|
| |
|
|
Softwarové prostředky pro optimalizaci základních elektrolytů v elektroforéze
Hruška, Vlastimil ; Gaš, Bohuslav (vedoucí práce) ; Gebauer, Petr (oponent) ; Kašička, Václav (oponent)
il l li I L 1. Dosaženévýsledky I]áPlní. mÍdisertačnípníce byl výoj softwarových prostředků pro optimďizaci zríkladních gte\trotytů v elektrofoÉze,studium systémov1;crr i*t a obécnéieorle etett,omi|nce. Spolupracoval jsem na interpretaci amplitud a irogramováni výpočetního ;aora v p.offiuP:šYasler 5. Hlavní ruáplní mé pníceóyl výoj prog-nmu simut š. sehem .Ěr.o 'tuaii;,E. áo něj zabudoval mnoho nástrojů, které vyznamne roxiň;íjeho aplikaci' ota. pr.ogramy jsou s oblibou pouŽívány na mnoha univerziLách a pracovištích po celém světě. Předevšímprogram PeakMaster si získal velmi širokou ziíkladnu uživatelů, jak výzkumnftů používajícíchelektroforetické separačnímetody, tak z dalšíchanalytickýcň aisáprrn afty rychlému výpočnrpH libovolně složitých roztoků s velmi dobrou korekcí na ióntouou síu. Dále jsem spolupracoval na nďezení někteýh reálných systémů, které jsou za|oženy na linearizaci elektromigračního problému a vlastnostech systémo;ých píku jako napríkhd nalezeni oscilujícíchelektrolytů, systémůbez stacionámích systémovyďzon (d. bez regulačníchfunkcí) nebo využitísystémových píku v micelámírn prostředí ke zjišiěníCMC micel. V ruísledujícíchkapitolách kopírujícístÍukturu disertačnípn{ce budou knátce tvto komentovánv. t-
|
|
|
Vliv interagující složky základního elektrolytu na elektroforetickou separaci
Müllerová, Ludmila ; Dubský, Pavel (vedoucí práce) ; Kašička, Václav (oponent) ; Petr, Jan (oponent)
Kapilární elektroforéza je široce používanou separační metodou analytické chemie. Pokud je do základního elektrolytu přidána interagující látka, selektor, lze tuto metodu využít i pro separace enantiomerů nebo látek s velmi podobnými fyzikálně-chemickými vlastnostmi. V analytické praxi se často využívají také směsi selektorů, jednak záměrně připravené pro dosažení lepší separace, jednak proto, že komerčně dodávané derivatizované selektory mohou být ve skutečnosti směsmi látek lišícími se stupněm derivatizace a polohou substituentů. Matematický popis elektromigrace analytu v systémech s více selektory může usnadnit hledání optimálních separačních podmínek a zároveň poskytuje užitečný vhled do mechanismu separace v těchto z aplikačního hlediska velmi významných systémech. V rámci této práce byl představen a experimentálně ověřen model elektromigrace analytu interagujícího se směsí dvou selektorů, který vychází z obecnějšího popisu systému s libovolným počtem selektorů. Tento model ukazuje, že směs, ve které se vzájemný poměr koncentrací selektorů nemění, lze pokládat za selektor jeden. V případě záměrné kombinace dvou selektorů lze pomocí tohoto popisu předpovědět, jak se budou separační schopnosti směsi měnit se změnou zastoupení obou selektorů, a zvolit nejvhodnější složení směsi i její celkovou...
|
|
|
Chirální separace diquatů a stanovení konstant stability jejich komplexů s cyklodextriny kapilární elektroforézou
Bílek, Jan ; Kašička, Václav (vedoucí práce) ; Jelínek, Ivan (oponent)
Kapilární zόnová elektroforéza byla využita pro chirální separaci jedenácti derivátů diquatu (DQ). Tyto N-heteroaromatické dikationty obsahující strukturní motiv 2,2'-bipyridinu jsou v současné době studovány pro své zajímavé redoxní vlastnosti a axiální chiralitu. Kombinace těchto vlastností může v budoucnu přinést zajímavé využití. Pro chirální separace DQ byly jako chirální selektory (CS) použity komerčně dostupné náhodně sulfatované α-, β-, a γ-cyklodextriny o vysokém stupni substituce (HS-α-CD, HS-β-CD, HS-γ-CD). Při použití všech uvedených CS bylo dosaženo velmi dobrého chirálního dělení. Separace enantiomerů na základní linii bylo dosaženo pro 82 %, 91 %, respektive 100 % analyzovaných derivátů DQ v přítomnosti HS-α-CD, HS- β-CD, respektive HS-γ-CD. Nejvyšších separačních účinností a rozlišení enantiomerů DQ bylo dosaženo při elektroforetické separaci v základním elektrolytu (BGE) obsahujícím 22 mmol/L NaOH, 35 mmol/L H3PO4 (pH 2,5) a 6 mmol/L HS-β-CD. Pomocí tří dostupných neracemických DQ byla provedena identifikace migračního pořadí jednotlivých M- a P-enantiomerů příslušných DQ. Metodou kapilární afinitní elektroforézy byly experimentálně zjištěny závislosti efektivní elektroforetické pohyblivosti enantiomerů DQ na koncentraci HS-α-CD, HS- β-CD, nebo HS-γ-CD v BGE. Efektivní pohyblivosti...
|
|
|
Stanovení a porovnání elektromigračních vlastností markerů pro izoelektrickou fokusaci
Lorinčíková, Kateřina ; Gaš, Bohuslav (vedoucí práce) ; Kašička, Václav (oponent)
Byly proměřeny závislosti elektroforetické mobility na pH pro 14 pI markerů využívaných pro izoelektrickou fokusaci připravených skupinou Šlaise, které jsou založené na substitucích na nitrofenolovém jádře, a pro 5 pI markerů připravených Shimurou, které mají strukturu oligopeptidů. Pomocí programu AnglerFish byly z těchto závislostí získány termodynamické disociační konstanty a limitní elektroforetické pohyblivosti daných látek. Ze získaných hodnot byly následně vypočítány hodnoty pI příslušných markerů. Provedlo se srovnání získaných hodnot pI s těmi, jež jsou uváděny v literatuře, avšak byly stanoveny jinými analytickými metodami. Klíčová slova kapilární zónová elektroforéza, izoelektrická fokusace, pI markery, izoelektrický bod, termodynamická disociační konstanta, limitní iontová pohyblivost
|
|
|
Matematické modelování lineárních a nelineárních jevů v kapilární elektroforéze
Dvořák, Martin ; Dubský, Pavel (vedoucí práce) ; Kašička, Václav (oponent) ; Gebauer, Petr (oponent)
Kapilární elektroforéza je jedna z předních analytických separačních metod. V současné době existuje řada počítačových programů, které jsou schopny předpovědět výsledek elektroforetického experimentu. Jde jednak o programy založené na numerickém řešení příslušných rovnic kontinuity a rovnic chemické rovnováhy a jednak o programy založené na aproximativních modelech kapilární elektroforézy. Programy z první skupiny jsou použitelné pro širokou škálu módů kapilární elektroforézy a poskytují přesné řešení. Jejich nevýhodou je však jejich značná časová náročnost. Aproximativní modely naopak dávají výsledek téměř okamžitě a navíc poskytují teoretické vztahy užitečné při optimalizaci separační metody. Tato disertační práce se zaměřuje na vylepšení a rozšíření oblasti platnosti stávajících aproximativních modelů kapilární elektroforézy. V rámci této práce je představen model vhodný pro plnohodnotný popis kapilární elektrokinetické chromatografie. Tento model je implementován do programu PeakMaster 6. Dále je pozornost věnována nelineárnímu modelu elektromigrace bez difúze. Tento model umožňuje velmi dobrý popis elektromigrační disperze včetně efektů spojených se vzájemnou interakcí mezi píky. Činí tak ovšem na úkor úplného zanedbání difúze. V této práci je nelineární model elektromigrace bez difúze...
|
|
|
Determination of binding constants of human insulin complexes with serotonin, dopamine, arginine, and phenol by pressure assisted partial filling affinity capillary electrophoresis
Šolínová, Veronika ; Žáková, Lenka ; Jiráček, Jiří ; Kašička, Václav
A new method, pressure assisted partial filling affinity capillary electrophoresis (PF-ACE), has been developed to study noncovalent interactions of the hexamer of human insulin (HI) with cationic ligands, such as phenolic neurotransmitters serotonin and dopamine, and amino acid arginine, or with anionic ligand phenol, in alkaline aqueous solutions. The apparent binding constants, Kb, of the HI-ligand complexes were determined from the dependence of the effective migration time changes of the above ligands on the variable zone lengths of HI dissolved in the background electrolyte and hydrodynamically introduced into the bare fused silica capillary close to the UV detector. The HI interactions with the above ligands were found to be moderately strong, with Kb values in the range 385-1314 L/mol.
|
|
|
Enantioseparation and estimation of racemization barriers of selected helquats and their derivatives by capillary electrophoresis using sulfated cyclodextrins as chiral selectors
Sázelová, Petra ; Koval, Dušan ; Severa, Lukáš ; Reyes Gutierrez, Paul Eduardo ; Jirásek, Michael ; Teplý, Filip ; Kašička, Václav
Anionic highly sulfated β- and γ-cyclodextrins (S-CDs) and single-isomer heptakis-(2,3-diacetyl-6-sulfato)-β-CD (14Ac-7S-β-CD) were used for chiral separation of [5], [6] and [7]-ring helquats and helquat styryl dyes by capillary electrophoresis (CE) in the background electrolyte composed of 22 mM NaOH/35 mM H3PO4, pH 2.4. The CE method was applied for monitoring of racemization of eight helquats and helical dyes. Rate constant k of conversion, half-life T1/2 of racemization, and activation Gibbs free energy ΔGǂ of interconversion of one enantiomer into the other were calculated from the dependence of natural logarithm of enantiomeric excess (ee) on time using linear regression analysis.
|
|
|
Separation of rotamers of 5-nitrosopyrimidines by capillary electrophoresis
Štěpánová, Sille ; Procházková, Eliška ; Čechová, Lucie ; Žurek, Jiří ; Janeba, Zlatko ; Dračínský, Martin ; Kašička, Václav
A new capillary electrophoresis (CE) method was developed for the separation of a new type of stereoisomers - rotamers of polysubstituted 5-nitrosopyrimidine derivatives. Partial separation of some rotamers was obtained in sodium borate, pH 9.3, or in Tris-phosphate, pH 2.2, background electrolytes (BGEs) free of cyclodextrins (CDs). However, the best, baseline separations of the rotamers of 5-nitrosopyrimidines were achieved in sodium borate BGE, pH 9.3, containing 20 mg/mL beta-CD as stereoselector, or in Tris-phosphate BGE, pH 2.2, with carboxymethyl-beta-CD as stereoselector.
|
|
| |
host ::
RSS.