|
|
Změny zbarvení u zvířat v průběhu domestikace
Ariskina, Sofya ; Hofmanová, Barbora (vedoucí práce) ; Kracíková, Olga (oponent)
V této práci jsou popsány změny různých druhů zvířat v průběhu domestikace. Vycházela jsem zvprací a článků, které popisovaly výsledky různých pokusů a experimentů.
Předpokládá se, že tento proces začal přibližně před 15 tisíci lety. Je zde popsáno několik scénářů, které znázorňují příčiny a způsoby začátku domestikace. Rovněž je tu ukázáno a popsáno několik ohnisek, kde tento proces původně začal.
Důležitější však je, že v průběhu procesu zdomácnění proběhlo velké množství morfologických, anatomických a fyziologických změn, a divoká zvířata se postupně přeměnila na domácí. Tyto změny ( mnohonásobné zmenšení nebo zvětšení původní velikosti, zmenšení mozku a změny nervové soustavy, vznik klapouchosti a velkého množství různých barevných variant) svědčí o tom, že zvířata ztratila potřebu samostatně přežívat a začala úplně nebo částečně záviset na člověku.
Hlavním cílem této práce je ale popsání a vysvětlení vzniku nových, u divokých forem
neexistujich zbarvení, která jsou úzce spjata s procesem domestikace, a později i selekce
člověkem. Společným výsledkem pro všechna domestikovaná zvířata (ať jsou vybírána a
selektována záměrně nebo náhodně podle jakýkoli znaků) je vznik strakatosti a nestejnoměrného zbarvení, postupně přecházejícího do zbarvení jiných, úplně atypických pro divoká zvířata. Pro divoká zvířata by toto zabarvení bylo nežádoucí, protože ve volné přírodě by zvířata zbytečně poutala pozornost predátorů nebo kořistí.
Je zde taky popsána genetická stránka tohoto procesu, zahrnující podrobné vysvětlění příčin
vzniku různých barev v důsledku různých poměrů eumelaninu a feomelaninu, a taky mutací
některých genů (např. MC1R, ASIP aj.).
|
|
|
Nejzávažnější genetické choroby u teriérů
KAMENÍKOVÁ, Petra
Úkolem této bakalářské práce je zpracovat kompletní literární studii týkající se dědičných chorob teriérů a podrobněji představit některé vybrané. Práce tedy obsahuje jak seznamy chorob prokázaných u plemen teriérů, tak i popisy nejčastějších a nejvýznamnějších chorob. Vysvětleny jsou hlavně příčiny vzniku těchto chorob, jejich dědičnost a dopad na jedince, popřípadě jejich léčbu. Dále práce pojednává o vlivu těchto odchylek na chov teriérů, o možnostech jejich eliminace a o možných strategiích zvýšení zdraví. V závěru shrnuji některá obecná doporučení pro chovatele teriérů.
|
|
|
Interpretace dat z biočipů
Ludwig, Petr ; Šilhavá, Jana (oponent) ; Smrž, Pavel (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá interpretací dat získaných pomocí technologie biočipů. Práce obsahuje také krátký úvod do problematiky genetické informace a jejího významu. Jádrem práce je pak sada skriptů provádějící analýzy nad testovacími daty. Jako vstupní data jsou použity výstupy biočipové analýzy tkání s rakovinou tlustého střeva. Dílčí výsledek je určení genových markerů rakoviny tlustého střeva. Finální výsledek určuje postavení markerů v kontextu objevených signálních drah, ty jsou nakonec seřazeny dle relevance.
|
|
|
Hardwarová akcelerace algoritmu pro hledání podobnosti dvou DNA řetězců
Nosek, Ondřej ; Kořenek, Jan (oponent) ; Martínek, Tomáš (vedoucí práce)
Metody pro zarovnání různých typů bioinformatických sekvencí jsou klíčovou součástí výzkumu v této oblasti. Úlohy jsou časově velmi náročné, a proto má smysl vytvořit hardwarovou platformu pro urychlení těchto výpoětů. Cílem této práce je navržení obecné architektury založené na FPGA technologii, která dokáže pracovat s několika různými druhy sekvencí. Metody, které bude navržená akcelerační karta používat budou především dynamické algoritmy Needleman-Wunsch a Smith-Waterman.
|
|
| |
|
|
Vyhledávání a charakteristika genů zodpovědných za modré zbarvení obilek pšenice seté (Triticum aestivum L.)
Musilová, Milena
Cílem této práce bylo studium genetické variability genotypů pšenice s modrým zabarvením obilky mikrosatelitními markery. Na tuto analýzu navazovala identifikace a charakteristika kandidátních sekvencí podílejících se na nestandardním modrém zabarvení obilky pšenice, s tím související bioinformatická analýza těchto kandidátních sekvencí a především studium genové exprese vybrané kandidátní sekvence v průběhu zrání obilky. Dále bylo mikroskopicky zkoumáno ukládání modrého pigmentu v aleuronové vrstvě obilky a orientačním "skríningem" vybrané kolekce genotypů s modrým aleuronem byly vytipovány tři nejperspektivnější genotypy z hlediska dobré pekařské kvality, a tím byl dotvořen komplexní náhled na problematiku vybraných genotypů pšenice seté s modrým aleuronem.
|
|
|
Analýza exprese genů pro růst a vývoj svaloviny u prasat, studium variability genu IL18 a jeho asociace s užitkovými znaky
Chalupová, Pavla
Práce navazuje na výsledky microarray analýz a zabývá se analýzou diferenciální exprese ve svalové tkáni u prasat. Pomocí kvantitativní real-time RT-PCR byla validována exprese 12 genů (ANXA1, ANXA2, BTG2, CSRP2, DAB2, EMP3, HBEGF, IL18, PRKAR1A, SGCD, SORT1, TGFB2) podílejících se na vývoji a růstu svaloviny u prasat. Byly sledovány rozdíly v expresi ve dvou svalech (m. longissimus lumborum et thoracis a m. biceps femoris) mezi prasetem divokým a českým bílým ušlechtilým, formami lišícími se výrazně v růstu. Všechny studované geny vykazovaly vyšší hladinu exprese u českého bílého ušlechtilého. Za účelem resekvenování a detekce polymorfismů byl vybrán gen IL18, kódující prozánětlivý cytokin interlerukin 18. IL18 byl dříve asociován s tukovým metabolismem, inzulínovou rezistencí a funkcí svalové tkáně. V úsecích pokrývajících exon 2, 4 a 5 bylo nalezeno celkem 40 polymorfismů. Pro dva polymorfismy: ENSSSCG00000015037:g.11237G>A v exonu 2 (MspI) a g.19480G>A v intronu 5--6 (VspI) byla navržena metodika PCR-RFLP a byla zhodnocena asociace s parametry užitkovosti a kvality masa u vybraných populací prasat (n = 344 a 669). Byly nalezeny asociace genu IL18 se znaky růstu, osvalení, ukládání tuku a kvality masa. IL18 by mohl být dalším genem využívaným v MAS u prasat.
|
|
| |
|
| |
|
| |
host ::
RSS.