|
|
Fluidní inkluze v Au-křemenné žilovině z lokalit Padrť a Sobětice
Hemalová, Kateřina ; Zachariáš, Jiří (vedoucí práce) ; Dobeš, Petr (oponent)
Systém křemenných žil s molybdenitem z lokality Padrť proniká do metamorfovaných kambroordovických sedimentů Barrandienu (křemence, arkózy, rohovce) v jihozápadní části středních Brd. Na základě mikrotermometrických údajů rozlišujeme tři hlavní generace křemene: Q1 - nejstarší křemen tvořící hlavní podíl žiloviny; Q2 - xenomorfní zrna narůstající na Q1, které lze dále dělit na subgeneraci Q2a (tmavá jádra zrn tvořena velkým množstvím primárnich inkluzí) a na něm narůstající Q2b (čirá zrna krystalizující do dutin); Q3 - nejmladší křemen narůstající na Q2b, charakteristický odlišnou interní texturou. Křemen 1. generace (Q1) precipitoval z H2O-CO2 fluid o nízké salinitě (cca 5 hm. % NaCl ekv.) s nízkou příměsí (~ 5 mol. %) ostatních plynů (CH4-N2). Odhadované podmínky vzniku křemene Q1 se pohybují za teplot > 350 řC, za tlaků ~ 400-500 MPa, což odpovídá hloubce zhruba 15 km za předpokladu litostatického tlaku. Vznik křemene 2. a 3. generace je spojen s fluidy H2O typu. Q2 vznikal z roztoků o nízké salinitě (< 5,9 hm. % NaCl ekv.) za teplot 250 až 320 řC a tlaků 60 až 120 MPa (interpretováno jako hydrostatický tlak, hloubka 3 až 5 km). Mladší subgenerace Q2b obsahuje četné traily inkluzí asociace varu a variabilní salinitou 1,2 až 7 hm. % NaCl ekv. Q3 precipitoval z nízce salinních roztoků (0,9 až 1,2 hm. %...
|
|
| |
|
|
Interakce proteinů s inhibitory: kvantověchemická studie
Dobeš, Petr ; Hobza, Pavel (vedoucí práce) ; Vondrášek, Jiří (oponent) ; Jurečka, Petr (oponent)
Předložená disertační práce se zabývá teoretickým studiem interakcí mezi proteinkinázami a jejich inhibitory. Studované proteinkinázy, cyklin-dependentní kináza 2 (CDK2) a kináza CK2 (angl. casein kinase 2) hrají důležitou roli v regulaci buněčných procesů u eukaryotických organismů. Jejich nesprávná funkce v buňce může u člověka vést k závažným onemocněním. Tento proces je možné zvrátit vyřazením aberantních proteinkináz pomocí specifických nízkomolekulárních inhibitorů. Inhibitory proteinkináz se typicky vážou do aktivního místa enzymu pomocí nekovalentních interakcí. Teoretický popis těchto interakcí pomocí kvantověchemických a molekulárně mechanických metod může pomoci při pochopení biofyzikálních principů řídících vazbu. Ty pak mohou být následně využity při racionálním návrhu účinnějších či specifičtějších inhibitorů. Stabilizační energie komplexu CDK2 s inhibitorem roskovitinem je převáženě tvořena disperzní energií. Metoda DFT, která nezahrnuje disperzní energii, je tak pro popis uvedeného komplexu zcela nevhodná. V případě zahrnutí disperze pomocí empirického členu dojde ke správnému popisu této interakce a metodu SCC-DFTB-D lze naopak doporučit pro uvedený komplex. Dominantní část celkové interakce je tvořena omezeným počtem aminokyselin, které přispívají k vazbě roskovitinu s CDK2 a jejich mutace...
|
|
|
Základy aplikace fluidních inkluzí při studiu hydrotermálních mineralizací
Štrba, Martin ; Zachariáš, Jiří (vedoucí práce) ; Dobeš, Petr (oponent)
Práce je rozdělena na dvě rešeršní a jednu experimentální část. První část se zaměřuje na petrografii a mikrotermometrické studium fluidních inkluzí. V kapitole věnované petrografii jsou uvedeny mechanismy, které určují genetický typ, tvar a stupeň zaplnění inkluzí. Důraz je kladen především na mikrotermometrické studium inkluzí. Podrobně jsou popsány fázové změny v systémech H2O - NaCl a H2O - CO2 - soli za nízkých a vysokých teplot. Samostatná kapitola je věnována interpretaci mikrotermometrických dat a jejich použití při určování teplotně-tlakových podmínek vzniku minerálu. Ve druhé části práce jsou uvedeny příklady využití fluidních inkluzí při studiu hydrotermálních mineralizací. Krátce je zde zmíněna aplikace mikrotermometrických dat při prospekci rudních ložisek (Pb - Zn - fluoritová ložiska Mississippi valley, porfyrické Cu - rudy Bingham). Větší prostor je v této části věnován ložiskům Bleïda (Maroko), Kanmantoo (Austrálie) a San Cristobal vein (Peru), u kterých je popsána geologie, mineralogie a výsledky měření fluidních inkluzí. Poslední kapitola se zabývá hydrotermální mineralizací v lomu Ševětín. Je zde uvedena regionálně-geologická pozice ševětínského masívu, dále geologie lomu a přehled mineralizací vázaných na hydrotermální žíly. Pro studium fluidních inkluzí byly vybrány dva...
|
|
|
Využití neanotovaných dat pro trénování OCR
Buchal, Petr ; Dobeš, Petr (oponent) ; Hradiš, Michal (vedoucí práce)
Vytvoření kvalitního systému rozpoznání textu (OCR) vyžaduje velké množství anotovaných dat. Získání, potažmo vytvoření anotací je nákladný proces. Tato práce se zabývá několika způsoby efektivního využití neanotovaných dat pro trénování OCR neuronové sítě. Navržené metody využívající neanotovaná data spadají do kategorie self-training algoritmů. Obecný postup navržených metod se dá sumarizovat tak, že nejprve je na omezeném množství anotovaných dat natrénován počáteční model neuronové sítě. Ten je následně spolu s jazykovým modelem použit k vygenerování pseudo-štítků neanotovaných dat. Takto strojově anotovaná data jsou zkombinována s trénovacími daty, která byla použita k vytvoření počátečního modelu a následně jsou využita k natrénování cílového modelu. Úspěšnost jednotlivých metod je měřena na ručně psaném ICFHR 2014 Bentham datasetu. Experimenty byly provedeny na dvou datových sadách, které reprezentují různou míru dostupnosti anotovaných dat. Nejlepší model trénovaný na malé datové sadě dosahuje 3.70 CER [%], což je relativní zlepšení o 42 % oproti počátečnímu modelu trénovanému pouze na anotovaných datech a nejlepší model trénovaný na velké datové sadě dosahuje 1.90 CER [%], což je relativní zlepšení o 26 % oproti počátečnímu modelu. Za pomocí navržených metod lze efektivně zvýšit úspěšnost OCR s využitím neanotovaných dat.
|
|
|
Anticurtaining - obrazový filtr pro elektronovou mikroskopii
Dvořák, Martin ; Dobeš, Petr (oponent) ; Zemčík, Pavel (vedoucí práce)
Tomografická 3D analýza v nanometrovém měřítku využívá snímky vzorků získané s využitím fokusovaného iontového svazku (FIB), při jejichž snímání ale dochází z fyzikálních důvodů k poškození "curtaining" efektem. Tato práce představuje nový přistup k odstranění curtaining efektu ze snímků pomocí strojového učení. Pro jeho odstranění je využita konvoluční neuronová síť (CNN) a technika učení s učitelem. Navržená síť pracuje s příznaky, které vytváří vlnková (wavelet) transformace a jejím výstupem je vizuálně "vyčištěný" snímek. K učení sítě je využita syntetická datová sada poškozených snímků, které jsou vytvořeny generátorem simulujícím fyzikální proces tvorby reálného snímku. Simulace se skládá z "opotřebení" vzorku pomocí fokusovaného iontového svazku (FIB) a zobrazení povrchu pomocí skenovacího elektronového mikroskopu (SEM). Nově vytvořený přístup velmi dobře pracuje i s reálně pořízenými snímky. Kvalitativní vyhodnocení představeného řešení a srovnání s jiným řešením hodnotili laici i experti na tuto problematiku. Řešení představuje nový nadějný přístup k odstranění curtaining efektu a přispívá k lepšímu postupu zpracování i porozumění snímkům pořízeným při materiálové analýze.
|
|
|
Monitorování využití ultralehkých letadel
Kudera, Matěj ; Dobeš, Petr (oponent) ; Zemčík, Pavel (vedoucí práce)
Cílem této bakalářské práce bylo vytvořit systém, který bude zaznamenávat provoz ultralehkého letounu, do kterého bude nainstalován. V práci jsou rozebrány principy potřebné pro návrh tohoto systému a je vytvořen podrobný návrh, který je postaven na získaných znalostech o jednotlivých principech. Vytvořený systém se skládá ze dvou částí. Vestavěného zařízení, které je zabudováno do ultralehkého letounu a zaznamenává, zda je v pohybu a mobilní aplikace, která umožňuje jednoduchý přístup k záznamům pořízených vestavěným zařízením. Mobilní aplikace byla zhotovena pro operační systém Android za pomoci vývojového prostředí Android Studio a vestavěné zařízení bylo implementováno pomocí minipočítače Raspberry Pi, ke kterému byly připojeny potřebné periferie. Na závěr byla otestována funkčnost systému pomocí vytvořených testů a byly provedeny testovací lety ultralehkého letounu se zabudovaným vestavěným zařízením.
|
|
|
Hluboké neuronové sítě pro posilované učení
Košák, Václav ; Dobeš, Petr (oponent) ; Hradiš, Michal (vedoucí práce)
Práce popisuje trénovací prostředí pro trénování postavičky chodící po dvou končetinách. Prostředí je implementováno v AI Gym pomocí fyzikálního modelu PyBullet. Úlohy z prostředí jsou řešené pomocí posilovaného učení algoritmem ActorCritic. Každá z úloh je zaměřená na základní pohyby postavičky. Práce ukazuje, pomocí jakých funkcí odměn je algoritmus schopen dospět k řešení úloh.
|
|
| |
|
|
Získání dat z hlubokých horizontů dolu Rožná - závěrečná zpráva
Bukovská, Z. ; Švagera, O. ; Chabr, T. ; Leichmann, J. ; Sosna, K. ; Souček, Kamil ; Vavro, Martin ; Zuna, M. ; Navrátil, P. ; Bohdálek, P. ; Bošková, M. ; Dobeš, P. ; Filipský, D. ; Franěk, J. ; Galeková, E. ; Georgiovská, Lucie ; Hanák, J. ; Havlová, V. ; Hlisnikovský, K. ; Holéczy, D. ; Jankovský, F. ; Jaroš, M. ; Jelínek, J. ; Knésl, I. ; Koucká, L. ; Kryl, J. ; Kříbek, B. ; Kubeš, M. ; Kubina, Lukáš ; Kučera, R. ; Kukutsch, Radovan ; Laufek, F. ; Mixa, P. ; Mozola, J. ; Násir, M. M. ; Palát, J. ; Patočka, M. ; Pořádek, P. ; Rosendorf, T. ; Soejono, I. ; Staš, Lubomír ; Vavro, Leona ; Veselovský, F. ; Vorel, J. ; Waclawik, Petr ; Wertich, V. ; Zajícová, Vendula ; Zelinková, T.
Závěrečná zpráva projektu „Získání dat z hlubokých horizontů dolu Rožná“ prezentuje výsledky studia vlastností horninového masivu s ohledem na přítomnost významné tektonické zóny. Studium se zaměřilo na změnu vlastností v okolí tzv. první zóny ložiska Rožná, ale také na změnu těchto vlastností s hloubkou na úrovni 12.–24. patra bývalého dolu, resp. cca 550-1200 m pod povrchem. Relaizované práce zahrnuly geologický, petrografický, geochemický popis horninového prostředí, geofyzikální práce (zejm. seismika), studium fyzikálně mechanických vlastností hornin, transportní experimenty a ložiskovou revalidaci ložiska Rožná. Veškeré práce byly provedeny pro účely popsání studované zóny a jejího projevu s důrazem na prokázání bezpečnosti potenciálního umístění hlubinného úložiště.
|
host ::
RSS.