|
|
Ovlivnění genové exprese u hyperproliferativních kožních onemocnění
Lysá, Barbora ; Arenberger, Petr (vedoucí práce) ; Kohoutová, Milada (oponent) ; Brdička, Radim (oponent) ; Nečas, Emanuel (oponent)
Úvodní část této dizertační práce dává náhled na vybrané aspekty dané problematiky, zabývá se nastíněním molekulární podstaty hyperproliferativních kožních onemocnění, do kterých jsou zahrnuty vedle psoriázy jako charakteristického zástupce i nemelanomové kožní nádory. Dále rozebírá částečně i exogenní vliv UV záření na jejich vznik. Vlastní výzkumná práce je zaměřena na skupinu genů, jejichž exprese byla zkoumána u onemocnění aktinickou keratózou v souvislosti s její léčbou topickým imunomodulátorem - imiquimodem. Zkoumané geny lze rozdělit do skupin na geny modulující imunitní odpověď, geny podílející se na apoptotických procesech a na geny hrající potenciální roli ve vzniku nádorů.
|
|
|
Diverzita mitochondriální DNA subsaharských populací - úloha jazykových a geografických faktorů
Musilová, Eliška ; Černý, Viktor (vedoucí práce) ; Brdička, Radim (oponent)
Za účelem popsání vztahů mezi genetickou, jazykovou a geografickou diverzitou v Africe byl v rámci diplomové práce sekvenován HVSI segment mitochondriálního genomu u 81 jedinců ze dvou západoafrických populací odlišných jazykových rodin. Získané sekvence byly porovnávány s obdobnými daty publikovanými jinými autory. Interpopulační analýza zahrnovala celkem 4550 sekvencí HVSI segmentu mtDNA 101 populačních celků reprezentujících hlavní geografické regiony a jazykové skupiny Afriky. AMOVA dokládá, že variabilita mtDNA mezi jednotlivými skupinami je vyšší, pokud jsou populace tříděny na základě jednotlivých regionů (9,85 %; p < 0,001) než podle jejich jazykové příslušnosti (4,09 %; p< 0,001). Také graf MDS založený na hodnotách FST odhaluje korelaci mezi genetickou a geografickou nikoli však jazykovou vzdáleností zkoumaných populací. Úloha jazykových faktorů nevzrůstá, ani pokud jsou odstraněny skupiny vnášející do analýzy největší podíl heterogenity (nigerokonžská a khoisanská jazyková rodina). Výsledky naznačují, že komplikované vztahy mezi jazykovou a genetickou diferenciací jednotlivých populací mohly být v minulosti ovlivněny jednostrannou výměnou partnerů a jazykovými výpujčkami mezi expandujícími bantuskými zemědělci a místními lovecko-sběračskými skupinami během uplynulých 3000 let. Jisté stopy...
|
|
|
The study of mitochondrial biogenesis during fetal development
Pejznochová, Martina ; Zeman, Jiří (vedoucí práce) ; Hyánek, Josef (oponent) ; Brdička, Radim (oponent)
Postnatální adaptace novorozence na extrauterinní prostředí je kromě jiného závislá i na efektivním průběhu mitochondriální biogeneze v období fetálního vývoje. Proto studium mitochondriální biogeneze na molekulárně genetické a biochemické úrovni může přispět k zlepšení péče o předčasně narozené děti, zvláště o kriticky nemocné novorozence. Práce vznikla v Laboratoři pro studium mitochondriálních poruch Kliniky dětského a dorostového lékařství 1.LF UK v Praze a zabývá se molekulárně genetickými analýzami zaměřenými na charakterizaci exprese genů podílejících se na mitochondriální biogenezi včetně genů pro systém oxidativní fosforylace (OXPHOS) a na charakterizaci změn množství mitochondriální DNA v průběhu fetálního vývoje člověka. Získané výsledky umožňují: Efektivní analýzu expresní hladiny mRNA metodou real-time PCR ve fetálních tkáních Kvantifikaci množství mtDNA v různých fetálních tkáních Pochopit a vysvětlit tkáňové specifické rozdíly v expresi OXPHOS genů a genů podílejících se na transkripci mtDNA a regulaci jejího množství v průběhu druhého trimestru gestace
|
|
| |
|
|
Pojem genu a některé jeho etické konsekvence
Franková, Věra ; Payne, Jan (vedoucí práce) ; Brdička, Radim (oponent) ; Križan, Peter (oponent)
Pojem genu poprvé použil v roce 1909 Wilhelm Johannsen, který jím označil teoretickou jednotku genetické analýzy. Stejně jako se vyvíjela genetika a možnosti její experimentální praxe, vyvíjel se i význam a obsah pojmu genu. Molekulární koncept genu používaný v současné biologii je založen na předpokladu, že DNA sekvence a její genový produkt si vzájemně lineárně odpovídají (Waters 2007). Gen je zároveň prezentován jako segment DNA, který tvoří kompaktní a ohraničený genetický lokus. Tento koncept se však stal ve světle poznatků získaných výzkumem genomů různých organismů již nevyhovujícím. Cílem této práce je vymezit pojem genu a to za použití výkladu mechanického, sémantického a hermeneutického (Payne 2002, 101-124). V práci je proto shrnuta historie pojmu genu. Dále jsou uvedeny některé poznatky, které zásadním způsobem narušují molekulární koncept genu. V rovině sémantické je poukázáno na to, že přestože je gen v biologickém výkladu skoro vždy bezprostředně spojován s molekulou DNA, jeho podstata není materiální, ale má charakter informace. DNA v procesu přenosu informace z generace na generaci funguje pouze jako prostředník či nosič. Gen je tudíž informace obsahující instrukci pro vytvoření fenotypového znaku, který je vymezen dle klinického či jiného teoretického zájmu. V rámci klinické genetiky lze...
|
|
| |
|
|
Apoptosis Signating Pathways and Biological Effects of TGFB
Šimáková, Olga ; Fuchs, Ota (vedoucí práce) ; Brdička, Radim (oponent) ; Holada, Karel (oponent)
Apoptosis is necessary for maintaing the integrity of all alive multicellular organisms and therefore needs to be precisely regulated. Very important regulators of apoptosis are pleiotropic cytokines from TFGβ superfamily (e.g. TGFβ, BMP, aktivins), whose signals are transduced by SMAD proteins. Patients with secondary myelodysplasias and acute myeloid leukemias (MDS/AML) frequently exhibit interstitial deletions of the chromosome-5q resulting in hemizygous loss of the transcription transactivator SMAD5. SMAD5 is a member of the signal transducer family conveying the pleiotropic TGFβ/BMP cytokine signals with roles in development, cell growth control, and tumor progression. Consistent Smad5 gene expression in these cell types and the gradual increase in its mRNA and protein levels in a model of induced erythroid differentiation of murine erythroleukemia (MEL) cells suggest a role of the gene in hematopoiesis. We show that bone morphogenetic protein 4 (BMP4) directs Smad5 activation in human hematopoietic cells, as monitored at the levels of protein phosphorylation, nuclear translocation, and specific transcription response. In vitro induction of normal human CD34+ cells by BMP4 results in significantly increased proliferation of erythroid progenitors (BFU-E) and formation of glycophorin- A+ cells, whereas...
|
|
|
Molecular genetic studies in colorectal cancer families
Vandrovcová, Jana ; Kohoutová, Milada (vedoucí práce) ; Sedláček, Zdeněk (oponent) ; Brdička, Radim (oponent)
Colorectal cancer (CRC) is one of the most common cancers in industrialized countries and affects men and women almost equally (1). The prognosis for a patient largely depends on the stage of the tumor at the time of diagnosis with the 5-year survival over 90% in cases where the cancer has not spread to the outer wall of the colon, but only 5% for stages where the cancer has spread outside the colon (2). CRC is a complex disease where environmental factors such as diet and lifestyle play an important role (3). Besides these factors, it has been shown that CRC occurs more frequently in certain families and a number of syndromes mainly with Mendelian dominant inheritance, which predispose to CRC development, have been described. The most common syndromes include hereditary non-polyposis CRC (HNPCC), familial adenomatous polyposis (FAP) and MUTYH associated polyposis. CRC develops in a multistep manner over 10-15 years and the tumorigenic process covers a wide range of both premalignant and malignant lesions, such as hyperplastic polyps and adenomas. These lesions are well characterized both morphologically and genetically and can be easily detected and removed by colonoscopy. Even though CRC develops during a long period, carcinomas are usually recognised at advanced stages of tumor development and surgical...
|
|
| |
|
|
Vliv variability genomu na interakci lidského organismu a životního prostředí - ENVIRONGENOM
Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i., Praha ; Skorkovský, Jiří ; Benešová, Marie ; Novák, Jiří ; Tabashidze, Nana ; Švecová, Vlasta ; Špátová, Milada ; Solanský, Ivo ; Nováková, Zuzana ; Milcová, Alena ; Líbalová, Helena ; Dejmková, Eva ; Schmutzerová, Jana ; Topinka, Jan ; Rössner, Pavel ; Dostál, Miroslav ; Brdička, Radim ; Šrám, Radim
Zpráva obsahuje jednotlivé výstupy spojené s realizací projektu (články, přednášky). Je uvedeno zhodnocení znečistění ovzduší v Teplicích, Prachaticích a v Praze za období 1994-2009 a vyhodnocení vztahu mezi znečištěným ovzduším a nemocností předškolních dětí v okrese Teplice a Prachatice. Je připojena zpráva o zdravotním stavu Romů ve sledované oblasti.
|
host ::
RSS.