|
Fluktuace v českých médiích a její příčiny
Ghanem, Jakub ; Trampota, Tomáš (vedoucí práce) ; Křeček, Jan (oponent)
Ústředním tématem magisterské diplomové práce je fluktuace zaměstnanců v tuzemských sdělovacích prostředcích. Pro zpracování bylo dominantně využito kvalitativního výzkumu, konkrétně individuálních polostrukturovaných interview s novináři. Rozhovory směřovaly k identifikaci jevů, které mediálním pracovníkům komplikují a znepříjemňují výkon povolání. Respondenti byli přímo i nepřímo dotazováni na motivace, které je vedly ke změně zaměstnání anebo mají tento potenciál. Brány na zřetel byly rovněž organizační prvky mediálních institucí, zejména kariérní řád a způsob plánování pracovních směn. Diplomová práce se zaobírá průvodními jevy působení v médiích, jako je nadměrné časové vytížení, stres, spěch, projevy konkurence, tlak ze strany zadavatelů reklamy a další. Všímá si dopadů, které mohou nevhodně vytvořené podmínky mít na svobodu vyjadřování a pravdivost publikovaných komunikátů. Rovněž zahrnuje náhled do ryze osobní roviny, mimo jiné na rodinný a partnerský život, popřípadě na možnost uspokojivě využívat volného času. Rozpoznané příčiny fluktuace byly na základě rozboru výsledků interview rozčleněny, popsány a dále kategorizovány. Zjištění byla v kritické kapitole objektivizována odpověďmi zástupce personální agentury a komentáři mediálního znalce.
|
|
Characterization of Mitochondrial Respiratory Chain Defects Using DNA Microarrays
Čížková, Alena ; Kmoch, Stanislav (vedoucí práce) ; Kováč, Ladislav (oponent) ; Červinková, Zuzana (oponent)
Poruchy respiračního řetězce jsou zpravidla způsobeny ztrátou aktivity jednoho případně několika specifických enzymů nebo poruchou transportu proteinů. Tyto poruchy představují širokou skupinu onemocnění s rozsáhlým spektrem patologických stavů, které se liší věkem nástupu onemocnění, závažností a klinickým fenotypem. Jejich diagnostika musí být komplexní a vyžaduje využití nových genetických a genomických technik, které tento proces urychlují a zefektivňují. Jedním z těchto genomickcých nástrojů pro kvalitativní a kvantitativní analýzu nukleových kyselin je technologie DNA čipů. Tato technologie je nyní využívána nejen v základním výkumu, ale také v klinické diagnostice a to v několika modifikacích, jako je analýza genové exprese, detekce polymorfismů, komparativní genomová hybridizace nebo detekce mutací. Tato dizertační práce se zabývá vývojem a následnou aplikací čipové technologie ve studiích zaměřených na identifikaci a charakterizaci genů způsobujících závažná onemocnění. Realizované projekty byly zaměřeny především na porozumění mitochondriálním dědičným poruchám jaderného původu (poruchy ATP syntázy), an charakterizaci změn v mitochondriální giogenezi v ledvinných nádorových buňkách a na molekulární charakterizaci mukopolysacharidózy IIIC. Všechny výsledky dokumentují významnost čipové technologie...
|
|
Identification of parentage in chamois (Rupicapra rupicapra) from NP Gran Paradiso
Poláková, Radka
We analysed 47 faecal samples of chamois (32 samples of kids and 15 samples of females). The remaining DNA samples comprised 28 tissue samples of males and other females. Tissue samples were stored in 96% ethanol and faecal samples were placed straight into silicagel. DNA from faecal and tissue samples was extracted using commercial kits. Parentage was determined using the likelihood-based approach in CERVUS 3.0 and these results were confirmed by the program ML-Relate. We found parentage in the case of seven males that sired ten kids.
|
|
Nové biologické markery u lymfoproliferativních onemocnění
Špaček, Martin ; Mandys, Václav (vedoucí práce) ; Smolej, Lukáš (oponent) ; Lysák, Daniel (oponent)
Nové biologické markery u lymfoproliferativních onemocnění Souhrn Prognóza pacientů s lymfoidními neopláziemi je extrémně variabilní. Spolehlivé prognostické markery mohou pomoci identifikovat skupiny pacientů, které mohou profitovat z odlišných přístupů. Virus Epsteina-Barrové (EBV) je asociován přibližně s jednou třetinou pacientů s Hodgkinovým lymfomem (HL). EBV-DNA je často přítomna v plazmě i plné krvi pacientů s EBV-asociovaným HL. Nicméně význam EBV-DNA monitorování je dosud nejasný. V souboru 165 dospělých pacientů s HL jsme prospektivně monitorovali nálož EBV-DNA. Naše výsledky ukázaly, že hodnocení EBV-DNA v plazmě by mohlo být využito k odhadu prognózy a při sledování pacientů s EBV-pozitivním HL. Role R72P polymorfismu genu TP53 byla analyzována v několika studiích u NHL, nikoli však dosud u HL. V naší práci jsme hodnotili roli R72P u 340 pacientů s NHL a 298 pacientů s HL. Naše výsledky ukázaly, že R72P není prognostický faktor u bělošských pacientů s NHL a že nemá vliv na vývoj či prognózu HL. Ve studii se 73 pacienty s chronickou lymfocytární leukemií jsme stanovovali mutační stav IgVH, mutaci genu TP53 a expresi CD38 a tyrozinkinázy ZAP-70. Celková konkordance mezi expresí ZAP-70 a mutačním stavem IgVH byla 85%. Validace flow cytometrické analýzy exprese ZAP-70 byla provedena srovnáním s...
|
|
Identifikace mrtvol a kostrových nálezů
Potůčková, Šárka ; Štourač, Petr (vedoucí práce) ; Konrád, Zdeněk (oponent)
1. Resumé Identifikace mrtvol a kostrových nálezů Tématem mé diplomové práce je identifikace mrtvol a kostrových nálezů. V této práci jsem popsala metody, které jsou v současné době využívány pro individuální identifikaci osob, ale také jsem věnovala pozornost metodám, které byly jejich předchůdkyněmi, a které již v současné kriminalistice využívány nejsou. V každé z kapitol této práce jsem popsala různé identifikační metody. K některým z nich jsem připojila krátké případy z praxe pro ilustraci práce kriminalistů, která probíhá po nálezu mrtvoly nebo kostry. V úvodní části mé práce jsem připojila slovník pojmů, který vysvětlí některé odborné či komplikované výrazy. Některé ze zde popsaných metod jsou také využívány v dalších oblastech, jako je občanské právo, zabezpečovací systémy, archeologie atd., ale tato práce je zaměřená na jejich využití v kriminalistické praxi při vyšetřování trestných činů. V současné době je jedna z nejrychleji se rozvíjejících identifikačních metod s nejširším spektrem využití metoda analýzy DNA, proto jsem rozhodla věnovat značnou část mé práce právě této metodě. Popsala jsem její historický vývoj, praktické využití v kriminalistické praxi a nastínila, jak expertiza probíhá v laboratořích v České republice. Pozornost jsem také věnovala přístrojům a metodám, které jsou používány...
|
| |
|
Identification of cadavers and skeleton findings
Maťašová, Mária ; Štourač, Petr (vedoucí práce) ; Musil, Jan (oponent)
Záver Vo svojej diplomovej práci som sa pokúsila načrtnúť základné metódy identifikácie mŕtvol a kostrových nálezov. Cieľom tejto práce nie je detailný popis týchto metód, pretože samotná téma je veľmi rozsiahla a u jednotlivých metód neustále dochádza k prevratnému rozvoju. V jednotlivých kapitolách som sa venovala obecnému vymedzeniu jednotlivých metód, ktoré som charakterizovala aj uvedením niekoľkých príkladov z praxe. Prvou metódou využívanou v policajnej praxi bola bertillonáž založená na meraní častí ľudského tela. Postupne ju vytlačila daktyloskopia, ktorá má svoje uplatnenie dodnes. Pri náleze kostrových pozostatkov sa i napriek neustálemu rozvoji identifikácie pomocou analýzy DNA využíva dodnes metóda antropologickej identifikácie, ktorá je dôležitá pre určenie veku, výšky, prípadne vzhľadu hľadanej osoby. Podobne metóda forenznej stomatológie sa využíva i v súčasnosti a na základe zdravotnej stomatologickej dokumentácie môže viesť k úspešnému preukázaniu totožnosti. Výhodou metódy superprojekcie je jej jednoduchá realizácia a rýchlosť, hlavne čo sa týka identifikácie mŕtvol. Vďaka pokroku vedy a techniky sa tieto metódy rapídne zdokonaľujú a procesy identifikácie sú čoraz menej časovo náročnejšie. Objavením polymerázovej reťazovej reakcií ( PCR), zdokonaľovaním techník molekulárnej biológie sa...
|
|
Statistické metody pro stanovení váhy evidence v procesu identifikace.
Slovák, Dalibor ; Klebanov, Lev (oponent) ; Zvárová, Jana (vedoucí práce)
In the present work we study an identification of culprit and assesment of evidence against him. At first we define a simple model called the island problem and we derive the weight-of-evidence formula in its basic form. In the next chapters we analyse several modifications of island problem and related issues. We find how we can deal with uncertainty about basic parametres of model, like size of population. We investigate possibility of inclusion of different errors or influence of relatedness and subpopulation structure into model. At the close we enlarge mixtures of DNA, including deriving and programming of appropriate formulas.
|
|
Porovnání eukaryotních genomů
Puterová, Janka ; Vogel, Ivan (oponent) ; Martínek, Tomáš (vedoucí práce)
Hlavním motivem pro vznik této diplomové práce byla potřeba kvalitních bioinformatických nástrojů, které slouží na porovnávání genomů a vylepšení jednoho z existujících nástrojů - RepeatExplorer. Práce přináší přehled transposibilních elementů v DNA, existujících nástrojů určených pro identifikaci a analýzu repetic v nasekvenovaných genomech. V práci jsou popsány nedostatky nástroje RepeatExplorer se zaměřením na komparativní analýzu genomů. Byly navrženy a implementovány dvě řešení k odstranění těchto nedostatků. První řešení je určeno na porovnávání dvojic genomů. Princip tohoto řešení je založen na porovnávání podobnosti rozložení pokrytí contigů prostřednictvím Kolmogorov-Smirnova testu, díky čemu víme určiť rozdílné místa v genomech. Druhé řešení, které slouží k porovnávání více genomů, je založeno na metodě mapování readů porovnávaných genomů na contigy referenčního genomu a poskytuje grafy s pokrytím contigů, pomocí kterých víme určit variabilitu repetic. Funkčnost byla ověřena na reálných NGS datech organizmu Silene latifolia.
|
|
Domain conformations of the motor subunit of EcoR124I involved in ATPase activity and dsDNA translocation
BIALEVICH, Vitali
Bacterial type I restriction-modification systems are composed of three different subunits: one HsdS subunit is required for identification of target sequence and anchoring the enzyme complex on DNA; two HsdM subunits in the methyl-transferase complex serve for host genome modification accomplishing a protective function against self-degradation; two HsdR (or motor) subunits house ATP-dependent translocation and consequent cleavage of double stranded DNA activities. The crystal structure of the 120 kDa HsdR subunit of the Type I restriction-modification system EcoR124I in complex with ATP was recently reported. HsdR is organized into four approximately globular structural domains in a nearly square-planar arrangement: the N-terminal endonuclease domain, the RecA-like helicase domains 1 and 2 and the C-terminal helical domain. The near-planar arrangement of globular domains creates prominent grooves between each domain pair. The two helicase-like domains form a canonical helicase cleft in which double-stranded B-form DNA can be accommodated without steric clash. The helical domain, probably involved in complex assembly, exhibits only a few specific interactions with helicase 2 domain. Molecular mechanism of dsDNA translocation, cleavage and ATP hydrolysis has not been yet structurally investigated. Here we propose a translocation cycle of the restriction-modification system EcoR124I based on analysis of available crystal structures of superfamily 2 helicases, strutural modeling and complementary biochemical characterization of mutations introduced in sites potentially inportant for translocation in the HsdR motor subunit. Also a role of the extended region of the helicase motif III in ATPase activity of EcoR124I was probed.
|
host ::
