|
|
Mammalian proteins carrying zinc finger arrays
Vobruba, Adam ; Svoboda, Petr (vedoucí práce) ; Mašek, Jan (oponent)
Zinkový prst je malý peptidový motiv stabilizovaný jedním zinečnatým iontem, známý zejména pro svou schopnost specificky vázat třínukleotidovou sekvenci DNA v závislosti na konkrétních aminokyselinách přítomných v DNA-vazebných pozicích. Zinkové prsty jsou unikátní svou schopností spojovat se do delších tandemově uspořádaných sad, které mohou vázat DNA cíle o libovolné délce a sekvenci, určené kombinací jednotlivých prstů. Tyto sady mohou jednoduše měnit vazebnou specificitu díky mutacím a přestavbám, což jim dodává velkou flexibilitu a pomohlo zinkovým prstům rozšířit se do mnoha endogenních proteinů o rozličných funkcích. Tato vlastnost sad zinkových prstů je také činí vhodnými pro tvorbu DNA-vazebných domén na míru pro využití v genovém inženýrství. Tato práce podává přehled o objevu těchto domén, jejich struktuře a funkci a poté shrnuje a diskutuje vybrané přirozeně se vyskytující savčí proteiny se zinkovými prsty a jejich vlastnosti, představujíc různé funkce pro něž byly sady zinkových prstů v průběhu evoluce adaptovány. Diskutována je také minulost a budoucnost zinkových prstů v umělých proteinech vytvořených pro genovou terapii a výzkum. Klíčová slova: zinkový prst, ZnF, KRAB, KZFP, CTCF, PRDM9, ZFN, savci
|
|
|
Politické procesy 50. let - konkrétní případová studie
Svoboda, David ; Kuklík, Jan (vedoucí práce) ; Blažek, Lukáš (oponent)
Politické procesy 50. let - konkrétní případová studie (Případ Babice) Abstrakt Tématem diplomové práce "Politické procesy 50. let - konkrétní případová studie" s podtitulem Případ Babice byl popis aplikace obecných nástrojů politické perzekuce využívaných v Československé republice v 50. letech 20. století na konkrétním případu jednání Ladislava Malého a skupiny, kterou kolem sebe vytvořil, přičemž tato situace vyvrcholila střelbou v babické škole a následnými politickými procesy. Významným je také cíl zasadit politické procesy v Československu do kontextu doby a mezinárodní politické situace, která právě v případu Babice hrála důležitou roli. První kapitola diplomové práce formuluje cíle diplomové práce a východiska z nichž vychází. V druhé kapitole diplomové práce je popsán význam politických procesů a obecná východiska jejich organizace. Významnou součástí 2. kapitoly diplomové práce je popis právního rámce vedení politických procesů, přičemž se zaměřuje jak na hmotněprávní aspekty, jako jsou nově vymezené trestné činy, tak na procesněprávní otázky, především na omezení práv obviněných. Jako významný jev je popsána také právnická dvouletka, tedy inciativa jejímž cílem byla změna právního řádu s ohledem na potřeby a ideologii KSČ. Třetí kapitola se stručně věnuje popisu situace v regionu Moravských...
|
|
|
Funkce hipokampální formace při vyhýbání se pohyblivému objektu u potkana
Zitta, Pavel ; Svoboda, Jan (vedoucí práce) ; Blahna, Karel (oponent)
V poslední dekádě došlo v oblasti výzkumu hipokampu k významnému posunu směrem od statických úloh k dynamickým prostředím, která lépe modelují skutečné situace zvířat v přírodě. Zároveň v poslední době je zvláštní pozornost věnována inhibičním parvalbuminovým interneuronům (PVI), které modulují hipokampální oscilace. Cílem práce proto bylo zjistit, jakou úlohu PVI hrají v orientaci v dynamických prostředích, respektive v chování vzhledem k potenciální hrozbě představovanou pohybujícím se objektem. V tomto kontextu byly využity chemogenetické metody, umožňující experimentální manipulaci s PVI. V rámci této práce jsme trénovali transgenní PV-cre potkany v úloze vyhýbání se robotu. Navzdory intenzivnímu behaviorálnímu tréninku se ukázalo, že potkani se úlohu učili jen velmi pomalu. Chemogenetická aktivace PVI pomocí látky C21 měla za následek pouze zvýšení lokomoční aktivity se stabilním robotem. Výsledky ukazují, že C21 jinak nemá zásadní vliv na chování potkanů, alespoň ne při relativně nízkém počtu exprimovaných hM3Dq v PVI. Na základě výsledků nahrávání místních potenciálů (LFP) jsme dále ukázali, že aktivace PVI měla vliv na výkon theta frekvenčního pásma. Klíčová slova: Behaviorální úloha, Hipokampus, Chemogenetika, LFP, Parvalbumin, Robot
|
|
|
Cortical microcircuits and synaptic transmission in epilepsy
Doležal, Filip ; Králíková, Michaela (vedoucí práce) ; Svoboda, Jan (oponent)
Epilepsie je trvalá predispozice mozku generovat epileptické záchvaty. Toto onemocnění je ve společnosti značně rozšířené a pacientům výrazně komplikuje život. Jelikož se jedná o onemocnění definované pouze společnými příznaky, výzkum je náročný kvůli množství příčin, které k epilepsii vedou. Přestože existuje mnoho forem terapie cílících na různé etiologie této nemoci, často je náročné nasadit pacientům správnou léčbu a asi třetina z nich stále trpí záchvaty refrakterními vůči jakékoli léčbě. Nicméně bylo identifikováno množství proteinů, které se podílejí na synaptickém přenosu, a popsáno, jaké důsledky mohou mít změny v jejich funkci. Změna funkce jednotlivých proteinů ovlivňuje aktivitu synapsí a také to, jak se jednotlivé synapse zapojí v rámci neuronálních mikrookruhů. Mikrookruhy jsou motivy zapojení excitačních a inhibičních neuronů, důležité pro přenos a zpracování informací v mozku. Mikrookruhy mohou být dočasně, nebo i dlouhodobě pozměněny patogenními ději na úrovni molekulárních mechanismů, které mohou zodpovídat za vznik a propagaci epileptických záchvatů. Klíčová slova epilepsie, iktogeneze, mikrookruhy, synaptický přenos
|
|
|
Pharmacokinetics, systemic toxicity, and acute behavioural effects of hexahydrocannabinol (HHC)- an animal study.
Mallarino, Barbara ; Šíchová, Klára (vedoucí práce) ; Svoboda, Jan (oponent)
Polosyntetické kanabinoidy, jako je například hojně rozšířený hexahydrokanabinol (HHC), představují významný problém pro veřejnézdraví. I přes stále rostoucí oblibu HHC mezi uživateli konopí, vzniklo do dnešní doby jen velmi málo prací zaměřených na vliv této látky na živé organismy. Cílem magisterské práce je proto s použitím samců laboratorních potkanů kmene Wistar stanovit farmakokinetický profil, akutní toxicitu a behaviorální účinky spektra dávek HHC (1, 5 a 10 mg/kg, p.o.). Koncentrace HHC dosáhla vrcholu dvě hodiny po podání, a to jak v krevním séru, tak v mozkové tkáni. Podle OECD protokolu pro stanovení akutní orální toxicity lze HHC klasifikovat jako látku 4. třídy s odhadovanou letální dávkou 1 g/kg pro laboratorního potkana. Podání HHC dále snižuje lokomotorickou aktivitu a zvyšuje anxietu v testu Otevřeného pole, a to v závislosti na dávce. Vysoká dávka HHC také narušuje sensorimotorické zpracování informací projevující se snížením Prepulzní Inhibice Akustické Úlekové Reakce. Tato magisterská práce je jednou z prvních studií zabývajících se akutními účinky široce rozšířeného polosyntetického kanabinoidu. Výsledky studie mohou být základem pro budoucí studie zaměřené na zhodnocení HHC jakožto možného terapeutika pro zmírnění chronických bolestí a poruch spánku. Keywords:...
|
|
|
Úloha HPA osy v rozvoji afektivních poruch
Fiedlerová, Alžběta ; Telenský, Petr (vedoucí práce) ; Svoboda, Jan (oponent)
Tato bakalářská práce se zaměřuje na vliv hypotalamo-hypofýzo-nadledvinové osy (HPA osy) na rozvoj afektivních onemocnění. Afektivní onemocnění, jako je velká depresivní porucha nebo posttraumatický stresový syndrom, jsou vážnými psychickými onemocněními, která mají závažný dopad na život jedince trpícího touto poruchou. HPA osa hraje klíčovou roli v adaptaci organismu na stresové situace. Dysfunkce HPA osy může významně ovlivnit homeostázu organismu díky zvýšeným či sníženým hladinám hormonů a neurotransmiterů či deregulacím stresového systému. To může vést k rozvoji afektivních poruch. Tato práce se zaměřuje na analýzu souvislostí mezi aktivitou HPA osy a vznikem afektivních poruch a zkoumá možnosti terapeutické léčby této osy jako potenciálního cíle léčby těchto poruch. Výsledky této rešerše jednotlivých vědeckých článků podporují porozumění mechanismům, které spojují HPA osu s afektivními poruchami a nabízejí perspektivu pro budoucí výzkum. Klíčová slova: HPAosa, kortizol, velká depresivní porucha, úzkostná porucha, posttraumatický stresový syndrom, bipolární porucha
|
|
|
Behaviorální fenotyp alzheimerovského modelu APPswe/PSEN1dE9 myší a úloha parvalbuminových interneuronů
Klausová, Tereza ; Svoboda, Jan (vedoucí práce) ; Telenský, Petr (oponent)
Alzheimerova choroba představuje sociální a ekonomickou zátěž pro celou společnost. Její etiologie stále zůstává neznámá, známe však některé mechanismy patogeneze, které nám umožňují vytvářet zvířecí modely (zejména myší). V této práci zkoumáme behaviorální fenotyp často používaného modelu APPswe/PSEN1. Zjistili jsme, že ani šestiměsíční, ani desetiměsíční zvířata nevykazují v testech anxiety (otevřené pole a vyvýšené křížové bludiště) ani v testech sociálního chování (sociální interakce a tříkomorový test) zhoršení oproti kontrolní skupině. Test prepulzní inhibice však odhalil, že PPI u alzheimerovských myší zcela mizí, což ukazuje na významnou aberaci v senzomotorickém gatingu. Druhá část práce je zaměřena na chemogenetickou studii úlohy parvalbuminových interneuronů v Alzheimerově chorobě a vlivu jejich excitace na sociabilitu, sociální paměť a senzomotorický gating. Využíváme zde výše zmíněný model křížený s PV-Cre myšmi, což nám umožnilo zavedení Cre dependentních DREADDs. U této skupiny zvířat jsme zkoumali sociální chování a přítomnost narušení v senzomotorickém gatingu. Získané výsledky však nepřinesly žádný důkaz vlivu excitace parvalbuminových interneuronů na chování zvířat a bude potřeba provést více experimentů s větším počtem zvířat. Klíčová slova: Alzheimerova choroba, chování,...
|
|
|
Analýza dat o poloze vozidel MHD: případová studie pro Most a Litvínov
Zátka, Josef ; Lysák, Jakub (vedoucí práce) ; Svoboda, Jan (oponent)
Práce se zabývá ex post (tj. nikoliv real time) analýzou dat o poloze vozidel městské hromadné dopravy. Cílem práce je navrhnout a implementovat časoprostorové analýzy těchto dat, které budou prakticky využitelné pro reálné sítě MHD. Jejich funkčnost je ověřována na datech z MHD v Mostě a Litvínově zaznamenaných v průběhu měsíce října roku 2023. Data mají charakter bodového záznamu s informací o poloze vozidla, s časem a datem záznamu, číslem linky, konečnou zastávkou, poslední projetou zastávkou, azimutem a rychlostí pohybu vozidla a o jeho zpoždění. Celkem je navrženo 5 dílčích analýz. První dvě analýzy se zabývají možnostmi efektivní kontroly vstupních dat, v rámci nich jsou navrženy algoritmy pro polohovou a atributovou kontrolu dat. Třetí analýza sleduje a vyhodnocuje časoprostorovou diferenciaci zpoždění, zaměřuje se na trendy v rozložení zpoždění v průběhu tras jednotlivých linek jak v průběhu denní doby, tak za delší časové úseky. Čtvrtá analýza se věnuje zpoždění na příjezdu linek na jednotlivé zastávky. Závěrečná analýza zkoumá spolehlivost přestupů mezi spoji MHD na přestupních uzlech. Navržené metody byly implementovány prostřednictvím skriptů napsaných v programovacím jazyku Python, pro práci s prostorovými daty byla využita knihovna ArcPy. Implementace metod je přizpůsobena struktuře...
|
|
|
Konstrukce jednoúčelového frézovacího přípravku pro sériovou výrobu
Okénka, Jan ; Michalec, Michal (oponent) ; Svoboda, Petr (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá problematikou upínání tvarově složitého odlitku na čtyřosém CNC stroji v sériové výrobě. Cílem bylo navrhnout upínací přípravek tak, aby byl snížen celkový počet nutných upnutí. Celkem byly představeny 4 koncepty, z nichž byl dle stanovených kritérií vybrán nejlepší návrh. Navrženým řešením je hydraulický středící svěrák, vybavený středovým dílcem k ustavení dvou obrobků a dvěma otočnými čelistmi, které umožňují přizpůsobení obrobku. Sérii 250 000 kusů za rok lze s tímto přípravkem splnit. Přípravek je možné lehce přestavit na jiný druh výroby výměnou čelistí a středového dorazu. Byla také vypočtena potřebná upínací síla pro bezpečné upnutí a pomocí konečnoprvkové analýzy bylo ověřeno, že nedojde k trvalé deformaci obrobku při upnutí. Práce dále obsahuje přehled komerčně dostupných přípravků, hliníkových slitin pro tlakové lití a vybraných CNC frézek.
|
|
|
Odbočení VRT z konvenční tratě u Zaječí
Šikula, Antonín ; Bušovský, Ján (oponent) ; Svoboda, Richard (vedoucí práce)
Bakalářská práce se zabývá návrhem napojení vysokorychlostní trati na konvenční u obce Zaječí. Napojení vysokorychlostní tratě je navrženo mimoúrovňové a předpokládá maximální rychlost 230 km/h. Dále bylo projektováno odvodnění a křížení s okolními komunikacemi. V rámci práce byl vytvořen 3D model, který je připraven k dalšímu využití jako digitální model stavby.
|
host ::
RSS.