|
|
Chromosomes of parasitic protist Trichomonas vaginalis
Zubáčová, Zuzana ; Tachezy, Jan (vedoucí práce) ; Alsmark, Cecília (oponent) ; Vanáčová, Štěpánka (oponent)
Univerzita Karlova v Praze Přírodovědecká fakulta Program: Biomedicína/Parazitologie Abstrakt disertační práce Chromosomy parazita Trichomonas vaginalis Mgr. Zuzana Zubáčová Školitel: Prof. RNDr. Jan Tachezy, Ph.D. Abstrakt Sekvenování genomů a přidružené proteomické studie způsobily převrat ve výzkumu v oblasti molekulární parazitologie. Postupující sekvenování jak parazitických, tak i volně žijících druhů umožňuje srovnávací a fylogenetické studie, a je rovněž zdrojem důležitých dat pro pochopení jejich základní biologie a identifikaci nových cílů terapie parazitárních nákaz. Sekvenování DNA parazita Trichomonas vaginalis překvapivě odhalilo u tohoto lidského patogena genom o velikosti až ~160 Mb. Zjistilo se, že expanze genomu je výsledkem zmnožení repetitivních sekvencí, specifických genových rodin a duplikací rozsáhlých částí genomu. Analýzou obsahu jaderné DNA u 9 příbuzných druhů trichomonád pomocí průtokové cytometrie jsem zjistila, že expanze velikosti genomu není specifická jen pro T. vaginalis, ale i ostatní druhy se vyznačují velkými genomy (86-177 Mb). Největší genomy mají zástupci rodů Trichomonas a Tritrichomonas, nejmenší genom jsme zjistili u druhu Tetratrichomonas gallinarum. Velikosti genomů trichomonád pozitivně korelovaly s objemy jejich buněk. Nepozorovali jsme korelaci mezi velikosti...
|
|
|
Reductive Evolution of Mitochondria - Related Organelles in Anaerobic Protist
Rada, Petr ; Tachezy, Jan (vedoucí práce) ; Embley, Martin (oponent) ; Eliáš, Marek (oponent)
Univerzita Karlova v Praze, Přírodovědecká fakulta Katedra Parazitologie Doktorský studijní program: Parazitologie Abstrakt k disertační práci Reduktivní Evoluce Organel Mitochondriálního Původu u Anaerobních Protist Petr Rada Školitel: RNDr. Jan Tachezy, Ph.D. Školitel-konzultant: Doc. RNDr. Ivan Hrdý, Ph.D. Praha, 2011 ABSTRAKT Trichomonas vaginalis a Giardia intestinalis patří mezi parazitacká protista skupiny Excavata. Oba prvoci obsahují anaerobní formy mitochondrie, které se nazývají hydrogenosomy (Trichomonas) a mitosomy (Giardia). Hydrogenosomy produkují vodík a ATP substrátovou fosforylací. Mitosomy představují vysoce redukovanou formu mitochondrie, nepodílejí se na energetickém metabolismu buňky a neprodukují ani ATP. Během vývoje hydrogenosomu a mitosomu došlo k přenosu genetické informace do jádra hostitelské buňky a vzniku specializovaných transportérů, které zajišťovaly přenos metabolitů, iontů a transport proteinů kódovaných jádrem zpět do organel. Do dnešní doby máme pouze velmi omezené znalosti o proteinech a mechanismech, které se podílejí na biogenezi a transportu metabolitů a proteinů přes membrány obou typů organel. Dosavadní znalosti o proteomech mitosomů pocházejí většinou z analýz genomů vybraných protist a z ověřených mitosomálních lokalizací vytipovaných proteinů. Rozhodli jsme se...
|
|
|
Iron-sulfur proteins and the role of iron in the gene expression of Trichomonas vaginalis
Horváthová, Lenka ; Tachezy, Jan (vedoucí práce) ; Rasoloson, Dominique (oponent) ; Vyoral, Daniel (oponent)
Železo je pro parazitického bičíkovce Trichomonas vaginalis jednou ze základních živin. Tento prvek je nepostradatelnou součástí železo-sirných (FeS) proteinů, které katalyzují energetický metabolismus trichomonád. FeS proteiny vznikají za pomoci specializovaného souboru proteinů zvaného "iron sulfur cluster assembly" (ISC) mašinerie. Tato mašinerie sídlí u trichomonád v hydrogenosomu. Hydrogenosomy jsou mitochondrii příbuzné organely ohraničené dvěma membránami, které zpracovávají malát a pyruvát a produkují ATP. Během zpracování genomové sekvence T. vaginalis jsme se zaměřili na získání kompletní informace o hydrogenosomálních metabolických drahách, ve kterých se uplatňují FeS proteiny. Byla vytvořena aplikace schopná in silico identifikovat N-koncové adresové sekvence u proteinů určených k doručení do hydrogenosomů. Výsledky této analýzy výrazně usnadnily anotace hydrogenosomálních genů a staly se tak základem pro sestavení nové metabolické mapy hydrogenosomu i pro následné studium hydrogenosmálního proteomu. Tyto studie vedly k identifikaci tří proteinů nazvaných HydE, Hyf a HydG, které jsou součástí takzvané Hyd mašinérie. Tato mašinérie je nutná k maturaci specifického FeS klastru, který je aktivním místem typického hydrogenosomálního proteinu hydrogenázy. T. vaginalis ja v současné době...
|
|
|
Patogenní trichomonády domácích zvířat
Vobořilová, Pavlína ; Tachezy, Jan (vedoucí práce) ; Čepička, Ivan (oponent)
Patogenní trichomonády domácích zvířat jsou anaerobní prvoci vyskytující se v trávicím a reprodukčním traktu. Způsobují většinou závažná onemocnění, která mají za následek ekonomické ztráty v hospodářství a u chovatelů. Mezi takové trichomonády se řadí Cochlosoma anatis. Parazituje ve střevech ptáků, kde je příčinou tzv. runting syndromu, enteritidy. Trichomonas gallinae postihuje zažívací trakt holubů a tyto těžké infekce představují hrozbu u volně žijících migrujících ptáků a ohrožených druhů dravých ptáků. Histomonas meleagridis představuje původce nejznámějšího, smrtelného a velice obávaného onemocnění krůt a brojlerů pro hospodářskou produkci, tzv. "blackhead disease (černohlavost)". Tritrichomonas foetus způsobuje nejvýznamnější sexuálně přenosné onemocnění tritrichomonózu skotu, které způsobuje značné ztráty hovězí produkce po celém světě. T. foetus byl nedávno identifikován také jako původce průjmového onemocnění koček. Podobně nedávno popsaný druh Tritrichomonas mobilensis pravděpodobně narušuje střevní sliznici u kotulů. Tato práce zahrnuje obecnou charakteristiku jednotlivých druhů a podrobný souhrn dosavadních znalostí popisujících jednotlivá onemocnění. Popis pojímá problematiku zdrojů a přenosu nákazy, hostitelskou specifitu parazita, rozšíření onemocnění. Shrnuje znalosti o...
|
|
|
Protein import into mitochondria and peroxisomes of parasitic protists
Žárský, Vojtěch ; Tachezy, Jan (vedoucí práce) ; Hampl, Vladimír (oponent)
Předkládaná práce vychází ze tří projektů, kterým je společný zájem o evoluci eukaryotických organel a molekulárních systémů importu proteinů. První projekt poukazuje na možnost, že se peroxisomy (typické organely aerobních eukaryot) zachovaly u anaerobní skupiny Archamoebae, která zahrnuje parazita Entamoeba histolytica a volně žijícího prvoka Mastigamoeba balamuthi. Nejsilnějším vodítkem byl nález proteinů homologních ke známým komponentám peroxisomálního importu proteinů. Cílem druhého projektu je charakterizovat neznámou proteinovou translokázu vnitřní membrány mitosomů (redukovaných mitochondrií) u anaerobního prvoka Giardia intestinalis, kde se podařilo objevit podjednotku Tim44 této translokázy. Poslední projekt ukazuje, že translokáza vnější mitochondriální membrány trypanosomatid je příbuzná typické eukaryotické translokáze Tom40. Toto zjištění je důležité, neboť nepřítomnost Tom40 byla dříve považována za jeden z ancestrálních znaků trypanosomatid.
|
|
| |
|
| |
|
|
Evoluce eukaryotických ABC transportérů
Žárský, Vojtěch ; Doležal, Pavel (oponent) ; Tachezy, Jan (vedoucí práce)
V posledních dvaceti letech probíhal intenzivní výzkum v oblasti ABC transportérů. Zájem o tyto membránové transportéry je zapříčiněn především tím, že některé ABC transportéry hrají roli v rezistenci rakovinných buněk a patogenů vůči používaným léčivům. Tento lékařský aspekt ABC transportérů byl ve výzkumu pochopitelně výrazně upřednostňován. Z pohledu obecných fyziologických funkcí a evoluce byly pak ABC transportéry přehlíženy. V této práci se proto zaměřuji na evoluci eukaryotických ABC transportérů, přehled ABC transportérů parazitických protist a na mitochondriální ABC transportéry, které jsou nejkonzervativnějšími eukaryotickými ABC transportéry.
|
|
| |
|
|
The essential processes of FeS cluster assembly and mitochondrial protein import in parasitic protists
Šmíd, Ondřej ; Tachezy, Jan (vedoucí práce) ; Hampl, Vladimír (oponent) ; DYALL, Sabrina D. (oponent)
CONCLUSIONS Mitochondria appear to be vital organelles for all eukaryotic organisms known to date. A large body of evidence strongly indicates that hydrogenosomes and mitosomes, the organelles of anaerobic or intracellular parasitic protists lacking the "typical" mitochondria, are only a variation on the mitochondrial theme. However, even though the three organelles are evolutionarily the same entity, remarkable differences exist between them that reflect the adaptation of the organisms to their specific niches. In the thesis I tried to unravel some aspects of the essential mitochondrial processes of FeS cluster assembly and mitochondrial protein import in parasitic protists T. brucei and G. intestinalis. We investigated the function of the T. brucei cysteine desulfurase IscS and the scaffold protein IscU. We demonstrated that the two proteins are essential for FeS cluster formation and consequently the viability of the procyclic stage of T. brucei. Even though both IscS and IscU were specifically localized to the mitochondrion, their deficient expression affected the maturation of FeS proteins operating not only in the mitochondrion, but also in the cytosol. This indicates that a crucial part of FeS cluster assembly is localized to the mitochondrion of T. brucei. One of the major differences between the T....
|
host ::
RSS.