|
|
Rozšíření funkcionality systému pro dolování z dat na platformě NetBeans
Šebek, Michal ; Zendulka, Jaroslav (oponent) ; Lukáš, Roman (vedoucí práce)
Databáze se neustále rozrůstají o nová data. Za účelem analýzy těchto dat byl definován proces získávání znalostí z databází. Pro podporu tohoto procesu vznikla řada nástrojů. Vývojem jednoho z těchto nástrojů se zabývá tato práce. Hlavním cílem je analyzovat stávající implementaci systému na přenositelné platformě Java NetBeans a databázovém serveru Oracle a rozšířit ji o algoritmy z oblasti předzpracování a analýzy vstupních dat. Podrobně je popsána implementace jednotlivých komponent pro předzpracování dat a provedené změny v jádře systému.
|
|
|
Rozvoj nástroje na podporu vývoje interaktivních aplikací
Rozsypálek, Michal ; Křivka, Zbyněk (oponent) ; Zendulka, Jaroslav (vedoucí práce)
Cílem práce je rozvoj nástroje Process Inspector pro získávání dat a modelování vnitrofiremních procesů. Pro rozvoj nástroje bylo rozhodnuto o přechodu na jiné technologie, nad kterými je nástroj vybudován. Hlavními body je přechod na databázi MSSQL a implementace v prostředí .NET Framework. Při rozvoji nástroje je důraz kladen na zpříjemnění uživatelského rozhraní. V neposlední řadě důležitým aspektem rozvoje nástroje je komunikace s produktem Business Precess Visual Architect.
|
|
|
Protein Classification Techniques
Dekrét, Lukáš ; Zendulka, Jaroslav (oponent) ; Burgetová, Ivana (vedoucí práce)
Main goal of classifying proteins into families is to understand structural, functional and evolutionary relationships between individual proteins, which are not easily deducible from available data. Since the structure and function of proteins are closely related, determination of function is mainly based on structural properties, that can be obtained relatively easily with current resources. Protein classification is also used in development of special medicines, in the diagnosis of clinical diseases or in personalized healthcare, which means a lot of investment in it. I created a new hierarchical tool for protein classification that achieves better results than some existing solutions. The implementation of the tool was preceded by acquaintance with the properties of proteins, examination of existing classification approaches, creation of an extensive data set, realizing experiments and selection of the final classifiers of the hierarchical tool.
|
|
|
Návrhové vzory pro webové aplikace
Dudek, Jan ; Rychlý, Marek (oponent) ; Zendulka, Jaroslav (vedoucí práce)
S nástupem webu se začal objevovat zcela nový typ klient-server aplikací založených na standardních webových technologiích. Tyto technologie jsou dostupné na drtivé většině klientských stanic a není tak nutná instalace dalšího softwaru. Z tohoto důvodu si získaly webové aplikace mezi uživateli i vývojáři značnou oblibu a jsou nasazovány nejen na Internet, ale i na firemní intranety. Vzhledem k současnému rozšíření těchto aplikací je důležité sumarizovat vyzkoušené a ověřené postupy využitelné při jejich návrhu. A právě tato práce popisuje vybrané návrhové vzory aplikovatelné při vývoji webových aplikací a demonstruje jejich použití na konkrétních existujících systémech stejně jako na vlastní ukázkové aplikaci.
|
|
|
Aplikace pro sumarizaci textu
Mička, Jakub ; Zendulka, Jaroslav (oponent) ; Bartík, Vladimír (vedoucí práce)
V této práci jsem se zaměřil na implementaci webové aplikace, která slouží jako prostředek pro automatickou tvorbu souhrnů v anglickém jazyce. Automatická tvorba souhrnů je v řešení prováděna pomocí metody TextRank a Latentní sémantické analýzy. Obě tyto metody jsou vylepšeny o rozpoznávání pojmenovaných entit. Přínosem této práce je zjištění, že využití rozpoznávání pojmenovaných entit u Latentní sémantické analýzy a především u metody TextRank, vede k vytváření kvalitnějších souhrnů. Tato kvalita souhrnů byla ověřena pomocí metrik ROUGE.
|
|
|
Detection of repetitive sequences in genomes
Puterová, Janka ; Jedlička, Pavel (oponent) ; Kléma, Jiří (oponent) ; Zendulka, Jaroslav (vedoucí práce)
Repetitive sequences can make up a significant part of the genome, in some cases more than 80%, but scientists have often overlooked them. Today we know that repeats have various functions in the genomes and are divided into two main groups: interspersed and tandem repeats. This work aimed to develop bioinformatics tools to detect repetitive sequences, either directly from sequencing data generated by sequencers or assembled genomes. In the introductory part, the work provides an insight into the issue and an overview of the repeat types occurring in genomes. Furthermore, the work deals with existing approaches and tools with an aim to detect repeats directly from the assembled sequences. The main contribution to this area was developing the digIS tool, which aims to detect insertion sequences that represent the most abundant interspersed repeats in prokaryotes. digIS is based on the principle of profile hidden Markov models constructed for the catalytic domains of transposases, representing the most conserved part of the insertion sequences and retaining a secondary structure within the family. Subsequently, the work provides an overview of sequencing technologies and discusses existing methods for detecting repeats directly from sequencing data without the need for prior genome assembly. A novel approach for a detailed analysis of tandem repeats is presented. This approach extends the primary analysis of RepeatExplorer, which detects and characterizes repeats directly from sequencing data. The work further discusses the applications of repeat detection in biological research, especially from the point of view of comparative repeatome studies and the evolution of sex chromosomes. Finally, the work summarizes the research results in the form of four articles published in international journals, the full text of which is available in the appendices, and provides a general summary of the work together with possibilities for future research.
|
|
|
Rozšíření uživatelských profilů pro účely cílené reklamy
Hadač, Filip ; Burgetová, Ivana (oponent) ; Zendulka, Jaroslav (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá návrhem a realizací obohacení uživatelských profilů pro účely vylepšení cílené reklamy. Pro získání nových informací je využita extrakce dat z webových stránek. Extrahovaná data pochází ze dvou serverů, ČSFD a Recepty. V případě ČSFD se jedná o filmové žánry, zatímco u Recepty se jedná o kategorie receptů. Pomocí streamovacích aplikací se tyto informace zpracují a uloží do databází uživatelských profilů. Nad profily spadajícími do určité reklamní kampaně se provádí předzpracování a následně klasifikační algoritmy strojového učení pro vyhodnocení přínosu nových informací. Vyhodnocením experimentů je poznatek, že nově obohacené informace mají mírný přínos pro vylepšení cílené reklamy.
|
|
|
Služba pro zjištění zranitelností knihoven použitých na webových stránkách
Bednář, Radek ; Zendulka, Jaroslav (oponent) ; Volf, Tomáš (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá vytvořením aplikace pro detekci technologií použitých na webových stránkách a následnému zjištění jejich zranitelností. Aplikace je implementována s využitím Symfony Frameworku a knihovny React.js. Zdrojem informací o zranitelnostech je databáze NVD spolu s daty ze služby GitHub. Kromě detekce technologií, umožňuje aplikace uživateli manuálně vytvářet vlastní sady technologií a ty poté sdílet pomocí URL adresy.
|
|
|
NoSQL: Podpora pro ukládání vícerozměrných dat
Hrivnák, Jan ; Zendulka, Jaroslav (oponent) ; Volf, Tomáš (vedoucí práce)
ato bakalářská práce se zabývá možnostmi uložení vícerozměrných dat v NoSQL databázích. Je zde diskutována vhodnost vybraných databází pro ukládání trajektorií pohybujících se 2D objektů. Nad vybranou databází MongoDB jsou poté provedeny experimenty s cílem nalézt nejlepší možný způsob uložení a indexování dat trajektorií. V rámci práce je také popsán jednoduchý demonstrační program pro práci s MongoDB API v jazyce Python. V závěru jsou navrženy možnosti dalšího rozšíření této práce.
|
|
|
Indexování databází: SP-GiST pro PostGIS
Matula, Lukáš ; Fröml, Vojtěch (oponent) ; Zendulka, Jaroslav (vedoucí práce)
Cílem této práce je seznámení se s indexačními metodami a datovými typy prostorových objektů v databázovém systému PostgreSQL (obsahuje indexační metody GiST a SP-GiST) a vytvoření indexu SP-GiST pomocí quad stromu v rozšíření PostGIS. Toto rozšíření přináší databázi možnost pracovat s prostorovými a geografickými objekty. PostGIS obsahuje své vlastní datové typy a metody, které s nimi pracují. Obsahuje také GiST index pro práci s daty, ale chybí v něm stále realizace SP-GiST indexu. Z tohoto důvodu byla vytvořena tato diplomová práce.
|
host ::
RSS.