|
|
Analýza metabolitů produkovaných kvasinkovými koloniemi a biofilmy
Karásek, Filip ; Palková, Zdena (vedoucí práce) ; Dostál, Jiří (oponent)
U bakterií je již delší dobu popsán fenomén signalizace pomocí malých molekul, tzv. quorum sensing. Tento fenomén byl v poměrně nedávné době popsán i u kvasinek, ovšem stále zůstává otevřena celá řada otázek ohledně signalizace pomocí malých molekul u kvasinek. Několik prací a publikací již popsalo vliv některých nízkomolekulárních látek jako například fenylethylalkoholu nebo tryptofolu na morfologii buněk S. cerevisiae. Ovšem o vlivu nízkomolekulárních látek na morfologii mnohobuněčného společenství kvasinek, jakými jsou i kolonie, je toho známo velmi málo. Cíle této práce jsou, za přístupu neselektivní metabolomiky, analyzovat jaké metabolity jsou produkovány různými kmeny S. cerevisiae při kultivaci na různých typech pevných komplexních medií. Na základě výsledků analýzy metabolitů bude testován vliv vybraných látek na morfologii mikrokolonií S. cerevisiae při kultivaci na pevném komplexním mediu. Třetí část práce pak popisuje přípravu klonů, u kterých došlo ke genovým manipulacím za účelem ovlivnit fungování Ehrlichovy dráhy, která je zodpovědná za produkci některých metabolitů, která dokáží ovlivnit morfologii kolonií S. cerevisiae. Klíčová slova: Saccharomyces cerevisiae, mikrokolonie, tryptofol, isoamyl alkohol, kyselina isovalerová, morfologie kolonií, strukturované mikrokolonie, hladké...
|
|
|
Sekretované aspartátové proteázy kvasinky Candida parapsilosis.
Marečková, Lucie ; Dostál, Jiří (vedoucí práce) ; Novotný, Marian (oponent)
Candida parapsilosis je oportunistický patogen člověka způsobující řadu infekcí. Mezi nejvíce ohroženou skupinu pacientů patří jedinci s oslabenou imunitou. Narůstající četnost infekcí spojená se vznikem rezistentních kmenů se stala hlavním důvodem pro hledání nových metod léčby. Jedním z možných řešení mohou být přístupy zabývající se inhibicí sekretovaných aspartátových proteáz, které jsou považovány za jeden z virulentních faktorů kandid. Genom C. parapsilosis obsahuje tři geny kódující sekretované aspartátové proteázy SAPP1, SAPP2 a SAPP3. Zatímco izoenzym Sapp1p byl dobře biochemicky i strukturně charakterizován, izoenzymům Sapp2p a Sapp3p byla doposud věnována jen malá pozornost. První část této diplomové práce je zaměřena na rentgenostrukturní analýzu vazby vybraných peptidových inhibitorů do aktivního místa izoenzymu Sapp1p a na vazbu známého inhibitoru aspartátových proteáz Pepstatinu A do aktivního místa izoenzymu Sapp2p. Druhá část této práce je spjata se zjištěním, že C. parapsilosis patří mezi kandidy, jež překládají standartní leucinový kodón CUG majoritně serinem. Ačkoliv se jedná o nekonzervativní záměnu hydrofobní aminokyseliny za hydrofilní, je tato unikátní schopnost některými druhy kandid udržována více jak 170 mil. let. Přestože se již některé studie věnovaly selekčním výhodám a...
|
|
|
Application of blood flow restriction by a sport training of climbers - an innovative training method for sportsmen?
Javorský, Tomáš ; Baláš, Jiří (vedoucí práce) ; Dostal, Jiří (oponent)
Názov práce: Aplikácia reštrikcie krvného obehu v športovom tréningu lezcov - inovatívna metóda tréningu športovcov? Autor: Bc. Tomáš Javorský Katedra: Katedra fyziológie Vedúci bakalárskej práce: doc. Jiří Baláš, Ph.D. Abstrakt: Medzi najčastejšie zranenia športových lezcov patria zranenia šliach ohýbáčov článkov prstov. Toto zranenie môže športovca vyradiť z tréningového programu na niekoľko mesiacov, čo môže mať rozhodujúci dopad na jeho vrcholovú sezónu. V práci bol porovnávaný tréning s vysokou intenzitou, ktorý prebieha na 70 % silového maxima s tréningom s reštrikciou krvného obehu, ktorý je vykonávaný pri 30% záťaži a ďalej fyziologické a funkčné aspekty tréningu. Hypotézy: Predpokladáme, že kombinácia nízkej záťaže a ischémie bude dosahovať rovnaké výsledky ako tréning s vysokou intenzitou. Ďalej predpokladáme, že zmeny v oxygenácii svalu budú aj napriek rozdielnej vykonávanej práci rovnaké. Metódy: trinásť participantov ukončilo experiment vykonaný formou prekríženej štúdie. Počas experimentu bola participantom odmeraná oxidačná kapacita svalu a miera deoxygenácie svalu pomocou spektroskopie. Maximálna sila, kritická sila, impulz sily a impulz sily nad hodnotou kritickej sily boli odmerané a určené pomocou využitia systému 1D-SAC Výsledky: Po aplikovaní tréningového protokolu s vysokou intenzitou...
|
|
|
Využití akustické emise při hodnocení procesu obrábění
Dostál, Jiří
Práce se zabývá aplikací systému měření akustické emise na obráběcí proces. V práci je popsána podstata obrábění, je zde uveden vliv řezných podmínek na obráběcí proces a pozornost je věnována také používaným nástrojovým materiálům a tvorbě třísky. Další část se zabývá akustickou emisí, její základní charakteristikou a oblasti jejího využití. V experimentální části se je stanoven cíl měření, podrobně popsána metodika měření a následně vyhodnocena data získána při měření.
|
|
|
Vliv stupňovaných dávek dusíku na výnos a kvalitu osiva kukuřice
Dostál, Jiří
Tato práce se zabývá posouzením vlivu stupňovaných dávek na výnos a kvalitu osiva kukuřice. Problematika byla řešena formou poloprovozního polního pokusu na množitelském porostu kukuřice v obci Kelčany v roce 2016. Na všechny varianty se aplikovalo 90 kg.ha-1 N a ve fázi 10 listů se aplikovaly stupňované dávky dusíku v hnojivu DASA. Pokus zahrnoval 5 variant: 1. varianta byla hnojena 120 kg.ha-1 N, 2. 90 kg.ha-1 N, 3. 60 kg.ha-1 N, 4. 30 kg.ha-1 N a 5. nehnojeno. Po sklizni byl stanoven výnos zrna v t.ha-1 při sušině 14 %. Pro vyjádření kvality osiva se provedla kalibrace na jednotlivé frakce a test klíčivosti. Nejvyšší výnos zrna v porovnání s kontrolou byl zjištěn u varianty 1 s nejvyšší dávkou dusíku. U ostatních variant nebyl pozorován významnější rozdíl ve výnosu zrna. Na základě tohoto jednoletého pokusu lze považovat za nejvhodnější dávky dusíku ve vztahu k výnosu a kvalitě osiva 90 kg.ha-1 N a 60 kg.ha-1 N.
|
|
|
Hodnocení kořenového systému a infiltrační schopnosti půdy u vybraných druhů trav
Dostál, Jiří
V zemědělství se velmi často využívají jílky, kostřavy a mezirodové hybridy xFestulolium, které jsou považovány za optimální travní druhy pro intenzivní produkci píce. Jílky jsou náchylné k abiotickým stresům, kterých s nastávající klimatickou změnou přibývá. Proto byly vyšlechtěny mezirodové hybridy Festulolium, které disponují vyhovujícími parametry (vyšší odolnost vůči suchu, schopnost prokořenění zhutnělých vrstev, lepší využitelnost živin aj.) pro zajištění kvalitní produkce a plnění dalších ekosystémových služeb. Pro plnění ekosystémových funkcí je zásadní biomasa a architektura kořenů. V této práci jsem se zaměřil na hodnocení kořenového systému a porovnání infiltrační schopnosti půdy u vybraných druhů trav. Pro porovnání vybraných parametrů, byly trávy pěstovány v trubkách naplněných pískem. Byly testovány druhy Lolium multiflorum (cv. DALLARA), Festuca pratensis (cv. HYPERBOLA), Festulolium braunii (cv. HOSTYN), Festulolium krasanii (cv. HYKOR a HIPAST), Festulolium loliaceum (cv. PRIOR) a Trifolium pratense (cv. CALLISTO). Hodnocenými parametry byly: délka rostlin, počet odnoží, maximální hloubka zakořenění, celková délka kořenů, objem kořenů, povrch kořenů, délka kořenů v jednotlivých tloušťkových kategoriích, hmotnost suché nadzemní a podzemní biomasy. Nejvyšší hodnoty byly naměřeny u jílku mnohokvětého (cv. DALLARA) a u Festulolium braunii (cv. HOSTYN). Další částí práce byl odběr a hodnocení kořenů z půdy na pokusných parcelách ve Vatíně. V tomto měření byly vybrány druhy Festuca rubra (cv. GONDOLIN) a Festulolium krasanii (cv. HYKOR). V parametrech celková délka kořenů, povrch kořenů a objem kořenů nebyly zjištěny statisticky průkazné rozdíly. Festulolium (cv. HYKOR) měl průkazně silnější kořeny v porovnání s kostřavou červenou. Poslední částí výzkumu bylo porovnání infiltrační schopnosti půdy u těchto druhů: Festuca rubra (cv. GONDOLIN) a Festulolium (cv. HOSTYN, PRIOR a HYKOR). Nejvyšší infiltrační schopnost byla změřena na parcele Festulolium loliaceum (cv. PRIOR).
|
|
|
Chirurgická problematika mozkové ischemie Flowmetrie v klinické praxi a experimentu
Dostál, Jiří ; Přibáň, Vladimír (vedoucí práce) ; Vaverka, Miroslav (oponent) ; Navrátil, Ondřej (oponent)
Souhrn dizertační práce Chirurgická problematika mozkové ischemie Flowmetrie v klinické praxi a experimentu MUDr. Jiří Dostál, Neurochirurgická klinika LF UK v Plzni a FN Plzeň Školitel: doc. MUDr. Vladimír Přibáň, Ph.D., Neurochirurgická klinika LF UK v Plzni a FN Plzeň Cílem této dizertační práce bylo zhodnotit možnosti a přínos transit time flowmetrie (TTF) v prevenci vzniku mozkové ischemie při neurochirurgických operacích. Na kazuistikách z neurochirurgické kliniky LF UK v Plzni je ukázáno použití a limitace TTF. Prezentované případy ukazují význam vyšetření a nutnost individuálního přístupu ke každé komplexní operaci na mozkových cévách. Byl zpracován soubor pacientů operovaných pro neprasklé aneuryzma střední mozkové tepny (MCA). U první skupiny pacientů bylo kontrolováno kvantitativně případné omezení průtoku cévami souvisejícími s výdutí po naložení svorky. U druhé skupiny TTF měření nebylo provedeno. Výsledky byly porovnány. Ačkoliv nebyl prokázán statisticky významný přínos použití TTF v zamezení vzniku ischemie, jednotlivé případy odůvodňují zvážení jejího použití. TTF měření je invazivní a vyžaduje dobrý přístup k cévě a její preparaci. Autoři doporučují ponechat na zvážení chirurga, zda v konkrétním případě převáží benefit rizika spojená s preparací zdravého úseku tepny potřebného k měření. V...
|
|
|
Metodický postup odběru vzorků hnojiv, rostlin a půdy pro stanovení rizikových prvků v agroekosystémech a dalších parametrů půdní úrodnosti: uplatněná certifikovaná metodika
Kunzová, Eva ; Menšík, Ladislav ; Hejcman, Michal ; Dostál, Jiří
Metodika přináší nejnovější poznatky o způsobech odběrů vzorků statkových, organických a organominerálních hnojiv, vzorků rostlinného materiálu a půdy pro stanovení obsahů rizikových prvků. Součástí metodiky je popis dostupných laboratorních metod pro stanovení obsahu sušiny, pH, obsahů základních živin a rizikových prvků ve vzorcích (statkových, organických a organominerálních hnojiv, rostlinného materiálu a půdy) a je popisem základních metod pro charakteristiku kvality půdní organické hmoty (POH) a je přehledem limitních hodnot rizikových prvků v hnojivech, substrátech a v půdách zakotvených v legislativních předpisech ČR. Uplatnění metodiky bude u subjektů hospodařících na orné půdě, trvalých travních porostech, konvenčním i ekologickém zemědělství, ve službách a v obchodní sféře pro zemědělství, v akreditovaných laboratořích, u zemědělských poradců i v poradenském systému MZe ČR apod. Předložené poznatky rovněž využijí pracovníci státní správy, studenti a pedagogové středních i vysokých škol, aj.
Plný text:  PDF
|
|
| |
|
|
Srovnání metody NIRS a dalších metod k určení anaerobního prahu
Šimon, Jan ; Slabý, Kryštof (vedoucí práce) ; Dostal, Jiří (oponent)
Cílem této práce bylo porovnat určení anaerobního prahu metodou NIRS (z angl. Near- infrared spectroscopy) se stanovením anaerobního prahu na základě ventilačních parametrů. Dále bylo cílem sledovat základní fyziologické změny svalové saturace (SmO2) v průběhu stupňovaného zátěžového vyšetření rampového typu na bicyklovém ergometru. Měření se zúčastnilo 15 probandů, 9 mužů a 6 žen. K ověření spolehlivosti měření byl experiment proveden formou test/re-test s odstupem několika dnů. Hodnota SmO2 byla měřena u m. gastrocnemius lateralis a m. vastus lateralis. Dále byly během vyšetření snímány respirační parametry a tepová frekvence. Ze získaných dat vyplývá, že breakpoint v dynamice SmO2 určený metodu NIRS značí dosažení intenzity zátěže nad anaerobním prahem, jelikož se nachází v oblasti bodu respirační kompenzace. V parametru SmO2 je také možné sledovat rovnovážný stav v průběhu klidové fáze. Parametr SmO2 po ukončení rampového protokolu převyšuje hodnotu v klidové fázi a k návratu do klidových hodnot dochází zpravidla do 2 minut. Metodou test/re-test byla ověřena spolehlivost měření.
|
host ::
RSS.