|
Základní in vitro testování stříbrných nanočástic
Čermáková, Gabriela ; Holas, Ondřej (vedoucí práce) ; Smékalová, Monika (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra Farmaceutické technologie Školitel: PharmDr. Ondřej Holas Ph.D. Konzultant: doc. PharmDr. Ivona Pávková Ph.D. Posluchač: Gabriela Čermáková Název diplomové práce: Základní in vitro testování stříbrných nanočástic Tato diplomová práce se zaměřuje na základní in vitro testování účinnosti stříbrných nanočástic (AgNP) velikosti 10 nm (AgNP10) a velikosti 30 nm (AgNP30) vůči infekčnímu agens Francisella tularensis (F. tularensis). Cílem bylo posoudit potenciál AgNP jako možné terapeutické strategie proti tularémii a zhodnotit účinnost spojenou s rozdílnou velikostí nanočástic. AgNP byly připraveny metodou chemické redukce. Citlivost bakterie F. tularensis po ovlivnění AgNP10 nebo AgNP30 byla testována mikrodiluční metodou za účelem stanovení inhibiční koncentrace (IC). Při testování AgNP10 v koncentračním rozmezí 5-30 µg/ml se podařilo na základě více pokusů stanovit IC100, která odpovídá koncentraci 20 µg/ml. U AgNP30 se nepodařilo z časových důvodů a technologických problémů přesně stanovit IC100. Při testování bylo nutné ověřit stabilitu AgNP v různých kultivačních médiích. Získané výsledky vedly k určení vhodného média pro testování citlivosti bakterie F. tularensis, kterým bylo BHI médium. Před samotným testováním AgNP byly kolonie...
|
|
Bezpečnost bezdrátových počítačových sítí
Jelínek, Martin ; Pelka, Tomáš (oponent) ; Doležel, Radek (vedoucí práce)
Diplomová práce se zaobírá problematikou bezdrátových lokálních sítí (WLAN) z hlediska bezpečnosti a funkčního principu zabezpečovacích mechanismů. Přechod do problematiky zabývající se bezpečností je provázen metodami bezdrátového přenosu dat, působícími na úrovni fyzické vrstvy (FHSS, DSSS, OFDM, MIMO), za čímž následuje přehled jednotlivých standardů 802.11. Dále je věnována část problematice sdíleného média (CSMA/CA), rušícím vlivům a opravným mechanismům (RTS/CTS). V rámci bezpečnosti jsou hlouběji popsány principy autentizace spolu s používanými metodami zabezpečení (WEP, WPA, WPA2). První část bezpečnosti probírá problematiku dnes již nevyhovujícího zabezpečení v podobě protokolu WEP, kde je poukázáno na nedokonalou implementaci a rizika z ní vyplývající. Následující část popisuje zabezpečení v podobě WPA, které odstraňuje implementační nedostatky předchozího zabezpečení WEP. Součástí je popis používaných mechanismů autentizace (PSK, 802.1x), potřebná správa dočasných klíčů (PTK, GTK), dále integrita dat (MIC) a šifrování využívající protokol TKIP. Poslední část, možného zabezpečení WLAN, je zaměřena na plnou podporu standardu 802.11i, která je označována jako WPA2 (někdy RSN). V této části je popsán základní bezpečnostní prvek CCMP zajišťující šifrování, který je založen na režimech blokové šifry AES. Praktická část diplomové práce je zaměřena na ověření bezpečnosti současných bezdrátových sítí. Při ověřování je využito dostupných HW prostředků a programových nástrojů z oblasti Open Source Software (OSS). Ověřením je poukázáno na možná bezpečnostní rizika plynoucí z použité metody zabezpečení a je uvedeno několik doporučení, jak snížit bezpečnostní rizika použité metody na minimum.
|
|
Vysoce náročné aplikace na svazku karet Intel Xeon Phi
Kačurik, Tomáš ; Hrbáček, Radek (oponent) ; Jaroš, Jiří (vedoucí práce)
Táto práca sa zaoberá implementáciou a optimalizáciou vysoko náročných aplikácií na zväzku Intel Xeon Phi koprocesorov. Na dvoch prístupoch k riešeniu N-Body problému boli demonštrované možnosti behu programov na zväzku procesorov, koprocesorov a s využitím oboch typov zariadení. Zvolené boli dva verzie N-Body problému - naivná a Barnes-hut. Oba problémy boli implementované a optimalizované. Práca tiež zachytáva proces optimalizácie a zmeny vo výkone po aplikovaní jednotlivých optimalizácií. Pre lepšie porovnanie dosiahnutých výkonov sme porovnávali programy na základe dosiahnutého zrýchlenia voči behu programu na jednom výpočtovom uzle pri využití len procesorov. V prípade naivnej verzie bolo dosiahnuté 15 násobné zrýchlenie pri využití procesorov a koprocesorov na 8 výpočtových uzloch. Výkon dosiahnutý v tomto prípade predstavoval 9 TFLOP/s. Na základe dosiahnutých výsledkov sme v závere zhodnotili výhody a nevýhody pri behu programov v distribuovanom prostredí na procesoroch, koprocesoroch alebo s využitím oboch typov zariadení.
|
|
Analýza šifrovacích algoritmů ve standardu 802.11
Vojtíšek, Jindřich ; Sobek, Jiří (oponent) ; Novotný, Bohumil (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá standardem 802.11 a hlavně algoritmy pro zabezpečení dat v nich. Je zde proveden rozbor algoritmů WEP, WPA a WPA2, kdy u těchto algoritmů je zde popsáno, jakým způsobem probíhá šifrování pomocí jednotlivých algoritmů. K tomuto účelu je práce doplněna o bloková schémata těchto metod. V praktické části je provedena realizace šifrovacích algoritmů WEP, WPA a WPA2 v prostředí Matlab simulink. Modely jsou doplněny grafickými výstupy pro pochopení, jak se mění data během průchodu tímto systémem.
|
|
Design výukové konzole
Hadáček, Milan ; Buganská, Tamara (oponent) ; Karásek, David (vedoucí práce)
Cílem diplomové práce je navrhnout design multifunkční výukové konzole. Práce obsahuje několik variantních studií, barevných nárvhů a konkrétní tvarové provedení. Zahrnuje určitý vývoj v oblasti polohovacích a multifunkčních zařízení. Vlastní práce se zabývá konkrétním tvarovým řešením multidotekové výukové konzole. Je zde řešen i sedák v podobě rehabilitačního míče. Součástí práce je i několikatiminutový video sestřih z oblasti interaktivních médií.
|
|
Efektivní implementace výpočetně náročných algoritmů na Intel Xeon Phi
Šimek, Dominik ; Hrbáček, Radek (oponent) ; Jaroš, Jiří (vedoucí práce)
Táto práca sa zaoberá implementáciou a optimalizáciou výpočtovo náročných algoritmov na koprocesore Intel Xeon Phi. Koprocesor Xeon Phi bol predstavený firmou Intel v roku 2012 ako odpoveď na obrovský nárast v používaní technológie GPGPU. Xeon Phi disponuje podstatne väčším výkonom ako procesor, preto je podobne ako GPGPU vhodnou platformou pre beh výpočtovo náročných programov. Xeon Phi zatiaľ v praxi nie je velmi používaný, preto je potrebné hľadať možné oblasti uplatnenia. Rozrastá sa ale jeho použitie v superpočítačových centrách, napríklad Milky Way 2 - Guangzhou (Čina), Salomon - Ostrava. Cieľom tohto dokumentu je oboznámiť čitateľa s problematikou implementácie náročných algoritmov na akceleračnej karte Xeon Phi, ich optimalizácie a meranie výkonu. Výkon koprocesoru Intel Xeon Phi bude porovnávaný s výkonom procesorov Intel Xeon. V teoretickej časti práce bude čitateľ oboznámený s architektúrou a princípmi koprocesoru Xeon Phi. Budeme sa venovať výhodám ale aj nevýhodám tohto koprocesoru, ktoré budú často porovnávané s všeobecnými vlastnosťami procesorov. Témou bude taktiež otázka, kedy je vhodné zvoliť pre výpočet akcelerečnú kartu Xeon Phi a kedy procesor. Detailne si vysvetlíme a znázorníme výber vhodných algoritmov pre Xeon Phi, postup ich implementácie, optimalizácie a meranie výkonu. Okrem toho budú rozoberané problémy a úskalia, ktoré môžu nastať pri implementácii algoritmov a používaní koprocesoru. Dané demonštrujeme najskôr na ukážkových problémoch, ktoré boli riešené na Ostravskom superpočítači Anselm. V prvom rade to budú jednoduché benchamrky typu násobenie matíc, násobenie matice a vektora, na ktorých budú ukázané základné princípy implementácie optimálnych algoritmov pre koprocesor Xeon Phi. Napríklad pri benchmarku násobenia matice a vektora bolo dosiahnutých asi 6.5% teoretického výkonu koprocesoru. Ďalším, komplexnejším problémom bude N-Body Simulation - simulácia pohybu častíc v priestore, na ktorom sme otestovali potenciál Xeon Phi. Výkon koprocesoru sa pri tomto benchmarku vyšplhal až na viac ako 35% teoretického výkonu - 725 gFLOPS (maximálny výkon 2000 gFLOPS pre dáta s jednoduchou presnosťou). Čitateľ sa okrem iného môže dozvedieť aj zaujímavé informácie z oblasti fyzikálnych simulácií, konkrétne bude reč o module pre MATLAB (k-Wave). K-Wave sa zaoberá simuláciou šírenia akustických vĺn v 1D, 2D a 3D, čo sa využíva napríklad pri simulácii šírenia ultrazvukových vĺn v mäkkých tkanivách. Na koniec si stručne povieme o portovaní už existujúcich knižníc, modulov či programov na Xeon Phi zo snahou využitia jeho potenciálu. Bude to napríklad kroskompilácia knižníc HDF5, ZLIB či konca interpretu jazyka Python s modulmi Numpy a Scipy.
|
|
Výskyt antimikrobiální rezistence u streptokoků (převážně beta-hemolytických) z ran pacientů
Kuropata, Daniel
V poslední době je pozorován častý výskyt antimikrobiální rezistence, který navíc stále stoupá. Proto je důležité neustále tuto rezistenci monitorovat, což bylo cílem této práce u rodu Streptococcus. Literární přehled je tedy zaměřen na vybrané druhy streptokoků (S. agalactiae, S. dysga-lactiae subsp. equisimilis, S. pyogenes, S. mitis a S. oralis), dále na antibiotika, včetně jejich působení, a antibiotickou rezistenci s důrazem na její vznik, šíření, mechanismy, determinující geny a rizika, které představuje. V experimentální části byl sledován výskyt rezistence u streptokoků (převážně beta-hemolytických) izolovaných z ran pacientů Úrazové nemocnice v Brně. K tomuto účelu bylo použito stanovení minimální inhibiční koncentrace (MIC), průkaz fenotypu rezistence k makrolidům, linkosamidům a streptograminu B (MLS) pomocí D-testu a screening genů resistence pomocí polymerázové řetězové reakce (PCR). Stanovením MIC bylo u klinických izolátů (n = 31) zjištěno zastoupení rezistence vůči kotrimoxazolu (96,8 %), ciprofloxacinu (71 %), tetracyklinu (29 %), erytromycinu (25,5 %), klidamycinu (16,1 %), ampicilinu (3,2 %) a oxacilinu (3,2 %). Rezistence vůči chloramfenikolu, gentamicinu, vankomycinu, teikoplaninu, linezolidu, tigecyklinu a nitrofurantoinu nebyla prokázána. D-test byl proveden u izolátů rezistentních vůči erytromycinu (n = 8). Konstitutivní fenotyp (cMLS) byl prokázán u 62,5 % erytromycin-rezistentních izolátů, indukovaný (iMLS) u 25 % a M fenotyp u 12,5 %. Metodou PCR byla potvrzena přítomnost vybraných genů rezistence, a to ermA (16,1 %), ermB (6,5 %), mefA (3,2 %), tetO (3,2 %), tetM (25,8 %) a intTn (32,3 %). Tato studie tedy prokázala, že všechny izoláty streptokoků pocházející z ran pacientů jsou rezistentní vůči některému z testovaných antibiotik, a navíc byla u některých izolátů zjištěna i multirezistence.
|
|
Navržení vhodného bakteriálního inokula pro podporu procesu kompostování gastroodpadu
Malinová, Lucie
Kompostování gastroodpadu je stále studovanějším odvětvím odpadového hospodář-ství. Mnoho prací se zabývá samotným mikrobiálním složením potravinového odpadu a metodami, které by celý proces urychlily. Cílem této práce bylo navrhnout bakteriální inokulum, které by celý proces kompostování gastrodpadu podpořilo. Testovaly se zejména bakterie rodu Lactobacillus, přesněji Lactobacillus acidophilus (CCM 4833), Ligilactobacillus salivarius (CCM 7274) a Limosilactobacillus fermentum (CCM 91). Bakteriální inokulum bylo přidáno v průběhu mezofilní fáze kompostování gastroodpa-du, kde se potvrdilo, že v prvotních fázích dochází ke snižování pH. V dalším pokusu byla zkoumána adaptace bakterií na kyselé prostředí, tak že do tekutého živného média s bakteriemi rodu Lactobacillus byly přidávány kyselé kompostovací šťávy. Výsledky ukázaly, že navyknutí na kyselé prostředí pomáhá bakteriím přežít takovéto extrémní podmínky a bakterie Lactobacillus mohou být vhodným inokulem pro podporu kompos-tování.
|
|
Vliv vybraných emulgátorů a různých způsobů emulzifikace na růst bakterií Staphylococcus aureus a Escherichia coli
KOLDOVÁ, Kamila
Hlavním tématem této bakalářské práce je stanovení minimální inhibiční a baktericidní koncentrace vybraných druhů emulgátorů a rostlinných silic na růst bakterií Escherichia coli a Staphylococcus aureus. Bakalářská práce se dále zabývá vlivem vybraných emulgátorů a jejich způsoby emulzifikace na stabilitu emulze. Teoretická část se věnuje základním informacím o použitých bakterií, jejich morfologickým vlastnostem, patogenezi a onemocněním, které způsobují. Dále jsou popsány emulgátory, jejich obecná charakteristika včetně stability emulze. V poslední teoretické části se bakalářská práce věnuje rostlinným silicím a jejich vlastnostem a možnostem využití. V metodické části této práce jsou znázorněny postupy přípravy emulgátorů a rostlinných silic a stanovení jejich minimální inhibiční a baktericidní koncentrace. Tato stanovení byla prováděna v mikrotitrační 96-ti jamkových destičkách, měřených spektrofotometricky. Stabilita emulzí byla testována ve skleněných zkumavkách, zkumavkách Eppendorf a centrifugačních zkumavkách. Při těchto metodách byla stanovována stabilita emulze na bázi Mueller - Hinton broth a cukerného roztoku. Výsledky minimální inhibiční a baktericidní koncentrace byly zpracovány do tabulek a vyhodnoceny. Stabilita emulze byla zpracována a zároveň vyhodnocena za pomoci získaných fotografií.
|
|
Úroveň české moderní gymnastiky v průběhu olympijského cyklu 2022-2024
Kadlečková, Natálie ; Holá, Iveta (vedoucí práce) ; Novotná, Viléma (oponent)
V této bakalářské práci byla porovnávána úroveň české a světové moderní gymnastiky metodou pozorování videozáznamů volných sestav vybraných moderních gymnastek v seniorské kategorii, konkrétně volných sestav s míčem a kuželi. Název: Úroveň české moderní gymnastiky v průběhu olympijského cyklu 2022-2024 Cíle: Cílem bakalářské práce je posouzení a porovnání zjištěné obtížnosti volných sestav na základě mezinárodně platných pravidel FIG u vybraných gymnastek. Metody: Pozorovaný soubor tvoří tři moderní gymnastky. U každé byl proveden rozbor volných sestav s míčem a kuželi. Celkem tedy bylo za pomoci expertů posuzováno šest sestav, které byly následně porovnány mezi sebou. Výsledky: Výsledky rozboru vybraných volných sestav jsou shrnuty do přehledných grafů. Rozbor sestav byl proveden nejprve jednotlivě u každé gymnastky a výsledky byly následně porovnány mezi sebou. Zjištěné údaje se vztahují především k náplni sestavy z hlediska obsahu a celkové obtížnosti. Pozorovaný rozdíl úrovně mezi světovou špičkou a českou reprezentantkou slouží jako podnět k zamyšlení nad vrcholovou přípravou českých moderních gymnastek. Klíčová slova: aktuální pravidla, artistika, gymnastická sestava, kužele, míč, moderní gymnastika, obtížnost, provedení, technika
|