|
Rekombinantní viry vakcinie určené pro nádorovou terapii; analýza biologických a biochemických vlastností
Žůrková, Kamila
SOUHRN Virus vakcínie lze využít pro vyvolání imunitní reakce proti virem produkovanému heterolognímu proteinu a organismus tak připravit na obranu proti přirozenému producentu tohoto antigenu, např. viru nebo nádorových buněk. V naší laboratoři jsou vyvíjeny vakcíny proti nádorům způsobeným lidským papilomavirem typu 16 (HPV16). Používají se rekombinantní viry vakcínie odvozené z replikujícího se kmene P13 nebo atenuovaného MVA. Rekombinantní viry byly použity v profylaktických i terapeutických schématech léčby u myšího modelu nádorových buněk TC-1 či TC-1/A9. Rekombinanty exprimovaly papilomavirový onkogen E7 ve formě vysoce imunogenního SigE7LAMP fúzního konstruktu. Pro podporu imunitního systému byly do virů vloženy navíc i geny pro stimulační cytokiny GM-CSF nebo Flt3 ligand, které vykazují adjuvantní vlastnosti při vyvolání protinádorových odpovědí. Pro imunomodulaci nádorového mikroprostředí byly do rekombinantních virů vloženy geny pro solubilní receptory pro TGF-β, jejichž funkcí bylo snížit inhibiční vliv nádorového cytokinu TGF-β. Intratumorální či intraperitoneální podání virů vedlo ke zvýšení protinádorové odpovědi, u virů exprimujících Flt3 ligand také ke zvýšení počtu cytotoxických E7-specifických T lymfocytů. Exprese GM-CSF a Flt3 ligandu zabránila vzniku supresorových MDSC buněk, ale...
|
|
Modern Asymptotic Perspectives on Errors-in-variables Modeling
Pešta, Michal
Univerzita Karlova v Praze Matematicko-fyzikální fakulta ABSTRAKT DISERTAČNÍ PRÁCE Michal Pešta MODERNÍ ASYMPTOTICKÉ PERSPEKTIVY PRO MODELOV ÁNÍ CHYB V POZOROV ÁNÍCH Uvažujeme lineární regresní model, kde kovariáty a odezva jsou měřeny s chybou. Pro takzvaný mo- del s chybami v měřeních (EIV) jsou navrženy vhodné struktury chyb, přědvedeny jsou různé techniky odhadování neznámých parametrů a zhrnuty jsou aktuální algebraické a statistické výsledky. Vynalezli jsme zobecnění odhadu založeného na úplně nejmenších čtvercích (TLS) v EIV modelu, tzv. EIV odhad. Odvozeny jsou jeho invariance (vzhledem k měřítku) a ekvivariance (vzhledem k rotaci kovariát, ke změne orientaci kovariát a k záměně kovariát). Navíc jsme ukázali, že EIV odhad je unitárně invariantní řešení EIV optimalizačního problému. Demonstrujeme, že asymptotická normalita EIV odhadu je z výpočetního hlediska nevhodná pro kon- strukci intervalu spolehlivosti nebo pro testování hypotéz. Je zkonstruována správná bootstrapová pro- cedura, aby překonala takový problém. Je dokázána její validita. Simulační studie a příklad s reálnýma daty potvrzují její vhodnost. Předpokládáme, že chyby tvoří slabý nebo stejnoměrně slabý mixing a tedy už nejsou...
|
|
Rekombinantní viry vakcinie pro nádorovou terapii, analyza biologickych a biochemickych vlastností.
Žůrková, Kamila ; Němečková, Šárka (vedoucí práce) ; Forstová, Jitka (oponent) ; Trejbalová, Kateřina (oponent)
150 7 SOUHRN Virus vakcínie lze využít pro vyvolání imunitní reakce proti virem produkovanému heterolognímu proteinu a organismus tak připravit na obranu proti přirozenému producentu tohoto antigenu, např. viru nebo nádorových buněk. V naší laboratoři jsou vyvíjeny vakcíny proti nádorům způsobeným lidským papilomavirem typu 16 (HPV16). Používají se rekombinantní viry vakcínie odvozené z replikujícího se kmene P13 nebo atenuovaného MVA. Rekombinantní viry byly použity v profylaktických i terapeutických schématech léčby u myšího modelu nádorových buněk TC-1 či TC-1/A9. Rekombinanty exprimovaly papilomavirový onkogen E7 ve formě vysoce imunogenního SigE7LAMP fúzního konstruktu. Pro podporu imunitního systému byly do virů vloženy navíc i geny pro stimulační cytokiny GM-CSF nebo Flt3 ligand, které vykazují adjuvantní vlastnosti při vyvolání protinádorových odpovědí. Pro imunomodulaci nádorového mikroprostředí byly do rekombinantních virů vloženy geny pro solubilní receptory pro TGF-β, jejichž funkcí bylo snížit inhibiční vliv nádorového cytokinu TGF-β. Intratumorální či intraperitoneální podání virů vedlo ke zvýšení protinádorové odpovědi, u virů exprimujících Flt3 ligand také ke zvýšení počtu cytotoxických E7-specifických T lymfocytů. Exprese GM-CSF a Flt3 ligandu zabránila vzniku supresorových MDSC buněk, ale...
|
|
Syntéza derivátů beta-cyklodextrinu pro medicinální aplikace
Popr, Martin ; Jindřich, Jindřich (vedoucí práce) ; Veselý, Jan (oponent)
Syntéza monosubstituovaných derivátů β -cyklodextrinu pro medicinální aplikace Abstrakt Tato diplomová práce se zabývá syntézou série derivátů β-cyklodextrinu, které jsou potenciálně využitelné pro konstrukci kontrastních látek MRI nové generace. Základní skelet β-CD je nejprve selektivně persubstituován v polohách 6 a vybaven azidovými skupinami. V dalších krocích je per-6-azido-β-CD monosubstituován na sekundárním okraji makrocyklu. Jako vhodná činidla pro derivatizaci byly vybrány (E)-cinnamylbromid a propargylbromid. Monosubstituční reakce poskytuje vždy dva regioisomery, se substituentem v poloze 2I -O- a 3I -O-. Tyto se podařilo, po následné peracetylaci zbylých hydroxylových skupin, od sebe úspěšně separovat pomocí sloupcové chromatografie. Deriváty s cinnamylovou skupinou byly následně oxidativně převedeny na 2I -O-, 3I -O-formylmethyl- a 3I -O-karboxymethyl- deriváty. Dále byla ověřena možnost spojení derivátu obsahující aldehydovou funkci s vhodným substrátem pomocí reduktivní aminace. Klíčová slova: cyklodextriny, monosubstituce, cinnamyl, propargyl, formylmethyl, karboxymethyl, reduktivní aminace, kontrastní látky, tomografie magnetické rezonance
|
|
Molekulárně-biologická charakterizace M viru bramboru a viru svinutky bramboru
Vaculík, Petr ; Čeřovská, Noemi (vedoucí práce) ; Fousek, Jan (oponent)
Diplomová práce má tři hlavní cíle: 1. Sekvenční analýza M viru bramboru (PVM) českého izolátu VIRUBRA 4/009 a fylogenetická analýza izolátů PVM 2. Bakteriální exprese rekombinantního pohybového proteinu TGB1 PVM českého izolátu VIRUBRA 4/007 3. Příprava binárního vektoru pGREEN-0029 s expresní kazetou kapsidového proteinu viru svinutky bramboru (PLRV) a jeho transformace do bakterie Agrobacterium tumefaciens V teoretické části je popsáno taxonomické zařazení, morfologie, struktura genomu a způsob přenosu PVM a PLRV. Dále je popsána bakteriální exprese rekombinantních proteinů, principy uplatňující se při tvorbě transgenních rostlin rezistentních k virům a transgenoze prostřednictvím Agrobacterium tumefaciens. Empirická část zahrnuje metody práce s DNA (např. immuno-capture, reverzní transkripce, polymerázová řetězová reakce, TA klonování) a metody práce s proteiny (např. ELISA, SDS-PAGE, Western blot). Sekvenční analýzou byly získány úplné nukleotidové sekvence čtecích rámců pro pohybové proteiny (TGB1, TGB2 a TGB3), kapsidový protein a "NA-binding" protein PVM izolátu VIRUBRA 4/009. Fylogenetickou analýzou kapsidových proteinů izolátů PVM bylo zjištěno, že izolát VIRUBRA 4/009, jako jediný z evropských a asijských izolátů, patří společně s americkými izoláty do jedné evoluční skupiny....
|
|
Diferencovatelnost inverzního zobrazení
Konopecký, František ; Hencl, Stanislav (vedoucí práce) ; Honzík, Petr (oponent)
V práci dokazujeme výsledek, že pokud pro ∈ ℕ a ≥ 1 bilipschitzovské zobrazení náleží do +1, loc ∩ ,∞ loc , tak náleží do +1, loc i jeho inverze −1 . Obdobné tvrzení dokazujeme i pro prostory loc. K tomuto účelu je v práci vybudováno nové uspořádání -tých parciálních derivací do zobecněné Jakobiho matice, díky níž můžeme vhodně deri- vovat matice. Zobecněná Jakobiho matice je navržena tak, aby bylo zachováno řetízkové pravidlo a bylo možné derivovat i součin matic. 1
|
|
Výroková logika a algebra
Polach, František ; Krajíček, Jan (vedoucí práce) ; Pudlák, Pavel (oponent)
Algebraic proof systems of which the most important are the polynomial calculus and the Nullstellensatz proof system are proof systems that use algebraic means for proving propositional tautologies - they are based on polynomial identities over (commutative) rings. Razborov [9] have proved a non-trivial lower bound on degree for polynomia calculus proofs of the tautologies (a set of polynomials) that express the pigeonhole principle over any field. This work gathers present important results for algebraic proof systems and generalizes the Razborov's construction used in his proof of the lower bound to another set of polynomials. We explicitly describe the basis of the vector space of polynomials that are derivable by a small degree polynomial calculus proof from the tautologies that express a variant of the pigeonhole principle (that generalizes the principle for multifunctions).
|
|
Letokruhová chronologie smrku pro východní Krkonoše
Janda, Martin ; Kolář, Tomáš (oponent) ; Treml, Václav (vedoucí práce)
4 PŘEDMLUVA Předložená diplomová práce je výsledkem úsilí, které, ač nenavázalo přímo na bakalářskou práci, bylo naplňováno neméně zajímavou a rozmanitou činností. Zaměřil jsem se na oblast mne důvěrně známou, východní Krkonoše. Jde o region, který se zároveň vyznačuje dlouhou tradicí fyzickogeografického výzkumu. Práce na tuto tradici navazuje a snaží se ji obohatit uplatněním dendrochronologických přístupů. Velký podíl na tom mají níže uvedené osoby, kterým patří poděkování i za to, že se pro mě dendrochronologie stala víc než pouhou "povinností". Na prvním místě patří velký dík Václavu Tremlovi, který mě zasvětil do teoretických i praktických základů dendrochronologie a práci od začátku do konce vedl na diskuzním základu. Pavlu Klimešovi děkuji za pomoc ve výběru krkonošských chalup a bud pro odběr historických vzorků a konzultaci řady dalších problémů. Kromě něj děkuji také majitelům všech ostatních jedinečných stavení za umožnění přístupu a bezproblémového odběru vývrtů. Dále bych rád poděkoval Tomáši Kynclovi za zodpovězení závažných dendrochronologických otázek i poskytnutí smrkových standardů, Otakaru Schwarzovi za sdělení informací o nejstarších krkonošských smrkových porostech, Ivanu Sládkovi a Jiřímu Kastnerovi pak za pomoc při shánění klimatických dat a konzultaci některých klimatických aspektů...
|
|
Sekuritizace rizik v životním pojištění
Stacho, Miroslav ; Mandl, Petr (oponent) ; Přecechtělová, Tereza (vedoucí práce)
In the presented work we focus on securitization of two major technical risks in life insurance - longevity risk and catastrophic mortality risk. We show some particular examples of issued bonds and some theoretical constructions of mortality linked derivatives. We mention several models applicable for projection of mortality and requirements on these models. Problems connected with projection will be discussed. We describe methods used for pricing these securities, ie. pricing by transformation of probability distribution.
|
|
Principy obchodování na sázkových burzách
Karásek, Michal ; Málek, Jiří (vedoucí práce) ; Moravec, Lukáš (oponent)
Na rozdíl od tradičních kapitálových burz, kde se obchoduje zejména s dluhopisy, akciemi či finančními deriváty, se na sázkových burzách obchoduje s pravděpodobnostními odhady výsledků sportovních či společenských událostí. Tržní cena sázek, tedy trhem implikovaná pravděpodobnost, je ovlivněna nejen odhadem spekulantů o výsledku zápasu, ale i dalšími faktory. Specifikum sázkových burz je také krátká doba do splatnosti kontraktů, většinou v řádu několika hodin či dnů. Důležitým arbitrážním aspektem je také možnost obchodovat s odhady výsledku jedné události skutečného světa na několika dílčích trzích zároveň. V teoretické analýze jsme postupně vymezili pojem losu, sázky, podkladového aktiva a binárního pravděpodobnostního kontraktu, který je ústředním obchodním prostředkem na sázkových burzách. Popsali jsme některé praktické aspekty obchodování. Vlastnosti pravděpodobnostních kontraktů jsme demonstrovali na několika příkladech. Nakonec jsme zkonstruovali matematický model tenisového zápasu, který vychází z binomického oceňovacího modelu. To umožňuje porovnat tržní cenu pravděpodobnostního kontraktu s cenou, kterou doporučuje model.
|
host ::
