|
|
Předzpracování snímků sítnice za účelem zlepšení diagnostiky glaukomu
Holásková, Anna ; Walek, Petr (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
Předzpracování snímků sítnice je prvním stupněm k dalšímu zpracování retinálních snímků nebo prvním krokem k diagnostice řady očních onemocnění. Předzpracování představuje takové úpravy obrazu, které zlepší jeho vizuální stránku. Je to především odstranění šumu vznikajícího při akvizici dat, transformace kontrastu a jasu, detekce hran a prahování. V této práci se zabýváme základními metodami předzpracování obrazu a dále konkrétními metodami předzpracování snímků sítnice. Mezi tyto patří globální jasové korekce, filtry typu horní propust, homomorfní filtrace a adaptivní zvýraznění. Kromě těchto metod, které lze implementovat do programového prostředí, existují i techniky ruční, založené na zkušenostech lékaře. V této práci je proto zmíněn i postup pro ruční úpravu snímků sítnice za pomocí programu Adobe Photoshop. Z výše zmíněných metod byly vybrány tři, které byly podrobněji nastudovány a implementovány do programového prostředí MATLAB. Jedná se o homomorfní filtraci, CLAHE (Contrast Limited Adaptive Histogram Equalization) a adaptivní zvýraznění. K těmto metodám byly vytvořeny funkce a byly otestovány na dostupných obrazových datech. V závěru práce jsou diskutovány výsledky vybraných metod. Uveden je také návod k použití.
|
|
|
Klasifikace cévního řečiště na snímcích sítnice
Tebenkova, Iuliia ; Kolář, Radim (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
Analýza snímků sítnice má důležitý význam, protože člověk získá kolem 90 % informací z okolí přes oči. Automatizace procesů analýzy zobrazení sítnice přispívá ke zlepšení efektivity lékařských retinálních vyšetření. Tato diplomová práce se zabývá automatickými metodami klasifikace snímků cévního řečiště retiny pořízených digitální fundus kamerou. Je prozkoumána a implementována metoda klasifikace cévního řečiště s použitím klasifikátoru na základě neuronových sítí, které se trénují a pak se testují na úsecích cév retinálního řečiště. Ve stručnosti je v této práci popsán anatomický pohled na sítnici, vlastnosti obrazových dat z digitální fundus kamery a metody klasifikace retinálních snímků. Poslední kapitola se zabývá hodnocením úspěšnosti klasifikace cévního řečiště automatickými metodami.
|
|
|
Registrace ultrazvukových sekvencí s využitím evolučních algoritmů
Hnízdilová, Bohdana ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se věnuje registraci ultrazvukových sekvencí s využitím evolučních algoritmů. V teoretické části práce je popsán proces registrace obrazů a jeho optimalizace pomocí genetických a metaheuristických algoritmů. V práci jsou také uvedeny problémy, které se mohou vyskytnout při registraci ultrasonografických snímků a různé přístupy k jejich registraci. V praktické části práce byla implementováno a srovnáno několik metod optimalizace pro registraci řady sekvencí.
|
|
|
Segmentace dýchacích cest v CT datech
Votoupal, Pavel ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Walek, Petr (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá segmentací plicního parenchymu a extrakcí dýchacího stromu z 3D CT dat. Nejprve je vytvořena externí maska plic, následně využitá k usnadnění segmentace dýchacích cest. V práci je provedena rešerše některých publikovaných metod a detailně popsána jedna, která je také implementována v prostředí MATLAB. Navržený přístup je založen na morfologické šedotónové rekonstrukci. Metoda je otestována na reálných pacientských datech a dosažené výsledky jsou v závěru práce diskutovány.
|
|
|
Analýza vrstvy nervových vláken pro účely diagnostiky glaukomu
Vodáková, Martina ; Malínský, Miloš (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
Diplomová práce je zaměřena na vytvoření metodiky kvantifikace vrstvy nervových vláken na fotografiích sítnice. V úvodní části textu je stručně nastíněna medicínská motivace práce včetně zmínky o některých studiích věnujících se dané problematice. Dále text popisuje uvažované texturní příznaky včetně jejich porovnání dle schopnosti kvantifikovat tloušťku vrstvy nervových vláken. Na základě popsaných poznatků byla navržena metodika využití regresních modelů za účelem predikce tloušťky nervových vláken, která byla dále testována na dostupných obrazových datech. Výsledky ukazují, že výstupy regresních modelů dosahují vysoké korelace mezi výstupem predikce a tloušťkou vrstvy nervových vláken měřenou optickou koherentní tomografií. Závěr práce diskutuje využitelnost aplikovaného řešení.
|
|
|
Biometrie s využitím videosekvencí sítnice
Oweis, Kamil ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Biometrické metody jsou nejmodernější způsob pro rozpoznání a ověření totožnosti osob. Jsou poměrně rychlé, bezpečné a použitelné v různých situacích. V této práci je použita sada snímků oční sítnice získaných použitím video oftalmoskopu. Snímky jsou dále upraveny pro další zpracování, nejprve převedením na černobílý binární obraz, v některých případech pak byla použita binární matice pro popis daného snímku. Poté byla navržena metoda srovnání snímků databáze s referenčním snímkem oční sítnice nazvaná metoda překrytí a posunu. Byla testována sada černobílých a poté i šedých snímků. Všechny výpočty metody byly realizovány v programu Matlab, jehož výsledkem bylo určení nejvíce shodného snímku se snímkem referenčním a vyhodnocení celkové přesnosti programu.
|
|
|
Precise Image Registration Used for Correction of Geometrical Image Distortion
Zemčíková, Petra ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
The main objective of the thesis is using image registration for a precise description of a deformation field for a following removal of a geometrical distortion. The geometrically distorted images were captured by a transmission electron microscope. The first part of the thesis is dedicated to the theory associated with the electron microscopy, the formation of the geometrical distortion, and the image registration with the main emphasis on the intensity based non-rigid methods. The next part describes a developed method for modelling the geometrical distortion and for the image registration. The method is then tested on both test and real data and compared to the existing methods for image registration (such as Elastix open-source software).
|
|
|
Experimentální stanovení hloubky ostrosti optických systémů
Kubáček, Svatopluk ; Čmiel, Vratislav (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
Cílem této práce je seznámit se s principem snímáním v oblasti optické mikroskopie. Dále se práce zabývá problematikou parametrů procesu zobrazení, jejich vlivem na výsledky a měření těchto parametrů. Podrobně je rozebrána hloubky ostrosti u optického systému a jsou zde určeny možnosti jejího teoretického i experimentálního stanovení. Součástí této práce je realizace měřícího pracoviště a program stanovující experimentálně hloubku ostrosti na základě různých metod měření. Závěr práce je věnován praktické části, která má za úkol sledovat nastavení optických systémů a jejich vliv na hloubku ostrosti.
|
|
|
Bezkontaktní měření a analýza vitálních parametrů
Kolářová, Jana ; Mézl, Martin (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
Tématem této práce je zpracování videa obličeje za účelem detekce vitálních parametrů – byla zvolena tepová a dechová frekvence. Účelem je bezkontaktní a bezbolestná metoda pro stanovení těchto parametrů jak pro jednodušší zisk těchto údajů u novorozenců, tak přirozenější hodnoty bez vlivu případného podvědomého strachu z přístrojů. Nebo také jako metoda ověření ergonomie práce, stresu na pracovišti v závislosti na pravidelnosti rytmů zmíněných parametrů. Řešení bylo zaměřeno na testování funkce navrženého algoritmu a přesnosti při různých akvizičních podmínkách. Podařilo se reálně ověřit spolehlivost metody za definovaných podmínek snímání.
|
|
|
Evoluční algoritmy pro ultrazvukovou perfúzní analýzu
Kolářová, Jana ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Tato diplomová práce je zaměřena na aplikaci evolučních algoritmů při prokládání dat získaných ultrazvukovým snímání tkáně. Proložená křivka slouží k odhadům perfúzních parametrů, umožňuje odhalit případné patofyziologie ve snímané oblasti. Teoretický úvod je věnován perfúzi a jejím parametrům, kontrastním látkám pro ultrazvukovou aplikaci, snímání ultrazvukovou modalitou, optimalizaci, evolučním algoritmům obecně a dvěma zvoleným evolučním algoritmům – genetický algoritmus a včelí algoritmus. Tyto dva algoritmy byly testovány na zašuměných datech získaných z klinických snímků myší s nádorem. V závěrečné části jsou shrnuty výsledky praktické části a poskytnuty návrhy a doporučení pro další možné zpracování.
|
host ::
RSS.