|
Vývoj kulturní krajiny v západní části Českého středohoří
Kyselka, Jan ; Lipský, Zdeněk (vedoucí práce) ; Skaloš, Jan (oponent)
Hlavním cílem diplomové práce je hodnocení změn ve využití krajiny v západní části Českého středohoří od poloviny 19. století do současnosti. Hodnoceny byly změny v zastoupení jednotlivých kategorií využití krajiny, vývoj ekologické stability krajiny, vývoj diverzity využití krajiny a také vliv fyzickogeografických podmínek na změny ve využití krajiny. Velká pozornost byla věnována opuštěné zemědělské půdě. V zájmovém území byly zmapovány všechny opuštěné plochy a následně byla hodnocena závislost výskytu opuštěné půdy na fyzickogeografických podmínkách. Klíčová slova: vývoj krajiny, využití krajiny, opuštěná půda, staré mapy, České středohoří
|
|
Genetická diverzita losa evropského v ČR
Veselý, Jan
Diplomová práce se zabývá genetickou variabilitou losa evropského (Alces alces) žijícího ve volné přírodě a chovaného v zoologických zahradách v České republice, dále se zabývá škodami vzniklými na losí zvěři při střetech s dopravními prostředky. Hlavním cílem bylo zmapovat genetickou variabilitu obou studovaných souborů, odhadnout četnost volně žijící populace a vyhodnotit informace o jeho migraci v rámci ČR. Genetické parametry losa evropského (Alces alces) byly studovány pomocí mikrosatelitních markerů OarFCB5, T156, BM888, RT1, RT13, T26, RM188, BM1818, ETH225, Haut17. Z deseti studovaných mikrosatelitních lokusů nebyl u losů z LS Vyšší Brod (LV) polymorfismus zjištěn na dvou lokusech (BM888 a Haut17). U losů chovaných v zoologických zahradách (LZ) v ČR byl polymorfismus nalezen ve všech lokusech. Zjištěná průměrná heterozygotnost byla nejvyšší u souboru LZ (HE = 0,6801 a HO = 0,6833), oproti LV, kde dosahovala průměrná HE = 0,5162 a HO = 0,5571. Počet alel zjištěný v polymorfních lokusech se u volně žijící populace pohyboval od 2 do 3 a v uzavřených chovech zoologických zahrad od 5 do 8 alel. Na základě zjištěných výsledků genetických parametrů lze konstatovat, že u volně žijící české populace byl zjištěn vliv inbreedingu na jejích genetickou strukturu. Migrace byla vyhodnocována ze získaných informací ze záznamů o pohybu losí zvěře a z vlastního výzkumu. V současnosti nebyl prokázán významný negativní vliv nějaké migrační bariéry na genetickou variabilitu, přesto je však možné potvrdit problematičnost dálnice D1 při migraci losů. Během posledních pěti let bylo na základě vlastního šetření, dotazníků a zpráv z médií evidováno celkem 21 pozorování losí zvěře na našem území a dvou srážek s dopravními prostředky.
|
| |
|
Neurofibromatóza typu 1 a zárodečné mutace genu NF1 u českých pacientů
Bendová, Šárka ; Křepelová, Anna (vedoucí práce) ; Kleibl, Zdeněk (oponent) ; Kadlecová, Jitka (oponent)
Neurofibromatóza typu 1 (NF1, MIM 162200) je autozomálně dominantní onemocnění s incidencí 1:3000 živě narozených dětí, vyvolávající multisystémové postižení organismu a častý výskyt nádorů centrálního a periferního nervového systému 1. Rozvoj nádorů je u NF1 podmíněn inaktivací tumor supresorového genu NF1 zárodečnými mutacemi a následnou deregulací buněčné proliferace 2. Mutační analýza genu NF1 je ztížena několika pseudogeny, značnou velikostí genu, absencí mutačních hotspotů a širokým spektrem typů mutací. Z důvodu nejasné korelace genotypu s fenotypem je predikce průběhu onemocnění obtížná a doposud byly popsány pouze dvě mutace specificky ovlivňující fenotyp pacientů 3,4. Tato disertační práce je komentovaným souborem šesti publikací věnujících se společnému tématu NF1. Publikace 1 a 6 se věnují problematice mutační analýzy genu NF1 v populaci 67 českých pacientů s NF1. Jsou zde prezentovány genotypy a spektra kauzálních mutací doplněná o fenotyp pacientů a srovnání výtěžnosti vyšetřovacích metod. U probandů s nalezenou kauzální mutací byl vyšetřením rodinných příslušníků posouzen sporadický nebo familiární výskyt onemocnění. Tato analýza vedla k závěru, že před zavedením rutinních vyšetřovacích metod mohl být odhad počtu sporadických případů NF1 z důvodu přehlédnutí mírného fenotypu u příbuzných...
|
|
Occurrence and significance of fungi associating with mycotrophic plants
Kohout, Petr ; Vohník, Martin (vedoucí práce) ; Gryndler, Milan (oponent)
Mykorhizní symbióza představuje jednu z nejdůležitějších interakcí v rostlinné říši. Jedná se o mutualistickou interakci mezi kořeny rostlin a vláknitými houbami, kde mykobiont poskytuje rostlině minerální živiny a vodu, či ji chrání proti patogenům a na druhou stranu rostlina houbě poskytuje část svých asimilátů. Kromě hub mykorhizních hostí rostliny ve svém kořenovém systému i velmi početnou skupinu nemykorhizních hub neboli endofytů. I přes všudypřítomnost endofytických hub a jejich možný význam pro hostitelskou rostlinu jim nebyla doposud věnována dostatečná pozornost. Předkládaná magisterská práce je založena na třech článcích a klade si za cíl přispět k celkovému pochopení významu mykorhizních a nemykorhizních interakcí v ekofyziologii rostlin a fungování ekosystémů; a to zodpovězením otázek týkajících se dvou hlavních tématických okruhů: (i) potenciální význam a role ektomykorhizních hub a vřesovcovitých rostlin během invaze borovice vejmutovky a (ii) druhové složení mykorhizních a nemykorhizních hub asociovaných s kořeny ponořených vodních rostlin a vzácného druhu orchideje Pseudorchis albida. Pro stanovení diverzity a složení společenstev mykorhizních i nemykorhizních hub byly využity jak klasické metody kultivace symbiotických hub, tak moderní metody na kultivacích nezávislé. Na základě výsledků...
|
|
Development of HPLC method for assesment of stability of amorphous compounds
Číhalová, Daniela ; Solich, Petr (vedoucí práce) ; Sklenářová, Hana (oponent)
Univerzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra analytické chemie Kandidát: Daniela Číhalová Školitel: Prof. RNDr. Petr Solich, CSc., Prof. Seppo Auriola, MSc. Marko Lehtonen Název diplomové práce: Vývoj HPLC metody ke sledování stability amorfních látek Pevné materiály se nacházejí v mnoha různých formách, které se liší svými vlastnostmi. Ve své práci se zabývám především amorfními látkami, jejich vlastnostmi, významem, výskytem a charakterizací. Představuji a popisuji nejčastěji používané metody se zaměřením na jejich praktické využití k charakterizaci polymorfů a amorfních sloučenin. Během přípravy jsou amorfní látky prudce zahřívány a ochlazeny, což může vést k degradaci. Pro ověření stability byla vyvinuta a validována HPLC metoda pro stanovení poklesu koncentrace účinné látky v amorfním stavu u 8 sloučenin. Tyto sloučeniny (benzokain, chlorpropamid, clotrimazol, furosemid, piroxicam, kyselina salicylová, kyselina thisalicylová a tolbutamid) byly stanovovány odděleně. Pro separaci byla použita kolona se zpětnou fází (1,8µm, 50 × 4,6 mm) udržovaná při 40řC. Mobilní fáze byla složena z acetonitrilu a vody s obsahem 50mmol/l fosfátového pufru, pH 2,1. Průtok mobilní fáze byl 1,0 ml/min izokraticky. Byla použita UV detekce při 4 vlnových délkách. Validační parametry, jako...
|
|
Verb Valency Frames Disambiguation
Semecký, Jiří ; Hajič, Jan (vedoucí práce) ; Krbec, Pavel (oponent) ; Lopatková, Markéta (oponent)
Semantic analysis has become a bottleneck of many natural language applications. Machine translation, automatic question answering, dialog management, and others rely on high quality semantic analysis. Verbs are central elements of clauses with strong influence on the realization of whole sentences. Therefore the semantic analysis of verbs plays a key role in the analysis of natural language. We believe that solid disambiguation of verb senses can boost the performance of many real-life applications. In this thesis, we investigate the potential of statistical disambiguation of verb senses. Each verb occurrence can be described by diverse types of information. We investigate which information is worth considering when determining the sense of verbs. Different types of classification methods are tested with regard to the topic. In particular, we compared the Naive Bayes classifier, decision trees, rule-based method, maximum entropy, and support vector machines. The proposed methods are thoroughly evaluated on two different Czech corpora, VALEVAL and the Prague Dependency Treebank. Significant improvement over the baseline is observed.
|
|
Verb Valency Frames Disambiquation
Semecký, Jiří
Semantic analysis has become a bottleneck of many natural language applications. Machine translation, automatic question answering, dialog management, and others rely on high quality semantic analysis. Verbs are central elements of clauses with strong influence on the realization of whole sentences. Therefore the semantic analysis of verbs plays a key role in the analysis of natural language. We believe that solid disambiguation of verb senses can boost the performance of many real-life applications. In this thesis, we investigate the potential of statistical disambiguation of verb senses. Each verb occurrence can be described by diverse types of information. We investigate which information is worth considering when determining the sense of verbs. Different types of classification methods are tested with regard to the topic. In particular, we compared the Na¨ive Bayes classifier, decision trees, rule-based method, maximum entropy, and support vector machines. The proposed methods are thoroughly evaluated on two different Czech corpora, VALEVAL and the Prague Dependency Treebank. Significant improvement over the baseline is observed.
|
|
Ko-evoluční aspekty genetické diverzity: mléčná produkce a laktázová persistence
Priehodová, Edita ; Černý, Viktor (vedoucí práce) ; Brůžek, Jaroslav (oponent) ; Macholán, Miloš (oponent)
Laktázovou persistencí (LP) nazýváme geneticky podmíněnou schopnost trávit laktózu (mléčný cukr) v dospělosti. Laktóza je štěpena enzymem tenkého střeva - laktázou, jehož produkce u savců po odstavení ustává. V případě LP je laktáza produkována po celý život, čímž je umožněno bez obtíží přijímat větší množství čerstvého mléka. LP je doložena jen u některých lidských populací. Celosvětově je její rozšíření nerovnoměrné, nejčastější je v severní Evropě a u pastevců aridních oblastí Afriky a Arábie. LP souvisí se vznikem zemědělství před 10 000 lety a počátky mléčné produkce. V určitých populacích nacházíme signál silné pozitivní selekce pro LP, zřejmě podmíněnou různými faktory v závislosti na různých životních podmínkách. LP způsobují jednobodové polymorfismy nacházející se zhruba 14 kb upstream od laktázového genu. Dnes je známo pět různých pro-LP variant, které vznikly a rozšířily se zcela nezávisle. Jedním z možných center vzniku LP je Arabský poloostrov, kde se poprvé objevila a rozšířila pro-LP varianta -13915*G. V této práci bylo studováno rozšíření pro-LP mutací u populací jižní Arábie a afrických Arabů. U všech analyzovaných souborů byl potvrzen výskyt -13915*G. V jižní Arábii pak u většiny souborů ve frekvenci vyšší než 50 %. U afrických Arabů patřících k pastevcům velbloudů byl zaznamenán...
|
|
Studium genetické variability a diverzity u populací prasat plemene české bílé ušlechtilé
Černošková, Barbora
Cílem diplomové práce bylo provést genetickou analýzu populací plemene české bílé ušlechtilé a zhodnotit jejich genetickou variabilitu a diverzitu. V kandidátních genech prasat bylo analyzováno jedenáct jednonukleotidových polymorfismů (SNPs). Hodnoceno bylo celkem 139 jedinců ze dvou populací různých chovů. Polymorfismy byly genotypovány metodou PCR-RFLP v lokusech: : HMGCR, TCF7L2, MC4R, EDG4, HFABP, FTO, LEPR6, LEPR18, PDK4, PLINHin, PLINNIa. Populačně-genetická analýza byla provedena v programu POPGENE verze 1.31. Všechny sledované lokusy byly v populacích polymorfní. Byl uvažován výskyt vzácné alely T pro lokus EDG4 v populaci šlechtitelského chovu. Genetická diverzita populace užitkového chovu byla vyšší než diverzita chovu šlechtitelského. Všechny sledované populace byly v Hardy-Weinbergově rovnováze.
|
host ::
