|
Změny v expresi genů B buněčné linie Ramos RA-1 po infekci Francisella tularensis
Matyášová, Simona ; Konečná, Klára (vedoucí práce) ; Kubelková, Klára (oponent)
Francisella tularensis je fakultativně intracelulární bakterie způsobující onemocnění tularemii různých druhů savců včetně člověka. Je schopná infikovat fagocytující i nefagocytující buňky. V naší práci jsme se zaměřili na studium B buněk, jejichž úloha v infekci F. tularensis byla dlouhou dobu opomíjena. Za posledních 10 let však byly publikovány práce, které poukazují na zapojení B buněk v časné imunitě proti F. tularensis. Cílem této diplomové práce bylo zjistit, jak se mění exprese genů kódujících molekuly cytokinů u B buněk vlivem infekce F. tularensis a vlivem stimulace bakteriálním rekombinantním proteinem IglC a lipopolysacharidem. Tyto změny jsme zkoumali na B buněčné linii Ramos RA-1. Metodou reverzní transkriptázové polymerázové řetězové reakce jsme detekovali geny pro cytokiny IFN-γ, IL-10 a TGF-β. Klíčová slova: Francisella tularensis, B buňky, cytokiny, reverzní transkriptázová polymerázová řetězová reakce
|
|
Chronická obstrukční plicní nemoc a její léčba
Vrátná, Sandra ; Vopršalová, Marie (vedoucí práce) ; Žáčková, Pavla (oponent)
1 ABSTRAKT Cílem mé diplomové práce bylo zobrazit CHOPN jako komplexní samostatnou nosologickou jednotku. Podstatná část se zaměřuje na aktuální terapii, kde jsou zmíněny jednotlivé skupiny jak úlevových, tak stabilizačních léčiv včetně jejich mechanismu účinku. V nefarmakologické léčbě hraje hlavní roli edukace a prevence kouření, ale třeba také rehabilitace, které u nás nejsou dosud příliš běžné, ale přesto mohou pacientovi výrazně přispět k zlepšení jeho zdravotního stavu. Součástí práce je rovněž názorné srovnání nemoci s bronchiálním astmatem z důvodu velké podobnosti těchto chorob, jejich možné záměny a množství překryvných syndromů, které mohou ztížit případnou diagnózu onemocnění. Samostatná kapitola je věnována novinkám v léčbě, které směřují k novým možnostem v kombinaci léčiv, k imunoterapii, ale třeba také k dlouhodobě působícím lékům, které podporují compliance pacienta a snaží se tak zvýšit jeho komfort při terapii. Vzhledem k tomu, že většina léků se aplikuje inhalačně, naznačila jsem ve své práci také problematiku inhalačních systémů, jejich dělení a dostupné pomůcky, které nabízí český trh.
|
|
Frekvence multiplicitních nádorů hlavy a krku na pracovišti ORL kliniky FNKV od roku 1984 do roku 2009
Cimalová, Lenka ; Čoček, Aleš (vedoucí práce)
Celosvětově stoupá výskyt zhoubných novotvarů hlavy a krku, proto stoupá i výskyt následných novotvarů v této oblasti. Diagnostika může být mnohdy nesnadná. Většina příznaků bývá pacienty bagatelizována, proto je velká část těchto onemocnění diagnostikována až v pozdním stádiu. Společným rysem nádorů ORL oblasti je jejich histologická skladba (90-95% tvoří dlaždicobuněčné karcinomy s různým stupněm diferenciace) a tendence k lokálnímu šíření s časným vznikem lokoregionálních metastáz. Nejvíce ohroženou skupinou jsou muži nad 45 let věku, především kuřáci cigaret a konzumenti alkoholu - hlavně lihovin. Mezi další rizikové faktory patří infekce HPV a HSV viry, profesní znečištění, špatná výživa, nedostatečná ústní hygiena a nevhodné zubní náhrady a podobně. Role prevence se zdá být v případě nádorů hlavy a krku zásadní. Podle American Cancer Society je až 85 - 90% malignit hlavy a krku způsobeno tabákovými produkty. Mimo jiné proto se boj proti kouření stal celosvětově jedním z hlavních preventivních programů. Klíčovou roli v léčbě těchto nádorů zaujímá chirurgická léčba a radioterapie, zatímco chemoterapie má omezený účinek. Budoucnost terapie představuje pravděpodobně biologická léčba. Za multiciplitní (vícečetné) nádory se považují následné primární novotvary. Vývoj následného primárního nádoru má...
|
|
Podjednotka delta bakteriální RNA polymerázy a její role v regulaci genové exprese u Bacillus subtilis
Dvořáček, Lukáš ; Krásný, Libor (vedoucí práce) ; Vopálenský, Václav (oponent)
Podjednotka delta bakteriální RNA polymerázy a její role v regulaci genové exprese u Bacillus subtilis. V této práci se zabývám regulací genové exprese u eubakterií. V první cásti shrnuji soucasné poznatky o klícové fázi genové exprese - transkripci, blíže se pak zameruji na regulaci iniciace transkripce pomocí malých efektorových molekul (guanosin tetrafosfát, iniciacní nukleosid trifosfát) u genu pro ribozomální RNA. Ve druhé, experimentální cásti této práce se zabývám rolí relativne málo studované podjednotky RNA polymerázy z gram pozitivních bakterií - proteinu _ - pri iniciaci transkripce a jejího vlivu na regulaci RNA polymerázy pomocí koncentrace iniciacního nukleosid trifosfátu.
|
|
Význam prolaktinu jako periferního cytokinu u dysbalance imunitního systému
Janatová, Kateřina ; Černá, Marie (vedoucí práce) ; Holáň, Vladimír (oponent)
Úvod: Interakce mezi neuroendokrinním a imunitním systémem hrají klíčovou roli v udržení homeostáze organismu. Tato komunikace je zprostředkována cytokiny, neurotransmitery a hormony a působí endokrinní, parakrinní a autokrinní cestou. Prolaktin (PRL), adenohypofyzární hormon, je produkován i řadou jiných tkání a také buňkami imunitního systému. Na periferii PRL působí jako cytokin. Sepse je zánětlivá odpověď organismu na těžkou infekci, zprostředkovaná Th1 imunitní odpovědí na jejíž aktivaci by se mohl podílet i PRL. Toll-like receptory (TLR) jsou klíčové pro rozpoznání bakteriálních komponent a zprostředkovávají systémovou odpověď (se sekrecí PRL) během infekce. Předpokládá se, že aktivace imunitního systému vede ke zvýšení genové exprese TLR2, TLR4 a PRL v monocytech. Zaměřili jsme se tedy na detekci hladin mRNA PRL, TLR2 a TLR4 v monocytech pacientů s celkovým zánětem. Sledovali jsme i vliv jednonukleotidového polymorfismu (SNP -1149 G/T)) v promotoru genu pro PRL, kde se v případě alely G předpokládá vliv na zvýšení exprese PRL. Materiál a Metody: Do pilotní studie bylo zahrnuto 30 pacientů s těžkou infekční epizodou. Pacientům byly krevní vzorky odebrány celkem třikrát, a to v určitých časových intervalech. V kontrolní skupině bylo 40 zdravých jedinců. Od nich bylo odebráno po jednom krevním...
|
|
Domain conformations of the motor subunit of EcoR124I involved in ATPase activity and dsDNA translocation
BIALEVICH, Vitali
Bacterial type I restriction-modification systems are composed of three different subunits: one HsdS subunit is required for identification of target sequence and anchoring the enzyme complex on DNA; two HsdM subunits in the methyl-transferase complex serve for host genome modification accomplishing a protective function against self-degradation; two HsdR (or motor) subunits house ATP-dependent translocation and consequent cleavage of double stranded DNA activities. The crystal structure of the 120 kDa HsdR subunit of the Type I restriction-modification system EcoR124I in complex with ATP was recently reported. HsdR is organized into four approximately globular structural domains in a nearly square-planar arrangement: the N-terminal endonuclease domain, the RecA-like helicase domains 1 and 2 and the C-terminal helical domain. The near-planar arrangement of globular domains creates prominent grooves between each domain pair. The two helicase-like domains form a canonical helicase cleft in which double-stranded B-form DNA can be accommodated without steric clash. The helical domain, probably involved in complex assembly, exhibits only a few specific interactions with helicase 2 domain. Molecular mechanism of dsDNA translocation, cleavage and ATP hydrolysis has not been yet structurally investigated. Here we propose a translocation cycle of the restriction-modification system EcoR124I based on analysis of available crystal structures of superfamily 2 helicases, strutural modeling and complementary biochemical characterization of mutations introduced in sites potentially inportant for translocation in the HsdR motor subunit. Also a role of the extended region of the helicase motif III in ATPase activity of EcoR124I was probed.
|
|
Molekulární markery ovlivňující přežití transplantované ledviny a progresi glomerulopatií
Brabcová, Irena ; Viklický, Ondřej (vedoucí práce) ; Jirsa, Milan (oponent) ; Rychlík, Ivan (oponent)
Na progresi chronických glomerulopatií, i na odhojování transplantované ledviny má vliv řada prozánětlivých cytokinů, jejichž role v patogenezi poškození není dosud detailně popsána. Cílem této disertační práce bylo identifikovat spolehlivé markery rizika progrese renální dysfunkce a přispět tak k efektivnější léčbě pacienta. Analyzovány byly vzorky biopsií nativních ledvin s histologicky potvrzenou glomerulopatií a biopsií ledvinných štěpů. Intrarenální genové exprese byly měřeny metodou RT- qPCR, jednonukleotidové polymorfizmy detekovány metodami založenými na PCR-RFLP. Pro hodnocení mononukleárního infiltrátu bylo využito imunohistochemické barvení. Na naměřených datech byla provedena statistická analýza. V době diagnózy IgA nefropatie byla zjištěna korelace genových transkriptů TGF-β1, HGF, BMP7, MCP-1 a RANTES a mononukleárního infiltrátu se sníženou renální funkcí a proteinurií. Ve dvouletém sledování závisela progrese IgAN na tíži chronické vaskulopatie a na míře exprese genu pro TGF-1. Pacienti po transplantaci ledviny s dysfunkcí štěpu a zvýšenou intrarenální expresí genu pro TGF-1 a MCP-1 měli zkrácenou dobu přežívání transplantované ledviny. V době biopsie měli pacienti s dysfunkcí štěpu upregulovány také mRNA genů pro IL- 10, TGF-1, IL-6, MCP-1, RANTES a TNF-. Míra tubulitidy ve...
|
|
Molecular Pathology of Rett Syndrome
Záhoráková, Daniela ; Martásek, Pavel (vedoucí práce) ; Kubala Havrdová, Eva (oponent) ; Mazura, Ivan (oponent)
Rettův syndrom (RTT) je vážné X-vázané neurologické onemocnění, postihující především dívky. Patří mezi poruchy autistického spektra a je charakterizován především regresem psychomotorického vývoje, ztrátou řeči, mikrocefalií, stereotypními pohyby rukou a záchvaty. Většina případů RTT je způsobena de novo mutacemi v genu pro metyl-CpG-vazebný protein 2 (MECP2) a jen velmi ojediněle se jedná o familiární výskyt. Produkt tohoto genu, MeCP2 protein, sehrává důležitou roli v chromatinové remodelaci, regulaci genové exprese a také se účastní modulace RNA sestřihu. Některé případy atypického RTT mohou být způsobeny mutacemi v dalších genech, např. CDKL5, FOXG1 nebo NTNG1. Tento přehledový článek uvádí souhrn současných poznatků o Rettovu syndromu, klinickém obrazu pacientů v jednotlivých stádiích, molekulární podstatě, diagnostických kritériích, terapeutických přístupech a o možnostech DNA diagnostiky.
|
|
Polyhydroxyalkanoáty a jejich role ve struktuře bakteriálního biofilmu
Rucká, Markéta ; Samek,, Ota (oponent) ; Obruča, Stanislav (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá polyhydroxyalkanoáty (PHA) a jejich rolí ve struktuře bakteriálního biofilmu. V teoretické části byla vypracována literární rešerše zabývající se polyhydroxyalkanoáty, bakteriálním biofilmem a jejich vzájemným vztahem. Práce byla zaměřena na rozdíly v produkcí PHA planktonickými a biofilmovými buňkami. Za účelem studie byly použity bakteriální kmeny Burkholderia cepacia a Burkholderia sacchari, které byly kultivovány s využitím CDC biofilmového reaktoru. Pozornost byla věnována kvantitě a zejména formě, v jaké se PHA vyskytují v planktonických a biofilmových buňkách. Výsledky Ramanovy spektroskopie ukázaly, že PHA se v planktonických bakteriálních buňkách vyskytuje výhradně v nativní amorfní formě. Naproti tomu v biofilmu PHA existuje také v částečně krystalické formě. Dále byla testována jednak odolnost planktonických a biofilmových buněk vůči působení různých stresových faktorů, a jednak vliv osmotického stresu na produkci PHA. Na základě výsledků experimentu, kdy byly bakterie vystaveny různým stresovým faktorům (vysoká teplota, nízká teplota, přítomnost detergentu a další), bylo zjištěno, že biofilmové buňky vykazují vyšší stresovou odolnost než buňky planktonické. Vystavení buněk zvýšenému osmotickému tlaku vedlo jednak ke zpomalení buněčného růstu a rozmnožování, ale také k poklesu produkce PHA. Planktonické buňky navíc reagovaly na vnější stimuly značně citlivěji než buňky biofilmové.
|
|
Problematika funkčního plochonoží
Michalec, Radim ; Dudová, Agnieszka (vedoucí práce) ; Véle, František (oponent)
SOUHRN Název: Problematika funkčního plochonoží Cíle práce: Tato diplomová práce se zabývá problematikou tzv. funkčního plochonoží. Hlavním cílem je popsat souvislost mezi změnou struktury, poruchou funkce nohy a vznikem plochonoží. Práce se snaží popsat chování nohy a klenby v rámci stoje a chůze. Dalším cílem je pak shrnout možnosti diagnostiky plochonoží. Metoda: Diplomová práce má deskriptivně-analytický charakter. Je zpracována formou literární rešerše. Výsledky: Práce ukazuje problém nejednotnosti nomenklatury, týkající se problému ploché nohy. Konkrétně se to týká výkladu slova funkční plochonoží, pohybových komponent v oblasti nohy a laboratorních diagnostických metod. Je zde nabídnuto vysvětlení pojmu funkčně plochá noha. Dále práce naznačila, že získaná plochá noha je otázkou funkční poruchy, která může progredovat do změn strukturálních. V rámci statické a dynamické zátěže byly potvrzeny role drobných svalů nohy v úloze dynamické stabilizace a vliv rotace femuru na postavení klenby. Byly shrnuty metody používané k diagnostice plochonoží včetně metod dynamické plantografie. Klíčová slova: plochá noha, klenba nohy, kineziologie, diagnostika
|
host ::
