jedinců s VTE užívajících přímé inhibitory koagulace. Do skupiny těhotných žen bylo zařazeno 60 žen s profylaktickou dávkou LMWH. Pro sledování generace trombinu jsme použili kit Technothrombin® TGA RC Low a RC High a analyzátor Ceveron® Alpha. Výsledky: Zvýšená generace trombinu byla nalezena u skupiny s vysokým faktorem...
|
|
Mobilní kamera realizovaná prostředky ROS2
Onderka, Daniel ; Peringer, Petr (oponent) ; Janoušek, Vladimír (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá middlewarem Robot Operating System 2. Konkrétně je jejím cílem prozkoumat a demonstrovat jeho možnosti. Použitým hardwarem je robot Adeept AWR 4WD. Jádrem této práce je implementace systému na jeho řízení. Výsledek nabízí jak režim manuálního ovládání, tak režim automatického bloudění s vyhýbáním se překážkám. Kromě čistého ROS2 se práce zabývá také souvisejícími technologiemi. Jednou z nich je Gazebo simulátor, do kterého byla replikována veškerá funkcionalita fyzického robota. Adeept AWR byl také doplněn o rozšiřující hardware, který umožnil použití knihoven slam_toolbox a Nav2 pro mapování a navigaci. Posledním rozšířením je použití ros2_control k řízení pohybu robota.
|
|
Sensor for bars of mallet percussion instruments
Pribol, Sebastián ; Balík, Miroslav (oponent) ; Jirásek, Ondřej (vedoucí práce)
This thesis addresses the issue of capturing melodic percussion instruments using dynamic sensors that can be attached to a musical instrument. It includes theoretical knowledge, analysis, and selection of appropriate sensing methods, and the actual implementation, which consists of testing, integration with MIDI, manufacturing of the device itself, and final calibration and adjustments for proper functionality. The device uses an ESP32-S3 Dev Kit N8R8 microcontroller, which was programmed in the Arduino IDE for proper operation. The device consists of twelve piezoelectric sensors that capture the dynamics of playing the musical instrument and send MIDI information to a DAW via a Bluetooth module.
|