|
|
Půdní mikromycety - potenciální zdroj N.sub.2./sub.O v půdách
Jirout, Jiří ; Šimek, Miloslav ; Elhottová, Dana
Cílem příspěvku je shrnout vědomosti o produkci N.sub.2./sub.O půdními mikromycety. Denitrifikace se předpokládala pouze u prokaryot, ale byly nalezeny důkazy produkce oxidů dusíku a N.sub.2./sub. i u hub. N.sub.2./sub.O houbového původu vzniká redukcí dusičnanů/dusitanů za anaerobních podmínek. Jelikož u hub byla nalezena schopnost používat denitrifikaci zároveň s respirací kyslíku, produkce N.sub.2./sub.O půdními houbami se dá předpokládat u širokého okruhu půd. Pro houby specifická nitrát/nitrit reduktáza (cytochrom P-450nor) byla objevena u druhu .i.Fusarium oxysporum./i.. Schopnost produkce N.sub.2./sub.O byla nalezena u dalších rodů mikromycetů (.i.Humicola, Cylindrocarpon, Trichoderma./i., atd.). Mnoho druhů mikromycetů nemá schopnost další redukce N.sub.2./sub.O na N.sub.2./sub.; u některých mikromycetů byla naopak popsána produkce N.sub.2./sub. pomocí tzv. kodenitrifikace.
|
|
|
Sbírka kultur půdních aktinomycetů v Ústavu půdní biologie BC AV ČR, v.v.i. České Budějovice
Krištůfek, Václav ; Chroňáková, Alica ; Elhottová, Dana ; Petrásek, Jiří ; Němec, Jan
Sbírka kultur aktinomycetů v Č. Budějovicích (CCACB) byla založena v roce 2006 a slouží jako úschovna kultur půdních aktinomycetů. Kultury mohou být použity pro výzkum, průmyslovou aplikaci, vzdělávání a další vědecké zájmy. Kultury jsou uchovávány hlavně jako glycerolové nebo lyofylizované konzervy. CCACB bude nabízet kmeny aktinomycetů, hlavně streptomycetů (více než 900 kultur) v Katalogu kultur www.upb.cas.cz, www.actinomycetes.cz.
|
|
|
Detekce mikroorganismů v půdě metodou CARD-FISH (Catalyzed Reporter Deposition - Fluorescence in situ Hybridization)
Krištůfek, Václav ; Kasalický, Vojtěch ; Chroňáková, Alica ; Elhottová, Dana ; Němec, Jan
Pro detekci půdních mikroorganismů byla na pracovišti Ústavu půdní biologie zavedena metoda CARD-FISH (Catalyzed Reporter Deposition - Fluorescence in situ Hybridization). CARD-FISH je relativně nová molekulární metoda pro zjištění podílu jednotlivých skupin mikroorganismů pomocí oligonukleotidových sond. Oproti klasické metodě FISH využívá enzymatické aktivity k zesílení signálu a tím umožňuje výrazně kvalitnější detekci mikroorganismů v půdě nebo organických substrátech. Metodou bylo poprvé sledováno složení bakteriálního společenstva datované vrstvy kupy netopýřího guána z jeskyně Domica (NP Slovenský kras). Bylo stanoveno procentické zastoupení těchto skupin mikroorganismů: bakterie (většina bakterií, .i.Planktomycetales, Verrucomicrobiales./i.), archaea, actinobacteria, proteobacteria, .i.Cytophaga-Flavobacter./i.-Bacteroidetes, sfingobacteria.
|
|
|
Změny mikrobiálního společenstva způsobené pasáží trávicím traktem žížal
Němcová, Anna ; Pižl, Václav ; Elhottová, Dana
Selektivní vliv podmínek trávicího traktu žížal se podílí na redukci nebo stimulaci různých mikrobiálních skupin. Pasáž půdy zažívacím traktem žížaly obecně podporuje zvýšení celkové aktivní mikrobiální biomasy. Počet kultivovatelných bakterií přítomných ve střevě žížaly průkazně nevzrůstá ve srovnání s okolním půdním prostředím, ale dochází ke změnám v druhové bohatosti. Obvykle se během pasáže částečně mění také zastoupení mikrobiálních skupin. Pasáž trávicím traktem a exkrece do půdy může dlouhodobě ovlivnit i funkci významných mikrobiálních skupin. Cílem příspěvku je shrnout přehled kvantitativních a kvalitativních charakteristik doprovodné mikroflóry těchto významných zástupců půdní makrofauny.
|
|
|
Kultivace bakterií z netopýřího guána
Petrásek, Jiří ; Elhottová, Dana ; Krištůfek, Václav ; Kováč, L.
Netopýří guano představuje důležitý zdroj organických látek v oligotrofních jeskyních. Vysoký obsah chitinu, který pochází z nestrávených zbytků těl hmyzu v potravě netopýrů, způsobuje, že se guano rozkládá velmi pomalu. V průběhu času se v blízkosti netopýřích kolonií vytváří kopy guana staré i několik stovek let. Netopýří guano tak představuje unikátní prostředí, ve kterém panují specifické podmínky a tomu odpovídá také složení bakteriálního společenstva. V rámci této studie byla plotnovou metodou pomocí šesti kultivačních médií sledována bakteriální společenstva guana z jeskyně Domica a z Ardovské jeskyně (NP Slovenský kras). Celkové počty kultivovatelných aerobních bakterií v guanu byly hodnoceny pomocí růstu na zpevněném komplexním médiu TSBA (Becton & Dickinson). Celkové počty kultivovatelných anaerobních bakterií byly sledovány pomocí DifcoTM Anaerobic Agar (Becton & Dickinson) a krevního agarového média (Shadler + 5% beranní krev, Oxoid).
|
|
|
GPC půdních huminových kyselin a fulvokyselin z Trojmezí
Šestauberová, Martina ; Novák, František
U vzorků huminových kyselin (HK) a fulvokyselin (FK), izolovaných z jednotlivých půdních horizontů podzolové půdy smrkového lesa na Trojmezí (Šumava, 48°46´25¨ sev. š., 13°51´04¨ vých. d.), byla pomocí gelové chromatografie stanovena molekulová hmotnost M.sub.r./sub. a průměrná molekulová hmotnost M.sub.w./sub.. Pro vysokomolekulární frakci HK bylo zjištěno rozmezí molekulových hmotností 380 – 569 kDa, pro hlavní frakci HK 6,7 – 31,4 kDa, u FK se hodnoty pohybovaly mezi 1,8 – 3,3 kDa. Z výsledků byl patrný klesající trend M.sub.r./sub. s rostoucí hloubkou, rovněž podíl vysokomolekulární frakce HK se směrem dolů snižoval. HK izolovaná z horizontu B.sub.h./sub. neobsahovala vysokomolekulární frakci a její molekulová hmotnost se blížila hodnotám stanoveným u fulvokyselin.
|
|
| |
|
| |
|
|
The impact of ungulates on epigeic assemblages of centipedes (Chilopoda) in the Křivoklátsko Protected Landscape Area - preliminary results
Aurová, Klára
The Křivoklátsko Protected Landscape Area and Biosphere Reserve (Czech Republic) represents a unique region covered in a high portion by forest ecosystems. Densities of ungulates in the forests are unusually high. Their impact on ecosystem is important, especially due to the removal and consumption of herbage, trampling of soil and vegetation, and the return of excreta. The aim of field study was to elucidate the impact of ungulates on soil invertebrates represented by centipedes. In this paper the first data about possible impact of ungulates on epigeic assemblage of centipedes are presented. In total, 9 centipede species were recorded. The species .i.Lithobius mutabilis./i. was dominant during the whole observation in all monitored plots. At the beginning of the experiment in 1994, this centipede outweighed other species with 91 %. After 12 years in 2006 the amount of other species arose almost up to 1/4 outside and more than 1/3 inside the fenced plots.
|
|
|
Seasonal development and vertical distribution of soil rotifer populations in South-Bohemian beech forest
Devetter, Miloslav
The soil rotifer community in a climax beech forest in South Bohemia was investigated during 2005 focusing on seasonal and vertical distribution changes. Samples 10 cm.sup.2./sup. large and 10 cm in depth were divided into 5 layers, which were processed separately. Altogether 31 rotifer species were determined during the investigation, of these 9 species were monogononts, while the rest were bdelloids. The most important species were .i.Encentrum arvicola, Wierzejskiella vagneri./i. among the monogononts and .i.Adineta steineri, Ceratotrocha cornigera, Habrotrocha filum, H. ligula, Macrotrachela plicata, Mniobia tentans, M. incrassata, M. granulosa./i. among the bdelloids. Mean Shannon diversity index varied from 1.99 to 2.63. Total rotifer abundance varied from 212 (± 63) to 513 (± 127) 10.sup.3./sup. ind. m.sup.-2./sup. year-round, with the highest numbers found in May, while the lowest were in July.
|
host ::
RSS.