|
|
Novel fluorescent nucleotides for metabolic labelling and for the construction of DNA probes
Kuba, Miroslav ; Hocek, Michal (vedoucí práce) ; Slanina, Tomáš (oponent) ; Míšek, Jiří (oponent)
Cílem této dizertační práce byla syntéza nových nukleosidů, nukleotidů a příslušných DNA sond nesoucích různé fluorescenční značky pro bioanalytické aplikace. V první části práce byl pomocí Sonogashiry cross-kapling reakce syntetizován 2'-deoxycytidin a jeho trifosfát nesoucí imidazolinový fluorofor na bázi tryptofanu. Daný fluorofor vykazoval citlivost na pH a viskozitu. Nukleotid byl použit pro konstrukci modifikovaných oligonukleotidů (ON) a DNA prodlužováním primeru (PEX) nebo polymerázovou řetězovou reakcí (PCR). Značená ON sonda byla použita pro snímání interakce se single-strand vazebným proteinem, což vedlo ke zvýšení intenzity fluorescence modifikovaného ON. Dále byl připraven thymidin a thymidin-5'-O-trifosfát, nesoucí benzyliden- tetrahydroxanthyliový fluorofor, pomocí mědí katalyzované azid-alkynové cykloadice (CuAAC). Fluorescence fluoroforu je závislá na polaritě a viskozitě prostředí. Inkorporace modifikovaného nukleotidu do DNA pomocí PEX nebo PCR vedlo k dramatickému zvýšení fluorescence, pravděpodobně díky interakcím fluoroforu ve velkém žlábku. Bohužel, modifikovaný nukleotid nebyl vhodný pro vizualizace v buňkách kvůli své cytotoxicitě. Modifikovaná dsDNA byla použita jako fluorescenční sonda pro snímání interakcí s malými molekulami a proteiny změnou fluorescence. Nakonec byl...
|
|
| |
|
| |
|
|
Evidence pro přímé a nepřímé výhody plynoucí samicím ze sexuální promiskuity u obratlovců
Kuba, Martin ; Albrecht, Tomáš (vedoucí práce) ; Šulc, Michal (oponent)
Promiskuitní chování samic je pozorováno u mnoha skupin obratlovců ovšem vysvětlení tohoto jevu včetně výhod, které z něj plynou samicím, zůstávají nejasné. Hypotézy, které by tento jev měly vysvětlovat, lze rozdělit na adaptivní a neadaptivní. Dle adaptivních hypotéz jsou samice promiskuitní, protože jim z kopulací s více samci plynou výhody, ať už přímé, které ovlivňují samici, její přežívání a zdroje, které má k dispozici, či nepřímé (genetické), které zvyšují fitness samice prostřednictvím kvalitnějších mláďat. Dle neadaptivních hypotéz samici z promiskuitního chování naopak žádné benefity neplynou a promiskuita je důsledkem samčích ofenzivních strategií k získávání paternit. Adaptivní hypotézy, zejména pak genetické výhody, jsou velmi diskutované a studie se ve svých závěrech částečně rozcházejí. Cílem práce je podat přehled přímých a nepřímých hypotéz a zhodnotit jejich validitu u druhů napříč hlavními skupinami obratlovců. Klíčová slova: Promiskuita, sexuální konflikt, kompetice spermií, dobré geny, komplementární geny, mimopárová mláďata, adaptivní hypotéza, přímé výhody, nepřímé výhody
|
|
|
Vybrané QEEG proměnné v časné predikci antidepresivní odpovědi
Vlček, Přemysl ; Brunovský, Martin (vedoucí práce) ; Kuba, Miroslav (oponent) ; Praško Pavlov, Ján (oponent)
Elektroencefalografie představuje citlivou metodu, která je schopna registrovat neurofyziologické změny (operace) v mozkové kůře, jež lze následně pomocí výstupů různě komplexních matematických transformací interpretovat v kontextu současného neurovědního poznání. Dynamický průběh elektrokortikální aktivity je podmíněn funkčními a strukturálními procesy, jež mohou mít svůj původ jak v kůře samé, tak v různých subkortikálních oblastech, které jsou s ní asociované. Rozvoj matematických metod zpracování biologických signálů (respektive vývoj teorie a praxe zpracování signálů obecně) umožnil postupný nárůst informační výtěžnosti EEG, která se dnes již zdaleka neomezuje na vizuální inspekci záznamu (ačkoliv ta zůstává pro kliniku stále velmi významná). Dnešní počítačem řízená analýza EEG signálů z jednotlivých elektrod umožňuje získat přehled o různých odrazech neuronální aktivity podle konkrétních frekvenčních pásem (spektrální výkon, asymetrie, kordance, frekvenční pík, rozložení proudové hustoty aj.), čímž lze vytvářet různé komplexní elektrofyziologické koreláty zdravé i patologické neuronální činnosti. V tomto kontextu se dnes pracuje s pojmem kvantitativní (tj. na výpočetní analýze EEG signálu založená) elektroencefalografie (QEEG). Mezi významné QEEG metody v elektrofyziologii patří ty, jež jsou...
|
|
|
Functional imaging of cortical evoked potentials following painful and nonpainful stimulation in healthy volunteers and chronic pain patients
Poláček, Hubert ; Stančák, Andrej (vedoucí práce) ; Šonka, Karel (oponent) ; Kuba, Miroslav (oponent)
Skúsenosti s tesnými vzťahmi bolestivého a nebolestivého telesného vnímania viedli už v dávnejšej minulosti k vypracovaniu viacerých dodnes používaných analgetických metód. K vedeckému vysvetleniu ich pôsobenia a ďalšiemu vývoju ešte nedávno prispievali prevažne animálne neuroanatomické a neurofyziologické práce, skúmajúce prepojenie rôznych etáží nervového systému pri bolestivom a nebolestivom dráždení. Recentne sa limitácie spojené so zvieracími modelmi darí preklenovať pomocou sofistikovaných neinvazívnych zobrazovacích metód u humánnych probandov in vivo. Cieľom predkladanej práce je preskúmať u normálnych dobrovoľníkov a pacientov s alterovaným algickým vnímaním časopriestorové vzťahy odpovedí mozgovej kôry pri súčasnom bolestivom a nebolestivom somatickom dráždení. Následne interpretovať nájdené modulačné vplyvy v svetle súčasného poznania a navrhnúť ďalšie využitie nových zistení. Prezentované sú 3 experimentálne štúdie s účasťou zdravých dobrovoľníkov a 1 štúdia s účasťou pacientov s postdiscektomickým syndrómom liečených implantovaným miechovým stimulátorom (SCS). Pri všetkých boli zdrojovou analýzou vyhodnocované kôrové evokované potenciály (SEPy) získané zo záznamu EEG s vysokým rozlíšením (75-111 kanálov, vzorkovacia frekvencia 1024 Hz) po fázickej elektrickej stimulácii n. medianus, n. tibialis...
|
|
|
Interaktivní webové výukové aplikace z oblasti zpracování signálů
Kuba, Michael ; Rajmic, Pavel (oponent) ; Záviška, Pavel (vedoucí práce)
Bakalářská práce se zabývá některými tématy z oblasti zpracování signálů. Cílem práce je vytvoření čtyř interaktivních webových aplikací v jazyce JavaScript, které mají sloužit k podpoře výuky. Aplikace jsou zaměřeny na témata: převzorkování diskrétního signálu v poměru racionálního čísla, střední a efektivní hodnota signálu, diskrétní lineární a kruhová konvoluce v 1D a diskrétní křížová korelace. Práce je rozdělena na teoretickou a praktickou část. Ke každé aplikaci je zde uveden teoreticky úvod, včetně úvodního seznámení se signály, a popis jejich funkčnosti či vzhledu.
|
|
|
Návrh podnikatelského plánu pro vznik a rozvoj společnosti
Kingová, Jana ; Kuba, Martin (oponent) ; Konečná, Zdeňka (vedoucí práce)
Obsahem této diplomové práce je návrh podnikatelského plánu pro vznik a rozvoj společnosti. Konkrétně byl vytvořen podnikatelský plan pro zřízení kavárny s názvem Ollie, která je zároveň komunitním místem, dílnou a místem pro práci v Brně Komárov, nedaleko sportovního areálu Komec. První část tvoří teoretická východiska práce, která obsahují vysvětlení pojmů potřebných ke zpracování praktické části diplomové práce. Praktická část obsahuje analýzu současného stavu a vlastní návrh řešení. Metodami, které byly použity k analýzám jsou například metoda PESTLE nebo Porterova analýza.
|
|
|
Regulace teploty v technologickém procesu
Kuba, Marek ; Marada, Tomáš (oponent) ; Zuth, Daniel (vedoucí práce)
Ve své bakalářské práci se zaměřuji na návrh a sestrojení vlastního zařízení pro regulaci teploty v jednotlivých kvasných nádržích ve vinařském provozu. Práce je rozdělena do dvou částí. V rešeršní části je stručně popsána vhodná automatizační technika a teplotní senzory. Návrhová část obsahuje výběr jednotlivých komponent a vyhodnocení výsledků. Dále bylo nutné vytvořit program na regulaci teploty, výkresovou dokumentaci a porovnání finálního výrobku s ostatními komerčními zařízeními. V závěru jsou shrnuta různá doporučení pro praktické užití vlastního navrženého zařízení.
|
|
|
Návrh silničního ocelobetonového komorového mostu na obchvatu Bludova
Kuba, Michal ; Marván, David (oponent) ; Nečesal, Petr (vedoucí práce)
Obsahem práce je variantní návrh nosné konstrukce komorového silničního mostu na obchvatu města Bludov. Most je navržený jako spřažený ocelobetonový o 5 polích s rozpětím 31,25 m; 40,0 m; 60,0 m; 60,0 m; 40,35 m. Hlavní nosná konstrukce je tvořená ocelovou komorou, uzavřenou železobetonovou deskou mostovky, vyztuženou podélnými a příčnými výztuhami. Nosná konstrukce pro každý dopravní směr je řešená samostatně. Překračovanou překážkou je řeka Morava a železniční trať v 2, respektive 3 poli. Návrhová kategorie převáděné komunikace I/44 je S 21,5/100, komunikace je vedena v směrovém oblouku. Výška ocelové komory je závislá od limitované stavební výšky mostu a je navržená na 2,5 m. Most bude vysouván, betonován na montážních podpěrách. Návrh jednotlivých části konstrukce ocelové komory a betonové desky je převáděn podle platných norem ČSN EN. Použitý materiál nosných prvků je ocel třídy S 355 a beton C 35/45.
|
host ::
RSS.