|
|
Evolutionary Analysis of Cystatins of Early-Emerging Metazoans Reveals a Novel Subtype in Parasitic Cnidarians
KYSLÍK, Jiří
The evolutionary aspects of cystatins are greatly underexplored in early-emerging metazoans. Thus, we surveyed the gene organization, protein architecture, and phylogeny of cystatin homologues mined from 110 genomes and the transcriptomes of 58 basal metazoan species, encompassing free-living and parasite taxa of Porifera, Placozoa, Cnidaria (including Myxozoa), and Ctenophora. We found that the cystatin gene repertoire significantly differs among phyla, with stefins present in most of the investigated lineages but with type 2 cystatins missing in several basal metazoan groups. Similar to liver and intestinal flukes, myxozoan parasites possess atypical stefins with chimeric structure that combine motifs of classical stefins and type 2 cystatins. Other early metazoan taxa regardless of lifestyle have only the classical representation of cystatins and lack multi-domain ones. Our comprehensive phylogenetic analyses revealed that stefins and type 2 cystatins clustered into taxonomically defined clades with multiple independent paralogous groups, which probably arose due to gene duplications. The stefin clade split between the subclades of classical stefins and the atypical stefins of myxozoans and flukes. Atypical stefins represent key evolutionary innovations of the two parasite groups for which their origin might have been linked with ancestral gene chimerization, obligate parasitism, life cycle complexity, genome reduction, and host immunity.
|
|
|
Trade-offs in parasitoid resistance and competitive ability in Drosophila
SIDWELL, Jeni
Trade-offs in fitness traits in Drosophila were studied in a laboratory environment. Fly and wasp lines originated from an ecological community in a tropical rainforest in Queensland, Australia and were established in České Budějovice. Experimental evolution was used to impose selective pressures on populations of flies to select for parasitoid resistance and competitive ability. The selection regimes were followed by two separate phenotyping experiments to measure the resulting phenotypic changes and impose novel conditions to the evolved flies in order to identify trade-offs.
|
|
|
The Mitochondrial Contact Site and Cristae Organization System and F1FO-ATP Synthase Crosstalk is a Fundamental Property of Mitochondrial Cristae
CADENA, Lawrence Rudy
The acquisition of mitochondria from an endosymbiont closely related to extant alphaproteobacteria occurred prior to the divergence of modern eukaryotes. Since then, diverse eukaryotes have not only developed a number of different mechanisms to adapt to their environment regarding growth and proliferation, but perpetuated certain traits that have persisted for eons. This thesis postulates an ancestral mechanism for cristae development in mitochondria involving interplay between two cristae shaping protein complexes, the Mitochondrial Contact Site and Cristae Organization System and F1FO-ATP Synthase, that has remained conserved throughout eukaryotic diversification for over 2 billion years.
|
|
| |
|
|
Dublety v současné francouzštině
DANGOVÁ, Phuong Thanh
Tato bakalářská práce se zabývá dublety v současné francouzštině. Práce je rozdělena do dvou hlavních částí - teoretické a praktické. První část si klade za cíl popsat vývoj francouzského jazyka v diachronním pohledu, vysvětlení pojmu dublety a jejich dělení. Praktická část spočívá v analýze úzu vybraných dublet v lingvistickém korpusu v průběhu staletí.
|
|
|
Jsou parmy obecné v době výtěru "jedovaté" pro ostatní vodní organismy?
ŠVEJDA, Pavel
Tato bakalářská práce se zabývá problematikou toxicity u ryb s důrazem na parmu obecnou Barbus barbus (Linnaeus, 1758), jejíž tkáně a především jikry způsobují člověku po požití otravu známou jako "parmová cholera". V této práci bylo zkoumáno její možné letální toxické působení na pokusné organismy, jimiž se pro účely experimentu stali blešivec ježatý Dikerogammarus villosus (Sowinsky, 1894), rak mramorovaný Procambarus virginalis Lyko, 2017 a hlaváč černoústý Neogobius melanostomus (Pallas, 1814). Z důvodu nejasné distribuce případného toxinu v těle byly k experimentu použity různé typy tkání a raná vývojová stádia parem obecných. Dále bylo prostřednictvím behaviorálního testu monitorováno, zda může být toxická látka v těle parem obecných potenciálním konzumentem detekována a zohledněna při výběru potravy. Modelovým druhem tohoto testu se stal rak mramorovaný. Výsledky testů vylučují možnost letální otravy jako následek požití tkání či raných vývojových stádií parem obecných pro studované zástupce. Z výsledků této práce je zřejmé, že toxin přítomný u parmy obecné nepůsobí pozorovatelnými negativními účinky na žádného ze tří druhů pokusných organismů a tedy potenciálně žádného zástupce vodních bezobratlých, raků i ryb. Výsledky tak naznačují spontánní původ toxického působení cypridinu na lidský, popř. jiný savčí organismus. Zároveň však není možné vyloučit adaptaci přirozených predátorů a dekompozitorů k toxinu vlivem dlouhé koevoluce těchto druhů či jejich fylogenetických předků.
|
|
|
\kur{Apodemus} vs. \kur{Eimeria}: Evolutionary factors of speciation and genomic diversification in host-parasite system
MÁCOVÁ, Anna
This thesis discusses and explains phylogenetic patterns observed in two different organisms: Eimeria, an unicellular parasite, and Apodemus, a rodent that often serves as a host for this parasitic species. The situation in rodents is intuitive, clearly reflecting their biogeographic history. Phylogenetic pattern in A. agrarius corresponds with its spread from the core locality of its distribution eastward. The lack of the genetic variability in European populations hints the recent origin of this population with the low number of founders. The phylogeny of A. flavicollis, a rodent inhabiting almost the whole Europe, reflects the situation during the last glacial maximum (i.e. speciation in several subpopulations that did not interbreed, but retained their independent nature). The situation in Eimeria is more complex. Parasites always fight in "arm races", trying to accommodate to their hosts as best they can, and to avoid their defense. This results in coevolutionary events such as cospeciation, host switches, duplications, and other events that form the genetic variability in parasites. The study of evolutionary relationships in Eimeria may be difficult due to lack or morphological and/or relevant molecular data. This thesis adds more information to this view. Several other studies were also included in this thesis to provide a broader picture of the complexity of host-parasite systems.
|
|
|
Existence daná darem: Teologická analýza pojmu "élan vital" v díle Henriho Bergsona
Filip, František ; Novotný, Vojtěch (vedoucí práce) ; Svoboda, David (oponent)
Tématem diplomové práce "Existence daná darem: Teologická analýza pojmu ‚élan vital' v díle Henriho Bergsona je analýza pojmu životní vzmach francouzského filosofa Henriho Bergsona, jejímž cílem je prověřit možný přínos tohoto konceptu pro současnou teologii a pro lidskou společnost jako takovou. Kompozice práce je tvořena pěti základními částmi, které korespondují s hlavními kapitolami. První kapitola je věnována životu Henriho Bergsona. Námětem druhé kapitoly je rámcové představení Bergsonovy metody a hlavních myšlenek Bergsonova díla. Třetí kapitola je zaměřena přímo na pojem životní vzmach tak, jak se objevuje a je postupně rozvíjen v rámci Bergsonova díla. Předmětem čtvrté kapitoly je pak shrnutí recepce ideje životního vzmachu. Závěrečná kapitola pak na základě teologické recepce prověřuje potenciální přínos tohoto pojmu pro dnešní teologickou diskuzi a život lidské společnosti. Práce dochází k závěru, že ačkoli pojem životního vzmachu staví na dnes již překonaných vědeckých zjištěních, může zůstávat trvale inspirujícím, pokud se budeme zamýšlet nad tím, co chtěl autor jeho prostřednictvím o skutečnosti našeho světa vyjádřit.
|
|
|
How can Factors Underlying Human Preferences Lead to Methods of Formal Characterizations towards Developing Safe Artificial General Intelligence?
Al-Nusair, Rana Ghalib ; Špelda, Petr (vedoucí práce) ; Butler, Eamonn (oponent) ; Biagini, Erika (oponent)
This research aims to investigate the Artificial Intelligence (AI) value alignment problem, which refers to the challenge in developing a safe and reliable AI that can achieve our goals and adhere to our values as we intend it to do. A misaligned AI, especially one which transcends all domains of cognitive abilities and has acquired vast computational powers, will be nearly impossible to manage and it will threaten our security. Research addressing this problem is now focused on understanding how to develop AI that can reliably infer our values from our preferences. Thus, preferences are the primary conceptual unit of analysis to the AI value alignment problem. This paper investigates our preferences and seeks to shed light on the issue of obtaining a formal truth that is fundamentally constitutive of our preferences, for the aim of using said formal truth to create a value aligned AI. To do this, this paper gathers data from economics, biological evolution, and neurocognitive studies to bridge the current gaps on the conceptual problem of preferences. The paper concludes with presenting a new kind of security dilemma which stems from the notion of combining a general theoretical framework that fully captures our preferences with the crucial elementof uncertainty inAI, effectively showcasing how...
|
|
|
Cross-cultural perception of sexual dimorphism in human face
Fiala, Vojtěch ; Kleisner, Karel (vedoucí práce) ; Králík, Miroslav (oponent) ; Lobmaier, Janek Simon (oponent)
Evoluční psychologie předpokládá, že lidské chování se skládá z funkčních a vzájemně propojených adaptivních nástrojů, které pomáhají jedinci přežívat a rozmnožovat se. Takovým adaptivním nástrojem může být lidská tendence připisovat ostatním psychologické charakteristiky na základě rysů obličeje. Pohlavní typičnost obličeje, individuální zastoupení rysů obličeje s ohledem na dané pohlaví (muž/žena), ovlivňuje další připisované vlastnosti. Tématem této práce je potenciální funkční souvislost mezi pohlavně dvojtvárnou strukturou obličeje, vnímanou pohlavní typičností a fyziologickými a behaviorálními koreláty. Práce je uvozena literární přehledem. Za ním následují tři již publikované studie (Studie 1-3). Studie 4, odevzdaný rukopis, neprošla dosud recenzí a nebyla publikována. Pátá studie, též již zveřejněná, je uvedena jako "Apendix". Studie 1 (Fiala a kol. 2021) porovnávala vliv vnímané "pohlavní typičnosti" a měřené tvarové pohlavní dvojtvárnosti na hodnocení atraktivity v pěti vzdálených zemích. Hodnotitelé a stimuly pocházeli vždy ze stejné země. Vnímaná femininita žen byla napříč zeměmi považována za atraktivní. Naproti tomu jsme odhalili značné mezikulturní rozdíly v preferenci vnímané mužské maskulinity. Také vliv tvarové pohlavní dvojtvárnosti se lišil mezi kulturami i pohlavími. Studie 2...
|
host ::
RSS.