| |
|
The role of ATM in breast cancer
Soukupová, Jana ; Pohlreich, Petr (advisor) ; Souček, Pavel (referee) ; Foretová, Lenka (referee)
Incidence of breast cancer is continuously increasing in the Czech Republic. Tumor development is a result of gene alterations'accumulation, particulary associated with genes involved in regulation of cell growth and division. Hereditary carcinomas account for approximately 5-10% of all breast tumors and in 60-80% cases are caused by a germline mutation in the major predisposition genes BRCA1 and BRCA2. Nevertheless, other genes, mostly of lower penetrance, may play a role in breast pathogenesis such as the ATM tumor-suppressor gene. ATM is the apex of the repair pathway of DSB. This protein kinase activates through phosphorylation of its substrates cell cycle checkpoints, which leads either to the delay of the cell cycle progression until DSB are repaired or to the promotion of apoptosis. To sum up, the ATM gene seems to have a role in breast cancer development in a minority of the high-risk families in our population which is significantly lower compared to BRCA1/2 and it also seems to be involved in pathogenesis of sporadic breast cancer. Despite the ATM gene's length, we do not perform the preventive screening of this gene in breast cancer high-risk families. Nevertheless, we offer the molecular diagnostics of ATM to ataxia telangiectasia patients.
|
|
Dance Therapy as Help in Integration of Peoplewith Cerebral Palsy
Šourková, Barbora ; Ortová, Marie (advisor) ; Olšiaková, Jasmína (referee)
Dance therapy is a form of psychotherapy where move is the main mean of change. A man uses its own body for this change because body is physical aspect of personality. This therapy helps to create positive image of myself. It is a new profession which is still in proces of defining itself. Dancing education and art performance in this therapy is not the aim. In this therapy the esthetic aspect of movement is not concidered. The Greek word therapy has the same meaning as Czech word accompany. Therapist is the one who accompanies client on his way to recovery and self-knowledge. The principial moment of dance therapy is connection of body movement and emotional experience. Connection body-mind is easy and harmonical functioning systém. Discruption continuity of this system can point out psychological and physical stress. Relation between emotion and movement charakterize an individual. That speaks about face expression, posture, space largeness, where the body moves etc. If psychotherapy changes psychical attitude, even the physical standard will change. In dance therapy thisprincipal also works but in revers order. Participant of this change of mans behaviour is his body. The fact that physical comunication becomes less important due to speach development is also surfaced. It is obvious that animals are in...
|
|
Optimalization of material flow in automotive industry
Kolář, Tomáš ; Jirsák, Petr (advisor) ; Vinš, Marek (referee)
This master thesis is focussed on optimalization of material flow in an automotive company. First part introduce theoretical background. Automotive industry and its actual trends on global markets. Follows short introduction of the company where project of this thesis was executed. Main theoretical part describes concept of lean management, its tools in practical examples, but it is also focussed on philosophical approach to the work and mindset of the company. Follows the aplication part based on theoretical background. The whole project of this master thesis is focussed on specific area called PC store. At first this area is showed in context of overall material flow. Shortly there are introduced processes and areas where full material packaging flows. Follows deeper analysis and optimalization of PC store itself. There are three approaches of stock and lead time reduction applied. Last part shows the comparison of initial and future state including performed changes.
|
|
Applied Arts, with a focus on Textiles for the Lower Grades of Primary School
Stupková, Tereza ; Skarlantová, Jana (advisor) ; Havlásek Tatarová, Lucie (referee)
Stupková, T.: Applied arts with a view to textile arts at junior high school /Diploma thesis/ Prague 2006 - Charles University, Faculty of Education, Department of Arts 97 pp This thesis is aimed at the theory of applied arts, especially of textile arts. It reviews some interesting techniques usable at junior high school and gives instructions how to perform these techniques. This thesis also contains two projects that are partly implemented at junior high school. The aim of this thesis was to find interesting techniques and describe them in such detail that a junior high teacher can use them in a class. The contribution of this thesis is in creation of an overview of applied arts and its potential, and in ideas that are summarized here and might be helpful to teachers. Key words: applied arts, textile, crafts, print, color, project
|
|
Modelling, parameter estimation, optimisation and control of transport and reaction processes in bioreactors.
ŠTUMBAUER, Václav
With the significant potential of microalgae as a major biofuel source of the future, a considerable scientific attention is attracted towards the field of biotechnology and bioprocess engineering. Nevertheless the current photobioreactor (PBR) design methods are still too empirical. With this work I would like to promote the idea of designing a production system, such as a PBR, completely \emph{in silico}, thus allowing for the in silico optimization and optimal control determination. The thesis deals with the PBR modeling and simulation. It addresses two crucial issues in the current state-of-the-art PBR modeling. The first issue relevant to the deficiency of the currently available models - the incorrect or insufficient treatment of either the transport process modeling, the reaction modeling or the coupling between these two models. A correct treatment of both the transport and the reaction phenomena is proposed in the thesis - in the form of a unified modeling framework consisting of three interconnected parts - (i) the state system, (ii) the fluid-dynamic model and (iii) optimal control determination. The proposed model structure allows prediction of the PBR performance with respect to the modelled PBR size, geometry, operating conditions or a particular microalgae strain. The proposed unified modeling approach is applied to the case of the Couette-Taylor photobioreactor (CTBR) where it is used for the optimal control solution. The PBR represents a complex multiscale problem and especially in the case of the production scale systems, the associated computational costs are paramount. This is the second crucial issue addressed in the thesis. With respect to the computational complexity, the fluid dynamics simulation is the most costly part of the PBR simulation. To model the fluid flow with the classical CFD (Computational Fluid Dynamics) methods inside a production scale PBR leads to an enormous grid size. This usually requires a parallel implementation of the solver but in the parallelization of the classical methods lies another relevant issue - that of the amount of data the individual nodes must interchange with each other. The thesis addresses the performance relevant issues by proposing and evaluation alternative approaches to the fluid flow simulation. These approaches are more suitable to the parallel implementation than the classical methods because of their rather local character in comparison to the classical methods - namely the Lattice Boltzmann Method (LBM) for fluid flow, which is the primary focus of the thesis in this regard and alternatively also the discrete random walk based method (DRW). As the outcome of the thesis I have developed and validated a new Lagrangian general modeling approach to the transport and reaction processes in PBR - a framework based on the Lattice Boltzmann method (LBM) and the model of the Photosynthetic Factory (PSF) that models correctly the transport and reaction processes and their coupling. Further I have implemented a software prototype based on the proposed modeling approach and validated this prototype on the case of the Coutte-Taylor PBR. I have also demonstrated that the modeling approach has a significant potential from the computational costs point of view by implementing and validating the software prototype on the parallel architecture of CUDA (Compute Unified Device Architecture). The current parallel implementation is approximately 20 times faster than the unparallized one and decreases thus significantly the iteration cycle of the PBR design process.
|
|
Studio Damúza
Řezníková, Veronika ; PROKOP, Petr (advisor) ; SULŽENKO, Jiří (referee)
The bachelor thesis named Studio Damúza analyses the current state of the eponymous production unit, founded 17 years ago as an alternative stage to the DISK Theatre of Prague´sTheatre Faculty of the Academy od Performing Arts. The term "production unit" is explained on the example of several other production units, comparing the operation of Studio Damúza, Jedefrau.org and ART Prometheus. It gives a brief outline of Studio Damúza´s history. If further describes its current operation, financing and attemps at obtaining a production space run solely by Damúza. The poetics of Studio Damúza are characterised through the current repertoire. In the end, the thesis offers several possibilities of advancing the work of Studio Damúza. It looks for problems that create obstacles and tries to offer solutions.
|
|
Subspace Modeling of Prosodic Features for Speaker Verification
Kockmann, Marcel ; Kenny, Patrick (referee) ; Nöth, Elmar (referee) ; Černocký, Jan (advisor)
Předložená disertační práce se zabývá ověřováním mluvčího pomocí prozodických příznaků zahrnujících hodnoty základního tónu, energie a délek řečových úseků. Studovali jsme dvě rozdílné techniky pro parametrizaci: první vede k dobře definované sadě menšího počtu příznaků, druhá k vysoko-dimenzionální sadě heterogenních prozodických příznaků. První část práce se věnuje vývoji příznaků reprezentujících prozodické kontury, zde jsme vyvinuli a ověřili několik modelovacích technik, s důrazem na modelování v reprezentativních podprostorech. Druhá část práce se zaměřuje na nové pod-prostorové modelovací techniky pro heterogenní prozodické parametry s velkou dimenzionalitou. Model je teoreticky odvozen a experimentálně ověřen na oficiálních datech z NIST evaluací ověřování mluvčího (NIST Speaker Recognition Evaluation). Ve srovnání s ostatními současnými prozodickými jsme dosáhli podstatně lepších výsledků. Na konci práce presentujeme také novou techniku pro elegantní kombinaci dvou prozodických systémů. Tato technika může být použita rovněž pro fúzi prozodického systému se standardním přesným cepstrálním systémem, což vede k dalšímu podstatnému zvýšení úspěšnosti verifikace.
|
|
STATISTICAL LANGUAGE MODELS BASED ON NEURAL NETWORKS
Mikolov, Tomáš ; Zweig, Geoffrey (referee) ; Hajič,, Jan (referee) ; Černocký, Jan (advisor)
Statistické jazykové modely jsou důležitou součástí mnoha úspěšných aplikací, mezi něž patří například automatické rozpoznávání řeči a strojový překlad (příkladem je známá aplikace Google Translate). Tradiční techniky pro odhad těchto modelů jsou založeny na tzv. N-gramech. Navzdory známým nedostatkům těchto technik a obrovskému úsilí výzkumných skupin napříč mnoha oblastmi (rozpoznávání řeči, automatický překlad, neuroscience, umělá inteligence, zpracování přirozeného jazyka, komprese dat, psychologie atd.), N-gramy v podstatě zůstaly nejúspěšnější technikou. Cílem této práce je prezentace několika architektur jazykových modelůzaložených na neuronových sítích. Ačkoliv jsou tyto modely výpočetně náročnější než N-gramové modely, s technikami vyvinutými v této práci je možné jejich efektivní použití v reálných aplikacích. Dosažené snížení počtu chyb při rozpoznávání řeči oproti nejlepším N-gramovým modelům dosahuje 20%. Model založený na rekurentní neurovové síti dosahuje nejlepších publikovaných výsledků na velmi známé datové sadě (Penn Treebank).
|
|
Extensions to Probabilistic Linear Discriminant Analysis for Speaker Recognition
Plchot, Oldřich ; Fousek, Petr (referee) ; McCree,, Alan (referee) ; Burget, Lukáš (advisor)
Tato práce se zabývá pravděpodobnostními modely pro automatické rozpoznávání řečníka. Podrobně analyzuje zejména pravděpodobnostní lineární diskriminační analýzu (PLDA), která modeluje nízkodimenzionální reprezentace promluv ve formě \acronym{i--vektorů}. Práce navrhuje dvě rozšíření v současnosti požívaného PLDA modelu. Nově navržený PLDA model s plným posteriorním rozložením modeluje neurčitost při generování i--vektorů. Práce také navrhuje nový diskriminativní přístup k trénování systému pro verifikaci řečníka, který je založený na PLDA. Pokud srovnáváme původní PLDA s modelem rozšířeným o modelování neurčitosti i--vektorů, výsledky dosažené s rozšířeným modelem dosahují až 20% relativního zlepšení při testech s krátkými nahrávkami. Pro delší testovací segmenty (více než jedna minuta) je zisk v přesnosti menší, nicméně přesnost nového modelu není nikdy menší než přesnost výchozího systému. Trénovací data jsou ale obvykle dostupná ve formě dostatečně dlouhých segmentů, proto v těchto případech použití nového modelu neposkytuje žádné výhody při trénování. Při trénování může být použit původní PLDA model a jeho rozšířená verze může být využita pro získání skóre v případě, kdy se bude provádět testování na krátkých segmentech řeči. Diskriminativní model je založen na klasifikaci dvojic i--vektorů do dvou tříd představujících oprávněný a neoprávněný soud (target a non-target trial). Funkcionální forma pro získání skóre pro každý pár je odvozena z PLDA a trénování je založeno na logistické regresi, která minimalizuje vzájemnou entropii mezi správným označením všech soudů a pravděpodobnostním označením soudů, které navrhuje systém. Výsledky dosažené s diskriminativně trénovaným klasifikátorem jsou podobné výsledkům generativního PLDA, ale diskriminativní systém prokazuje schopnost produkovat lépe kalibrované skóre. Tato schopnost vede k lepší skutečné přesnosti na neviděné evaluační sadě, což je důležitá vlastnost pro reálné použití.
|
guest ::
