|
Řízení enzymatické aktivity molekuly kreatinkinázy změnami její konformace
Horníková, Daniela
Konformační změny myofibrilární kreatinkinázy byly studovány za účelem sledování jejich významu v řízení enzymatické aktivity. Získaná data pomocí fluorescence a absorpční spektroskopie ukazují na tři konformační stavy v závislosti na vazbě substrátů. Tak, jak se snižoval poloměr CK molekuly pod vlivem vazby substrátů v uspořádání: CK volná, komplex CK-ATP+kreatin a komplex CK-ATP, tak se ve stejném uspořádání snižoval poločas života emise fluorescence (lifetimes) 2.72, 2.42, 2.38 ns vnitřních tryptofanových zbytků, pokles anisotropie, rotační korelační časy 35, 29, 27 ns a zhášení akrylamidem. Data byla potvrzena měřením anizotropie u fluorescenčně značené CK (CK-FITC), které poskytlo korelační časy 34, 30, 27 ns. Výsledky ukazují, že vedle "minimalizačního energetického principu", který se projevil konformačními změnami při vazbě substrátů, existuje ještě další esenciální komponenta odpovědná za fyziologické řízení enzymatické aktivity na subcelulární úrovni, která se účastní přechodu CK-ATP+creatine komplexu z intermediární (nereaktivní) konformace do uzavřené (reaktivní) konformace molekuly. Klíčová slova: kreatinkináza, konformační závislot na substrátech, enzymatická aktivita
|
|
Modulace exprese alfa-synukleinu pomocí působení 5-S-cysteinyldopaminu na buňky lidského neuroblastonu SH-SY5Y: možná úloha katecholthioetherů při neurodegeneraci
Hrabáková, Rita ; Štaud, František (vedoucí práce) ; Mladěnka, Přemysl (oponent)
Souhrn -Synuklein je presynaptický protein, který hraje důležitou roli v etiopatogenezi Parkinsonovy choroby (Parkinson's disease - PD). Jeho přirozenou funkcí je udržování homeostázy dopaminu prostřednictvím inhibice tyrosinhydroxylázy, regulací dopaminového transportéru a potencionální rolí v uskladnění dopaminu do vezikul. Tento přirozeně rozvinutý protein může být vlivem toxických působků a oxidativního stresu více exprimován a agregován. Jeho agregace vede ke ztrátě funkce způsobující dysregulaci dopaminových drah s následným vzestupem dopaminu v cytosolu, který ještě zesiluje neurotoxický efekt synukleinových agregátů. 5-S-Cysteinyl-dopamin (Cys-DA), katecholthioetherový metabolit dopaminu, který byl nedávno objeven v dopaminergních oblastech mozku (zvláště v Substantia nigra), se zdá být pravděpodobným ukazatelem oxidativního stresu během stárnutí a neurodegenerace. Protože Cys-DA a jeho metabolity mohou být endogenními neurotoxiny zodpovědnými za neurodegeneraci u PD, cílem naší práce bylo určit, zda Cys-DA způsobuje overexpresi -synukleinu na translační i transkripční úrovni v buněčném modelu PD - buněčná linie lidského neuroblastomu SH-SY5Y. Buňky byly vystaveny toxickému působení Cys-DA a poté byla hodnocena exprese -synukleinu pomocí Western blotu a Real-time PCR. Cys- DA indukoval...
|
|
Vliv estrogenů na spermie savců.
Šidlová, Adéla ; Šebková, Nataša (oponent) ; Hortová, Kateřina (vedoucí práce)
Po mnoho let byly estrogeny brány jako typicky samičí pohlavní hormony. Dnes už je jisté, že jsou velmi důležité i v regulaci samčí reprodukce. A to ať už je jejich účinek pozitivní či negativní. Endogenní estrogeny jsou u savčích samců důležitou částí endokrinního systému. Estrogeny hrají významnou roli při růstu a udržování kostní hmoty, stejně jako při vývoji zárodečných buněk a při pochodech spermatogeneze. Zdravé spermie jsou esenciální pro úspěšnou reprodukci. A právě endogenní estrogeny se svým vlivem částečně podílejí v regulaci správného vývoje spermií. Vedle pozitivního vlivu endogenních estrogenů je zde ovšem i negativní vliv estrogenů z vnějšího prostředí, tzv. environmentálních estrogenů. Mezi environmentální estrogeny patří chemické látky vznikající lidskou činností, xenoestrogeny, které čím dál více kontaminují životní prostředí. Nebezpečí těchto látek estrogenní povahy se skrývá v jejich schopnosti fungovat jako endokrinní disruptory, které způsobují defekty v řadě aspektů savčí reprodukce. Vzhledem k tomu, že v dnešní době se vyskytuje v prostředí čím dál více environmentálních estrogenů, které mohou interferovat s hormonální drahou savců a ovlivňovat tak jejich reprodukci, je důležité se tomuto tématu věnovat. Reprodukční poruchy, které mohou být vyvolány endokrinními disruptory...
|
|
Studium strukturních rozdílů mezi izoformami 14-3-3 proteinů.
Macáková, Eva ; Gryčová, Lenka (oponent) ; Obšil, Tomáš (vedoucí práce)
Proteiny 14-3-3 jsou regulační proteiny, které se vyskytují v mnoha isoformách ve všech eukaryotických organismech a účastní se řady buněčných dějů. V této práci jsem se zabývala vlivem struktury ohybu H8-H9 u ječmenných isoforem hv 14-3-3A a lidských isoforem 14-3-3ζ na afinitu k vazebnému partnerovi. Z dříve publikovaných výsledků vyplývá, že isoforma hv 14-3-3A se váže s nejmenší afinitou, což může být způsobeno přítomností glycinu v H8-H9 ohybu, na rozdíl od ostatních isoforem, které mají na stejné pozici serin. Vazebnou afinitu jsem zjišťovala jak pro původní protein hv 14-3-3A WT, tak i pro jeho mutant, u kterého byl glycin v H8-H9 ohybu nahrazen serinem. Pro srovnání jsem také provedla měření s lidskou isoformou 14-3-3ζ WT, která v H8-H9 ohybu na studované pozici obsahuje serin, a jejího mutantu, u kterého byl tento serin nahrazen glycinem. Proteiny jsem exprimovala v bakteriích E. coli kmen BL21(DE3) a poté jsem je purifikovala. Disociační konstanty pro vazbu peptidů pRaf značenými sondami FITC a ATTO jsem získala pomocí metod fluorescenční korelační spektroskopie a stacionárního měření intenzity fluorescence. Z naměřených hodnot vyplývá, že v případě lidských i ječmenných isoforem došlo po mutaci ke zhoršení afinty k vazebnému partnerovi.
|
|
Vliv aplikace botulotoxinu na nadměrné svalové napětí a funkční schopnosti pacienta
Kratochvílová, Pavla ; Syslová, Jana (oponent) ; Kraus, Josef (vedoucí práce)
Práce se zabývá vlivem botulotoxinu na nadměrné svalové napětí u 53 dětských pacientů. Jejím cílem je ověřit efekt botulotoxinu na svalové napětí, rozsah pohybu v kloubu a funkční schopnosti pacienta. Teoretická část shrnuje základní poznatky k tomuto tématu, zabývá se charakteristikou spasticity a působením botulotoxinu na svaly s nadměrným svalovým napětím. Praktická část hodnotí efekt botulotoxinu u dvou skupin pacientů. První skupinu tvoří 14 předem vybraných, osobně sledovaných pacientů, kteří prošli vyšetřením v domácím prostředí před aplikací botulotoxinu a za stejných podmínek minimálně měsíc po aplikaci botulotoxinu. Vyšetření zahrnovalo měření rozsahů pohybu v odpovídajících kloubech, hodnocení spasticity dle modifikované Ashworthovy škály, vyplnění globální škály hodnocení spasticity (GSA), vyšetření funkčních schopností za použití testu GMFM a testu WeeFIM a sleduje volbu fyzioterapeutických metod před aplikací botulotoxinu a po ní. Druhou skupinu tvoří 39 pacientů, kteří po dobu jednoho měsíce vyplňovali dotazník subjektivního vnímání nadměrného svalového tonu na základě GSA. Výsledky potvrdily pozitivní vliv botulotoxinu na snížení svalového napětí, zvětšení rozsahu pohybu i na hrubou motoriku pacienta. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
|
|
Vyhodnocení jakosti vody a odtokových poměrů na povodí Jenínského toku.
KROPÁČEK, Robin
Cílem této diplomové práce je vyhodnocení jakosti vody a odtokových poměrů na povodí Jenínského toku. Za tímto účelem bylo provedeno zpracování a analýza dat. Na tomto povodí byly vyhodnocovány dvě subpovodí, označeny jako J1 a J2. Sledované období zahrnuje roky 2008-2012. Výsledky byly porovnávány s léty 1983-1985, kdy byla plocha zájmového území využívána jako orná půda. Vlivem zatravnění a snížení používání hnojiv došlo ke snížení koncentrací všech vyhodnocovaných ukazatelů. Také došlo k výraznému omezení extrémních výkyvů a ustálení koncentrací u vybraných ukazatelů jakosti vody. Nejvýrazněji se změna systému hospodaření projevila u amonných iontů, jejichž průměrná koncentrace se snížila o 79% (J1) a 87% (J2). Bylo tak potvrzeno, že přechod na extenzivní zemědělství má v podhorských oblastech příznivý vliv na jakost vody.
|
|
Vladimír Fultner ve spleti české architektury do roku 1914
Pencák, Marcel ; Švácha, Rostislav (vedoucí práce) ; Wittlich, Petr (oponent) ; Vybíral, Jindřich (oponent)
Práce se zaměřuje na monografické zachycení života a díla Vladimíra Fultnera (1887-1918), jehož jméno bývá v historii české architektury opomíjeno či ponecháváno na okraji. Při podrobném výzkumu se však ukazuje, že jeho tvorba se opírala o nevšední talent, vynikala vysokou uměleckou úrovní a nespornou originalitou na podkladě soudobého architektonického vývoje. Zasluhuje tedy přehodnocení svého významu pro formování domácí modernistické tradice, přestože je soustředěna do nepatrného časového období (1908-1914) a sevřeného realizačního prostoru (Hradec Králové, Jaroměř, Praha, Kutná Hora, Brno). Fultner studoval od podzimu 1904 na české technice v Praze, ale zdejší výuka pozemního stavitelství pod vedením Josefa Schulze a Jana Kouly byla pokrokovými tvůrci považována za zpátečnickou. Pod vlivem agilních spolužáků (P. Janák, J. Chochol, V. Hofman, E. Králík, O. Novotný ad.) se zapojil do činnosti obrodného studentského Spolku posluchačů architektury. Od roku 1906 se řádnému studiu na této škole nevěnoval a vzdělával se zřejmě v okruhu žáků a ateliérových zaměstnanců Jana Kotěry. Stejně jako jeho vrstevníci dostal Fultner možnost pracovat na drobných zakázkách pro výstavu Obchodní a živnostenské komory v Praze v roce 1908, kdy také navázal podnětnou spolupráci s Otakarem Španielem. Krátce po dvacátém roce...
|
|
Interaktivní Java applet pro 3D vizualizaci optického disku oka
Šikl, Jaroslav ; Kolář, Radim (oponent) ; Peter, Roman (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá návrhem a realizací interaktivního Java appletu pro 3D vizualizaci topografie optického disku oka. Primárním účelem 3D vizualizace je oftalmologie a to především při diagnostice zeleného zákalu – glaukomu. Program může sekundárně sloužit i jako názorná pomůcka, pomocí níž je možné prakticky se seznamovat s transformací 2D obrazu na 3D model a s vlivem úprav a nastavování jednotlivých parametrů na vykreslování tohoto modelu ve 3D prostoru. V práci jsou navrženy dvě verze appletu, které byly vytvořeny ve vývojovém prostředí NetBeans verze 5.5, a jejich finální realizace je provedena jako aplikace typu .html, pracující v okně webového prohlížeče s vhodnou mírou uživatelské interaktivity. První verzí realizovaného appletu je jednoduchá intuitivní aplikace, v níž jsou přednastaveny některé parametry zobrazení tak, že po načtení obrázku je automaticky vykreslen 3D model. Applet následně dovoluje nastavovat u tohoto zobrazení velikost, 3D hloubku zobrazení, vyhlazení hran povrchu a možnost volby zobrazení šedotónového, nebo barevného obrázku. Druhá verze realizovaného appletu je rozšířením prvního appletu o možnost zobrazení os x, y, z ve 3D prostoru, vykreslování povrchu 3D modelu pomocí jednotlivých bodů v prostoru, čar nebo sítě, nebo osvětlení jeho povrchu. Software byl otestován na dostupných topografických datech pořízených přístrojem HRT a součástí jsou tedy i ukázky dosažených výsledků. Práce obsahuje také technickou a uživatelskou dokumentaci.
|
|
Hormonální kontrola samčího sexuálního chování u plazů
Schořálková, Tereza ; Kratochvíl, Lukáš (vedoucí práce) ; Landová, Eva (oponent)
Bezpochyby nejdůležitější hormon, který ovlivňuje typické samčí sexuální chování je testosteron, ovšem i další steroidní hormony jako je dihydrotestosteron, estrogeny nebo progestiny se mohou uplatňovat v této regulaci. Podle teorie organizace a aktivace testosteron působící během ranného ontogenetického vývinu má organizační účinek na chování v dospělosti a toto chování je pak spouštěno vlivem aktuálních hladin hormonů. Navíc existuje ještě hypotéza dočasné organizace, která by mohla změnit náhled na dosavadní výsledky. Základní dělení hojně používané u plazů je dělení podle průběhu steroidogeneze a gametogeneze do skupin s asociovanou nebo disociovanou reprodukční strategií, ale toto rozdělení je jen uměle vytvořené. Tato literární rešerše shrnuje dosavadní poznatky o hormonálním ovlivnění samčího sexuálního chování u plazů a kriticky rozebírá nejčastěji používané metodiky.
|
|
New Approaches in Numerical Aeroelasticity Applied in Aerodynamic Optimization of Elastic Wing
Navrátil, Jan ; Slavík, Svatomír (oponent) ; Komárek,, Martin (oponent) ; Hlinka, Jiří (vedoucí práce)
The aeroelasticity is an essential discipline involved in the aircraft design, aiming to predict phenomena occurring due to interaction of aerodynamic, elastic and inertial forces. Those phenomena might often lead to catastrophic consequences, thus it must be proven that they do not occur between the speeds bounding the airplane flight envelope. Current aircraft design leads to increased flexibility of the airframe as a result of modern materials application or aerodynamically efficient slender wings. The airframe flexibility influences the aerodynamic performance and it might significantly impact the aeroelastic effects, which can be more easily excited by rigid body motions than in case of stiffer structures. The potential aeroelastic phenomena can occur in large range of speeds involving transonic regime, where the non-linear flow effects significantly influence the flutter speed. Common aeroelastic analysis tools are mostly based on the linear theories for aerodynamic predictions, thus they fails to predict mentioned non-linear effect. The objective of the thesis is, therefore, to design, implement and test an aeroelastic computational tool employing the aerodynamic prediction solver which is able to predict non-linear flow. In the thesis, the main focus is directed to the static aeroelastic simulations. The methods involved in numerical static aeroelastic simulation are presented in the thesis. The implementation of the computational aeroelastic tool was described and the convergence of the coupled solver was investigated. The tool functionality was validated in the test cases involving different types of the aerodynamic and structural models. The tool was applied also in the aerodynamic shape optimization of an elastic wing. The results and computational cost were compared to the rigid wing optimization. Last chapter presents the author's contribution to the research oriented on the assessment of time synchronization scheme for the CFD-CSM coupled problem. The test case used here is a transonic flow around the Benchmark Super-Critical Wing at flutter condition. Results were compared to the experimental data provided by NASA.
|
host ::
