|
|
Texturní analýza retinálních snímků
Mikauš, Jakub ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Gazárek, Jiří (vedoucí práce)
Práce se zabývá detekcí výpadku ve vrstvě nervových vláken retinálních snímků. V úvodu je seznámení s fyziologií lidského oka a analýza vstupních obrazových dat. Dále se zabývá práce texturní analýzou pomocí dvou metod. Zatímco metoda přizpůsobených filtrů nevykazuje uspokojivé výsledky, metoda hodnocení jasu dosahuje přijatelných výsledků. V závěru práce je část věnována realizovanému programu pro detekci výpadků ve vrstvě nervových vláken.
|
|
|
Hodnocení kvality snímků sítnice
Tvarůžek, Marek ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá vlastnostmi barevných snímků sítnice, které jsou pořízeny digitální fundus kamerou a principem funkce těchto kamer. Podrobněji jsou zde popsány základní operace pro předzpracování nejen snímku sítnice, ale i pro ostatní biomedicínské obrazy. Teoretické poznatky z těchto základních operací pro zpracování obrazu jsou využíty k vytvoření algoritmu v programovém prostředí Matlab pro kvantitativní hodnocení kvality snímku sítnice i modelových dat z hlediska zaostření. Zjištěné výsledky jsou porovnány a zaneseny do grafických závislostí.
|
|
|
Exploring the Population Characteristics of Direction-Selective Ganglion Cells Across the Retinal Space
Svatoň, Jan ; Paštěka, Richard (oponent) ; Jösch, Maximilian (vedoucí práce)
In the last century, substantial research has been dedicated to gaining an understanding of how visual information is encoded by neural populations and circuits. The overall picture that emerged from these efforts shows that visual information is first processed by intricate circuitries in the retina and subsequently relayed to higher brain structures. Both stages appear to have developed remarkably sophisticated computations. The functional study of these neuronal transformations has been examined either using electrophysiological or imaging techniques. In the retina, these techniques have limited the analysis of spatial specializations across the retina, either by the number of available electrodes (in electrophysiology) or the size of the field-of-view (FOV) (in imaging experiments). For example, simultaneous recordings of retinal ganglion cells (RGC) have been confined to an area (~ 200 x 200 um2) using state-of-the-art imaging techniques. In my thesis, I have explored a newly developed method that uses a FOV, which is 40-times larger in comparison with conventional optical methods, allowing me to overcome this technical limitation. This thesis uses this novel method to explore population characteristics of direction-selective ganglion cells (DSGCs) across the retinal space of mouse retinas. By recreating already known population patterns, we confirmed that our novel imaging method works. In addition, this thesis investigates the effects of adjuvants for enhanced global RGC infection rates that may potentially facilitate the unbiased recording of RGCs and introduces a novel stimulus for inspecting receptive fields (RFs) of RGCs. This novel stimulus outperforms conventional stimuli used in current studies in both the resolution of the yielded RF and the necessary time of stimulus presentation. It opens the door for following studies to describe for the first time the distribution patterns of RFs across the retinal space and to improve the clustering of cell classes.
|
|
|
Generování kryptografického klíče z biometrických vlastností oka
Semerád, Lukáš ; Hájek, Josef (oponent) ; Drahanský, Martin (vedoucí práce)
Hlavním tématem práce je vytvoření vzorců pro množství informační entropie v biometrických vlastnostech duhovky a sítnice. Toto odvětví je zatím v těchto biometrikách neprostudováno, proto se diplomová práce snaží zahájit výzkum tímto směrem. V práci jsou dále zmíněny historické souvislosti z oboru bezpečnosti a identifikace podle biometrických vlastností člověka, s případným přesahem pro využití v biometrikách duhovky a sítnice. Podrobně je probrán Daugmanův algoritmus pro převod snímku duhovky na binární kód, který může být využit jako kryptografický klíč. Součástí práce je i aplikace, která právě zmíněný převod provádí.
|
|
| |
|
| |
|
|
Optic disc segmentation in retinal images
Vymazal, Bronislav ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
The goal of this thesis is to propose a compact algorithm for localizing, segmenting and tracking the optic disk in fundus images. For localizing the optic disk a new technique based on fast radial symmetry transform was used. The segmentation is based on the Chan-Vese model but is also extended about multi feature space and implemented in its localized version that helped to deal with image inhomogeneity. The optical flow approach base on lucas-kanade algorithm is used for tracking of the optic disk through the image sequences. The algorithms are evaluated on two different fundus image databases with different characteristics. First is high resolution databases containing 45 images and the second is noisy low resolution database containing 33 images provided separately for each color plane. The results are then compared to a gold standard reference values.
|
|
|
Analýza pulzace retinálních cév
Holásková, Anna ; Mézl, Martin (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
Obsahem této práce je analýza pulzace sítnicových cév z videosekvencí získaných experimentální fundus kamerou na základě měření intenzitního profilu cévy. Základním stupněm analýzy je v této práci segmentace cévního řečiště a následné měření průměru cév v průběhu videosekvencí. V práci je uvedena rešerše metod zabývajících se právě měřením průměru a vyhodnocováním pulzací a také rozbor segmentačních metod využívajících se při analýze cévního řečiště sítnice. Z nastudovaných metod byla pro segmentaci vybrána metoda sledování kontur. Ve videosekvencích získaných po segmentaci cévního řečiště je dále analyzována pulzace retinálních cév na základě měření intenzitních profilů. Analýza je také provedena na originálních videosekvencích a výstupy jsou porovnávány na základě frekvenčních charakteristik.
|
|
|
Klasifikační metody analýzy vrstvy nervových vláken na sítnici
Zapletal, Petr ; Kolář, Radim (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá klasifikací vrstvy nervových vláken na sínici. Pro klasifikaci jsou použita data získaná šesti různými metodami texturní analýzy. Každá metoda vypočítá ze vstupních obrazů vektor příznaků, který je pro danou skupinu charakteristický. Vlastní třídění je realizováno třemi algoritmy učení s učitelem a jedním algoritmem učení bez učitele. Jako první je otestován algoritmus Ho-Kashyap. Poté Bayessovský klasifikátor NDDF (Normal Density Discriminant Function) a pro třetí klasifikátor je použita metoda nejbližších sousedů (Nearest Neighbors) k-NN. Jako poslední je zde odzkoušen klasifikátor K-means, který pracuje na principu shlukové analýzy. Pro větší kompaktnost jsou použity tři metody výběru testovacích dat pro algoritmy učení s učitelem. Jsou to „Repeated random subsampling cross validation“, „K-fold cross validation“ a „Leave one out cross validation“. Všechny použité třídící algoritmy jsou nakonec porovnány podle výsledné chyby klasifikace.
|
|
|
Texturní analýza oftalmologických snímků
Kaňka, Jan ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Jan, Jiří (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá vytvořením programu pro texturní analýzu snímků retinální oblasti pomocí statistické metody co-occurrence matrices jako možnou alternativu detekce poškození sítnice glaukomem. Glaukomové onemocnění bez včasné diagnostiky a následné léčby vede k slepotě. Snímky sítnice pořízené fundus kamerou jsou běžné a velmi snadno zpracovatelné. Moderní přístroje jsou schopny zachytit snímek o rozlišení 10MPix a více, což zpřesňuje výstupy analytického software. Metoda co-occurrence analýzy je jednoduchá a velmi účinná statistika. Její nevýhodou je výpočetní náročnost, jenž přichází spolu s rostoucí objektivní kvalitou snímků.
|
host ::
RSS.