|
|
Identification of lactic acid bacteria in probiotic products (tablets) using amplification methods
Balogová, Petra ; Trachtová, Štěpánka (referee) ; Španová, Alena (advisor)
Lactobacillus have been playing a crucial role in the fermentation processes for millenia. Their probiotic effects have been studied deeply and nowadays they are used in the production of fermented products and food adjunkt including probiotic preparations. This thesis was focused on bakteria of genus Lactobacillus in probiotic preparations (tablets). Polymerase chain reaction method (PCR) based on amplification of DNA was used to identify lactobacillus in seven probiotic preparations. As DNA matrices whole DNA recovered from tablets with the help of magnetic microparticles (P(HEMA-co¬-GMA) coated by carboxylic groups was used into a PCR mixture. Genus specific PCR products (250 bp) were detected with the help of gel electrophoresis on agaróse. DNA of genus Lactobacillus was proved in all but one product. In this product only probiotic bacteria were declared presence without family identification was proved. It contained different bakteria then bakteria of Genus Lactobacillus probably.
|
|
|
Isolation of bacterial DNA from foods using magnetic carriers
Bubeníková, Lucia ; Horák, Daniel (referee) ; Španová, Alena (advisor)
The aim of the work was the selective isolation of bacterial DNA with help of magnetic carriers covered by streptavidine (PGMA-NH2-STV, MPG® Streptavidin). Conditions of functionalisation of carriers using two biotinylated probes were optimized: the amount of carrier, the amount of probe, binding of biotinyled probe to streptavidine. Purified DNA Lactobacillus was used for hybridization. DNA binding to the probe (DNA/DNA hybridization) and nospecific adsorption of DNA to the carrier were tested. Target DNA eluted from the carrier was identified using PCR with primers R16-1 and LbLMA1-rev and with primers P_eub and F_eub. The amount of probe bound to the carrier was estimated using UV spectrophotometry. It was estimated that biotinyled probe can be used for functionalisation in concentration 5 pmol/µl added to the carrier in the ration carrier : probe 1:1. It was shown that nonspecific DNA adsorption to the MPG® Streptavidin is significantly lower than to the carrier PGMA-NH2-STV.Using DNA/DNA hybridization and the MPG® Streptavidin, DNA from pure culture Lactobacillus was isolated. Procedure was applicated for DNA isolation from milk products.
|
|
|
Application of real-time PCR in microbiological analysis of food-stuffs
Novotná, Eva ; Michaela, Kotianová (referee) ; Španová, Alena (advisor)
Probiotic lactic acid bacteria of genus Lactobacillus play an important role in the digestive tract of human, e.g. protect against pathogenic microorganisms. Lactobacilli are often present in various food products. Lactic acid bacteria of the genus Lactobacillus can be detected by polymerace chain reaction (PCR) using specific primers LbLMA1 and R16. The bacterial DNA was isolated from Actimel Natur probiotic product by the phenol extraction method. DNA was amplified using real time PCR. Specific PCR products were detected using fluorescent intercalaction dye SybrGreen. The specific PCR products were verified by melting curve analysis (Tm 85°C) and by agarose gel electrophoresis (PCR products of 250 bp was amplified).
|
|
|
Identification of probiotic Bifidobacterium strains in dairy products
Zovčáková, Monika ; Horák, Daniel (referee) ; Španová, Alena (advisor)
Lactobacilli are dominant bacteria of the vaginal flora. Lactobacillus-containing probiotics products are used for the treatement and profylaxis of bacterial urogenital infections. This work is focused on DNA identification and species identification of probiotic bacteria in 5 different vaginal tablets using molecular-genetic methods. Total DNA isolated from complex matrix of vaginal tablets was used for amplification in polymerase chain reaction. DNA was isolated from crude cell lysates by magnetic particles P(HEMA-co-GMA) and by method of phenol extraction. Identification of species of probiotic bacteria was verified using genus-specific and species-specific PCRs. Results of bacterial identification obtained by PCR were compared with declared specification given by producers. Bacteria of genus Lactobacillus were proved in all tablets whereus species identification was in accordance with the stated composition in 1 tablet only.
|
|
|
Microbial characterization of yoghurts and probiotic foods.
Kocourková, Hana ; Burdychová, Radka (referee) ; Španová, Alena (advisor)
Zvýšená konzumace fermentovaných mléčných výrobků v posledních letech vede k zavádění nových výrobků na trh. Funkční a probiotické produkty jsou v dnešní době také hojně rozšířeny. Cílem diplomové práce bylo posoudit mikrobiální kvalitu komerčních jogurtů a nefarmakologických probiotických výrobků. Bylo zkoumáno 24 vzorků jogurtů a 8 vzorků probiotických mléčných výrobků. Pozornornost byla zaměřena zvláště na kvantifikaci mikroorganismů v jednotlivých výrobcích a na sledování viability buněk. Většina mléčných produktů obsahovala počty odpovídající minimální požadované hodnotě 1x107cfu/ml. Nicméně byly objeveny produkty, které neobsahovaly živé bakterie nebo obsahovaly jen jejich menší množství. To platí zejména pro běžné jogurty. Probiotické mléčné výrobky v zásadě obsahovaly větší množství bakterií než jogurty, protože je u nich navíc požadováno 1x106cfu/ml minimálního množství specifických bakterií jiných než jogurtových startovacích kultur. Isoláty z fermentovaných mléčných výrobků byly identifikovány jako Streptococcus thermophilus and Lactobacillus spp. Isoláty byly poté rozlišeny na jednotlivé kmeny pomocí RAPD použitím tří různých primerů. Byla zjištěna velká různorodost mezi kmeny rodu Lactobacillus spp. používaných různými podniky.
|
|
|
Probiotics in food products
Silná, Renata ; Trachtová, Štěpánka (referee) ; Španová, Alena (advisor)
Probiotics are living microorganisms with a positive effect on the consumer when they are added to food in adequate amount. The best known probiotic are lactic acid bacteria and yeast Saccaromyces cerevisiae var. boulardii. The theoretical part of the thesis is focused on using probiotics microorganisms in food. In the experimental part of the thesis were prepared crude lysates from three food products and the presence of bacterial DNA was proved by PCR method.
|
|
|
Fermentation of different cereals by the probiotic bacteria Lactobacillus plantarum 299v
Hamalová, Sabina ; Španová, Alena (referee) ; Prof.Siv Ahrne (advisor)
Počet obyvatel trpících různými infekčními, zánětlivými a alergickými nemocemi stejně jako výskyt laktózové nesnášenlivosti a vysoké hodnoty krevního cholesterolu, má narůstající tendenci. Některé z těchto zdravotních problémů jsou způsobeny nevyváženou střevní mikroflorou. Probiotika jsou pak chápána (nejen) jako potravní komponenty, které přispívají k ustanovení mikrobiální rovnováhy (Parker, 1974) mezi zdraví prospěšnými a škodlivými bakteriemi. Z tohoto důvodu, terapie založená na podávání probiotik pacientům přitáhla zájem ze strany vědců. Vhodný probiotický kmen se pak volí v závislosti na požadovaném zdravotním účinku (příp. zdravotním problému, který má být probiotickou terapií léčen). Lactobacillus plantarum 299v již prokázal své blahodárné účinky na lidech a zároveň byla i potvrzena jeho zdravotní bezpečnost, díky čemuž může tato bakterie být kategorizována jako probiotický kmen (Probi AB, Sweden). I díky tomu je Lactobacillus plantarum 299v ve značné oblibě přidáván do mnoha fukčních potravin a prodáván na trhu pod různými jmény, probiotický nápoj ProViva je jedním takovým příkladem. Cílem této práce bylo studovat fermentační proces na žitném, ječmenném a sojovém substrátu pomocí kmene Lactobacillus plantarum 299v, přičemž zvýšená pozornost byla věnována právě soji a ječmeni jako potenciálně novým substrátům pro výše uvedenou bakterii. Hlavními záměry bylo zkoumání růstu a metabolické aktivity bakterie Lactobacillus plantarum 299v v asociaci s různými cereálními substráty, a později bylo studováno totéž také ve směsi fermentované cereální komponenty s běžně dostupným ovocným džusem. K tomu, aby se dosáhlo optimálních podmínek fermentace, je třeba vzít v úvahu několik aspektů. Hlavní role při konceptování nového fermentovaného produktu patří především zpracování a taktéž kompozici surového materiálu, růstové kapacitě a produktivitě bakteriální kultury a stabilitě finálního produktu během skladování (De Vuyst, 2000). Tyto parametry jsou důležité hlavně ze strany výrobců. Krom toho jsou tu ale i zákazníci, pro něž je přijatelnost produktu založena z velké části na organoleptických vlastnostech finálního probiotického produktu, tj. aromatu a chuti. Přítomnost a dostupnost různých jednotlivých nutrientů, která byla obsažena ve fermentačním médiu výsledkem rozdílných použitých cereálních substrátů, pravděpodobně vyústila v odlišnosti metabolických drah, což pak později mohlo způsobit rozdíly v organoleptických vlastnostech finálního produktu.
|
|
|
Optimization of recombinant protein production in animal cell culture
Kyselá, Hana ; Španová, Alena (referee) ; Ševčík,, Mojmír (advisor)
V této diplomové práci je popsána přechodná transfekce buněk 293 HEK adaptovaných na růst při suspenzní kultivaci bez přítomnosti séra za použití polyethyleniminů (PEI). Buňky byly transfekovány plasmidem pcDNA5/SEAP, který exprimuje sekretovanou formu lidské placentální alkalické fosfatázy. K porovnání účinnosti jednotlivých transfekcí byla měřena koncentrace exprimované fosfatázy v buněčném supernatantu. Cílem této práce bylo optimalizovat různé faktory ovlivňující účinnost transfekcí s důrazem na nalezení optimálního poměru DNA:PEI.
|
|
|
PCR identification of selected bacteria in cheeses
Gregušová, Barbora ; Burdychová, Radka (referee) ; Španová, Alena (advisor)
This work is focused on identification and species specification of a collection of 44 clostridial strains using molecular-genetic methods. DNA of bacteria isolated from late-blowing defected cheeses was used. The purified DNA was diluted to 10 ng/µl and its ability to be amplified was verified by PCR with universal primers. By genus-specific PCR was proved that DNA of all samples belongs to Clostridium genus. Based on species-specific PCR reactions, it was determined that 7 strains belong to C. butyricum and 12 strains belong to C. tyrobutyricum. 15 strains were positively detected in both species-specific PCRs and therefore identified as mixed cultures. Another 10 strains were not classified into tested species. Strains with the gene encoding the enzyme hydrogenase hydA were searched using PCR. Specific PCR products for this gene were detected in 30 strains of the analysed collection. Especially intense were the amplicons by all strains belonging to C. butyricum species.
|
|
|
The monitoring of the lactic acid bacteria in the Moravian wines
Valicová, Markéta ; Španová, Alena (referee) ; Omelková, Jiřina (advisor)
The aim of this Master Degree Thesis was to monitor the total number of lactic acid bacteria occurring in grape must during wine production. The study was performed on the red wine grape variety Cabernet Moravia from organic vineyard and on the white wine grape variety Sauvignon from both organic and integrated vineyards. The isolation of pure cultures of lactic acid bacteria from mixed cultures and subsequently their identification by genus and species-specific PCR was also subject of the thesis. The experimental results show that the number of viable cells of lactic acid bacteria is influenced not only by the wine grape variety, whether it is a variety of red or white wine grape, but also by the way of wine growing. The method of wine growing also had an impact on the species representation of lactic acid bacteria in each variety.
|
guest ::
