|
|
Chování tří populací myši domácí ( Mus musculus sensu lato) v baterii pěti behaviorálních testů: vliv poddruhové příslušnosti a komensálního způsobu života
Voráčková, Petra ; Frynta, Daniel (vedoucí práce) ; Macholán, Miloš (oponent)
Pojempersonalitase dnesobjevujestále častějivpsychologickýchstudiíchlidí,ale také zvířat. Studiumpersonalitynámpomáhádefinovatjednotlitvérysychování,které se mohoulišitvrámci věku,pohlaví,druhůneboprostředí.Behaviorálnítestysloužíkodhalenítěchtoprvkůchovánía dokážourozdělitzvířatadorůzných variabilníchskupin. Předmětemnašehobádáníse stalytři populace myši domácí(Mus musculussensulato),které jsme otestovali vtestechvolnéexplorace,nucené explorace,hole-boardtestu,testuvertikálníaktivityave vyvýšenémkřížovémbludišti.Testymělyodhalit,zdase tytomyši budoulišitve svémchovánív rámci pohlaví,komenzalismunebopoddruhu. Zjistili jsme(svýjimkoujednohotestu),že ve vnitropopulačnívariabilitějsourozdílyvelmimalé,avšak mezipopulačnírozdílyjsouvlivemkomenzalismuapoddruhovépříslušnosti velkéajasně zřetelné. Klíčováslova:Mus musculus,komenzalismus,openfieldtest,Elevatedplus-maze,Principal ComponentAnanlysis(PCA)
|
|
|
The impact of geography and subsistence on distribution of NRY haplogroups in Europe and Africa
Nováčková, Jana ; Černý, Viktor (vedoucí práce) ; Munclinger, Pavel (oponent) ; Macholán, Miloš (oponent)
Chromozóm Y je v dôsledku špecifických vlastnosti ideálnym nástrojom archeogenetických štúdií. Jeho diverzita je ovplyvnená viacerými faktormi a dvom z nich (geografická poloha a spôsob života) sa venuje aj táto dizertačná práca, ktorá bola založená na analýze SNP a STR lókusov vzoriek pochádzajúcich zo Slovenska (156 vzoriek, 5 oblasti) a subsaharskej Afriky, kde boli zastúpené populácie praktikujúce usadlý farmársky (481 vzoriek, 18 oblasti) a kočovný pastiersky (405 vzoriek, 16 oblasti) spôsob života. Slovensko leží v mieste stretu dvoch migračných vĺn. Jedna sa šírila z oblasti dnešnej Ukrajiny smerom na západ a súvisí s rozšírením haploskupiny R1a v Európe a druhá šla z oblasti Pyrenejského poloostrova smerom na východ a je dávaná do súvislosti s rozšírením haploskupiny R1b. Výsledky MDS grafu kopírujú geografickú mapu Európy, kde vzorky zo Slovenska ležia medzi ruskými, balkánskymi a pyrenejskými vzorkami. Závislosť medzi genetickými a geografickými vzdialenosťami bola preukázaná aj hierarchickou AMOVOU a Mantelovými testami. V oblasti subsaharskej Afriky vedľa seba žijú populácie, ktoré sa líšia typom životnej subsistencie a tento ich odlišný spôsob života sa odráža aj v diverzite chromozómu Y. Kočovné pastierske a usadlé farmárske populácie sa líšia zastúpením haploskupín chromozómu Y,...
|
|
|
Biologie nekomensálních populací myši domácí (Mus musculus sensu lato) Blízkého Východu
Slábová, Markéta ; Frynta, Daniel (vedoucí práce) ; Macholán, Miloš (oponent) ; Sedláček, František (oponent)
ZÁVĚR - 114 - 6 Závěr Předložená disertační práce přispívá k poznání nejrůznějších aspektů biologie nekomensálních populací myši domácí (Mus musculus sensu lato). Ačkoliv jsou myši velmi častým modelových organismem, pozornost se téměř výhradně soustřeďuje buď na myši laboratorní, nebo na příslušníky komensálních populací. Nicméně vznik komensalismu jistě znamenal rozsáhlé změny ve způsobu života, chování, morfologii i sociálním uspořádání myší. Cílem práce bylo alespoň částečně zaplnit tuto mezeru v poznatcích o tomto jinak důkladně probádaném druhu. Práce se soustředí zejména na nekomensální populace Mus musculus domesticus obývající Blízký Východ a zjištěné poznatky porovnává s výsledky získanými studiem komensálních populací M. m. domesticus i M. m. musculus. Výsledky jsou rovněž diskutovány se znalostmi o jiných volně žijících evropských a blízkovýchodních druzích rodu Mus (M. spicilegus, M. macedonicus, M. spretus). Výsledky prezentované v této disertační práci ukazují, že se komensání a nekomensální populace jednoho druhu mohou výrazně lišit v některých aspektech své biologie. V předložené disertační práci jsou prezentované následující dílčí výsledky: ⇒ Komensální a nekomensální populace M. m. domesticus se výrazně liší v míře agonistického chování během dyadických střetů v neutrálním prostředí....
|
|
|
Genomická architektura a molekulární mechanismy hybridní sterility myši.
Vališková, Barbora ; Forejt, Jiří (vedoucí práce) ; Janko, Karel (oponent) ; Macholán, Miloš (oponent)
Hybridní sterilita je jedním z reprodukčně izolačních mechanismů, který zabraňuje genovému toku mezi příbuznými druhy a tím vede ke speciaci. Prdm9 je zatím jediný známý gen hybridní sterility u obratlovců, jenž určuje místa DNA dvouřetězcových zlomů (DSBs), a tak specifikuje hotspot místa meiotické rekombinace, avšak u hybridů mezi dvěma myšími poddruhy způsobuje selhání synapse meiotických chromozomů a samčí hybridní sterilitu. V této studii na sterilních hybridech jsme zjistili, že nejvíce náchylných k asynapsi bylo pět nejmenších autozomů. Abychom mohli manipulovat s mírou synapse, začlenili jsme různě dlouhé konsubspecifické homologní úseky do vybraných autozomálních párů. Konsubspecifické úseky delší než 27 Mb dokázaly obnovit synapsi u daných chromozomů. Dále jsme zjistili, že alespoň dva symetrické DNA dvouřetězcové zlomy na chromozomu jsou nezbytné pro správnou synapsi. Navíc došlo k částečné nápravě samčí neplodnosti F1 hybridů u jedinců s obnovenou synapsí tří ze čtyř segregujících chromozomů. K ověření vlivu nedostatečného počtu symetrických DSBs u meiotických chromozomů sterilních hybridů byly generovány exogenní DNA DSBs s využitím chemoterapeutického léčiva cisplatiny. Jádra, která byla ošetřena cisplatinou o koncetraci 5 mg/kg a 10 mg/kg váhy těla, vykazovala zvýšený počet DSBs...
|
|
|
Virtual reconstruction, interests and contribution to the paleobiological studies of fossil humans
Rmoutilová, Rebeka ; Brůžek, Jaroslav (vedoucí práce) ; Berillon, Gilles (oponent) ; Macholán, Miloš (oponent)
Zachovalost kosterního materiálu je hlavní překážkou paleoantropologických studií. Virtuální metody se od 90. let 20. století staly důležitou součástí antropologického výzkumu, přičemž značně pomáhají překonat problémy zachovalosti, a to dvěma hlavními způsoby: zlepšují extrakci informací z fragmentárního materiálu a umožňují objektivnější rekonstrukci fragmentárních a nekompletních nálezů. Tato práce se zaměřila na virtuální rekonstrukci dvou fosilních nálezů: lebky moderního člověka Zlatý kůň (ZK; Česká republika) ze svrchního paleolitu a neandertálské pánve Regourdou 1 (R1) z Francie. Rekonstrukce lebky ZK nám umožnila revidovat pohlavní diagnózu a analyzovat její morfologickou afinitu. Na základě sekundární pohlavní diagnózy byl jedinec ZK s vysokou pravděpodobností žena a lebka vykazuje afinitu k rané svrchně paleolitické populaci. Pánev R1 vykazuje značnou asymetrii, která byla nejprve analyzována na křížové kosti v porovnání se zdravými moderními lidmi a neandertálci. Asymetrie výrazně překračuje variabilitu pozorovanou v současné populaci a mohla souviset s asymetrickým přenosem zátěže. Výrazná asymetrie byla proto zohledněna při následné rekonstrukci pánve, která nám umožnila posoudit pohlaví jedince a analyzovat transverzální rozměry pánevního kanálu a orientaci křížové kosti. Na základě...
|
|
|
Meiotic homologous recombination and hybrid sterility
Gergelits, Václav ; Forejt, Jiří (vedoucí práce) ; Macholán, Miloš (oponent) ; Munclinger, Pavel (oponent)
(česky) Meiotická homologní rekombinace, synapse homologních chromosomů a hybridní sterilita F1 kříženců jsou vzájemně provázané fenomény závisející jeden na druhém. V předložené dizertační práci jsme tyto fenomény zkoumali na genetické i mechanistické úrovni za využití modelu myších poddruhů. Identifikovali a charakterizovali jsme noncrossovery (NCO, též genové konverze), které zprostředkovávají 90% všech oprav meiotických dvouřetězcových zlomů (DSB), determinovaných genem Prdm9, a to na celochromosomální úrovni. Na základě 94 detekovaných NCO jsme spočítali střední délku doprovodných úseků genové konverze jako 32 bp. Na lokální úrovni se NCO překrývaly s již známými hotspoty trimethylovaných histonů a utváření DSB. Lokalizace hotspotů v genomu je určená proteinem PRDM9. Z toho vyplývá, že NCO skutečně mají původ ve standardní dráze opravy meiotických DSB. Na celochromosomální úrovni jsme pozorovali rozdílné distribuce NCO a crossoverů (CO), projevující se zejména relativní preferencí CO před NCO v subtelomerických oblastech. Pozorovali jsme deficit specifické třídy tzv. nonparentálních, či asymetrických NCO a CO. Navrhujeme, že tyto NCO a CO jsou obtížně orpavitelné a hypoteticky by mohly být opraveny sesterskou chromatidou. Takováto oprava by nepřispěla k nezbytné homologní synapsi....
|
|
|
Speciation genomics in nightingales
Mořkovský, Libor ; Reifová, Radka (vedoucí práce) ; Macholán, Miloš (oponent) ; Piálek, Lubomír (oponent)
Shrnutí Speciacejeobvyklepomalýproces,kdesečasměřívtisícíchažmilionechlet.Todělávýzkum speciaceobtížným,protože"celou"speciacinelzeanipozorovat,anisníexperimentálněma- nipulovat.Nejvíceinformacíospeciacinámposkytnepodrobnápopulačnístrukturaspolečně s rekonstruovanou populační historií vybraných populací, které považujeme za vznikající nebo nedávno vzniklé druhy. Díky nedávnému vzestupu nových sekvenačních metod lze nyní zjistit genotypy mnoha jedinců ve velkém rozlišení za přijatelnou cenu. Výzkum spe- ciace tím získává nové obzory. Speciace totiž není jeden konkrétní proces, který se pokaždé odehraje podle stejného scénáře, ale spíše symfonie různých událostí, jež vedou v konečném důsledku k (trvalé) reprodukční izolaci dvou subpopulací. Proto je k pochopení celého feno- ménudůležitézkoumatpříkladyurůznýchmodelovýchsystémů.Myjsmesizvolilidvadruhy slavíků(LuscinialusciniaaL.megarhynchos),kteréseoddělilypředzhruba1,8 milionemlet, pravděpodobnědíkyposunůmzaledněníběhemstřídánídobledových.Našímhlavnímcílem bylopomocínovýchsekvenačníchmetod(1)detekovatmezidruhovéhybridy,(2)odhadnout úroveň genového toku mezi druhy, (3) najít oblasti v genomu slavíka, které podmiňují reprodukční izolaci mezi druhy a konečně (4) prozkoumat roli chromosomu Z při speciaci....
|
|
|
Kandidátní geny pro behaviorální adaptace u tropických a temperátních ptáků
Křístková, Barbora ; Munclinger, Pavel (vedoucí práce) ; Macholán, Miloš (oponent)
Využití kandidátních genů se stalo velmi rozšířeným přístupem při studiu behaviorálních adaptací. Funkce genu bývá často zachována i u velmi vzdálených evolučních linií. Díky tomu nám tento přístup umožňuje rozšíření znalostí i o druzích, které nejsou využívány jako modelové a tedy u nich není zmapován celý genom. Ve své práci jsem se zabývala vlivem selekce na kandidátní geny behaviorálních adaptací spojených především s biorytmy. Zajímalo mě porovnání genetické variability mezi blízce příbuznými druhy pěvců z tropické a temperátní zóny. Tato prostředí se liší především ve stabilitě podmínek. Tropické druhy žijí ve velmi stabilních podmínkách s celkově nízkou sezónností, na rozdíl od druhů temperátních. Právě kvůli střídání krátkých období s příznivými podmínkami a obdobími nepříznivými, dochází u temperátních druhů k migraci a její načasování je pro tyto druhy životně důležité. Předpokládala jsem tedy snížení genetické variability u migrujících druhů temperátní zóny, oproti druhům tropickým, v důsledku stabilizující selekce. Studie je založena na analýzách mikrosatelitových lokusů v oblasti exonů. Z důvodu možného snížení genetické variability z jiných příčin je do studie zapojena i kontrolní analýza neutrálních mikrosatelitů, u kterých nepředpokládáme vliv selekce. U tropických druhů jsem...
|
|
|
Morfometrická analýza zapadopalearktických zástupců rodu Apodemus: od determinace k ekomorfologii
Mikulová, Pavlína ; Frynta, Daniel (vedoucí práce) ; Macholán, Miloš (oponent) ; Sedláček, František (oponent)
Souhrn Disertačnípráce je za|oženananiŽe uvedených rukopisech: Trsr or cHARÁcTER DIsPLACEMENT IN URBAN PoPULATIoNs oF ApopBuassylvATrcus MikulováP.& FryntaD.2001 CanadianJountalofZoology79:794-80I V tétopráci jsme využili jedince druhuA. sylvaticus pro studium uplatněníposunu znaků.Svou pozornostjsme přitom zaměřili na urbánní pražské prostředí, kde jsme srovnávali populace A. sylvaticus z lokalit se sympatrickým výskýem s A. flavicollis s populacemi z lokalit s výlučn;im výskytem A. sylvaticus. A, sylvaticuspředstavujev danésouvislostiideálnípředmět studia, vezmeme-li v úvahu dostupnéliterární údaje, které dokládají podobnéekologickénároky druhůA. sylvaticus a A, flavicollis a zároveň naznačuji významnou roli kompetice (interferenčníči exploatační)ve vzájemných interakcíchmezi nimi. omezená studijní plocha navíc nevyžaduje analyzování dalších faktoru (klimatickéfaktory,evolučníhistorie sfudovanýchpopulacíapod.) s možnouvazbou na sfudovanéznaky,kteréby mohly nabývatna vjznamnosti v případě rozdílného geografického původu studovaných vzorků. Výsledky multivariátní analýzy 12 kraniálnícha 5 tělesnýchrozměru 1410jedinct A. sylvaticus (I7 vzorků) překvapivě uplatnění posunu znaků u populací A' sylvaticu.snepodpořily, nicméněprokázaly odlišnostpopulací A. sylvaticus zcentÍaměsta od populacítohoto druhu zokraje...
|
|
| |
host ::
RSS.