|
|
Test benches for microcontroller kits
Žaludek, Ivo ; Arm, Jakub ; Bradáč, Zdeněk
This paper deals with the design of a test bench for modules used in educational labs. The first section outlines the requirements for the tester, followed by a description of the printed circuit board design process. Implementation details of the software are then examined, including a graphical user interface based on Model-View-Controller (MVC) architecture that allows for easy result printing. The obtained results are presented, and further work is discussed.
|
|
|
Srovnání podobností hmotnostních spekter a struktur malých molekul
Malíčková, Viktorie ; Galgonek, Jakub (vedoucí práce) ; Škrhák, Vít (oponent)
Metody pro měření podobnosti hmotnostních spekter a struktur malých molekul jsou důležité pro pokroky v lékařské chemii, farmakologii a metabolomice. Mezi běžně využívané metody pro porovnání hmotnostních spekter molekul patří kosinová podobnost. Jedná se o míru podobnosti mezi dvěma nenulovými vektory, která měří kosinus úhlu mezi nimi. Porovnání hmotnostních spekter molekul umožňuje vyhledávání v databázích molekul, klastrování spekter a vyhledávání ve spektrálních knihovnách. Strukturní podobnost se pak měří na základě nejrůznějších molekulárních fungerprintů, jako jsou například Daylight fingerprint, RDKit fingerprint, Atom-Pair Fingerprint, Topological Torsion Fingerprint, Extended-Connectivity Fingerprint a další. Tyto fingerprinty jsou pak porovnávány pomocí koeficientů podobnosti. Zmíněné metody pro porovnávání struktur a hmotnostních spekter molekul lze aplikovat pomocí bioinformatických knihoven RDKit a CDK pro generování a analýzu strukturních fingerprintů a knihovny matchms pro porovnání hmotnostních spekter. Práce poskytuje teoretický přehled jak molekulárních deskriptorů, zahrnující rozmanité typy molekulárních fingerprintů a techniky pro měření strukturní podobnosti, tak principu hmotnostní spektrometrie a přístupu k porovnání hmotnostních spekter. Praktická část práce je zaměřena na...
|
|
|
Zkoumání změn v epigenetických modifikacích v mozku potkana vyvolaných působením morfinu
Hronová, Anna ; Novotný, Jiří (vedoucí práce) ; Roubalová, Lenka (oponent)
Tato práce se zabývala vlivem různě dlouhých abstinenčních období na epitran- skriptomickou modifikaci m6 A a enzymy účastnící se této modifikace, stejně jako na transkripční faktory v mozku potkanů závislých na morfinu. Použité metody zahrnovaly využití kolorimetrického kitu pro určení hladin m6 A a Western blot metodu pro kvantifikaci hladin enzymů a transkripčních faktorů. Výsledky ukázaly, že různě dlouhé úseky morfinové abstinence neměly významný vliv na m6 A modi- fikaci, což naznačuje, že tato dráha pravděpodobně nebyla ovlivněna morfinovou abstinencí. Nicméně byly pozorovány signifikantní změny v hladinách enzymů, které jsou zapojené do regulace m6 A, které byly místně a časově specifické, bez jasného trendu. Zkoumání transkripčních regulátorů ∆FosB a MeCP2 taktéž odha- lilo signifikantní změny jen v některých částech mozku a v určitých časech, ale bez jasného trendu ve změnách hladin. Výsledkem této práce je, že dynamika hladin transkripčních regulátorů, N6 6-metyl-adenosinu a enzymů, které se účastní m6 A modifikace je místně a časově specifické a otevírá nové otázky ohledně mechanismů, které řídí neurobiologické pochody během abstinenčního období.
|
|
|
Laboratorní diagnostika microRNA u různých diagnostických skupin
Hrachovcová, Eliška ; Urbánková Rathouská, Jana (vedoucí práce) ; Tripská, Katarína (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biologických a lékařských věd Student: Bc. Eliška Hrachovcová Vedoucí diplomové práce: PharmDr. Jana Rathouská, Ph.D. Konzultant diplomové práce: doc. RNDr. Pavlína Kušnierová, Ph.D. Název diplomové práce: Laboratorní diagnostika microRNA u různých diagnostických skupin Cíl práce: Identifikace potenciálních miRNA cílů pro diferenciální diagnostiku pacientů s aterosklerózou a demencí. Porovnání exprese a záchytu miRNA ve vzorcích séra se vzorky mozkomíšního moku. Výběr vhodných miRNA v rámci diferenciální diagnostiky u pacientů s aterosklerózou a s demencí. Dále také výběr miRNA cílů s co nejvýraznější fold-change a zároveň co nejnižší p-hodnotou pro následnou validační studii. Metody: Pro identifikaci potenciálních miRNA byly přijaté vzorky centrifugovány, alikvotovány a skladovány při - 80C. miRNA byla izolována pomocí kitu iCatcher Circulating cfRNA 1000 kit a izolátoru CatchGene. Poté byla provedena reverzní transkripce a amplifikace s detekcí. Data byla zpracována v Excelu a následně statisticky zpracována v programu GenEx pomocí Mann- Whitney testu. Výsledky: Výsledky byly hodnoceny pro 2 skupiny pacientů: skupinu A (vzorky pacientů s Parkinsonovou nemocí a demencí) a skupina B (s aterosklerózou a demencí). Byla hodnocena...
|
|
|
Komplexní molekulární diagnostika gastrointestinálních stromálních nádorů
Kalfusová, Alena ; Kodet, Roman (vedoucí práce) ; Mandys, Václav (oponent) ; Vaněček, Tomáš (oponent)
Komplexní molekulární diagnostika gastrointestinálních stromálních nádorů ABSTRAKT Většina gastrointestinálních stromálních nádorů (GIST) je charakterizována přítomností aktivačních mutací v genech KIT a PDGFRA (80 - 85 %). Ve skupině KIT/PDGFRA nemutovaných GIST (10 - 15 %) byly detekovány mutace v genech BRAF, KRAS, defekty v komplexu SDH nebo fúze FGFR1::TACC1, ETV6::NTRK3. Cílená terapie Imatinib mesylátem (IM) znamenala významný průlom v terapii GIST. Výrazným problémem cílené terapie je vznik primární nebo sekundární rezistence. Biologické chování GIST je nepředvídatelné. Stanovení proliferační aktivity vybraných markerů proliferace a senescence umožní objektivizovat riziko agresivního chování nádoru. Cílem první části naší práce byla mutační analýza genů KIT a PDGFRA a detekce sekundárních mutací u pacientů s progresí onemocnění. V 83.5 % vzorků jsme detekovali primární mutace v genech KIT a PDGFRA. U 16 pacientů s progresí onemocnění jsme prokázali přítomnost sekundárních mutací (v 29 progresivních ložiscích - 69 %). Potvrdili jsme výraznou intranádorovou a rovněž internádorovou heterogenitu sekundárních mutací. Cílem druhé části práce byla analýza alterací ve skupině KIT/PDGFRA nemutovaných GIST. V této skupině GIST jsme prokázali defekty v podjednotkách SDH komplexu, mutace v genech BRAF a NF1 a...
|
|
|
Generace trombinu u patofyziologických stavů
Malíková, Ivana
Úvod: Trombofilní stavy mohou být provázeny zvýšenou generací trombinu, zvláště pak v těhotenství, kdy nárůst generace trombinu vyplývá z řady změn v hemostatickém systému. Při podávání antikoagulační léčby je žádoucí nárůst generace trombinu snížit. Cíle studie: Jedním z cílů naší studie bylo porovnat generaci trombinu u jedinců s prokázanou mutací faktoru V Leiden a jedinců se zvýšenou hladinou faktoru VIII. Dalším úkolem bylo porovnat pacienty s VTE s prokázanou mutací faktoru V Leiden (nebo bez ní) a užívající rozdílnou antikoagulační léčbu. Posledním cílem bylo posoudit generaci trombinu u těhotných žen a jejich odpovědi na podávání LMWH při závažném trombofilním stavu. Soubor pacientů a metody: Do kontrolní skupiny bylo zařazeno 170 zdravých dárců krve, do skupiny vrozené a získané trombofilie bylo zahrnuto 44 jedinců s mutací faktoru V Leiden a 38 jedinců s hladinou faktoru VIII >150 % bez další prokázané trombofilie. Do skupiny s antikoagulační léčbou bylo zařazeno 347 jedinců s VTE užívajících přímé inhibitory koagulace. Do skupiny těhotných žen bylo zařazeno 60 žen s profylaktickou dávkou LMWH. Pro sledování generace trombinu jsme použili kit Technothrombin® TGA RC Low a RC High a analyzátor Ceveron® Alpha. Výsledky: Zvýšená generace trombinu byla nalezena u skupiny s vysokým faktorem...
|
|
|
Mobilní kamera realizovaná prostředky ROS2
Onderka, Daniel ; Peringer, Petr (oponent) ; Janoušek, Vladimír (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá middlewarem Robot Operating System 2. Konkrétně je jejím cílem prozkoumat a demonstrovat jeho možnosti. Použitým hardwarem je robot Adeept AWR 4WD. Jádrem této práce je implementace systému na jeho řízení. Výsledek nabízí jak režim manuálního ovládání, tak režim automatického bloudění s vyhýbáním se překážkám. Kromě čistého ROS2 se práce zabývá také souvisejícími technologiemi. Jednou z nich je Gazebo simulátor, do kterého byla replikována veškerá funkcionalita fyzického robota. Adeept AWR byl také doplněn o rozšiřující hardware, který umožnil použití knihoven slam_toolbox a Nav2 pro mapování a navigaci. Posledním rozšířením je použití ros2_control k řízení pohybu robota.
|
|
|
Sensor for bars of mallet percussion instruments
Pribol, Sebastián ; Balík, Miroslav (oponent) ; Jirásek, Ondřej (vedoucí práce)
This thesis addresses the issue of capturing melodic percussion instruments using dynamic sensors that can be attached to a musical instrument. It includes theoretical knowledge, analysis, and selection of appropriate sensing methods, and the actual implementation, which consists of testing, integration with MIDI, manufacturing of the device itself, and final calibration and adjustments for proper functionality. The device uses an ESP32-S3 Dev Kit N8R8 microcontroller, which was programmed in the Arduino IDE for proper operation. The device consists of twelve piezoelectric sensors that capture the dynamics of playing the musical instrument and send MIDI information to a DAW via a Bluetooth module.
|
|
|
Půdní aplikace hydrogelů s obsahem rhizobakterii
Hlaváčková, Barbora ; Černayová, Diana (oponent) ; Kalina, Michal (vedoucí práce)
Rhizobakterie podporující růst rostlin (PGPR) se řadí do skupiny půdních bakterií, které mohou svými mechanismy ovlivňovat růst rostlin. V posledních letech dochází k nárůstu používání těchto podpůrných látek ve formě biohnojiv s cílem zvýšit výnosy a zlepšit růst plodin v nepříznivých podmínkách ekologicky šetrným způsobem. Cílem této bakalářské práce bylo posoudit vliv externího přídavku PGPR v různých formách na fyzikálně-chemické charakteristiky půdy a na růst modelových rostlin lociky seté v prvním případě bez omezení závlahy a ve druhém případě za podmínek omezené závlahy. Byl vybrán konkrétní kmen bakterie Azotobacter vinelandii CCM 289 pro přípravu čtyř forem ošetření, konkrétně biomasa v PBS, alginátový gel bez bakteriální kultury, gel s bakteriální kulturou a lyofilizovaný gel s bakteriální kulturou. Vliv jednotlivých ošetření byl porovnán s negativní kontrolou bez přídavku PGPR, jelikož různé formy ošetření mohou dosahovat odlišné efektivity kolonizace rhizosféry, což může mít různý vliv na růst rostlin. K posouzení vlivu přídavku PGPR byly v průběhu kultivačních experimentů měřeny fyzikálně-chemické charakteristiky půdy (vlhkost, pH) a růstové charakteristiky lociky seté, jako je počet listů, výška a šířka nadzemních částí těchto modelových rostlin. Po ukončení kultivačních experimentů byly stanoveny základní růstové parametry modelových rostlin z jednotlivých ošetření, jako je celková délka, délka nadzemních částí a kořenů modelových rostlin, dále také celková hmotnost jednotlivých rostlin a hmotnost jejich nadzemních částí a kořenů. Po vysušení byla charakterizována celková hmotnost sušiny jednotlivých rostlin a hmotnost sušiny nadzemních částí rostlin a kořenů. Po vysušení byla analyzována hustota kořenů provedením jejich skenů a porovnána mezi jednotlivými ošetřeními. Na půdních výluzích z jednotlivých ošetření po ukončení kultivačních experimentů byl analyzován vliv přídavku PGPR na mikrobiální aktivitu půdy použité v experimentech pomocí kultivace na Petriho miskách s agarovým mediem a pomocí sady BIOLOG EcoPlate byla stanovena hodnota průměrného vývoje barvy jamky (AWCD) a výsledky byly srovnány s jednotlivými ošetřeními mezi kultivačními experimenty, které probíhaly s odlišnými podmínkami zavlažování. Na půdních výluzích z vysušených půd po ukončení kultivačních experimentů byly provedeny fyzikálně-chemické charakteristiky (pH, vodivost). Na vysušených půdách jednotlivých ošetřeních bylo analyzováno množství organické a anorganické frakce metodou TGA. Výsledky byly mezi sebou porovnány a byl posuzován vliv různých forem externího přídavku PGPR na fyzikálně-chemické charakteristiky zvolené půdy za podmínek bez omezení závlahy a za podmínek s omezením závlahy v průběhu experimentů.
|
|
|
Demonstrační kit pro optovláknový senzorický systém
Beránek, Karel ; Klíčník, Ondřej (oponent) ; Dejdar, Petr (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá návrhem a~realizací demonstračního kitu pro optovláknový senzorický systém. Práce obsahuje teoretický rozbor optických jevů, jako je polarizace, disperze a~interference, které jsou klíčové pro pochopení principů fungování optovláknových senzorů. Navržený senzorický systém zahrnuje Machův-Zehnderův interferometr, vývojový kit UP-Board, externí 24bitovou zvukovou kartu a~dotykový displej. Praktická část práce se zaměřuje na konstrukci krytu pomocí 3D tisku, integraci jednotlivých komponent, návrh vlastní aplikace a~testování systému. Výsledky této práce přispívají k rozvoji znalostí v~oblasti optovláknových senzorů a~mohou být využity v~akademickém i průmyslovém prostředí.
|
host ::
RSS.