|
|
Studium biologické funkce nádorového supresoru HIC1
Hlavatá, Adéla ; Kořínek, Vladimír (vedoucí práce) ; Macůrková, Marie (oponent)
Souhrn Nádorový supresorový gen HIC1 kóduje transkripční represor z rodiny BTB/POZ. Ve velkém množství nádorů bývá často umlčován hypermetylací svého promotoru. HIC1 je také negativním modulátorem kanonické signální dráhy Wnt, jež se významně podílí na regulaci sebeobnovy kmenových buněk střevní výstelky. Střevní výstelka je díky své stavbě vhodnou modelovou tkání pro výzkum kmenových buněk a jejich patologie. Protože kompletní "knock-out" myšího genu Hic1 je embryonálně letální, byla biologická funkce tohoto genu zkoumána pomocí podmíněné delece v dospělosti. Expresní čipovou analýzou myších embryonálních fibroblastů jsme zjistili řadu nových cílových genů Hic1, z nichž nejzajímavějším v souvislosti s rakovinou jsme shledali gen Toll-like receptor 2. Na regulaci exprese těchto cílových genů má pravděpodobně vliv i p53, ačkoliv přímé působení nebylo potvrzeno. Hic1 ovlivňuje zastoupení typů diferencovaných buněk ve střevním epitelu pomocí regulace Atoh1. Po vyřazení Hic1 ve střevním epitelu jsme pozorovali a kvantitativně potvrdili zvýšené množství pohárkových buněk. Ovlivnění dráhy diferenciace epiteliálních buněk může být jedním ze způsobů, kterým Hic1 plní i funkci potlačování nádorů.
|
|
|
Wnt signaling inside out
Doubravská, Lenka ; Kořínek, Vladimír (vedoucí práce) ; Stopka, Tomáš (oponent) ; Krylov, Vladimír (oponent)
Signální dráhy jsou molekulární nástroje buňky zprostředkující odpovědi na vnitřní i vnější podněty, které mohou následně vést k buněčnému dělení nebo diferenciaci na jedné straně, stejně jako k buněčné smrti na straně druhé. Molekulární síť různých signálních drah umožňuje mezibuněčnou komunikaci, a tudíž může celý organismus existovat a koordinovaně fungovat. Signální dráha Wnt patří mezi evolučně staré a konzervované molekulární dráhy a účastní se celé řady dějů během vývoje. Navíc je nezbytná pro udržování dospělých tkání, protože se podílí na jejich regeneraci. Mnohá zhoubná onemocnění, související s nefunkčními komponentami dráhy Wnt, představují temnější úhel pohledu. Tato práce je postavena na čtyřech níže uvedených publikacích, které se týkají různých buněčných úrovní dráhy Wnt. Nejdříve je zmíněna práce o ligandu Wnt, jež stojí na samém začátku signalizace, na plazmatické membráně buňky. Dále jsme se zabývali fenoménem přežívajících leukemických buněk, vyvolaném fibroblasty produkujícími protein Wnt po indukci apoptózy ligandem TRAIL. Poslední dvě publikace ukazují nové komponenty Wnt signalizace a uvedou nás do buněčného jádra - až "na dno" celé dráhy. 1. Fatty acid modification of Wnt1 and Wnt3a at serine is prerequisite for lipidation at cysteine and is essential for Wnt signalling....
|
|
|
Regulatory mechanisms of WNT signalling
Pospíchalová, Vendula ; Kořínek, Vladimír (vedoucí práce) ; Trka, Jan (oponent) ; Bryja, Josef (oponent)
AB S úspěšno v této si rakovin β signaliz na velm transkrip komplex vstupuje dráhu sp úrovníc P nepublik publikac o poziti studie c buňkách dvou m Hic1 in HIC1, o transkrip střevním zvýšeno V řídící vý BSTRAKT Signální drá ou embryog ignální dráz ny. β-katenin je zace Wnt/β- mi nízké ú pce cílovýc x je degrad e do jádra, pecifickými h regulován Podkladem kovaná dat ce se zaměř ivním vlivu charakterizu h střevního myších kmen vivo. Závěr o interakci p pčního repr m epitelu, c ou citlivost k Věřím, že n ývoj živočic T áha Wnt je genezi, regen ze tudíž ved e hlavním v -katenin). V úrovni neu ch genů pro dační kompl kde vytvář i, a spouští t na celkově a pro předk ta, jež maj řuje na pořa u jaderné b uje protein epitelu exp nů s cílenou rečná kapit polypeptidu resoru HIC1 což má za n k rakovinné naše výsled chů. jednou z h neraci tkání dou ke vznik vnitrobuněč V nestimulov stálou degr oto neprobí lex inaktivo í komplexy tak expresi až stovkou r kládanou di í za cíl lé adí posttrans bílkoviny D TROY jak primujicích u změnou v ola obsahuj u HIC1 se č 1 a v neposl následek ne ému bujení. dky přispěly hlavních ce í a homeost ku vrozený čným prostř vaných buňk radací za íhá. Naopak ován a hladi y s transkrip cílových ge různých fak isertační pr épe porozum slačních úp Dazap2 na h ko nový inh LGR5. Pos v genu Hic1 je...
|
|
|
Kmenové buňky v tkáních savců - pohled do minulosti a současný stav poznání
Hlavatá, Adéla ; Kořínek, Vladimír (vedoucí práce) ; Krylov, Vladimír (oponent)
V dospělém savčím organismu je sebeobnova tkání zajištěna aktivitou kmenových buněk. V rámci epitelu tenkého střeva jsou kmenové buňky, na rozdíl od většiny ostatních tkání, poměrně přehledně uspořádány. Mimo to je epitel tenkého střeva pro studium kmenových buněk vhodný i z hlediska své pravidelné struktury a vysoké rychlosti sebeobnovy. Jedny z prvních poznatků o kmenových buňkách střevního epitelu byly získány z experimentů zahrnujících generování embryonálních agregačních chimér a transgenních chimér myši. Zásadní význam pro studium mělo objasnění vlivu signalizace Wnt na kontrolu dynamiky linií kmenových buněk a s tím související objev jedinečného markeru kmenových buněk střevního epitelu proteinu Lgr5. Hlavním nástrojem výzkumu se následně staly geneticky modifikované myši s modifikovaným lokusem Lgr5. Názory na konkrétní identitu a organizaci dělení střevních epiteliálních kmenových buněk zůstávají dosud sporné. klíčová slova: kmenové buňky, CBC buňky, střevní epitel, chiméra, signalizace Wnt, Lgr5, "reportérové" myši
|
|
|
The role of transcription factors PU.1 a GATA-1 during leukemia differentiation.
Burda, Pavel ; Stopka, Tomáš (vedoucí práce) ; Kořínek, Vladimír (oponent) ; Machová Poláková, Kateřina (oponent)
Hematopoéza neboli krvetvorba je proces regulovaný transkripčními faktory, mezi nimiž hrají klíčovou roli molekuly PU.1 (Spi1, Sfpi1) a GATA-1. GATA-1 a PU.1 se mohou na DNA vzájemně vázat a blokovat tím své transkripční programy. Myší erytroleukemické buňky (MEL) jsou transformované erythroidní prekurzory zablokované v pokročilejším stádiu erythroidní diferenciace, současně exprimují PU.1 i GATA-1 a lze u nich navodit erytroidní diferenciaci snížením hladiny PU.1 či zvýšení hladiny GATA-1 v jádře. Ve své práci ukazuji, že v MEL buňkách je PU.1 dependentní transkriptom negativně regulovaný pomocí GATA-1. Tuto represi a následně možnou derepresi podrobněji popisuji na genech Cebpa a Cbfb, které kódují další důležité hematopoetické transkripční faktory. Pomocí chromatinové imunoprecipitace a reportérových esejí jsme identifikovali vazebné sekvence DNA pro vazbu PU.1 na genech Cebpa a Cbfb, na nichž jsme v leukemických blastech detekovali současně faktory PU.1 i GATA-1. Regulace transkripce těchto genů manipulací hladiny PU.1 a GATA-1 zahrnuje kvantitativní změny úrovně acetylace H3K9, známky transkripčně aktivního chromatinu. Data jsou podpořena experimenty ukazujícími, že signifikantní derepresi genů Cebpa a Cbfb lze v MEL buňkách dosáhnout jak aktivací PU.1, tak i inaktivací GATA-1. Má disertační práci...
|
|
|
Tumour Suppressor HIC1 - a novel inhibitor of Wnt Signalling
Pospíchalová, Vendula ; Filipp, Dominik (oponent) ; Kořínek, Vladimír (vedoucí práce)
1. ABSTRACT In all metazoan organisms Wnt ligands regulate various developmental and physiological processes during embryogenesis and also in adult tissues. Moreover, deregulation in Wnt-related signalling is associated with several human disorders including cancer. In the so-called canonical pathway, activation of the Wnt receptor complex Frizzled/LRP triggers a complex network of molecular events that ultimately lead to the stabilization of β-catenin and formation of TCF/β- catenin heterodimers in the nucleus. These protein complexes drive expression of a specific set of genes that control the cell fate decision. The Wnt pathway is tightly regulated by several mostly negative feedback loops involving scores of extracellular, cytoplasmic or nuclear proteins. Recently, we have identified tumour suppressor Hypermethylated in cancer 1 (HIC1) as a negative modulator of canonical Wnt signalling. The HIC1 gene encodes a BTB/POZ-zinc finger transcriptional repressor. Interestingly, the HIC1-dependent repression of the TCF/β-catenin- dependent genes is not mediated by direct association of HIC1 with the regulatory regions of the Wnt-responsive genes but rather by a sequestration of TCF/β-catenin complexes to the nuclear speckle-like structures - the HIC bodies. These data indicate quite a pleiotropic role of HIC1...
|
|
| |
|
|
Morfologická a genetická variabilita druhu Chydorus sphaericus (Crustacea, Cladocera) v závislosti na prostředí
Matušková, Ludmila ; Kořínek, Vladimír (oponent) ; Sacherová, Veronika (vedoucí práce)
Úvod 5 ABSTRACT Genus Chydorus or more specifically the species of Chydorus sphaericus represents an extremely tolerant freshwater organism, which occurs in littoral zone of almost all kinds of aquatic habitats all over the world. It is usually associated with submerged macrophytes or substrate and also plays a key role in food webs of both vertebrate (fish) and invertebrate predators. Not only is this species in most localities the most common chydorid, but it is quite often the most common filtering cladoceran. Moreover, due to its little morphological variation most small globular representatives of the genus Chydorus were in the past all incorrectly ascribed to Chydorus sphaericus. However, thanks to more detailed studies it was suggested that so called species Chydorus sphaericus was not in fact a single taxonomic entity, but a group of several closely related species. It is clear today that for correct taxonomic desision it is necessary to combine all ecological, morphological, and genetic methods. The aim of this study was to explore genetical and morphological variation in populations of Chyrodis sphaericus from localities representing different sets of environmental factors. Four model localities were chosen: eutrophic ponds, temporary pools, mountain lakes and waterbodies affected by mining...
|
|
| |
|
| |
host ::
RSS.