|
Bioinformatic approaches to the evaluation of frequency population data based on DNA sequence polymorphisms
Milotová, Lujza ; Stenzl, Vlastimil (vedoucí práce) ; Daněček, Petr (oponent)
Tato práce se zaměřuje na problém efektivní správy dat využitelných při DNA analýze, konkrétně dat získaných z krátkých tandemových repetic v lidské DNA, které mají klíčový význam ve forenzní analýze pro identifikaci osob. Práce představuje návrh a implementaci systému pro správu a vizualizaci těchto dat z české populace, získaných Kriminalistic- kým ústavem Policie České republiky. Hlavním cílem bylo transformovat stávající datové soubory do univerzálního a snadno spravovatelného formátu, který by byl kompatibilní s existujícími forenzními databázemi. Výsledkem návrhu je transformace dat do struk- turovaného formátu a jejich následná vizualizace v tabulkovém uspořádání, což zvyšuje snadnost interpretace a manipulace s daty. Práce rovněž popisuje problémy zjištěné při zpracování dat a jejich řešení.
|
|
Nové možnosti rozlišení monozygotních dvojčat
Letková, Kristína ; Kulichová, Iva (vedoucí práce) ; Priehodová, Edita (oponent)
Nutnost rozeznání monozygotních dvojčat z genetického hlediska je důležité nejen pro určování paternity, kdy se rozhoduje, který ze dvou jednovaječných dvojčat je otcem, ale také například pro kriminální případy, v nichž je nutné identifikovat pachatele, jímž je jedno z monozygotních dvojčat. Mimo rozbor a zhodnocení molekulárně biologických metod se práce zabývá i samotnými monozygotními dvojčaty, jejich vznikem a příčinami vzniku. Téma zasahuje jak do oblasti forenzní genetiky, tak i do oblasti medicinální.
|
|
Izolace DNA z dotykových stop a její forenzní analýza
Hnyková, Tereza ; Korabečná, Marie (vedoucí práce) ; Stenzl, Vlastimil (oponent)
Dotyková DNA je ve forenzní genetice ještě stále celkem novým objevem, ale využívá se velmi často jako důkazní materiál při soudních řízení. Přesto například její definice není jednotná a zdroj DNA v dotykových stopách není kompletně prozkoumán. Tato práce tedy shrnuje všechny doposud nalezené zdroje DNA v dotykových stopách. Zároveň se zevrubně zaměří i na výzkum prováděný na těchto modelově vytvářených stopách v laboratořích a jak se získané informace mohou uplatnit v reálných případech ve forenzní praxi. Na závěr budou shrnuty metody extrakce DNA a nejlepší doposud objevené metody k izolaci DNA z dotykových stop. Klíčová slova: Dotyková DNA, Dotykové stopy, Stopová DNA, Forenzní genetika, Volná DNA, Korneocyty, Extrakce DNA, Případy, Kriminalistika
|
|
Predikce biologického věku pomocí analýzy DNA
Stokičová, Linda ; Vaněk, Daniel (vedoucí práce) ; Tomášek, Petr (oponent)
Na základě analýzy DNA lze predikovat barvu očí, vlasů a biogeografický původ jedince. Toho se využívá ve forenzní genetice, kdy neznámý pachatel zanechá biologický materiál na místě trestného činu. Předmětem výzkumů je predikce biologického věku pachatele. V současnosti ale neexistuje žádný standardizovaný model, podle kterého lze spolehlivě biologický věk jedince predikovat. Jako nejlepší metoda se jeví predikce biologického věku na základě methylace DNA, což je stabilní epigenetická modifikace. Bylo zkoumáno mnoho markerů v různých tkáních. Methylace těchto markerů koreluje s biologickým věkem, pozitivně či negativně. Methylace je tkáňově specifická, a tak nelze jeden model aplikovat na všechny tkáně. Model pro predikci biologického věku se uplatní zejména při vyšetřování a objasňování trestné činnosti, kdy neznáme identitu osoby, jež zanechala biologický materiál na místě činu či těle oběti. Klíčová slova: methylace, chronologický věk, biologický věk, analýza DNA, forenzní genetika
|
|
Forenzní analýza biologických stop a její využití ve výuce na SŠ
Hrubá, Barbora ; Ehler, Edvard (vedoucí práce) ; Hlaváčová, Lucie (oponent)
Tato diplomová práce je věnována forenzní genetice. V prvé řadě je forenzní genetika uvedena do historického kontextu. Poté je zde popsán biologický materiál a možnosti detekce biologických stop. Dále je práce zaměřena na analýzu DNA, přičemž jsou zde detailně rozpracovány používané techniky jak izolace nukleových kyselin, kvantifikace DNA, tak i varianty polymerázové řetězové reakce (PCR). Taktéž se práce zabývá i metodami získávání profilů DNA - elektroforézou a sekvenováním a jejími druhy. V neposlední řadě zde nalezneme i problematiku interpretace forenzně genetických dat. V didaktické části jsou zpracována cvičení pro studenty středních škol s forenzně biologickým tématem. Ta byla vyzkoušena v praxi v rámci biologického semináře na Jiráskově gymnáziu v Náchodě. Klíčová slova forenzní genetika, biologické stopy, didaktika biologie
|
|
Forenzní analýza biologických stop a její využití ve výuce na SŠ
Hrubá, Barbora ; Ehler, Edvard (vedoucí práce) ; Hlaváčová, Lucie (oponent)
Tato diplomová práce je věnována forenzní genetice. V prvé řadě je forenzní genetika uvedena do historického kontextu. Poté je zde popsán biologický materiál a možnosti detekce biologických stop. Dále je práce zaměřena na analýzu DNA, přičemž jsou zde detailně rozpracovány používané techniky jak izolace nukleových kyselin, kvantifikace DNA, tak i varianty polymerázové řetězové reakce (PCR). Taktéž se práce zabývá i metodami získávání profilů DNA - elektroforézou a sekvenováním a jejími druhy. V neposlední řadě zde nalezneme i problematiku interpretace forenzně genetických dat. V didaktické části jsou zpracována cvičení pro studenty středních škol s forenzně biologickým tématem. Ta byla vyzkoušena v praxi v rámci biologického semináře na Jiráskově gymnáziu v Náchodě. Klíčová slova forenzní genetika, biologické stopy, didaktika biologie
|
|
Význam repetitivních sekvencí v lékařské a forenzní genetice
Cerovská, Ela ; Daňková, Pavlína (vedoucí práce) ; Šolc, Roman (oponent)
Repetitivní sekvence jsou důležité pro genom i pro celý organismus. Tyto nekódující sekvence tvoří velkou část genomu a říká se jim "odpadní DNA". V mnoha odvětvích vědy však mají velký význam, především kvůli svému polymorfnímu charakteru, který se projevuje jak inter-, tak intraindividuálně. Předkládaná práce se zabývá významem mikrosatelitových repetic v lékařské a forenzní genetice. Některé nádory vykazují mikrosatelitovou nestabilitu (MSI) v porovnání s repeticemi zdravé tkáně. To lze použít při diagnostice rakoviny. MSI se v buňkách někdy objeví ještě před propuknutím onemocnění, což by umožnilo ranou diagnostiku. MSI je také spojena s lepší prognózou. Ve forenzní genetice se uplatňuje polymorfismus mikrosatelitů mezi jedinci. DNA profilování se využívá nejen při identifikaci osob v kriminalistice, ale i k určování otcovství nebo ochraně divokých zvířat.
|
|
Úloha polymorfních markerů DNA v identifikaci osob a určování vybraných fenotypových znaků.
Zidkova, Anastassiya ; Korabečná, Marie (vedoucí práce) ; Drábek, Jiří (oponent) ; Hradil, Roman (oponent)
V současné době probíhá intenzivní výzkum použití genetických polymorfizmů pro analýzu degradovaných vzorků, identifikaci a určení příbuznosti. Dalším výzkumným cílem je rozšíření možností forenzní genetiky směrem k determinaci biogeografického původu a s ním spojených fenotypových charakteristik, jako barva očí, vlasů a pleti. První část předkládané práce se zabývala zpracováním studie založené na vyšet- ření populačního vzorku z České republiky pomocí sady markerů Investigator DIP- plex (QIAGEN, Německo) obsahující 30 autozomálních inzerčně-delečních polymor- fizmů. Diskriminační síla (Power of Discrimination - PD), která udává pravděpodob- nost, že dvě náhodně vybrané osoby nebudou mít stejný genotyp, pro celou sadu dosáhla hodnoty 99,9999999999%. Tato část studie dospěla k výsledku, že uvedená sada markerů je vhodná jako doplňkový panel markerů pro forenzní identifikaci a určování příbuznosti v české populaci. Druhá část předkládané práce představuje studii na středochorvatském populačním vzorku pomocí sady Mentype Argus X-8 (QIAGEN, Německo) obsahující 8 poly- morfizmů krátkých tandemových repetic na chromozómu X (X-STR) rozdělených do 4 vazebných skupin. PD celé sady...
|
|
Informační systémy v identifikační genetice
Dorčáková, Terézia ; Vaněk, Daniel (vedoucí práce) ; Formanová, Dominika (oponent)
DNA analýza slúži ako vysoko efektívny nástroj identifikácie, keď biologický materiál, ktorý má byť rozpoznaný je vážne poškodený alebo nevykazuje dostatočné morfologické charakteristiky. Používa sa pre identifikáciu ľudského, ako aj iného materiálu v mnohých prípadoch, napríklad vyšetrovanie a prevencia zločinu, populačné štúdie, rodová analýza, testovanie otcovstva, rozpoznanie obetí z masových hrobov alebo záchrana ohrozených druhov. K úspešnej identifikácii je potrebné zhromažďovať a udržiavať databázy DNA profilov. Pre rôzne oblasti identifikácie sú určené špecializované databázy, ktoré obsahujú, napríklad záznamy páchateľov kriminálnych činov alebo sekvencie z iných ako ľudských zdrojov. Táto práca sumarizuje poznatky z odbornej literatúry o základných princípoch identifikácie a rodovej analýzy s použitím genetického materiálu. Ďalej sú zhrnuté najvýznamnejšie databázy zhromažďujúce DNA profily. Hoci sú výhody takýchto databáz rozsiahle, existuje veľa etických otázok a znepokojení ohľadom zneužitia informácií obsiahnutých v záznamoch ľudských jedincov. Pre pohodlné prehľadávanie databáz bol autorom vyvinutý špeciálny set nástrojov pre príkazový riadok. Tieto nástroje sú použité na predvedenie druhovej identifikácie neznámej sekvencie.
|
|
Odhad věku donora lidského biologického materiálu na základě metylace DNA
Matoušková, Laura ; Kulichová, Iva (vedoucí práce) ; Priehodová, Edita (oponent)
Metylace DNA představuje jednu z lidském těle mnoho úloh prostřednictvím umlčování genů a udržování genomové stability. Metylační změny průběhu života kumulují a současné studie poukazují to, že určitých chronologickým věkem. Metylační vzorec nemění pouze s přibývajícím věkem, může jej ovlivňovat i mnoho vnějších faktorů životním stylem a biogeografický původ jedinců. Proto je pro úspěšný odhad věku klíčové nalezení takových CpG úseků, které jsou pokud možno nezávislé na proměnných. Tato práce pojednává o problematice odhadu věku na základě analýzy metylace konkrétních lokusů DNA se zaměřením na ejí využití ve
|