2025-07-05
00:21 |
Holostei as a model of recent evolutionary studies
Križan, Adam ; Černý, Robert (vedoucí práce) ; Musilová, Zuzana (oponent)
Prvokostnaté ryby (Holostei) sú reliktnou skupinou lúčoplutvovcov, ktorá zahŕňa šťukovce (Lepisosteiformes) a amie (Amiiformes). Predstavujú sesterskú líniu vysoko odvodených kostnatých rýb (Teleostei). Zároveň sú však považované za živé fosílie a majú spomalenú evolúciu morfologických, molekulárnych aj ontogenetických znakov. Zachovali si ancestrálny karyotyp a mnoho starobylých génov, ktoré v iných líniách vymizli. Vďaka tomu odhaľujú evolúciu génových rodín alebo dôsledky duplikácie genómu kostnatých rýb. Pomocou Holostei je možné prepojiť genómy vzdialených línií stavovcov a hľadať homologické sekvencie, čo má využitie v biomedicínskom výskume. Starobylá embryogenéza z prvokostnatých rýb činí aj ideálny model pre evolučno- ontogenetickú biológiu (evo-devo). Ancestrálne znaky sú prítomné ako v najranejších štádiách vývinu (ryhovanie a gastrulácia), tak aj pri tvorbe faryngeálnej oblasti či exoskeletu. Spolu s ďalšími bazálnymi rybami sú preto kľúčové pre rekonštrukciu pôvodných embryonálnych procesov a ich evolúcie v jednotlivých líniách stavovcov. Cieľom tejto práce je predstaviť Holostei ako vhodný model pre výskum evolúcie kostnatých rýb, ale aj ranej evolúcie všetkých stavovcov.
Úplný záznam
|
2025-07-05
00:21 |
Cα a Cβ zhrubené modely pro studium struktury funkčních materiálů založených na peptidech
Zahradník, Adam ; Nová, Lucie (vedoucí práce) ; Blanco Andrés, Pablo Miguel (oponent)
Porozumění struktuře proteinů (a celkově struktuře molekul) hraje klíčovou roli při hledání molekul pro specifické aplikace (např. pro pokročilé materiály nebo léčiva a farma- ceutický průmysl). Výpočetní chemie a molekulové simulace mohou hledání správné struktury výrazně usnadnit. Aby bylo možné tyto molekulové simulace provést, je třeba vytvořit silové pole (force field) reprezentující simulovaný systém. V rámci této práce jsou vytvořeny dvě jednoduchá silová pole pro zhrubené modely reprezentující jednotlivé aminokyseliny jejich Cα, resp. Cβ atomem. Množství typů aminokyselin v modelu lze re- dukovat aplikováním aminokyselinové abecedy, v nejjednodušším případě dvoupísmenné. Silové pole pro Cβ atomy bylo testováno pomocí Hamiltoniánského Monte Carla a Pivot Monte Carla. Přesnost skládání jednotlivých struktur byl ověřována jednak numericky (RMSD), jednak vizuálně.
Úplný záznam
|
2025-07-05
00:21 |
Optimalizace přípravy rekombinantního CYP3A4
Zvolská, Eliška ; Indra, Radek (vedoucí práce) ; Martínek, Václav (oponent)
Cytochrom P450 3A4 (CYP3A4) je nejvíce zastoupeným cytochromem P450 v lidském těle. Hraje zásadní roli v metabolismu xenobiotik, kdy se podílí na metabolismu 30 až 50 % všech klinicky využívaných léčiv. Rovněž se účastní metabolismu endogenních substrátů a roli hraje i v některých rakovinných onemocněních. Z těchto důvodů je CYP3A4 nutno získávat pro vědecké účely. Nejvíce využívanými expresními systémy pro jeho přípravu jsou bakterie, konkrétně E. coli. V této práci byl využit kmen DH5α, který byl transformován plazmidem nesoucím gen pro CYP3A4 a NADPH:cytochrom P450 oxidoreduktázu (CPR). Cílem práce bylo najít vhodné podmínky exprese tohoto konstruktu. Prvním cílem bylo ověření pozitivního vlivu δ-aminolevulové kyseliny (δALA) na expresi CYP3A4 a určení optimální doby exprese. Dalším krokem pak bylo provedení expresí za čtyř různých podmínek - exprese byly provedeny při 20; 25 a 30 řC při 120 rpm a dále pak při 30 řC a 180 rpm. V rámci každé série byly testovány tři optické denzity - OD600 0,4; 0,6 a 0,8. Pro OD600 0,6 byly v rámci každé série testovány tři různé koncentrace IPTG jako induktoru - 0,1; 1 a 5mM IPTG. Pomocí sonikace a několika centrifugací byly pro každý vzorek izolovány bakteriální membrány obsahující membránově vázaný CYP3A4 a NADPH:cytochrom P450 oxidoreduktázu. V membránové...
Úplný záznam
|
2025-07-05
00:21 |
Membránová kontaktní místa u Saccharomyces cerevisiae
Pazourová, Martina ; Vopálenská, Irena (vedoucí práce) ; Plocek, Vítězslav (oponent)
Membránová kontaktní místa jsou mikrodomény organelových membrán držené vazebnými proteiny v těsné blízkosti. Tento blízký kontakt umožňuje komunikaci organel transportem metabolitů či signalizací, navíc se membránová kontaktní místa podílejí na biogenezi, dědičnosti či autofagii organel. Tato práce se zabývá charakterizací kontaktních míst, převážně peroxisomu, v kvasince Saccharomyces cerevisiae. Dále se zaměřuje na vazebné proteiny, na jimi tvořené komplexy a také na celkový význam a funkci kontaktních míst peroxisomu s endoplazmatickým retikulem, plazmatickou membránou, mitochondrií, lipidovými kapkami a vakuolou. Klíčová slova: membránová kontaktní místa, Saccharomyces cerevisiae, peroxisom, endoplazmatické retikulum, plazmatická membrána, mitochondrie, lipidovékapky, vakuola, Pex3
Úplný záznam
|
2025-07-05
00:20 |
Diversification of portfolio
Mrkva, Vojtěch ; Polák, Petr (vedoucí práce) ; Hanus, Luboš (oponent)
Cílem této práce je určit počet akcií pro diverzifikaci portfolia pro vzorek českého trhu, konkrétně pro akcie kótované na na třech trzích Burzy cen- ných papírů Praha, a porovnat jej s výsledky získanými z amerického trhu, a to v letech 2020 až 2024. Pro detailnější pohled na diverzifikaci portfo- lia jsou použity různé míry rizika, které zajistí lepší porovnání malého trhu s omezeným počtem kótovaných akcií s velkým akciovým trhem v USA. Studie zkoumá směrodatnou odchylku časových řad, míry rizika poklesu a směrodat- nou odchylku koncového bohatství. Výsledky práce naznačují, že pro všechny použité rizikové míry je doporučená velikost portfolia pro český trh stejná nebo menší v porovnání s americkým trhem. Jedinou výjimku tvoří analýza výnosů, která doporučila větší počet akcií pro česká data. Celkově výsledky ukazují́, že vzorek akcií na pražské burze jsou lepší v diverzifikaci rizika než firmy s největší tržní kapitalizací kótované ve Spojených státech. Navíc tyto vybrané české akcie poskytovaly vyšší průměrné výnosy pro portfolia o alespoň dvou akciích. Klasifikace JEL G11 Klíčová slova Diverzifikace portfolia, Směrodatná od- chylka časových řad, Riziko poklesu hod- noty, Směrodatná odchylka koncového bo- hatství Název práce Diverzifikace portfolia E-mail autora 87948038@fsv.cuni.cz E-mail...
Úplný záznam
|
2025-07-05
00:20 |
Kryptický výběr partnera: přehled mechanismů a empirická evidence u ptáků a dalších obratlovců
Matoušková, Kateřina ; Albrechtová, Jana (vedoucí práce) ; Frolíková, Michaela (oponent)
Pohlavní výběr představuje jednu z nejvýznamnějších evolučních sil, jež formuje reprodukční chování a morfologii mnoha živočišných druhů. Ačkoliv byl původně považován za proces probíhající pouze před kopulací, bylo prokázáno, že pokračuje i po ní. Samice mohou aktivně ovlivňovat využití spermií různých samců a tím i otcovství svých potomků. Tento mechanismus ovlivňující úspěch oplození jednotlivých samců se označuje jako kryptický výběr partnera. Vědecké výzkumy se jím zabývají napříč širokým spektrem různých živočišných skupin, včetně hmyzu, ryb, plazů, obojživelníků a savců. Tato bakalářská práce se zaměřuje na vysvětlení jednotlivých mechanismů kryptického výběru partnera u ptáků, které jsou rozděleny do čtyř základních kategorií: morfo-anatomické, fyzikálně-chemické, genetické a behaviorální. Rozšířená diskuze je věnována například funkci tubulů pro ukládání spermií (SSTs), proteinovému složení samičí kloakální tekutiny či významu genetické komplementarity mezi partnery. Shrnutí empirických studií potvrzuje, že kryptický výběr partnera je významný a komplexní proces ovlivňující nejen reprodukční úspěch jednotlivců, ale také přispívá k pochopení populační dynamiky a evoluce rozmnožovacích strategií u ptáků. Klíčová slova: kryptický výběr partnera, postkopulační pohlavní výběr, ptáci,...
Úplný záznam
|
2025-07-05
00:20 |
Úplný záznam
|
2025-07-05
00:20 |
Transport mramoru v antice: svědectví vraků a problém určení provenience na příkladu artefaktů z lokality San Severo (Itálie)
Kohout, Matyáš ; Kuchařová, Aneta (vedoucí práce) ; Přikryl, Richard (oponent)
V antice byl bílý mramor těžen v západním, centrálním i východním Středomoří. Ovšem hlavní těžební lokality se mimo severozápadní Itálii koncentrovaly především v oblasti Egejského moře. Geografická nerovnoměrnost zdrojů mramoru podmínila intenzivní zámořské obchodní plavby. Vraky římských nákladních plavidel ilustrují jak enormní poptávku po východomediteránních mramorech za cenu risku plavby v nebezpečnějších vodách, tak i obraz antických obchodních tras širší optikou. Tato bakalářská práce se soustředí na problematiku transportu bílého mramoru v antice (především v době římské a pozdně antickém období) a otázku analýzy jeho provenience. Rešeršní část je zaměřena na římské obchodní trasy ve Středomoří a trendy v otázce distribuce lodních vraků. Dále jsou představeny hlavní těžební lokality v Mediteránu, odkud byl mramor v antice získáván; jejich historický/archeologický kontext, geologické pozadí a mineralogicko- petrografické a geochemické charakteristiky. Následující kapitola popisuje tři vybrané příkladové studie vraků plavidel transportujících mramor nalezených na pobřeží jižní Itálie. Závěrečná kapitola teoretické části představuje komplexitu analýzy provenience mramoru a jmenuje nejpoužívanější analytické metody této archeometrické disciplíny. Zájmem experimentální části této práce je...
Úplný záznam
|
2025-07-05
00:20 |
Role T antigenů polyomaviru Merkelových buněk (MCPyV) v kancerogenezi
Ryšavá, Kateřina ; Saláková, Martina (vedoucí práce) ; Šroller, Vojtěch (oponent)
Polyomavirus Merkelových buněk (MCPyV) je virus s dvouřetězcovým DNA genomem, který způsobuje nejčastěji bezpříznakovou primární infekci, po které dochází k ustavení perzistence a virus se stává součástí běžné kožní mikroflóry. Za určitých okolností může dojít k mutacím virového genomu, spojených s integrací do genomu hostitele. Tyto události vedou k rozvoji karcinomu z Merkelových buněk (MCC), velmi vzácného, ale agresivního typu kožního karcinomu. Tato práce se soustředí na charakteristiku MCPyV a popis proteinů velký T antigen (LT), malý T antigen (ST), 57kT a ALTO. Jsou popsány funkce T antigenů během aktivního virového cyklu, spolu s charakteristikou jejich domén. Důraz je kladen především na vybrané molekulární mechanismy, prostřednictvím kterých T antigeny modulují buněčné signální dráhy, metabolismus a přispívají k dysregulaci buněčného cyklu. Tyto procesy hrají důležitou roli během transformace buněk a rozvoje MCC. Klíčová slova: MCPyV, T antigen, karcinom
Úplný záznam
|
2025-07-05
00:19 |
Mechanismy rezistence karcinomu pankreatu k chemoterapii a imunoterapii
Pachmanová, Hana ; Kovář, Marek (vedoucí práce) ; Bušek, Petr (oponent)
Duktální adenokarcinom pankreatu (PDAC) je vysoce agresivní zhoubné onemocnění s vysokou mortalitou. Jeho pětiletá míra přežití je jedna z nejnižších mezi maligními chorobami zejména kvůli diagnóze v pozdních stádiích onemocnění a omezené účinnosti dostupné léčby. Nádorové mikroprostředí PDAC, tvořené nádorovými, stromálními a imunitními buňkami a jimi secernovanými molekulami, má vysoce imunosupresivní charakter a zprostředkovává mechanismy rezistence nádoru vůči chemoterapii a imunoterapii. Mezi dostupné léčebné modality PDAC patří převážně chirurgická resekce a systémová chemoterapie, a to buď ve formě kombinovaného režimu FOLFIRINOX, kombinace gemcitabinu s nab-paklitaxelem, nebo jako monoterapie gemcitabinem. Chemoterapie však nevede k výrazné odezvě a pouze mírně prodlužuje život pacientů trpících PDAC. Protinádorová imunoterapie v posledních letech zaznamenala významný pokrok a stala se konvenční léčbou řady malignit. V kontextu léčby PDAC se však imunoterapie potkává s nízkou odpovídavostí a omezenou účinností. V současnosti probíhá intenzivní vývoj inovativních terapeutických postupů, které si kladou za cíl obejít mechanismy rezistence PDAC k chemoterapii a imunoterapii a zvýšit jejich léčebný potenciál. Klíčová slova: pankreatický karcinom, chemoterapie, imunoterapie, nádorové...
Úplný záznam
|
|
|
|
host ::
