|
|
Creating a knowledge base for the diagnosing of diseases
Macháček, Daniel ; Steinerová, Kateřina (referee) ; Jirsík, Václav (advisor)
This bachelor thesis is focused on problematic of creation knowledge base. It is describing basics of expert systems, their function and possible usage in modern world. In result of this thesis is knowlenge base in web aplication NPS able to diagnose diseases of hematology-oncology and that is proving possibility for use in real life. Knowledge base was created in cooperation with experts in the medical field and contains real data.
|
|
|
Volume Rendering Using Programmable HW
Jošth, Radovan ; Kršek, Přemysl (referee) ; Herout, Adam (advisor)
This work describes and implementing method for volume data rendering. Main purpose of this work is visualization of scanned 3D data with some current method used for the 3D volumetric scanning. The 3D volumetric scanning is mainly used in medicine and chemistry. System is using programmable pipeline of current graphic cards, which provides us fast parallel work with large volumetric data. This paper introduces some basics about the volumetric rendering and scanning, describes design and at the end, the implementation steps. Result of this project is application which renders volumetric data with OpenGL.
|
|
|
Implementation of industrial X-ray computed microtomography in developmental biology
Tesařová, Markéta ; Křivánek,, Jan (referee) ; Novotná, Marie (advisor)
Rentgenová počítačová mikrotomografie (CT) je metoda pro trojrozměrné (3D) zobrazování vnitřní struktury objektů. Laboratoř rentgenové počítačové mikro a nanotomografie na CEITEC VUT (Středoevropský technologický institut, Vysoké učení technické v Brně) se zaměřuje zejména na nedestruktivní analýzu v průmyslovém odvětví. Ukázalo se ale, že tato metoda nachází široké uplatnění i v dalších vědeckých oblastech včetně vývojové biologie. Tato práce poskytuje propojení mezi materiálovými a živými vědami. Kompletní proces vedoucí k vytvoření 3D modelu různých anatomických struktur je detailně popsán. Tento postup zahrnuje kontrastování vzorků, samotné CT měření a analýzu dat. Právě zpracování dat je mnohdy považováno za nejdůležitější část v rentgenové počítačové tomografii a proto je této oblasti věnována v práci největší část. Úpravou měřicích parametrů byl dále optimalizován CT přístroj GE v|tome|x L 240 za účelem umožnění automatické segmentace. Navíc je diskutována možnost měření na synchrotronu za účelem zvýšení prostorového rozlišení a diferenciálního kontrastu. Předpokládá se, že v blízké budoucnosti získají průmyslové CT přístroje podobné zobrazovací vlastnosti, a to jak díky nedávnému vývoji v oblasti hardwaru, tak v oblasti zpracování dat.
|
|
|
Interactive Medical Image Segmentation
Olša, Martin ; Kršek, Přemysl (referee) ; Španěl, Michal (advisor)
This work deals with a fast level-set approach for segmentation of anatomical structures in volumetric medical images. The fast level-set method evolves a closed 3D surface in time propagating the surface form an initial position. The major contribution of this work is the implementation of the level-set method and construction of an interactive tool for segmentation of 3D medical data using this method. The tool is able to interactively change parameters of the evolution during the segmentation process itself. Due to the nature of level-set method, the evolution process can be stopped at any time, or backtracked and restarted from any previous step with a different configuration.
|
|
|
Development of Imaging Methods and its Importance to Biomechanics
Sedláček, Tomáš ; Houfek, Martin (referee) ; Florian, Zdeněk (advisor)
The main objective of this bachelor thesis is to collect all available literature, from which can reader obtain basic knowledge of imaging methods. The methods are divided by its origin into four categories: x-rays, magnetic resonance, ultrasound and nuclear medicine. Each of them is described from the historical, physics and technological view. At the end the importance of each method to medicine and biomechanics is summarized.
|
|
|
Automatic rotational alignment of head CT scans
Karmazinová, Inna ; Kolář, Radim (referee) ; Jakubíček, Roman (advisor)
The aim of this thesis is automatic alignment of head CT scan. Currently, the alignment is performed manually by an expert, however this process is time consuming. Therefore, methods for automatization of this process are being developed. Two algorithms for alignment in axial and coronal plane were designed based on bilateral symmetry of head. Following an algorithm for alignment in sagittal plane which uses CG-TOB reference line for rotation angle detection. Algorithms were implemented in MATLAB and tested and validated using a database of manually annotated head CT scans.
|
|
|
Deep-learning-based pattern detection in medical images
Koščová, Zuzana ; Vičar, Tomáš (referee) ; Jakubíček, Roman (advisor)
This Bachelor thesis deals with Deep-learning-based pattern detection in medical images. For better understanding of a subject artificial neural network and convolutional neural network (CNN) are described at first. Next chapter is focused on specific detection methods which use CNN. Within a bachelor thesis a dataset of abdominal CT a MRI scans was created. Faster R-CNN and YOLO algorithms were trained and tested on acquired scans for liver detection. Implementation of chosen methods took place in Python programming language using the Pytorch library. Finally, detection results and possible use in medicine are discussed.
|
|
|
Correlative tomography
Vařeka, Karel ; Touš,, Jan (referee) ; Bábor, Petr (advisor)
Předložená diplomová práce se zabývá korelativním přístupem multimodální analýzy struktur prokovování s různým rozlišením. Výzkum je součástí mezinárodního projektu týkajícího se charakterizace poruch zmíněných struktur, které jsou implementovány v polovodičových zařízeních. Kombinace korelativní mikroskopie a tomografie technikami NanoXCT, FIB-SEM (EDS), FIB-SIMS a AFM byla navržena k zavedení opakovatelného pracovního postupu. Tomografie fokusovaným iontovým svazkem je metoda přesného odprašování v řezech, která mimo jiné v každém průřezu získává cenné snímky s vysokým rozlišením (FIB-SEM) nebo mapy chemického složení (FIB-SIMS). Následující transformace obrazu umožňuje identifikaci defektů jako funkci hloubky ve struktuře. Práce dále věnuje pozornost metodám sjednocení obrazů za účelem optimální prezentace získaných dat.
|
|
|
Java Client for 3D Displaing of Medical Image Data
Bireš, Jiří ; Štancl, Vít (referee) ; Kršek, Přemysl (advisor)
The thesis considers use of Java language in interactive 3D displaying of medical image data. Main point is to find out advantages of using this language in medical visualisations and find suitable tools for its future usage. At the conclusion it evaluates advantages and disadvantages of used technologies and suggests possible development of the appliacation
|
|
| |
guest ::
