|
|
Charakterizace vlivu lidského mutovaného huntingtinu na diferenciaci nervových kmenových buněk.
Budková, Kateřina ; Vodičková, Kateřina (vedoucí práce) ; Romanyuk, Natalyia (oponent)
Huntingtonova choroba (HD) je autozomálně dominantní neurodegenerativní onemocnění způsobené expanzí repetice CAG kodonu v genu huntingtin (HTT). Tato expanze způsobuje změnu biochemických vlastností proteinu huntingtinu (HTT), jeho agregaci a buněčnou toxicitu, což vede k degeneraci neuronů mozku zejména v oblasti striata. Jako modelový systém pro in vitro modelování tohoto onemocnění mohou sloužit indukované pluripotentní buňky odvozené přímo z buněk pacientů s HD. Jelikož k neuronálním dysfunkcím dochází u pacientů s HD již roky před manifestací prvních klinických příznaků, může tento modelový systém pomoci objasnit mechanismy, které předcházejí nástupu onemocnění. Cílem této diplomové práce bylo diferencovat iPSC (odvozené z fibroblastů HD pacientů a zdravých kontrol) do nervových kmenových buněk (NSC) a následně do populací neuronálních buněk a sledovat molekulární změny v jejich diferenciaci spojené s vlivem mutovaného HTT. Proces diferenciace byl sledován na základě vybraných markerů pomocí imunofluorescence, metody western blot a qRT-PCR. Podařilo se nám vytvořit stabilní linie NSC odvozených ze 3 kontrolních a 3 HD iPSC linií. Všech 6 linií NSC bylo schopno dále diferencovat do neuronálních populací. Na transkripční úrovni jsme nalezli vyšší expresi genu ADAM10 v HD NSC liniích a vyšší...
|
|
|
Monasticismus u Martina Luthera a některé jeho ohlasy v dějinách protestantismu
Vodičková, Kateřina ; Ventura, Václav (vedoucí práce) ; Hrdlička, Jaroslav (oponent)
Autorka se ve své práci zabývá otázkou, zda se ideály katolického monasticismu zachovaly i v protestantských hnutích a církvích. Teoretickým zázemím pro tento výzkum byly myšlenky Martina Luthera, který na téma mnišství napsal několik spisů. Práce začíná historickým přehledem počátků křesťanského monasticismu jako takového a stručným Lutherovým životopisem pro porozumění jeho myšlenkového pozadí. Následně začíná sama analýza Lutherových spisů a dalších teologických i historických děl, jejímž hlavním úkolem je přinést poznatky o reflexi Lutherových postojů v protestantismu. Jako zvláštní případ je stručně popsána mnišská komunita v Taizé. Výsledkem je potvrzení počáteční hypotézy a popsání některých výrazných reziduí monastických ideálů a to zejména čistoty, poslušnosti a chudoby.
|
|
|
Interakce proteinů s bromfenolovou modří, možnosti analytického využití
Vodičková, Kateřina ; Hudeček, Jiří (vedoucí práce) ; Moserová, Michaela (oponent)
Jednou z metod stanovení proteinů je spektrofotometrická metoda, založená na proteinové chybě acidobazického indikátoru. Často pro tento účel je používaným barvivem bromfenolová modř, jako standard se obvykle využívá hovězí sérový albumin. Tato bakalářská práce zkoumá vliv močoviny na absorpční spektrum komplexu tohoto proteinu s bromfenolovou modří. Rozdíly v absorbanci, způsobené přídavkem močoviny odpovídající fyziologickým hodnotám v moči (0,2-0,4 mol/l), nepřesáhly 1 % (což odpovídá experimentální chybě). Obdobně je tomu až do koncentrace 4 mol/l. Naopak přídavek močoviny v koncentraci 6 mol/l způsobuje pokles absorbance o téměř 29 %, pravděpodobně v důsledku denaturace albuminu.
|
|
|
Stanovení proteinů - vliv složení proteinu, možnost použití spektrofotometru pro malé objemy
Vodičková, Kateřina ; Hudeček, Jiří (vedoucí práce) ; Moserová, Michaela (oponent)
V posledních letech se na trhu objevily spektrometry pro měření malých objemů v řádu mikrolitrů. Jejich hlavní aplikační oblastí je stanovení proteinů, resp. proteinů a nukleových kyselin vedle sebe přímou spektrofotometrií, popř. dalšími spektrálními metodami. Jedním z takových přístrojů je i spektrofotometr NanoVueTM Plus (GE Healthcare). V práci byla nejprve ověřována použitelnost tohoto přístroje (stabilita) a optimalizovány podmínky měření (objem vzorku). Pro stanovení proteinů přímou spektrofotometrií byly využity přednastavené programy na tomto přístroji, data byla ověřena nezávislým výpočtem. Dále bylo studováno ovlivnění naměřených hodnot rozdíly ve složení různých proteinů. Jak ukazují výsledky této diplomové práce, nejsprávnějších výsledků se dosahuje s použitím přednastaveného programu E 1%, když se potřebná hodnota E 1% zjistí experimentálně. Naopak použití programu Protein UV poskytuje výsledky často výrazně odlišné od správných hodnot a projevuje se zde vysoká závislost na složení proteinu. Klíčová slova: stanovení proteinů, spektrofotometr NanoVueTM Plus, vliv aminokyselinového složení proteinu
|
|
|
Mezidenní proměnlivost teploty vzduchu
Vodičková, Kateřina ; Holtanová, Eva (vedoucí práce) ; Mikšovský, Jiří (oponent)
Název práce: Mezidenní proměnlivost teploty vzduchu Autor: Kateřina Vodičková Katedra / Ústav: Katedra fyziky atmosféry MFF UK Vedoucí bakalářské práce: RNDr. Eva Holtanová, Ph.D., Katedra fyziky atmosféry MFF UK Abstrakt: Jednou z důležitých charakteristik klimatu je proměnlivost teploty vzduchu. V této práci je věnována pozornost anomáliím od shlazeného průměrného ročního chodu teploty vzduchu a jejich mezidenním a vícedenním proměnlivostem. Je zkoumán vývoj anomálií a jejich proměnlivostí v období 1900-2015 na vybraných klimatologických stanicích ve střední Evropě. Vývoj anomálií i jejich mezidenní proměnlivosti odpovídá vývoji teploty vzduchu ve 20. století. Byl zjištěn jistý systematický trend ve zvyšování mezidenní proměnlivosti anomálií teploty vzduchu v posledních desetiletích. Klíčová slova: teplota vzduchu, proměnlivost, mezidenní změny, průměrný roční chod, anomálie od průměrného ročního chodu
|
|
|
Stanovení proteinů - vliv složení proteinu, možnost použití spektrofotometru pro malé objemy
Vodičková, Kateřina ; Hudeček, Jiří (vedoucí práce) ; Moserová, Michaela (oponent)
V posledních letech se na trhu objevily spektrometry pro měření malých objemů v řádu mikrolitrů. Jejich hlavní aplikační oblastí je stanovení proteinů, resp. proteinů a nukleových kyselin vedle sebe přímou spektrofotometrií, popř. dalšími spektrálními metodami. Jedním z takových přístrojů je i spektrofotometr NanoVueTM Plus (GE Healthcare). V práci byla nejprve ověřována použitelnost tohoto přístroje (stabilita) a optimalizovány podmínky měření (objem vzorku). Pro stanovení proteinů přímou spektrofotometrií byly využity přednastavené programy na tomto přístroji, data byla ověřena nezávislým výpočtem. Dále bylo studováno ovlivnění naměřených hodnot rozdíly ve složení různých proteinů. Jak ukazují výsledky této diplomové práce, nejsprávnějších výsledků se dosahuje s použitím přednastaveného programu E 1%, když se potřebná hodnota E 1% zjistí experimentálně. Naopak použití programu Protein UV poskytuje výsledky často výrazně odlišné od správných hodnot a projevuje se zde vysoká závislost na složení proteinu. Klíčová slova: stanovení proteinů, spektrofotometr NanoVueTM Plus, vliv aminokyselinového složení proteinu
|
|
|
Interakce proteinů s bromfenolovou modří, možnosti analytického využití
Vodičková, Kateřina ; Hudeček, Jiří (vedoucí práce) ; Moserová, Michaela (oponent)
Jednou z metod stanovení proteinů je spektrofotometrická metoda, založená na proteinové chybě acidobazického indikátoru. Často pro tento účel je používaným barvivem bromfenolová modř, jako standard se obvykle využívá hovězí sérový albumin. Tato bakalářská práce zkoumá vliv močoviny na absorpční spektrum komplexu tohoto proteinu s bromfenolovou modří. Rozdíly v absorbanci, způsobené přídavkem močoviny odpovídající fyziologickým hodnotám v moči (0,2-0,4 mol/l), nepřesáhly 1 % (což odpovídá experimentální chybě). Obdobně je tomu až do koncentrace 4 mol/l. Naopak přídavek močoviny v koncentraci 6 mol/l způsobuje pokles absorbance o téměř 29 %, pravděpodobně v důsledku denaturace albuminu.
|
|
|
Transkriptomika embryonální genomové aktivace preimplantačního vývoje skotu v podmínkách in vivo a in vitro kultivace
Vodičková Kepková, Kateřina ; Kaňka, Jiří (vedoucí práce) ; Petr, Jaroslav (oponent) ; Krylov, Vladimír (oponent)
Cílem práce bylo charakterizovat transkripční profil in vivo a in vitro získaných embryí během bovinní minoritní a majoritní genomové aktivace a dále identifikovat mRNA transkripty, které jsou nově syntetizované během těchto stádií. V naší první studii jsme se zaměřili na studium minoritní aktivace genů ve 4-buněčném stádiu embrya. Pomocí metody supresivní subtraktivní hybridizace (SSH) jsme nalezli 31 amplikonů homologních s již známými geny. Pro podrobnější studium exprese během celého období preimplantačního vývoje jsme vybrali 5 genů: centromere protein, 350/400 kDa (CENPF, mitosin), splicing factor arginine/serine-rich 3 (SRFS3), high mobility group nucleosomal binding domain 2 (HMGN2) protein a eukaryotické translační iniciační faktory EIF4A2 a EIF4E. Všechny tyto geny hrají důležitou roli v raném vývoji embrya. Gen SRFS3 je prvním genem s významnou funkcí, jehož exprese byla nalezena již v průběhu minoritní genomové aktivace, což potvrdila citlivost jeho transkripce k α-amanitinu v tomto stádiu. Pro další studium jsme si vybrali gen CENPF (centromeric protein F, mitosin), jehož funkci během preimplantačního vývoje bovinního embrya jsme podrobně studovali pomocí specifického umlčení injikací double- stranded (dsRNA) do embrya ve stádiu zygoty. Zjistili jsme, že mikroinjekce CENPF dsRNA...
|
|
|
Monasticismus u Martina Luthera a některé jeho ohlasy v dějinách protestantismu
Vodičková, Kateřina ; Ventura, Václav (vedoucí práce) ; Hrdlička, Jaroslav (oponent)
Autorka se ve své práci zabývá otázkou, zda se ideály katolického monasticismu zachovaly i v protestantských hnutích a církvích. Teoretickým zázemím pro tento výzkum byly myšlenky Martina Luthera, který na téma mnišství napsal několik spisů. Práce začíná historickým přehledem počátků křesťanského monasticismu jako takového a stručným Lutherovým životopisem pro porozumění jeho myšlenkového pozadí. Následně začíná sama analýza Lutherových spisů a dalších teologických i historických děl, jejímž hlavním úkolem je přinést poznatky o reflexi Lutherových postojů v protestantismu. Jako zvláštní případ je stručně popsána mnišská komunita v Taizé. Výsledkem je potvrzení počáteční hypotézy a popsání některých výrazných reziduí monastických ideálů a to zejména čistoty, poslušnosti a chudoby.
|
host ::
RSS.