|
Gene Expression Data Analysis for in Vitro Toxicology
Šimeček, Petr
Microarray analyses have been performed on CD34-progenitor derived dendritic cells that have been exposed to chemical skin sensitizers; allergens (4) and irritants (2). The aim of this work is to identify genes whose expression is affected by exposure to the allergens but not by the irritants. The inference is based on a dataset containing 72 microarrays.
|
|
Mechanismy vývoje krevních cév v žaberní oblasti
Kolesová, Hana ; Grim, Miloš (vedoucí práce) ; Slípka, Jaroslav (oponent) ; Nečas, Emanuel (oponent)
Žabgní oblast a její cévy prochází v embryonálním vývoji rozsáhlou přestavbou, ktérá odráží také její fylogenetický vývoj. Studovali jsme mechanismy vývoje žaberní oblasti, abychom zjistili, jak se známý morfogen Sonic hedgehog (Shh) podílí na formování a přestavbě této oblasti a jejích cév. Význam Shh pro vývoj žaberní oblasti jsme posuzovali podle změn, které vyvolala jeho inhibice. Funkci Shh jsme u ptačích embryí krátkodobě inhibovali pomocí anti-Shh protilátky produkované do embrya in vivo hybridomovými buňkami 5E1; dále jsme Shh signální kaskádu inhibovali pomocí cyclopaminu. Výsledky ukazují, že Shh je nutný pro tvorbu de novo vznikajících cév v oblasti žaberních oblouků; dále také pro stabilitu cévní stěny, hlavně u vena cardinalis anterior. Shh ovlivňuje i další vývoj a přestavbu cév, jakou je například fůze aorta dorsalis, větvení arteria carotis interna a vývoj výtokového traktu srdečního. Shh nemá při krátkodobé inhibici vliv na proliferační aktivitu a apoptózu v mesenchymu žaberní oblasti. Domníváme se, že Shh ovlivňuje endotel krevních cév přímo, protože jeho receptor ptcl je exprimován v endotelových buňkách a při inhibici Shh exprese ptcl klesá. Zjistili jsme, že Shh neovlivňuje distribuci hladkých svalových buněk ve stěně cév a neovlivňuje ani expresi receptoru růstového faktoru krevních...
|
| |
|
Signální dráhy a geny regulující u prasete zrání oocytů a expanzi kumulu indukované gonadotropiny
Blaha, Milan ; Němcová, Lucie (vedoucí práce) ; Král, Jiří (oponent)
V podmínkách in vitro jsou meotické zrání prasečích oocytů a expanze kumulu indukovány FSH a peptidy rodiny EGF (AREG a EREG). FSH a tyto peptidy způsobují expresi genů spojených s expanzí kumulu (HAS2, PTGS2 a TNFAIP6). Za účelem zjistit signální dráhy, které kontrolují expanzi kumulu indukovanou FSH nebo AREG, prasečí komplexy oocyt-kumulus (COC) byly ošetřeny specifickými inhibitory proteinkináz. Inhibitory MAPK3/1, MAPK14 a ERBB1 signifikantně redukovaly expresi HAS2, PTGS2 a TNFAIP6. Tyto inhibitory rovněž snížily expresi AREG a EREG indukovanou FSH a LH v buňkách stěnové granulózy. Inhibitor PKA překvapivě neměl efekt na expresi AREG v COC, ale snížil expresi TNFAIP6 indukovanou AREG. Inhibitor PI3K zvýšil expresi AREG a PTGS2, ale snížil expresi EREG, HAS2 a TNFAIP6. Anlog cGMP (8-CPT-cGMP) neovlivnil expresi genů spojených s expanzí kumulu. Nicméně blokoval spontánní meiotickou maturaci prasečích oocytů a jeho efekt byl eliminován FSH. Klíčová slova: expanze kumulu, geny spojené s expanzí kumulu, meiotická maturace, FSH, amfiregulin, cGMP
|
|
Vliv MDOCTM na expresi buněčných adhezních molekul ve stěně cévy u apoE/LDLr-deficientních myší
Drnek, Ludvik ; Nachtigal, Petr (vedoucí práce) ; Štaud, František (oponent)
Ateroskleróza patří mezi kardiovaskulární onemocnění, které tvoří v posledních letech nejčastější příčinu morbidity a mortality ve všech ekonomicky vyspělých zemích Evropy a USA. Cílem této rigorózní práce bylo zjistit potencionální hypolipidemické a protizánětlivé účinky MDOC jako nové potenciální substance patří do skupiny dietární vlákniny. V této rigorózní práci byl použit geneticky modifikovaný kmen ApoE/LDLr deficientní myši (n=8), které byly krmeny po odstavení aterogenní dietou s obsahem 1,25% cholesterolu po dobu 8 týdnů (kontrolní skupina). V MDOC skupině byly myši krmeny stejnou aterogenní dietou, ke které bylo přidáváno 5% MDOC denně. Zvířatům byly odebrány ze srdce vzorky krve pro biochemické vyšetření. Dále byly odebrány segmenty tkáně tvořené aortou spolu s horní polovinou srdce. Dále byla provedena biochemická analýza krve a imunohistochemická a stereologická analýza exprese VCAM-1 a ICAM-1 v aortálním sinu a oblouku. Výsledky ukázaly, že podávání MDOC statisticky významně snížilo hladiny celkového cholesterolu, VLDL a navíc statisticky významně zvýšilo hladiny HDL cholesterolu Stereologická analýza imunohistochemického barvení cév ze všech zvířat ukázala, že podávání MDOC signifikantně snížilo expresi VCAM-1 v aterosklerotických plátech ve srovnání s kontrolní skupinou v oblasti...
|
|
Vliv Spirulina platensis na expresi endoteliální NO syntázy u apodeficientního myšího modelu aterosklerózy
Pešlová, Monika ; Nachtigal, Petr (vedoucí práce) ; Kopecký, Martin (oponent)
1. ABSTRAKT Spirulina platensis je modrozelená řasa patřící do cyanobakterií. Řasa je velkým zdrojem lehce zpracovatelných bílkovin, nenasycených mastných kyselin a dalších elementů, např. z makroelementů železo a vápník z mikroelementů chrom, lithium a selen. Dále obsahuje přírodní barviva chlorofyl, phycocyanin. Byly popsány její antioxidační a protizánětlivé účinky. Tato rigorózní práce se zabývala vlivem Spiruliny Platensis na parametry lipidového spektra a expresi eNOS u apoE-deficientního modelu aterosklerózy. ApoE deficientní myši (n=8) byly krmeny po odstavení standardní dietou po dobu 2 týdnů. Ve věku 8 týdnů jim začala být podávána aterogenní dieta (Western type diet) obsahovala 21% tuku (11% nasycených mastných kyselin) a 0,15% cholesterolu po dobu 8 týdnů (kontrolní skupina). Ve Spirulina platensis skupině byly myši krmeny stejnou aterogenní dietou, ke které bylo přidáváno 20 mg Spirulina platensis denně. Byla provedena biochemická analýza lipidního spektra, a dále provedena imunohistochemická a stereologická analýza exprese endoteliální NO syntázy (eNOS). Výsledky ukázaly na pozitivní vliv Spiruliny platensis na hladinu celkového cholesterolu, VLDL, LDL, přičemž triacylglyceroly byly sníženy pouze statisticky nevýznamně. Stereologická analýza imunohistochemického barvení dále prokázala, že...
|
|
Vliv Calculus Bovis na krevní lipidy a expresi endoteliální NO syntézy u apoE-deficientního myšího modelu aterosklerózy
Studená, Romana ; Nachtigal, Petr (vedoucí práce) ; Trejtnar, František (oponent)
Calculus Bovis (Niuhuang) představuje substanci používanou v tradiční čínské medicíně přes 2 tisíce let. Jedná se v podstatě o drcené sušené hovězí žlučové kameny společně s některými žlučovými kyselinami a bilirubinem. Tato rigorózní práce se zabývala vlivem Calculus Bovis na parametry lipidového spektra a aterogenezi ve stěně cévy u apoE-deficientních myší. ApoE-deficientní myši (n=8) byly krmeny po odstavení standardní dietou po dobu 2 týdnů. Ve věku 8 týdnů jim začala být podávána aterogenní dieta (Western type diet) obsahovala 21% tuku (11% nasycených mastných kyselin) a 0,15% cholesterolu po dobu 8 týdnů (kontrolní skupina). V Calculus Bovis skupině byly myši krmeny stejnou aterogenní dietou, ke které bylo přidáváno 50 mg/kg b.wt. Calculus Bovis (Artificial bezoar, Biopharma, Australia) denně. Byla provedena biochemická analýza lipidního spektra, a dále provedena imunohistochemická a stereologická analýza exprese endoteliální NO syntázy (eNOS). Podávání Calculus Bovis však nevedlo k ovlivnění parametrů lipidového spektra representovaného celkovým cholesterolem, VLDL, LDL, HDL a TAG. Podávání Calculus Bovis nevedlo ani k ovlivnění velikosti plátů, vyjádřeno plochou barvení olejovou červení. Podávání Calculus Bovis také nevedlo k ovlivnění endoteliální exprese eNOS ve stěně cévy. Tento neúspěch...
|
| |
|
Cirkadiánní rytmy u sekundární řasy Chromera velia
JONÁKOVÁ, Martina
Životní cyklus mnoha známých řas je ovlivněn cirkadiánními hodinami. Zdá se pravděpodobné, že také Chromera velia, nejbližší známý fotosyntetický příbuzný apixomplexům, používá cirkadiánní oscilátor. Testovali jsme, zda kolísání abundance bičíkatých stádií (zoospor) je řízeno cirkadiánními hodinami. Tento rytmus je stabilnídokonce i v konstantních světelných podmínkách. Dále byly osekvenovány tři geny kryptochromů a následně byly fylogeneticky analyzovány. Dv ay nich byly klasifikovány jako CRY-DASH třetí jako CRY-DASH-like. Rytmičnost exprese CRY-DASH v C. velia byla také zkoumána. Hladina exprese byla rovněž testována v konstantních světelných podmínkách . Je možné, že exprese těchto genů je spojená s cirkadiánním oscilátorem. Toto je první studie cirkadiánních hodin v C. velia.
|
| |
host ::
