|
| |
|
| |
|
|
Mikropáskové vazební směrové a hybridní členy - laboratorní úloha
Orság, Petr ; Vídenka, Rostislav (oponent) ; Svačina, Jiří (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se věnuje metodice návrhu, simulaci, realizaci a vytvoření laboratorní úlohy se základními mikropáskovými vazebními směrovými a hybridními členy v pásmu jednotek až desítek GHz. Těmito členy jsou zejména čtvercová odbočnice, kruhová odbočnice, kombinovaný člen, odbočnice z vázaných mikropáskových vedení, Langeho odbočnice. Simulované výsledky jsou zde konfrontovány s naměřenými výsledky získanými skalárním obvodovým analyzátorem. Z celkových poznatků byla navržena laboratorní úloha orientovaná na návrh, simulaci a měření parametrů těchto členů.
|
|
|
Magnetic Beads-Based Electrochemical Techniques for DNA-Protein Interaction Monitoring
Fojta, Miroslav ; Pivoňková, Hana ; Němcová, Kateřina ; Horáková Brázdilová, Petra ; Havran, Luděk ; Orság, Petr ; Vidláková, Pavlína ; Macíčková-Cahová, Hana ; Balintová, Jana ; Hocek, Michal
Electrochemical techniques, in connection with separation of nucleoprotein complexes at magnetic beads, are suitable for the monitoring of DNA-protein interactions. For the detection of complexes captured at the beads it is possible to utilize intrinsic electrochemical activity of the protein, intrinsic structure-selective signals of the DNA, or indicator DNA substrates tail-labeled with electroactive moieties.
|
|
| |
|
|
Utilisation of enzymatic labelling with 4-aminophtalimide and 4-hydroxybenzylideneimidazolinone fluorescent derivates for monitoring of DNA-protein interaction
Orság, Petr ; Pivoňková, Hana ; Riedl, Jan ; Hocek, Michal ; Fojta, Miroslav
The 5’-substituted deoxycytosine triphosphates with conjugated solvatochromic derivates of 4-aminophtalimide (API) and derivates of the green fluorescent protein, 4-hydroxybenzylideneimidazolinone (HBI) were synthetized and successfully tested for enzymatic incorporation using primer extension assay. Site specifically labelled oligonucleotide probes were prepared and tested for interaction with p53 and SSB proteins, displaying distinct DNA-binding properties. The incorporation of multiple fluorescent labels did not interfere with natural protein binding and protein interaction leaded in both cases the to the gradual ratiometric increase of the fluorescence intensity moreover accompanied with the changes of the fluorescence emission spectra profile. Neither effect was observed after incubation with BSA, non-DNA binding protein, confirming the specificity of the interaction. Modified nucleoside triphosphates with conjugated fluorescence labels derivates of API and HBI can be used as substrates for preparation of the specific oligonucleotide labelled probes and provide the novel tool for studying and monitoring the DNA-protein interaction.
|
|
| |
|
| |
host ::
RSS.