|
|
Benchmark of the Computational Tools for the Prediction of the Effect of Mutations on Protein Stability
Berezný, Matej ; Martínek, Tomáš (oponent) ; Musil, Miloš (vedoucí práce)
Protein design necessitates understanding how mutations influence their stability. Numerous online predictors exist for this aim, but it is challenging to compare them or to use them collectively. For that purpose I developed BenchStab, a console application/Python package designed for the swift and straightforward operation of 18 predictors, gathering results from a series of mutants. Benchstab is freely available on GitHub and can be expanded to include more predictors. To avoid potential dataset bias towards some predictors, I have constructed a new unique dataset, sourced from FireProtDB. I utilized this dataset to assess 24 distinct prediction methods from the three different perspectives.
|
|
|
Konstrukční řešení vyvážecího přívěsu
Jílek, Jan ; Pokorný, Přemysl (oponent) ; Mergl, Václav (vedoucí práce)
Bakalářská práce se zabývá návrhem konstrukce vyvážecího návěsu a analytickými pevnostními výpočty v daných uzlech. První část práce je zaměřena na popis komponent, rešerši obdobných konstrukcí návěsů a shrnutí legislativních předpisů. Dále je popsána konstrukce navrženého návěsu a jsou provedeny analytické výpočty. Součástí práce je i výkresová dokumentace sestavy a podsestavy svařence rámu.
|
|
|
Analýza a návrh způsobu využití stávajícího objektu v obci Stařeč
Janovská, Dagmar ; Hlavinková, Vítězslava (oponent) ; Čech, Josef (vedoucí práce)
V diplomové práci je zpracována analýza a návrh nového využití pro objekt, který se nachází v obci Stařeč prostřednictvím metody nejvyššího a nejlepšího využití jinak známé jako HABU. První část práce je věnována vysvětlením pojmů použitých v diplomové práci. Následně jsou stanoveny metody řešení a jejich zdůvodnění. V další části jsou sestaveny návrhy na nové řešení objektu, které jsou podrobeny zkouškám metody HABU, přičemž nevyhovující návrhy jsou zamítány. Vybrán je návrh, který dosahuje nejvyššího a nejlepšího využití pro obec Stařeč.
|
|
|
Zlín FCK Technology
Kučera, Petr ; Pecka, Lukáš (oponent) ; Štěpán, Marek (vedoucí práce)
Práce se zabývá návrhem bytového domu na území obce Malenovice u Zlína, kde na pozemku bývalé Malenovické pily má vzniknout nový bytový komplex. Pozemek se nachází v těsné blízkosti hlavní tepny do Zlína. Práce navrhuje systém modulového domu z prefabrikovaných CLT prvků se sociálním a komunitním přesahem. Systém, který umožňuje rychlou výstavbu a tvorbu zástavby s rozdílnou konfigurací podle daných požadavků nejen na území Malenovic. Do systému navrhování je zahrnuto malometrážní bydlení s prvky variabilního nábytku, které umožňuje snížení nákladů na bydlení, a tak reagovat na současné nedostupné bydlení, ale při zachování komfortu člověka. Návrh také řeší efektivní používání technologií na stavbě a jejich až někdy nadbytečné používání.
|
|
|
Vliv antiky na stavby románského období v Čechách a na Moravě
Jubánek, Tomáš ; Royt, Jan (vedoucí práce) ; Kuthan, Jiří (oponent)
Bakalářská práce se snaží popsat a dokumentovat zprostředkovaný vliv antiky na stavby v románském období v Čechách a na Moravě. Všímá si historického vývoje od vzniku a zániku antické civilizace až do konce románské doby, kontextuálně zpracovává vývoj architektury v západní a střední Evropě a na významných stavbách - vzorech - dokládá cesty vlivu antiky vedoucí až na území Čech a Moravy, se zvláštním přihlédnutím ke křesťanství a jeho úloze na formování architektury, jakož i ke svědkovi antické architektury, kterým byl Marcus Vitruvius Pollio. Na několika vhodných příkladech dokládá vliv antiky na architekturu konkrétních staveb na území Čech a Moravy, jmenovitě klášterního kostela v Doksanech, paláce na Olomouckém hradě, kostela sv. Prokopa v Záboří nad Labem, kostela sv. Jakuba v Jakubu u Kutné Hory, a nakonec kostela svatých Petra a Pavla v Řeznovicích. Výsledky zkoumání pak posuzuje v závěru bakalářské práce.
|
|
|
Structural studies of an abasic site DNA damage repair and DNA interstrand cross-link formation
Landová, Barbora
Poškozením DNA se rozumí jakákoli změna nebo modifikace struktury DNA, která se odchyluje od jejího přirozeného stavu. Abasické místo (Ap místo) je jedním z nejčastějších poškození DNA, které vzniká spontánní depurinací/depyrimidinací nebo enzymatickým odstraněním báze. Pokud se neopraví, může vést ke genetické mutaci a potenciálně způsobit onemocnění, jako je například rakovina. Pochopení mechanismu opravy DNA je zásadní pro lékařský výzkum a aplikaci. Bakteriální MutM je glykosyláza opravující DNA, která odstraňuje poškození DNA vzniklé oxidačním stresem a zabraňuje mutacím a genomové nestabilitě. MutM patří do rodiny prokaryotických enzymů Fpg/Nei a je strukturně i funkčně podobná se svým eukaryotickým protějškům, jako jsou NEIL1-NEIL3. Zde prezentuji dvě krystalové struktury MutM z patogenní Neisseria meningitidis: MutM holoenzym a MutM vázaný na DNA. Volný enzym existuje v otevřené konformaci, zatímco po vazbě na DNA, dochází k podstatným strukturním změnám a přeskupení domén enzymu i ohybu DNA. Jednou z poškození DNA opravovaných MutM je Ap místo, které, pokud není opraveno, může spontánně vést k vytvoření mezivláknového kovanetního prokřízení DNA (Ap-ICL) se sousedním adeninem na opačném vlákně DNA. Je známo, že glykosyláza NEIL3 odstraňuje Ap-ICL. Pomocí série různých oligonukleotidů jsme...
|
|
|
V bytě maloměstě, Mikulov
Solár, Michal ; Kozelský, Tomáš (oponent) ; Hora, Jan (vedoucí práce)
Koncept vychádza z historického vývoja danej parcely ale aj mesta ako takého. Historicky sa oblasť definovala svojpomocne a bez jasne špecifikovaných dogmatických poučiek. Práve vďaka tomu je mesto obohatené o momenty, ktoré neplnia len estetickú či duchovnú, ale aj funkčnú podstatu mesta. Moment prekvapenia a určitých priehľadov obohacuje interiér dvora ale aj celkového mesta. Na prvý pohľad tak nepríjemné priestory disponujú určitou kvalitou, spôsobenou hrou svetla či celkovou koncepciou priestoru. Významním špecifikom objektu je práve moment prekvapenia z vnímaného priestoru. Prechod od jasne definovaného parteru do zadného , na prvý pohľad, iracionálneho nádvoria je umocnený pasážou, ktorá sa taktiež odkazuje na typické členenie domu v Malomeste. ARCHITEKTONICKÉ RIEŠENIE Princíp vrstvenia jednotlivých priestorov jasne naväzuje na momenty prekvapenia. Špecifickým členením objektu, charakterovo pripomínajúcim skôr rodinné domy ako bytový objekt, vznikajú priestory rôznej kvality a využitia. Dolné byty disponujú záhradou priestorovo aj opticky oddelenou od celkovej hmoty, pričom horným bytom náležia terasy, ktoré sú opticky prepojené s nádvorím, avšak nie sú prístupné verejnosti. Byty umiestnené v priečelnej hmote majú zas prevažne mestský charakter. Vytvára sa tak princíp spolunažívania, ktorý je typický pre celú oblasť mesta. Vrstvenie je patrné práve na rozmiestnení bytov s rozdielnou náväznosťou na záhrady a terasy, ako aj rozmanitosť veľkostí bytových jednotiek. Duchom miesta je stávajúci sklípek, ktorý reflektuje historickú premenu parcely a je akýsi symbol lokality.
|
|
|
Polyfunkční dům – železobetonová nosná konstrukce
Tesař, David ; Kraut, Jan (oponent) ; Šulák, Pavel (vedoucí práce)
Cílem diplomové práce je statické a konstrukční řešení polyfunkčního domu. Zatížení bude stanoveno podle normy ČSN EN 1990. Pro výpočet vnitřních sil bude použita metoda konečných prvků. Konstrukce bude dimenzována podle normy ČSN EN 1992. Výstupem práce bude textová část, statický výpočet a výkresy tvaru a výztuže.
|
|
|
Příprava školicích materiálů pro rozváděče vysokého napětí
Nosek, Jan ; Kozel, Tomáš (oponent) ; Lázničková, Ilona (vedoucí práce)
Bakalářská práce dokumentuje tvorbu školicích materiálů pro rozváděče vysokého napětí. Převážná část práce je věnována seznámení s produkty firmy ABB, ke kterým jsou školicí materiály vypracovány. Hlavní důraz byl kladen na seznámení s rozváděčem UniGear ZS1, který je hlavním produktem firmy ABB v oblasti rozváděčů vysokého napětí. Poslední kapitola je věnována rozboru jednotlivých úrovní školicích materiálů.
|
|
|
Obytný soubor na ul. Pastviny v Brně - Komíně
Selnarová, Elisabeth ; Pospíšil, Zdeněk (oponent) ; Boháč, Ivo (vedoucí práce)
S využitím svažitosti terénu byly s ohledem na okolní zástavbu navrženy dva typy bytových domů -Komín a Komínek, které jsou v pravidelné struktuře rozmístěné na zadaném území. Při návrhu bylo dbáno na udržitelný rozvoj z hlediska stavebního řešení. Bytové domy jsou navrženy jako kompozitní stavba. Nosnou konstrukci tvoří železobetonový, deskový skelet a výplní obvodových stěn jsou tepelně izolační dřevěné panely. Vytápění bytových domů bude teplovzdušné (ohřev teplého vzduchu bude zajištěn plynovým kotlem). Stavby spadají díky své kvalitní obálce do skupiny nízkoenergetických domů. Jelikož se jedná o bodové bytové domy, každý jednotka má často třístrannou orientaci ke světovým stranám. Některé pokoje mají dvoustranné osvětlení, což zvyšuje jejich atraktivitu. Bytový dům je seskládán z mezonetů, které tvoří nestejnorodou strukturu. Základní hmota je propletena „stužkou“, která na svých záhybech vytváří balkóny, terasy či je pod ní umístěno parkování. Každá bytová jednotka má vlastní balkón a tak zde majitelé mohou relaxovat a vychutnat okolní zeleň. Bydlení je navrženo pro širokou škálu obyvatel. Je vyprojektováno několik typů bytů od prvního bezbariérového podlaží pro osoby s omezenou schopností pohybu až po luxusní mezonet v posledním podlaží.
|
host ::
RSS.